187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0702 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_0702  hypothetical protein  100 
 
 		 112 aa  228  2e-59  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.254087  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0170  protein of unknown function UPF0102  42.42 
 
 		 108 aa  73.9  0.0000000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.633607  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1413  hypothetical protein  40 
 
 		 112 aa  70.1  0.00000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0146  hypothetical protein  30.53 
 
 		 135 aa  66.2  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2025  hypothetical protein  38.38 
 
 		 119 aa  65.1  0.0000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1639  protein of unknown function UPF0102  38.61 
 
 		 110 aa  64.7  0.0000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0181  hypothetical protein  31.37 
 
 		 136 aa  64.3  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.973166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0216  hypothetical protein  41.05 
 
 		 112 aa  64.3  0.0000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0017  hypothetical protein  36.84 
 
 		 126 aa  63.2  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00052241  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1176  hypothetical protein  33.64 
 
 		 122 aa  63.2  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.108145 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5877  protein of unknown function UPF0102  34.34 
 
 		 117 aa  63.2  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.662779 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0320  hypothetical protein  27.62 
 
 		 135 aa  62.8  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0400  hypothetical protein  28.57 
 
 		 131 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0629  hypothetical protein  38.94 
 
 		 122 aa  62  0.000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0116  hypothetical protein  29.47 
 
 		 118 aa  61.6  0.000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.185512 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0977  hypothetical protein  40.95 
 
 		 119 aa  62  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.320606  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0144  hypothetical protein  39.8 
 
 		 112 aa  61.2  0.000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0184  hypothetical protein  39.8 
 
 		 112 aa  61.2  0.000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.805797  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0163  hypothetical protein  38.78 
 
 		 112 aa  60.8  0.000000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0325  hypothetical protein  27.88 
 
 		 130 aa  60.5  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.493012  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0420  hypothetical protein  27.62 
 
 		 128 aa  60.1  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1509  hypothetical protein  36.27 
 
 		 133 aa  60.5  0.000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2095  protein of unknown function UPF0102  33.67 
 
 		 137 aa  60.1  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1143  hypothetical protein  39.39 
 
 		 113 aa  60.1  0.00000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2488  protein of unknown function UPF0102  29.13 
 
 		 123 aa  58.5  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0776001  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1901  formate dehydrogenase H large subunit  36.96 
 
 		 109 aa  58.5  0.00000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1703  hypothetical protein  37.62 
 
 		 123 aa  58.5  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0294  hypothetical protein  34.38 
 
 		 112 aa  58.2  0.00000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0546  hypothetical protein  31.82 
 
 		 115 aa  57.8  0.00000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.672576  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1175  protein of unknown function UPF0102  31.31 
 
 		 122 aa  57.8  0.00000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1530  hypothetical protein  37.62 
 
 		 118 aa  57.8  0.00000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0048655  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1475  endonuclease  33.33 
 
 		 115 aa  57.4  0.00000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.733308  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0142  conserved hypothetical protein TIGR00252  26.92 
 
 		 121 aa  57  0.00000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0315  protein of unknown function UPF0102  26.92 
 
 		 121 aa  57  0.00000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000225244 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0017  hypothetical protein  34.74 
 
 		 128 aa  56.2  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000457371  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0016  hypothetical protein  34.58 
 
 		 129 aa  56.2  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.197298  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1228  hypothetical protein  33.68 
 
 		 119 aa  56.2  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.74821  normal  0.260342 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0701  hypothetical protein  36.54 
 
 		 122 aa  55.8  0.0000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2202  hypothetical protein  30.53 
 
 		 121 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.474644  normal  0.174288 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07400  hypothetical protein  38.46 
 
 		 116 aa  55.5  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1217  hypothetical protein  32.38 
 
 		 123 aa  55.5  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.266389  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2864  hypothetical protein  34.95 
 
 		 122 aa  54.3  0.0000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00415914  hitchhiker  0.000000500394 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0123  hypothetical protein  30.21 
 
 		 156 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1406  protein of unknown function UPF0102  33.66 
 
 		 114 aa  53.9  0.0000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1959  hypothetical protein  36.96 
 
 		 122 aa  53.1  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.142549  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07020  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  31.31 
 
 		 186 aa  53.5  0.000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00114408  normal  0.507303 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0993  protein of unknown function UPF0102  34 
 
 		 129 aa  52  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00109853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1272  protein of unknown function UPF0102  28.57 
 
 		 125 aa  52.8  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2474  hypothetical protein  31 
 
 		 118 aa  52.4  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0253334  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1478  protein of unknown function UPF0102  33.75 
 
 		 118 aa  52.8  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.10043  normal  0.036198 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0465  hypothetical protein  35.35 
 
