226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_4010 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_4010  hypothetical protein  100 
 
 		 124 aa  246  1e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.571569  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0178  hypothetical protein  66.96 
 
 		 126 aa  143  8.000000000000001e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.647134  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0187  hypothetical protein  58.68 
 
 		 125 aa  139  9.999999999999999e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3545  hypothetical protein  61.26 
 
 		 122 aa  137  4.999999999999999e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0353  hypothetical protein  62.28 
 
 		 128 aa  134  6.0000000000000005e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1042  hypothetical protein  55.17 
 
 		 122 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0556279  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4331  hypothetical protein  58.41 
 
 		 122 aa  124  6e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.84486 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3586  hypothetical protein  52.73 
 
 		 133 aa  106  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4594  hypothetical protein  59.22 
 
 		 122 aa  104  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.042758 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0420  hypothetical protein  50.89 
 
 		 128 aa  103  8e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0400  hypothetical protein  49.11 
 
 		 131 aa  99.4  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0146  hypothetical protein  50 
 
 		 135 aa  99.8  1e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0181  hypothetical protein  51.38 
 
 		 136 aa  99.8  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.973166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0325  hypothetical protein  47.86 
 
 		 130 aa  96.3  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.493012  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0320  hypothetical protein  47.83 
 
 		 135 aa  95.1  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3014  hypothetical protein  46.79 
 
 		 127 aa  94  6e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0116  hypothetical protein  46.43 
 
 		 118 aa  92.4  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.185512 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0293  protein of unknown function UPF0102  48.18 
 
 		 124 aa  91.7  3e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.210059 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3496  hypothetical protein  46.36 
 
 		 125 aa  90.9  5e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.215369 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0021  hypothetical protein  51.82 
 
 		 133 aa  90.5  6e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0577391 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0439  hypothetical protein  48.67 
 
 		 128 aa  89  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.111388  normal  0.465101 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0406  hypothetical protein  48.67 
 
 		 128 aa  88.6  3e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.442549 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2938  hypothetical protein  44.25 
 
 		 129 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.703285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0024  hypothetical protein  50.44 
 
 		 129 aa  82  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0228023  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0175  hypothetical protein  43.33 
 
 		 139 aa  80.9  0.000000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.361745 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0572  hypothetical protein  43.36 
 
 		 118 aa  73.9  0.0000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.421068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0474  hypothetical protein  51.09 
 
 		 125 aa  73.6  0.0000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2830  hypothetical protein  43.21 
 
 		 134 aa  65.5  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.31307  normal  0.486249 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1703  hypothetical protein  37.89 
 
 		 123 aa  65.1  0.0000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3692  hypothetical protein  41.35 
 
 		 125 aa  65.1  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.598845  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1530  hypothetical protein  35.05 
 
 		 118 aa  64.3  0.0000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0048655  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00890  hypothetical protein  38.54 
 
 		 122 aa  63.5  0.0000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0093  hypothetical protein  32.35 
 
 		 122 aa  63.2  0.000000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.560974  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1291  protein of unknown function UPF0102  31.3 
 
 		 115 aa  62.8  0.000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000677509  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0189  protein of unknown function UPF0102  35.05 
 
 		 127 aa  62.8  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.452343  normal  0.48907 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1959  hypothetical protein  35.29 
 
 		 122 aa  62  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.142549  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5237  protein of unknown function UPF0102  37.5 
 
 		 164 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1376  protein of unknown function UPF0102  32.67 
 
 		 119 aa  61.6  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000032081  normal  0.333882 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0262  hypothetical protein  39.18 
 
 		 116 aa  62  0.000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.605183  normal  0.332641 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3485  hypothetical protein  36.61 
 
 		 125 aa  62  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000340579 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004502  endonuclease  35.42 
 
 		 122 aa  62  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000161677  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3424  hypothetical protein  36.61 
 
 		 125 aa  60.5  0.000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2298  hypothetical protein  37.5 
 
 		 123 aa  60.5  0.000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0057  hypothetical protein  26.92 
 
 		 122 aa  60.1  0.00000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1677  hypothetical protein  34.31 
 
 		 122 aa  59.7  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.238653  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3756  hypothetical protein  35.54 
 
 		 127 aa  59.3  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00341379  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3311  protein of unknown function UPF0102  40.62 
 
 		 134 aa  58.2  0.00000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1475  endonuclease  35.51 
 
 		 115 aa  57.8  0.00000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.733308  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0339  hypothetical protein  45.74 
 
 		 127 aa  58.2  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0692015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2488  protein of unknown function UPF0102  39.18 
 
