220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0216 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0216  hypothetical protein  100 
 
 
112 aa  219  9.999999999999999e-57  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0294  hypothetical protein  61.26 
 
 
112 aa  144  6e-34  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1413  hypothetical protein  55.86 
 
 
112 aa  130  6e-30  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1143  hypothetical protein  58.41 
 
 
113 aa  127  6e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0163  hypothetical protein  59.46 
 
 
112 aa  126  1.0000000000000001e-28  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0144  hypothetical protein  59.46 
 
 
112 aa  125  2.0000000000000002e-28  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0184  hypothetical protein  59.46 
 
 
112 aa  125  2.0000000000000002e-28  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.805797  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0170  protein of unknown function UPF0102  49.51 
 
 
108 aa  93.6  8e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.633607  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1901  formate dehydrogenase H large subunit  45.71 
 
 
109 aa  84  7e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0695  hypothetical protein  38.24 
 
 
108 aa  78.2  0.00000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000229548  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0671  hypothetical protein  38.24 
 
 
108 aa  78.2  0.00000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000156143  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0320  hypothetical protein  28.87 
 
 
135 aa  68.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1509  hypothetical protein  40 
 
 
133 aa  68.2  0.00000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0146  hypothetical protein  30.85 
 
 
135 aa  67  0.00000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0420  hypothetical protein  27.84 
 
 
128 aa  66.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0325  hypothetical protein  31.33 
 
 
130 aa  66.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.493012  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1992  hypothetical protein  36.46 
 
 
129 aa  66.2  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0400  hypothetical protein  29.67 
 
 
131 aa  66.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1959  hypothetical protein  45.68 
 
 
122 aa  65.1  0.0000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.142549  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2864  hypothetical protein  36.52 
 
 
122 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00415914  hitchhiker  0.000000500394 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3485  hypothetical protein  38.53 
 
 
125 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000340579 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0116  hypothetical protein  29.91 
 
 
118 aa  64.3  0.0000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.185512 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0702  hypothetical protein  41.05 
 
 
112 aa  64.3  0.0000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.254087  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0181  hypothetical protein  30.85 
 
 
136 aa  63.2  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.973166  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3424  hypothetical protein  38.53 
 
 
125 aa  63.2  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1723  hypothetical protein  26.92 
 
 
123 aa  62.4  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.471951 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2398  hypothetical protein  35.85 
 
 
118 aa  61.6  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.430013  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2025  hypothetical protein  40.59 
 
 
119 aa  61.6  0.000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1677  hypothetical protein  42.11 
 
 
122 aa  61.6  0.000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.238653  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5237  protein of unknown function UPF0102  31.18 
 
 
164 aa  61.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0977  hypothetical protein  50.65 
 
 
119 aa  61.2  0.000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.320606  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0546  hypothetical protein  37 
 
 
115 aa  61.2  0.000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.672576  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2488  protein of unknown function UPF0102  27.88 
 
 
123 aa  60.5  0.000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0776001  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1530  hypothetical protein  44.3 
 
 
118 aa  60.1  0.000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0048655  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1475  endonuclease  46.94 
 
 
115 aa  59.7  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.733308  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0037  hypothetical protein  35.29 
 
 
127 aa  59.7  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1836  hypothetical protein  28.57 
 
 
117 aa  58.9  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0316841 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1406  protein of unknown function UPF0102  31.25 
 
 
114 aa  59.3  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1291  protein of unknown function UPF0102  37.27 
 
 
115 aa  58.9  0.00000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000677509  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0503  hypothetical protein  31.07 
 
 
120 aa  58.5  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.451178 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0017  hypothetical protein  35.29 
 
 
128 aa  58.5  0.00000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000457371  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0355  hypothetical protein  32 
 
 
124 aa  58.2  0.00000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0629  hypothetical protein  38.94 
 
 
122 aa  58.2  0.00000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3298  hypothetical protein  50.88 
 
 
124 aa  58.2  0.00000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.861672  normal  0.570212 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2007  hypothetical protein  28.33 
 
 
124 aa  57.4  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.63182  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004502  endonuclease  30.77 
 
 
122 aa  56.2  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000161677  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0669  hypothetical protein  28.72 
 
 
124 aa  56.6  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2298  hypothetical protein  40.51 
 
 
123 aa  56.6  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07020  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  34.07 
 
 
186 aa  56.6  0.0000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00114408  normal  0.507303 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2095  protein of unknown function UPF0102  29.47 
 
 
137 aa  56.6  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2464  hypothetical protein  31.53 
 
