256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4594 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_4594  hypothetical protein  100 
 
 		 122 aa  238  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.042758 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4331  hypothetical protein  93.44 
 
 		 122 aa  223  5.0000000000000005e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.84486 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0353  hypothetical protein  65.22 
 
 		 128 aa  149  8e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3545  hypothetical protein  64.04 
 
 		 122 aa  143  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4010  hypothetical protein  58.41 
 
 		 124 aa  124  3e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.571569  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0178  hypothetical protein  57.14 
 
 		 126 aa  122  1e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.647134  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0187  hypothetical protein  54.62 
 
 		 125 aa  122  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1042  hypothetical protein  51.85 
 
 		 122 aa  106  9.000000000000001e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0556279  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3014  hypothetical protein  44.64 
 
 		 127 aa  95.9  2e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0181  hypothetical protein  50 
 
 		 136 aa  93.2  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.973166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0146  hypothetical protein  46.72 
 
 		 135 aa  92.4  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0420  hypothetical protein  47.27 
 
 		 128 aa  90.1  9e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0325  hypothetical protein  46.36 
 
 		 130 aa  89  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.493012  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0400  hypothetical protein  46.36 
 
 		 131 aa  88.2  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0116  hypothetical protein  46.36 
 
 		 118 aa  85.5  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.185512 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0320  hypothetical protein  46.36 
 
 		 135 aa  84.7  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0175  hypothetical protein  46.73 
 
 		 139 aa  79  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.361745 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0293  protein of unknown function UPF0102  44.44 
 
 		 124 aa  77.8  0.00000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.210059 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3586  hypothetical protein  42.73 
 
 		 133 aa  75.9  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0439  hypothetical protein  44.07 
 
 		 128 aa  73.9  0.0000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.111388  normal  0.465101 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0406  hypothetical protein  44.07 
 
 		 128 aa  73.6  0.0000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.442549 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1218  protein of unknown function UPF0102  38.94 
 
 		 119 aa  70.9  0.000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.648075  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3496  hypothetical protein  39.81 
 
 		 125 aa  68.6  0.00000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.215369 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0021  hypothetical protein  40.19 
 
 		 133 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0577391 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0189  protein of unknown function UPF0102  34.55 
 
 		 127 aa  66.6  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.452343  normal  0.48907 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0572  hypothetical protein  37.27 
 
 		 118 aa  66.6  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.421068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1530  hypothetical protein  36.08 
 
 		 118 aa  65.9  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0048655  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0977  hypothetical protein  38.54 
 
 		 119 aa  65.5  0.0000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.320606  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1406  protein of unknown function UPF0102  38.54 
 
 		 114 aa  64.3  0.0000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0024  hypothetical protein  42.5 
 
 		 129 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0228023  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2398  hypothetical protein  35.45 
 
 		 118 aa  63.5  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.430013  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1703  hypothetical protein  35.09 
 
 		 123 aa  63.5  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3485  hypothetical protein  38.54 
 
 		 125 aa  62  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000340579 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1376  protein of unknown function UPF0102  31.58 
 
 		 119 aa  62  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000032081  normal  0.333882 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3998  protein of unknown function UPF0102  39.58 
 
 		 139 aa  62.4  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2298  hypothetical protein  41 
 
 		 123 aa  61.6  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1992  hypothetical protein  38.95 
 
 		 129 aa  61.6  0.000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2864  hypothetical protein  36.94 
 
 		 122 aa  61.6  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00415914  hitchhiker  0.000000500394 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3756  hypothetical protein  38.54 
 
 		 127 aa  61.6  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00341379  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3424  hypothetical protein  38.54 
 
 		 125 aa  60.8  0.000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3692  hypothetical protein  38.89 
 
 		 125 aa  60.8  0.000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.598845  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0992  hypothetical protein  43.3 
 
 		 117 aa  59.7  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.528214  normal  0.0951104 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2083  hypothetical protein  40.78 
 
 		 104 aa  59.7  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2938  hypothetical protein  37.96 
 
 		 129 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.703285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2007  hypothetical protein  43.27 
 
 		 124 aa  58.9  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.63182  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0016  hypothetical protein  35.9 
 
 		 129 aa  59.3  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.197298  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0017  hypothetical protein  35.9 
 
 		 128 aa  58.9  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000457371  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1969  hypothetical protein  41.23 
 
 		 133 aa  58.9  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00399816  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2054  hypothetical protein  41.23 
 
 		 133 aa  58.9  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.595954  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0629  hypothetical protein  34.78 
 
 		 122 aa  59.3  0.00000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00890  hypothetical protein  34.38 
 
