287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0146 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_0146  hypothetical protein  100 
 
 		 135 aa  265  1e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0181  hypothetical protein  85.12 
 
 		 136 aa  211  2.9999999999999995e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.973166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0116  hypothetical protein  88.89 
 
 		 118 aa  205  1e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.185512 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0320  hypothetical protein  85 
 
 		 135 aa  204  3e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0420  hypothetical protein  78.99 
 
 		 128 aa  194  3e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0400  hypothetical protein  76.47 
 
 		 131 aa  192  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0325  hypothetical protein  69.83 
 
 		 130 aa  160  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.493012  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0187  hypothetical protein  50 
 
 		 125 aa  108  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3545  hypothetical protein  51.33 
 
 		 122 aa  108  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3586  hypothetical protein  49.62 
 
 		 133 aa  107  5e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0178  hypothetical protein  50 
 
 		 126 aa  101  3e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.647134  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4010  hypothetical protein  50 
 
 		 124 aa  99.8  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.571569  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1042  hypothetical protein  43.59 
 
 		 122 aa  98.2  3e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0556279  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0293  protein of unknown function UPF0102  47.86 
 
 		 124 aa  95.5  2e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.210059 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0406  hypothetical protein  54.21 
 
 		 128 aa  95.1  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.442549 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0439  hypothetical protein  54.21 
 
 		 128 aa  94.4  5e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.111388  normal  0.465101 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0353  hypothetical protein  42.75 
 
 		 128 aa  94.4  5e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3496  hypothetical protein  50.94 
 
 		 125 aa  92.8  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.215369 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4331  hypothetical protein  48.18 
 
 		 122 aa  91.3  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.84486 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0021  hypothetical protein  50.94 
 
 		 133 aa  89.4  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0577391 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0339  hypothetical protein  52.29 
 
 		 127 aa  89.7  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0692015  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0024  hypothetical protein  50.85 
 
 		 129 aa  88.2  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0228023  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3014  hypothetical protein  46.23 
 
 		 127 aa  87  7e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4594  hypothetical protein  48.54 
 
 		 122 aa  84  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.042758 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3692  hypothetical protein  48.6 
 
 		 125 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.598845  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2398  hypothetical protein  40 
 
 		 118 aa  78.6  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.430013  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0175  hypothetical protein  46.85 
 
 		 139 aa  79  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.361745 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0037  hypothetical protein  39.45 
 
 		 127 aa  79  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1291  protein of unknown function UPF0102  40.37 
 
 		 115 aa  75.5  0.0000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000677509  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0474  hypothetical protein  51.61 
 
 		 125 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3485  hypothetical protein  39.34 
 
 		 125 aa  74.3  0.0000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000340579 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2230  protein of unknown function UPF0102  44.92 
 
 		 127 aa  73.9  0.0000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0169041  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1703  hypothetical protein  42.11 
 
 		 123 aa  73.6  0.0000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1695  hypothetical protein  36.61 
 
 		 120 aa  73.2  0.000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0170  protein of unknown function UPF0102  37.11 
 
 		 108 aa  73.2  0.000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.633607  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2298  hypothetical protein  38.39 
 
 		 123 aa  73.2  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1413  hypothetical protein  32.61 
 
 		 112 aa  72  0.000000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0189  protein of unknown function UPF0102  37.84 
 
 		 127 aa  71.6  0.000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.452343  normal  0.48907 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0262  hypothetical protein  41.84 
 
 		 116 aa  71.6  0.000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.605183  normal  0.332641 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3424  hypothetical protein  38.52 
 
 		 125 aa  70.9  0.000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0017  hypothetical protein  39.81 
 
 		 128 aa  70.5  0.000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000457371  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1186  hypothetical protein  39.55 
 
 		 140 aa  70.5  0.000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00400032  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0016  hypothetical protein  43.16 
 
 		 129 aa  68.6  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.197298  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0017  hypothetical protein  43.16 
 
 		 126 aa  68.9  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00052241  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0294  hypothetical protein  31.68 
 
 		 112 aa  69.3  0.00000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2261  hypothetical protein  44.09 
 
 		 128 aa  67.8  0.00000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1475  endonuclease  38.74 
 
 		 115 aa  67.4  0.00000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.733308  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0216  hypothetical protein  30.85 
 
 		 112 aa  67  0.00000000009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3919  protein of unknown function UPF0102  35.58 
 
 		 144 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000143067  normal  0.216721 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3870  protein of unknown function UPF0102  35.58 
 
 		 144 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1093  endonuclease-like  38.68 
 
 		 202 aa  66.2  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0572  hypothetical protein  38.05 
 
