170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_1143 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_1143  hypothetical protein  100 
 
 
113 aa  228  3e-59  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1413  hypothetical protein  61.61 
 
 
112 aa  135  2e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0144  hypothetical protein  58.41 
 
 
112 aa  127  6e-29  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0184  hypothetical protein  58.41 
 
 
112 aa  127  6e-29  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.805797  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0216  hypothetical protein  58.41 
 
 
112 aa  127  6e-29  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0163  hypothetical protein  57.52 
 
 
112 aa  126  9.000000000000001e-29  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0294  hypothetical protein  53.1 
 
 
112 aa  121  3e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0170  protein of unknown function UPF0102  48.11 
 
 
108 aa  97.1  8e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.633607  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1901  formate dehydrogenase H large subunit  41.9 
 
 
109 aa  82  0.000000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0671  hypothetical protein  38.46 
 
 
108 aa  74.7  0.0000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000156143  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0695  hypothetical protein  38.46 
 
 
108 aa  74.7  0.0000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000229548  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1509  hypothetical protein  36.79 
 
 
133 aa  66.2  0.0000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2488  protein of unknown function UPF0102  34.58 
 
 
123 aa  62.4  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0776001  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0546  hypothetical protein  37.61 
 
 
115 aa  60.8  0.000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.672576  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0702  hypothetical protein  39.39 
 
 
112 aa  60.1  0.00000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.254087  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0400  hypothetical protein  33 
 
 
131 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0629  hypothetical protein  38.39 
 
 
122 aa  57.8  0.00000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2217  hypothetical protein  33.01 
 
 
123 aa  57  0.00000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000089571  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0503  hypothetical protein  32.08 
 
 
120 aa  56.2  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.451178 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2035  hypothetical protein  40 
 
 
122 aa  56.2  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.848509  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3298  hypothetical protein  49.06 
 
 
124 aa  55.8  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.861672  normal  0.570212 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03356  Sigma-54 factor  28.45 
 
 
113 aa  55.5  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0226  hypothetical protein  32.08 
 
 
114 aa  55.5  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.113401  normal  0.113585 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1703  hypothetical protein  41.05 
 
 
123 aa  55.5  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2025  hypothetical protein  39.18 
 
 
119 aa  53.9  0.0000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0146  hypothetical protein  33.33 
 
 
135 aa  53.9  0.0000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1218  protein of unknown function UPF0102  31.03 
 
 
119 aa  53.9  0.0000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.648075  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0116  hypothetical protein  31.82 
 
 
118 aa  53.5  0.0000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.185512 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0420  hypothetical protein  30 
 
 
128 aa  53.5  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0320  hypothetical protein  31.03 
 
 
135 aa  53.5  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1530  hypothetical protein  57.14 
 
 
118 aa  53.1  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0048655  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0181  hypothetical protein  30 
 
 
136 aa  52.8  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.973166  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0701  hypothetical protein  34.34 
 
 
122 aa  53.1  0.000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2303  hypothetical protein  35.19 
 
 
130 aa  52.8  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0306992  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4433  hypothetical protein  34 
 
 
129 aa  52.8  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.875795  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10070  conserved hypothetical protein TIGR00252  28.07 
 
 
153 aa  52.4  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0294595  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3311  protein of unknown function UPF0102  31.68 
 
 
134 aa  52.4  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3675  protein of unknown function UPF0102  30 
 
 
122 aa  52  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.344366 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2298  hypothetical protein  34.86 
 
 
123 aa  51.6  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1641  protein of unknown function UPF0102  40 
 
 
122 aa  51.2  0.000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0797113  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0112  hypothetical protein  26.73 
 
 
122 aa  51.2  0.000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3430  hypothetical protein  28.85 
 
 
134 aa  50.8  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.157474  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0460  protein of unknown function UPF0102  31.68 
 
 
153 aa  50.8  0.000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09830  conserved hypothetical protein TIGR00252  45.16 
 
 
125 aa  50.4  0.000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.351272  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0184  hypothetical protein  27.83 
 
 
123 aa  50.4  0.000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1406  protein of unknown function UPF0102  31.58 
 
 
114 aa  50.4  0.000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1475  endonuclease  46 
 
 
115 aa  50.1  0.000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.733308  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2213  protein of unknown function UPF0102  22.64 
 
 
118 aa  50.1  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.19652 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10390  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  40.54 
 
 
167 aa  49.7  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000139118  unclonable  0.000000000910029 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1284  hypothetical protein  28.57 
 
 
121 aa  48.9  0.00002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1093  endonuclease-like  31.63 
 
