169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_0733 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_0733  hypothetical protein  100 
 
 
180 aa  370  1e-102  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.646389 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5237  protein of unknown function UPF0102  47.02 
 
 
164 aa  146  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3870  protein of unknown function UPF0102  47.17 
 
 
144 aa  140  9e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3919  protein of unknown function UPF0102  47.17 
 
 
144 aa  140  9e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000143067  normal  0.216721 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1324  protein of unknown function UPF0102  46.91 
 
 
148 aa  134  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4800  hypothetical protein  45 
 
 
151 aa  122  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0312  hypothetical protein  42.15 
 
 
142 aa  83.2  0.000000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0320  hypothetical protein  34.86 
 
 
135 aa  71.2  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0400  hypothetical protein  36.7 
 
 
131 aa  70.5  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0420  hypothetical protein  36.7 
 
 
128 aa  68.9  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0497  hypothetical protein  36.67 
 
 
142 aa  68.2  0.00000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1291  protein of unknown function UPF0102  36.8 
 
 
115 aa  65.9  0.0000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000677509  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1959  hypothetical protein  37.04 
 
 
122 aa  65.5  0.0000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.142549  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0116  hypothetical protein  34.86 
 
 
118 aa  63.9  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.185512 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0325  hypothetical protein  37.5 
 
 
130 aa  63.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.493012  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0146  hypothetical protein  34.86 
 
 
135 aa  63.9  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1186  hypothetical protein  38.98 
 
 
140 aa  63.9  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00400032  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1703  hypothetical protein  31.45 
 
 
123 aa  63.2  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1908  hypothetical protein  31.16 
 
 
173 aa  62.4  0.000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000102604  hitchhiker  0.00425538 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0181  hypothetical protein  35.78 
 
 
136 aa  62.4  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.973166  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1677  hypothetical protein  34.29 
 
 
122 aa  62  0.000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.238653  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12912  hypothetical protein  34.07 
 
 
141 aa  59.7  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0199208  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2303  hypothetical protein  33.33 
 
 
130 aa  57.8  0.00000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0306992  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2864  hypothetical protein  38.1 
 
 
122 aa  57.8  0.00000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00415914  hitchhiker  0.000000500394 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0650  hypothetical protein  38.1 
 
 
128 aa  57.4  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0093  hypothetical protein  30.56 
 
 
122 aa  57  0.0000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.560974  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3463  hypothetical protein  36.11 
 
 
125 aa  57  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2298  hypothetical protein  31.9 
 
 
123 aa  57.4  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2095  protein of unknown function UPF0102  31.45 
 
 
137 aa  56.2  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0676  hypothetical protein  36.7 
 
 
167 aa  56.6  0.0000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0552943  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0700  protein of unknown function UPF0102  37.27 
 
 
172 aa  56.6  0.0000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000202877  hitchhiker  0.000000354886 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0037  hypothetical protein  33.04 
 
 
127 aa  56.2  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1406  protein of unknown function UPF0102  34.29 
 
 
173 aa  56.2  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000418677  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2035  hypothetical protein  34.48 
 
 
122 aa  56.6  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.848509  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3135  hypothetical protein  36.11 
 
 
125 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1836  hypothetical protein  36.61 
 
 
117 aa  56.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0316841 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0355  hypothetical protein  28.97 
 
 
124 aa  55.8  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3586  hypothetical protein  31.48 
 
 
133 aa  56.2  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3740  protein of unknown function UPF0102  30.97 
 
 
121 aa  55.5  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000086697  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2198  hypothetical protein  28.99 
 
 
172 aa  55.1  0.0000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00219221  decreased coverage  0.00807275 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10390  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  35.71 
 
 
167 aa  55.5  0.0000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000139118  unclonable  0.000000000910029 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1156  hypothetical protein  34.82 
 
 
118 aa  54.7  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0160558  normal  0.0576877 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2217  hypothetical protein  36.75 
 
 
123 aa  54.7  0.0000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000089571  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1212  protein of unknown function UPF0102  29.06 
 
 
121 aa  54.3  0.0000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1530  hypothetical protein  31.78 
 
 
118 aa  54.3  0.0000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0048655  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1406  protein of unknown function UPF0102  33.64 
 
 
114 aa  54.3  0.0000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1447  protein of unknown function UPF0102  35.24 
 
 
127 aa  53.9  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2532  protein of unknown function UPF0102  45.16 
 
 
118 aa  53.9  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.388001 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2007  hypothetical protein  32.32 
 
 
124 aa  53.9  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.63182  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2398  hypothetical protein  33.33 
 