 
123 aa  56.6  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.164658  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3053  protein of unknown function UPF0102  34.29 
 
 
111 aa  56.2  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3756  hypothetical protein  37.8 
 
 
127 aa  56.2  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00341379  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4800  hypothetical protein  35.87 
 
 
151 aa  55.5  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0195  hypothetical protein  31.13 
 
 
119 aa  56.2  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.227376  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2201  hypothetical protein  29.59 
 
 
123 aa  55.8  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1350  protein of unknown function UPF0102  27.27 
 
 
118 aa  55.8  0.0000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0189  protein of unknown function UPF0102  25.3 
 
 
127 aa  55.1  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.452343  normal  0.48907 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0017  hypothetical protein  35.92 
 
 
126 aa  55.5  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00052241  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1985  hypothetical protein  28.57 
 
 
135 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0318406  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2031  hypothetical protein  28.57 
 
 
135 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.474175  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2217  hypothetical protein  27.62 
 
 
123 aa  55.1  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000089571  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0666  hypothetical protein  27.88 
 
 
116 aa  54.7  0.0000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0397911  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0277  protein of unknown function UPF0102  34.86 
 
 
120 aa  54.3  0.0000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.107261  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3496  hypothetical protein  30.86 
 
 
125 aa  54.7  0.0000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.215369 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12912  hypothetical protein  28.43 
 
 
141 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0199208  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0184  hypothetical protein  25.26 
 
 
123 aa  53.9  0.0000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0701  hypothetical protein  33.33 
 
 
122 aa  54.3  0.0000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1218  protein of unknown function UPF0102  30.48 
 
 
119 aa  53.9  0.0000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.648075  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3586  hypothetical protein  24.21 
 
 
133 aa  53.9  0.0000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00890  hypothetical protein  28.21 
 
 
122 aa  53.9  0.0000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0992  hypothetical protein  27.55 
 
 
117 aa  53.9  0.0000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.528214  normal  0.0951104 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1703  hypothetical protein  35.58 
 
 
123 aa  53.5  0.0000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1965  hypothetical protein  27.55 
 
 
135 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.52969 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0226  hypothetical protein  30.1 
 
 
114 aa  53.5  0.0000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.113401  normal  0.113585 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0650  hypothetical protein  33.33 
 
 
128 aa  53.1  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1406  protein of unknown function UPF0102  41.38 
 
 
173 aa  53.1  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000418677  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3065  hypothetical protein  32.69 
 
 
118 aa  53.5  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10070  conserved hypothetical protein TIGR00252  26.32 
 
 
153 aa  53.1  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0294595  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0142  conserved hypothetical protein TIGR00252  31.65 
 
 
121 aa  53.1  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0315  protein of unknown function UPF0102  31.65 
 
 
121 aa  53.1  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000225244 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0993  protein of unknown function UPF0102  30.34 
 
 
129 aa  52.8  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00109853  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09830  conserved hypothetical protein TIGR00252  30.69 
 
 
125 aa  52.4  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.351272  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0016  hypothetical protein  34.95 
 
 
129 aa  52.8  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.197298  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3248  hypothetical protein  26.26 
 
 
124 aa  52.4  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.852323  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2202  hypothetical protein  25 
 
 
121 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.474644  normal  0.174288 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2655  hypothetical protein  31.73 
 
 
123 aa  52  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3675  protein of unknown function UPF0102  40.38 
 
 
122 aa  51.2  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.344366 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1934  hypothetical protein  29.63 
 
 
120 aa  51.2  0.000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.547856  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0339  hypothetical protein  38.98 
 
 
127 aa  51.2  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0692015  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0259  hypothetical protein  29.63 
 
 
120 aa  51.2  0.000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1186  hypothetical protein  33.33 
 
 
140 aa  51.6  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00400032  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1639  protein of unknown function UPF0102  33.64 
 
 
110 aa  51.2  0.000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0572  hypothetical protein  28.57 
 
 
118 aa  51.2  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.421068  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4331  hypothetical protein  29.89 
 
 
122 aa  51.2  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.84486 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1156  hypothetical protein  28 
 
 
118 aa  51.2  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0160558  normal  0.0576877 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4433  hypothetical protein  33.64 
 
 
129 aa  50.4  0.000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.875795  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0758  hypothetical protein  52.94 
 
 
130 aa  50.8  0.000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0733  hypothetical protein  27.18 
 
 
180 aa  50.4  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.646389 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0676  hypothetical protein  28.81 
 
 
167 aa  50.4  0.000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0552943  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>