 
202 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0676  hypothetical protein  27.27 
 
 
167 aa  49.3  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0552943  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0325  hypothetical protein  27.91 
 
 
130 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.493012  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0017  hypothetical protein  31.19 
 
 
126 aa  48.5  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00052241  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07020  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  46.3 
 
 
186 aa  48.5  0.00003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00114408  normal  0.507303 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1959  hypothetical protein  53.06 
 
 
122 aa  48.5  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.142549  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3766  hypothetical protein  25.69 
 
 
122 aa  48.5  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.969308  normal  0.0430921 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0017  hypothetical protein  32.11 
 
 
128 aa  48.5  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000457371  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1639  protein of unknown function UPF0102  32.41 
 
 
110 aa  47.8  0.00006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2198  hypothetical protein  28.57 
 
 
172 aa  47.4  0.00006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00219221  decreased coverage  0.00807275 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1406  protein of unknown function UPF0102  40.68 
 
 
173 aa  47.8  0.00006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000418677  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0993  protein of unknown function UPF0102  38.98 
 
 
129 aa  47.8  0.00006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00109853  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1639  hypothetical protein  25.89 
 
 
136 aa  47.4  0.00007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.106195 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4800  hypothetical protein  32.99 
 
 
151 aa  47.4  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1677  hypothetical protein  55.56 
 
 
122 aa  47.4  0.00007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.238653  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2230  protein of unknown function UPF0102  41.07 
 
 
127 aa  47.4  0.00007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0169041  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1272  protein of unknown function UPF0102  34.78 
 
 
125 aa  47.4  0.00007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1350  protein of unknown function UPF0102  27.52 
 
 
118 aa  46.2  0.0001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0142  conserved hypothetical protein TIGR00252  29.35 
 
 
121 aa  47  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0355  hypothetical protein  27.27 
 
 
124 aa  46.6  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1695  hypothetical protein  30.11 
 
 
120 aa  46.6  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3135  hypothetical protein  25.45 
 
 
125 aa  46.2  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0391  hypothetical protein  27.03 
 
 
149 aa  47  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0487377 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0315  protein of unknown function UPF0102  29.35 
 
 
121 aa  47  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000225244 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3709  protein of unknown function UPF0102  32.29 
 
 
119 aa  46.6  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3463  hypothetical protein  25.45 
 
 
125 aa  47  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2019  protein of unknown function UPF0102  29.21 
 
 
134 aa  46.2  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.573307  normal  0.167847 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3148  hypothetical protein  32.93 
 
 
160 aa  45.8  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2213  hypothetical protein  44 
 
 
132 aa  45.4  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000124547 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0465  hypothetical protein  29.41 
 
 
113 aa  45.8  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0932  hypothetical protein  30.43 
 
 
123 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3740  protein of unknown function UPF0102  28.57 
 
 
121 aa  45.4  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000086697  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00890  hypothetical protein  30.7 
 
 
122 aa  45.8  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0145  hypothetical protein  26.73 
 
 
124 aa  45.8  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0280805  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2398  hypothetical protein  30.84 
 
 
118 aa  45.8  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.430013  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5917  protein of unknown function UPF0102  34.55 
 
 
117 aa  45.1  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00245822  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2283  hypothetical protein  30 
 
 
113 aa  45.4  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.567685 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1176  hypothetical protein  33.33 
 
 
122 aa  45.4  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.108145 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1521  protein of unknown function UPF0102  32.56 
 
 
157 aa  45.1  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0637187  normal  0.0119716 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12912  hypothetical protein  27.38 
 
 
141 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0199208  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2395  hypothetical protein  34.57 
 
 
127 aa  44.7  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.615386  normal  0.0739869 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1908  hypothetical protein  27.66 
 
 
173 aa  44.7  0.0005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000102604  hitchhiker  0.00425538 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004502  endonuclease  29.66 
 
 
122 aa  44.7  0.0005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000161677  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1212  protein of unknown function UPF0102  39.29 
 
 
121 aa  44.7  0.0005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0977  hypothetical protein  47.37 
 
 
119 aa  44.3  0.0005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.320606  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3355  hypothetical protein  25.96 
 
 
108 aa  44.3  0.0005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3990  hypothetical protein  28.57 
 
 
108 aa  44.3  0.0006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4100  hypothetical protein  28.57 
 
 
108 aa  44.3  0.0006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4070  hypothetical protein  28.57 
 
 
108 aa  44.3  0.0006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4188  hypothetical protein  28.57 
 
 
108 aa  44.3  0.0006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>