 		 122 aa  58.5  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2095  protein of unknown function UPF0102  37.14 
 
 		 137 aa  58.5  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2217  hypothetical protein  40.62 
 
 		 123 aa  58.2  0.00000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000089571  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2830  hypothetical protein  39.24 
 
 		 134 aa  58.2  0.00000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.31307  normal  0.486249 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0017  hypothetical protein  39.18 
 
 		 126 aa  58.2  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00052241  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4433  hypothetical protein  29.46 
 
 		 129 aa  57.8  0.00000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.875795  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3311  protein of unknown function UPF0102  38.61 
 
 		 134 aa  57.8  0.00000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2488  protein of unknown function UPF0102  48.57 
 
 		 123 aa  57.4  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0776001  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1156  hypothetical protein  41.58 
 
 		 118 aa  57.4  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0160558  normal  0.0576877 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1406  protein of unknown function UPF0102  41.6 
 
 		 173 aa  57  0.00000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000418677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2035  hypothetical protein  31.43 
 
 		 122 aa  57  0.00000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.848509  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3709  protein of unknown function UPF0102  35.96 
 
 		 119 aa  57  0.00000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0339  hypothetical protein  42.06 
 
 		 127 aa  56.6  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0692015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0671  hypothetical protein  31.91 
 
 		 108 aa  56.2  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000156143  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0695  hypothetical protein  31.91 
 
 		 108 aa  56.2  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000229548  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0720  hypothetical protein  34.26 
 
 		 126 aa  56.6  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0341617  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0474  hypothetical protein  42.5 
 
 		 125 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1291  protein of unknown function UPF0102  31.13 
 
 		 115 aa  56.2  0.0000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000677509  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0037  hypothetical protein  34.75 
 
 		 127 aa  56.6  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0650  hypothetical protein  37.5 
 
 		 128 aa  55.8  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0758  hypothetical protein  38.54 
 
 		 130 aa  55.8  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1324  hypothetical protein  34.02 
 
 		 124 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.294844  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0460  protein of unknown function UPF0102  37.1 
 
 		 153 aa  55.1  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1186  hypothetical protein  38.53 
 
 		 140 aa  55.5  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00400032  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0930  hypothetical protein  37.63 
 
 		 123 aa  55.1  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.930588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0355  hypothetical protein  33.67 
 
 		 124 aa  54.7  0.0000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4400  hypothetical protein  34.02 
 
 		 123 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.147019 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07400  hypothetical protein  33.33 
 
 		 116 aa  54.7  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4420  hypothetical protein  33.33 
 
 		 128 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.149236  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1272  protein of unknown function UPF0102  34 
 
 		 125 aa  54.3  0.0000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0262  hypothetical protein  34.38 
 
 		 116 aa  54.3  0.0000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.605183  normal  0.332641 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004502  endonuclease  31.25 
 
 		 122 aa  54.3  0.0000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000161677  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0465  hypothetical protein  30.91 
 
 		 113 aa  53.9  0.0000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2103  hypothetical protein  38.14 
 
 		 121 aa  53.9  0.0000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.374615  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3452  hypothetical protein  37.3 
 
 		 131 aa  54.3  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0142  conserved hypothetical protein TIGR00252  37.84 
 
 		 121 aa  53.9  0.0000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3620  hypothetical protein  37.3 
 
 		 131 aa  53.9  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3560  hypothetical protein  37.3 
 
 		 131 aa  53.9  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3523  hypothetical protein  37.3 
 
 		 131 aa  53.9  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.578592  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3454  hypothetical protein  37.3 
 
 		 131 aa  53.9  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0700  protein of unknown function UPF0102  34.78 
 
 		 172 aa  53.9  0.0000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000202877  hitchhiker  0.000000354886 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4524  hypothetical protein  32.99 
 
 		 123 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0315  protein of unknown function UPF0102  37.84 
 
 		 121 aa  53.9  0.0000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000225244 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1836  hypothetical protein  38.95 
 
 		 117 aa  53.5  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0316841 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0546  hypothetical protein  31.82 
 
 		 115 aa  52.8  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.672576  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2230  protein of unknown function UPF0102  34.21 
 
 		 127 aa  53.1  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0169041  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3355  hypothetical protein  37.86 
 
 		 108 aa  53.1  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2202  hypothetical protein  35.35 
 
 		 121 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.474644  normal  0.174288 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5877  protein of unknown function UPF0102  36.94 
 
 		 117 aa  53.5  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.662779 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0910  hypothetical protein  38.95 
 
 		 119 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.21322  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>