 		 118 aa  66.6  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.421068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1959  hypothetical protein  35.48 
 
 		 122 aa  66.6  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.142549  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0650  hypothetical protein  43.22 
 
 		 128 aa  65.5  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5237  protein of unknown function UPF0102  33.33 
 
 		 164 aa  65.5  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3998  protein of unknown function UPF0102  40.94 
 
 		 139 aa  65.5  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0702  hypothetical protein  30.53 
 
 		 112 aa  66.2  0.0000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.254087  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2938  hypothetical protein  37.17 
 
 		 129 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.703285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1677  hypothetical protein  35.79 
 
 		 122 aa  65.1  0.0000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.238653  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_687  endonuclease  39.78 
 
 		 121 aa  64.7  0.0000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2217  hypothetical protein  41.38 
 
 		 123 aa  64.7  0.0000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000089571  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0093  hypothetical protein  31.82 
 
 		 122 aa  64.7  0.0000000004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.560974  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1723  hypothetical protein  37.61 
 
 		 123 aa  64.7  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.471951 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0503  hypothetical protein  37.84 
 
 		 120 aa  64.3  0.0000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.451178 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1901  formate dehydrogenase H large subunit  30.61 
 
 		 109 aa  64.3  0.0000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0733  hypothetical protein  34.86 
 
 		 180 aa  63.9  0.0000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.646389 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1509  hypothetical protein  33.33 
 
 		 133 aa  63.5  0.0000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0781  hypothetical protein  37.63 
 
 		 121 aa  62.4  0.000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1530  hypothetical protein  34 
 
 		 118 aa  62.8  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0048655  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07400  hypothetical protein  35.14 
 
 		 116 aa  62.8  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0700  protein of unknown function UPF0102  34.96 
 
 		 172 aa  62.8  0.000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000202877  hitchhiker  0.000000354886 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2083  hypothetical protein  43.43 
 
 		 104 aa  62.4  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3298  hypothetical protein  37.5 
 
 		 124 aa  62.4  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.861672  normal  0.570212 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0497  hypothetical protein  37.14 
 
 		 142 aa  62.4  0.000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1992  hypothetical protein  42.27 
 
 		 129 aa  60.8  0.000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0629  hypothetical protein  31.03 
 
 		 122 aa  60.8  0.000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3146  sigma-54 factor  37.76 
 
 		 118 aa  60.8  0.000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0707  hypothetical protein  38.71 
 
 		 121 aa  60.8  0.000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0977  hypothetical protein  35.05 
 
 		 119 aa  60.5  0.000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.320606  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2303  hypothetical protein  32.35 
 
 		 130 aa  60.5  0.000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0306992  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2007  hypothetical protein  38.78 
 
 		 124 aa  60.1  0.000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.63182  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3311  protein of unknown function UPF0102  39.51 
 
 		 134 aa  59.7  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0756  hypothetical protein  36.84 
 
 		 118 aa  59.7  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.477778  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0900  hypothetical protein  41.67 
 
 		 100 aa  59.7  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.813892 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1934  hypothetical protein  33.66 
 
 		 120 aa  59.7  0.00000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.547856  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0259  hypothetical protein  33.66 
 
 		 120 aa  59.7  0.00000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3355  hypothetical protein  41 
 
 		 108 aa  59.7  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2103  hypothetical protein  42.05 
 
 		 121 aa  60.1  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.374615  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0144  hypothetical protein  27.17 
 
 		 112 aa  59.3  0.00000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0464  hypothetical protein  33.7 
 
 		 116 aa  59.3  0.00000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0142  conserved hypothetical protein TIGR00252  37.23 
 
 		 121 aa  59.3  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0315  protein of unknown function UPF0102  37.23 
 
 		 121 aa  59.3  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000225244 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0465  hypothetical protein  29.63 
 
 		 113 aa  58.9  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1156  hypothetical protein  43.3 
 
 		 118 aa  59.3  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0160558  normal  0.0576877 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0163  hypothetical protein  26.09 
 
 		 112 aa  59.3  0.00000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0184  hypothetical protein  27.17 
 
 		 112 aa  59.3  0.00000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.805797  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2864  hypothetical protein  40.18 
 
 		 122 aa  58.5  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00415914  hitchhiker  0.000000500394 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1969  hypothetical protein  37.5 
 
 		 133 aa  58.5  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00399816  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2202  hypothetical protein  37.25 
 
 		 121 aa  58.9  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.474644  normal  0.174288 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2054  hypothetical protein  37.5 
 
 		 133 aa  58.5  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.595954  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>