186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1284 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1284  hypothetical protein  100 
 
 		 121 aa  241  1.9999999999999999e-63  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1186  hypothetical protein  67.05 
 
 		 114 aa  102  2e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16141  hypothetical protein  48.7 
 
 		 126 aa  96.7  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.21518 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5237  protein of unknown function UPF0102  38.14 
 
 		 164 aa  70.5  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4800  hypothetical protein  31.03 
 
 		 151 aa  63.9  0.0000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3694  hypothetical protein  35.44 
 
 		 114 aa  60.5  0.000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0930  hypothetical protein  39.47 
 
 		 123 aa  58.5  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.930588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1406  protein of unknown function UPF0102  42.31 
 
 		 114 aa  57.8  0.00000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0669  hypothetical protein  38.39 
 
 		 124 aa  57.4  0.00000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1324  protein of unknown function UPF0102  25.86 
 
 		 148 aa  57.4  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4114  hypothetical protein  34.19 
 
 		 123 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1475  endonuclease  50 
 
 		 115 aa  56.6  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.733308  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0112  hypothetical protein  37.18 
 
 		 122 aa  56.6  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0184  hypothetical protein  30.7 
 
 		 123 aa  55.5  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2202  hypothetical protein  38.37 
 
 		 121 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.474644  normal  0.174288 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0231  protein of unknown function UPF0102  38.64 
 
 		 121 aa  55.8  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.819406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1407  protein of unknown function UPF0102  36.19 
 
 		 122 aa  55.5  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.993674  normal  0.0549137 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5917  protein of unknown function UPF0102  35.09 
 
 		 117 aa  55.8  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00245822  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3065  hypothetical protein  24.32 
 
 		 118 aa  55.5  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4140  hypothetical protein  42.86 
 
 		 123 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2864  hypothetical protein  35.06 
 
 		 122 aa  54.3  0.0000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00415914  hitchhiker  0.000000500394 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0277  protein of unknown function UPF0102  31.58 
 
 		 120 aa  54.3  0.0000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.107261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07020  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  34.62 
 
 		 186 aa  53.5  0.0000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00114408  normal  0.507303 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0312  hypothetical protein  47.46 
 
 		 142 aa  53.5  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3586  hypothetical protein  34.82 
 
 		 118 aa  53.1  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2283  hypothetical protein  37.14 
 
 		 113 aa  53.1  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.567685 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3675  protein of unknown function UPF0102  48.98 
 
 		 122 aa  53.1  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.344366 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1703  hypothetical protein  32.91 
 
 		 123 aa  52.8  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09830  conserved hypothetical protein TIGR00252  40.28 
 
 		 125 aa  52.4  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.351272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0700  protein of unknown function UPF0102  41.07 
 
 		 172 aa  52.4  0.000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000202877  hitchhiker  0.000000354886 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3298  hypothetical protein  32.93 
 
 		 124 aa  52.8  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.861672  normal  0.570212 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0142  conserved hypothetical protein TIGR00252  33.33 
 
 		 121 aa  52.4  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0315  protein of unknown function UPF0102  33.33 
 
 		 121 aa  52.4  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000225244 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0701  hypothetical protein  34.25 
 
 		 122 aa  52.4  0.000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2488  protein of unknown function UPF0102  36.99 
 
 		 123 aa  52  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0776001  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00890  hypothetical protein  32.99 
 
 		 122 aa  52  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0293  protein of unknown function UPF0102  32.97 
 
 		 124 aa  52  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.210059 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0650  hypothetical protein  31.58 
 
 		 128 aa  51.6  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4524  hypothetical protein  33.94 
 
 		 123 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1175  protein of unknown function UPF0102  35.23 
 
 		 122 aa  51.2  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23670  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  37.35 
 
 		 127 aa  51.6  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.183487  normal  0.0867152 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2213  protein of unknown function UPF0102  35.34 
 
 		 118 aa  51.6  0.000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.19652 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0145  hypothetical protein  34.25 
 
 		 124 aa  51.6  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0280805  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1186  hypothetical protein  36.14 
 
 		 140 aa  51.2  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00400032  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3870  protein of unknown function UPF0102  30.19 
 
 		 144 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3919  protein of unknown function UPF0102  30.19 
 
 		 144 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000143067  normal  0.216721 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57490  hypothetical protein  42.47 
 
 		 125 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0325  hypothetical protein  35.63 
 
 		 130 aa  50.4  0.000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.493012  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3413  protein of unknown function UPF0102  34.62 
 
 		 124 aa  50.8  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2095  protein of unknown function UPF0102  36.71 
 