 
118 aa  53.9  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.430013  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0781  hypothetical protein  33.04 
 
 
121 aa  53.1  0.000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1992  hypothetical protein  34.58 
 
 
129 aa  52.8  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3146  sigma-54 factor  30.43 
 
 
118 aa  53.1  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0294  hypothetical protein  32.22 
 
 
112 aa  53.5  0.000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2202  hypothetical protein  31.2 
 
 
121 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.474644  normal  0.174288 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0017  hypothetical protein  33.33 
 
 
126 aa  53.1  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00052241  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1723  hypothetical protein  34.29 
 
 
123 aa  53.5  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.471951 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2488  protein of unknown function UPF0102  33.33 
 
 
123 aa  53.1  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0776001  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0629  hypothetical protein  32.41 
 
 
122 aa  52.8  0.000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0669  hypothetical protein  35.11 
 
 
124 aa  52  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0546  hypothetical protein  29.91 
 
 
115 aa  52  0.000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.672576  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3265  hypothetical protein  34.69 
 
 
130 aa  52  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2230  protein of unknown function UPF0102  36.94 
 
 
127 aa  51.6  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0169041  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3485  hypothetical protein  33.33 
 
 
125 aa  52  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000340579 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1475  endonuclease  33.33 
 
 
115 aa  52  0.000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.733308  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0707  hypothetical protein  33.04 
 
 
121 aa  52  0.000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1218  protein of unknown function UPF0102  31.82 
 
 
119 aa  52  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.648075  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16141  hypothetical protein  34.26 
 
 
126 aa  51.6  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.21518 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1965  hypothetical protein  34.82 
 
 
135 aa  51.6  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.52969 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07020  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  32.41 
 
 
186 aa  51.2  0.000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00114408  normal  0.507303 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1985  hypothetical protein  35.4 
 
 
135 aa  51.2  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0318406  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2031  hypothetical protein  35.4 
 
 
135 aa  51.2  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.474175  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3424  hypothetical protein  33.33 
 
 
125 aa  50.4  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4140  hypothetical protein  32.8 
 
 
123 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1350  protein of unknown function UPF0102  32 
 
 
118 aa  50.4  0.00001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0216  hypothetical protein  27.18 
 
 
112 aa  50.4  0.00001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4524  hypothetical protein  28.32 
 
 
123 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3311  protein of unknown function UPF0102  31.53 
 
 
134 aa  50.4  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0675  protein of unknown function UPF0102  28.7 
 
 
165 aa  49.7  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1093  endonuclease-like  32.43 
 
 
202 aa  50.1  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0977  hypothetical protein  32.11 
 
 
119 aa  50.1  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.320606  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0666  hypothetical protein  33.33 
 
 
116 aa  50.1  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0397911  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4420  hypothetical protein  29.73 
 
 
128 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.149236  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0589  hypothetical protein  27.59 
 
 
131 aa  49.3  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.424556  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0315  protein of unknown function UPF0102  32.41 
 
 
121 aa  49.3  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000225244 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0142  conserved hypothetical protein TIGR00252  32.41 
 
 
121 aa  49.3  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1324  hypothetical protein  28.32 
 
 
124 aa  48.9  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.294844  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4010  hypothetical protein  30.56 
 
 
124 aa  48.5  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.571569  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57490  hypothetical protein  30.91 
 
 
125 aa  48.9  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1550  hypothetical protein  41.3 
 
 
132 aa  48.9  0.00004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.176091 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0017  hypothetical protein  31.03 
 
 
128 aa  48.9  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000457371  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10070  conserved hypothetical protein TIGR00252  36.04 
 
 
153 aa  48.5  0.00005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0294595  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07400  hypothetical protein  31.07 
 
 
116 aa  48.5  0.00005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_687  endonuclease  32.17 
 
 
121 aa  48.5  0.00005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1376  protein of unknown function UPF0102  33.04 
 
 
119 aa  48.5  0.00005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000032081  normal  0.333882 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2019  protein of unknown function UPF0102  33.33 
 
 
134 aa  48.5  0.00005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.573307  normal  0.167847 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0639  conserved hypothetical protein TIGR00252  35.45 
 
 
182 aa  48.1  0.00006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.372666 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1284  hypothetical protein  31.48 
 
 
121 aa  48.1  0.00006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0910  hypothetical protein  28.7 
 
 
119 aa  48.5  0.00006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.21322  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3123  protein of unknown function UPF0102  36.61 
 
 
121 aa  48.1  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0308676  normal  0.107591 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>