 		 113 aa  52  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1376  protein of unknown function UPF0102  32.67 
 
 		 119 aa  51.6  0.000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000032081  normal  0.333882 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0460  protein of unknown function UPF0102  32.65 
 
 		 153 aa  51.6  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1407  protein of unknown function UPF0102  28.12 
 
 		 122 aa  51.6  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.993674  normal  0.0549137 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3709  protein of unknown function UPF0102  34.95 
 
 		 119 aa  51.2  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1677  hypothetical protein  36.26 
 
 		 122 aa  51.2  0.000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.238653  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0353  hypothetical protein  25.71 
 
 		 128 aa  50.8  0.000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0650  hypothetical protein  34.78 
 
 		 128 aa  50.4  0.000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1992  hypothetical protein  33.68 
 
 		 129 aa  50.4  0.000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0189  protein of unknown function UPF0102  23.3 
 
 		 127 aa  50.4  0.000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.452343  normal  0.48907 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10070  conserved hypothetical protein TIGR00252  29.47 
 
 		 153 aa  50.4  0.000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0294595  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04380  hypothetical protein  24.3 
 
 		 122 aa  50.1  0.000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2303  hypothetical protein  33.65 
 
 		 130 aa  50.1  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0306992  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1908  hypothetical protein  33 
 
 		 173 aa  50.1  0.00001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000102604  hitchhiker  0.00425538 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3496  hypothetical protein  26.67 
 
 		 125 aa  50.1  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.215369 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2198  hypothetical protein  29 
 
 		 172 aa  50.1  0.00001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00219221  decreased coverage  0.00807275 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0037  hypothetical protein  34 
 
 		 127 aa  49.7  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0405  hypothetical protein  29.9 
 
 		 154 aa  49.7  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11140  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  30.61 
 
 		 120 aa  50.1  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0330886  normal  0.323386 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4313  hypothetical protein  27 
 
 		 140 aa  49.3  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2103  hypothetical protein  26.88 
 
 		 121 aa  49.3  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.374615  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03356  Sigma-54 factor  31 
 
 		 113 aa  49.7  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0497  hypothetical protein  31.07 
 
 		 142 aa  48.9  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3545  hypothetical protein  27.37 
 
 		 122 aa  48.9  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2213  hypothetical protein  31.31 
 
 		 132 aa  48.5  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000124547 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0671  hypothetical protein  27.72 
 
 		 108 aa  48.5  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000156143  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12912  hypothetical protein  28.87 
 
 		 141 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0199208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0695  hypothetical protein  27.72 
 
 		 108 aa  48.5  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000229548  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0503  hypothetical protein  28.12 
 
 		 120 aa  48.1  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.451178 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0930  hypothetical protein  28.72 
 
 		 123 aa  47.8  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.930588  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0992  hypothetical protein  31.58 
 
 		 117 aa  47.8  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.528214  normal  0.0951104 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1792  hypothetical protein  26.26 
 
 		 160 aa  47.8  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1320  hypothetical protein  31.58 
 
 		 121 aa  47.8  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2230  protein of unknown function UPF0102  32.29 
 
 		 127 aa  47.8  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0169041  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3756  hypothetical protein  35.9 
 
 		 127 aa  47.8  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00341379  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0669  hypothetical protein  29.29 
 
 		 124 aa  47.4  0.00007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1695  hypothetical protein  28.72 
 
 		 120 aa  47.4  0.00007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1969  hypothetical protein  29.47 
 
 		 133 aa  47.4  0.00007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00399816  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0720  hypothetical protein  32.32 
 
 		 126 aa  47.4  0.00007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0341617  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3311  protein of unknown function UPF0102  30 
 
 		 134 aa  47.4  0.00007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2054  hypothetical protein  29.47 
 
 		 133 aa  47.4  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.595954  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0910  hypothetical protein  23.3 
 
 		 119 aa  47  0.00008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.21322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2298  hypothetical protein  32.47 
 
 		 123 aa  47  0.00009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3485  hypothetical protein  31.31 
 
 		 125 aa  46.2  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000340579 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1723  hypothetical protein  26.53 
 
 		 123 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.471951 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4996  hypothetical protein  22.77 
 
 		 125 aa  47  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.608406  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0259  hypothetical protein  26.26 
 
 		 120 aa  46.2  0.0001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2398  hypothetical protein  31.31 
 
 		 118 aa  46.6  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.430013  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1521  protein of unknown function UPF0102  32.14 
 
 		 157 aa  46.6  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0637187  normal  0.0119716 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1934  hypothetical protein  26.26 
 
 		 120 aa  46.2  0.0001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.547856  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>