 		 137 aa  50.4  0.000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0932  hypothetical protein  36.78 
 
 		 123 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4420  hypothetical protein  30.08 
 
 		 128 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.149236  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0355  hypothetical protein  27.52 
 
 		 124 aa  49.7  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3248  hypothetical protein  44.83 
 
 		 124 aa  49.7  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.852323  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0993  protein of unknown function UPF0102  33.71 
 
 		 129 aa  49.7  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00109853  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0992  hypothetical protein  37.66 
 
 		 117 aa  50.1  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.528214  normal  0.0951104 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4996  hypothetical protein  42.47 
 
 		 125 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.608406  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3783  hypothetical protein  37.35 
 
 		 118 aa  48.9  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00882109  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3311  protein of unknown function UPF0102  33.73 
 
 		 134 aa  49.7  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0639  conserved hypothetical protein TIGR00252  45.21 
 
 		 182 aa  49.3  0.00002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.372666 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12912  hypothetical protein  39.08 
 
 		 141 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0199208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0216  hypothetical protein  29.87 
 
 		 112 aa  49.3  0.00002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1143  hypothetical protein  28.57 
 
 		 113 aa  48.9  0.00002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1324  hypothetical protein  38.96 
 
 		 124 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.294844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0195  hypothetical protein  34.21 
 
 		 119 aa  48.5  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.227376  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1985  hypothetical protein  37.97 
 
 		 135 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0318406  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2474  hypothetical protein  32.95 
 
 		 118 aa  48.5  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0253334  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2031  hypothetical protein  37.97 
 
 		 135 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.474175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1965  hypothetical protein  37.97 
 
 		 135 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.52969 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0910  hypothetical protein  31.62 
 
 		 119 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.21322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1217  hypothetical protein  30.68 
 
 		 123 aa  48.5  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.266389  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4400  hypothetical protein  38.96 
 
 		 123 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.147019 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1836  hypothetical protein  31.48 
 
 		 117 aa  48.9  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0316841 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1406  protein of unknown function UPF0102  37.25 
 
 		 173 aa  48.5  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000418677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1272  protein of unknown function UPF0102  41.67 
 
 		 125 aa  48.5  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0733  hypothetical protein  31.48 
 
 		 180 aa  48.1  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.646389 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1550  hypothetical protein  51.02 
 
 		 132 aa  48.1  0.00004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.176091 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3391  hypothetical protein  38.04 
 
 		 128 aa  47.8  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1959  hypothetical protein  30.77 
 
 		 122 aa  47.8  0.00005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.142549  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1478  protein of unknown function UPF0102  35.56 
 
 		 118 aa  47.8  0.00005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.10043  normal  0.036198 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1156  hypothetical protein  34.83 
 
 		 118 aa  47.8  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0160558  normal  0.0576877 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0197  hypothetical protein  36.25 
 
 		 137 aa  47.4  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.404878  unclonable  0.00000000000559374 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0216  hypothetical protein  35.85 
 
 		 142 aa  47  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0192793 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1677  hypothetical protein  31.37 
 
 		 122 aa  47  0.00008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.238653  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2103  hypothetical protein  34.94 
 
 		 121 aa  47.4  0.00008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.374615  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004502  endonuclease  29.47 
 
 		 122 aa  47  0.00009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000161677  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1639  protein of unknown function UPF0102  35.71 
 
 		 110 aa  47  0.00009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3265  hypothetical protein  30.77 
 
 		 130 aa  47  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0017  hypothetical protein  25.22 
 
 		 126 aa  46.2  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00052241  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3014  hypothetical protein  32.67 
 
 		 127 aa  46.2  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1413  hypothetical protein  27.96 
 
 		 112 aa  46.6  0.0001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2395  hypothetical protein  36.36 
 
 		 127 aa  46.6  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.615386  normal  0.0739869 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4252  hypothetical protein  32.88 
 
 		 117 aa  46.6  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000137469 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2398  hypothetical protein  38.89 
 
 		 118 aa  46.2  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.430013  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3463  hypothetical protein  36.99 
 
 		 125 aa  46.2  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0756  hypothetical protein  38.16 
 
 		 118 aa  46.2  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.477778  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11140  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  34.82 
 
 		 120 aa  45.8  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0330886  normal  0.323386 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3146  sigma-54 factor  41.07 
 
 		 118 aa  45.8  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0629  hypothetical protein  27.27 
 
 		 122 aa  45.8  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2007  hypothetical protein  35.37 
 
 		 124 aa  46.2  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.63182  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>