 		 123 aa  57.4  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0776001  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5877  protein of unknown function UPF0102  34.82 
 
 		 117 aa  57.8  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.662779 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2864  hypothetical protein  34.58 
 
 		 122 aa  57.4  0.00000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00415914  hitchhiker  0.000000500394 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0650  hypothetical protein  38.95 
 
 		 128 aa  57  0.00000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0977  hypothetical protein  35.42 
 
 		 119 aa  57  0.00000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.320606  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2217  hypothetical protein  39.64 
 
 		 123 aa  57  0.00000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000089571  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2398  hypothetical protein  37.37 
 
 		 118 aa  57  0.00000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.430013  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0231  protein of unknown function UPF0102  38.32 
 
 		 121 aa  56.6  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.819406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0016  hypothetical protein  38 
 
 		 129 aa  56.6  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.197298  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3998  protein of unknown function UPF0102  38.78 
 
 		 139 aa  56.6  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1407  protein of unknown function UPF0102  34.26 
 
 		 122 aa  56.2  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.993674  normal  0.0549137 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4114  hypothetical protein  34.26 
 
 		 123 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0017  hypothetical protein  37.89 
 
 		 128 aa  55.8  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000457371  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1992  hypothetical protein  37.89 
 
 		 129 aa  55.5  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0037  hypothetical protein  37.37 
 
 		 127 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0758  hypothetical protein  35.85 
 
 		 130 aa  55.8  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02085  hypothetical protein  32.73 
 
 		 119 aa  55.1  0.0000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.997348  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2083  hypothetical protein  38.83 
 
 		 104 aa  54.7  0.0000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2095  protein of unknown function UPF0102  34.74 
 
 		 137 aa  54.7  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0629  hypothetical protein  31.58 
 
 		 122 aa  54.7  0.0000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1695  hypothetical protein  34.04 
 
 		 120 aa  54.7  0.0000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2202  hypothetical protein  38.95 
 
 		 121 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.474644  normal  0.174288 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0993  protein of unknown function UPF0102  42.06 
 
 		 129 aa  54.3  0.0000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00109853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0666  hypothetical protein  35.79 
 
 		 116 aa  53.9  0.0000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0397911  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1509  hypothetical protein  48.08 
 
 		 133 aa  53.5  0.0000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0700  protein of unknown function UPF0102  33.67 
 
 		 172 aa  53.5  0.0000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000202877  hitchhiker  0.000000354886 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1406  protein of unknown function UPF0102  35.42 
 
 		 114 aa  53.5  0.0000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2103  hypothetical protein  35.24 
 
 		 121 aa  53.5  0.0000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.374615  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4420  hypothetical protein  33.33 
 
 		 128 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.149236  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2230  protein of unknown function UPF0102  36.08 
 
 		 127 aa  53.1  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0169041  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1406  protein of unknown function UPF0102  35.65 
 
 		 173 aa  53.1  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000418677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57490  hypothetical protein  32.04 
 
 		 125 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3298  hypothetical protein  34.74 
 
 		 124 aa  53.1  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.861672  normal  0.570212 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1186  hypothetical protein  39.8 
 
 		 140 aa  53.1  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00400032  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0675  protein of unknown function UPF0102  32.14 
 
 		 165 aa  53.1  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07400  hypothetical protein  28.83 
 
 		 116 aa  53.1  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4524  hypothetical protein  31.96 
 
 		 123 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0992  hypothetical protein  39.18 
 
 		 117 aa  52.4  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.528214  normal  0.0951104 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13130  hypothetical protein  31.96 
 
 		 120 aa  52  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0720  hypothetical protein  32.73 
 
 		 126 aa  52.8  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0341617  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2474  hypothetical protein  39.58 
 
 		 118 aa  52.8  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0253334  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3740  protein of unknown function UPF0102  33.68 
 
 		 121 aa  52.4  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000086697  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0112  hypothetical protein  31.96 
 
 		 122 aa  52.4  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10390  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  39.64 
 
 		 167 aa  52.4  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000139118  unclonable  0.000000000910029 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0669  hypothetical protein  37.84 
 
 		 124 aa  52  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0701  hypothetical protein  31.43 
 
 		 122 aa  51.2  0.000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2025  hypothetical protein  28 
 
 		 119 aa  51.6  0.000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0497  hypothetical protein  31.43 
 
 		 142 aa  51.6  0.000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0294  hypothetical protein  26.47 
 
 		 112 aa  51.2  0.000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2261  hypothetical protein  40.7 
 
 		 128 aa  51.2  0.000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1218  protein of unknown function UPF0102  36.08 
 
 		 119 aa  50.8  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.648075  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>