224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_0474 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_0474  hypothetical protein  100 
 
 		 125 aa  238  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0439  hypothetical protein  88.8 
 
 		 128 aa  187  5e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.111388  normal  0.465101 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0406  hypothetical protein  88.8 
 
 		 128 aa  185  2e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.442549 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2938  hypothetical protein  57.02 
 
 		 129 aa  123  7e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.703285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0024  hypothetical protein  73.55 
 
 		 129 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0228023  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0021  hypothetical protein  68.75 
 
 		 133 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0577391 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3496  hypothetical protein  56.03 
 
 		 125 aa  114  6e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.215369 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0293  protein of unknown function UPF0102  55.65 
 
 		 124 aa  107  8.000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.210059 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0420  hypothetical protein  52.07 
 
 		 128 aa  101  3e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0400  hypothetical protein  51.24 
 
 		 131 aa  100  6e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0320  hypothetical protein  54.21 
 
 		 135 aa  100  8e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0178  hypothetical protein  49.58 
 
 		 126 aa  97.8  5e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.647134  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3586  hypothetical protein  54.72 
 
 		 133 aa  97.8  5e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0325  hypothetical protein  50.47 
 
 		 130 aa  96.3  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.493012  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0181  hypothetical protein  50 
 
 		 136 aa  96.7  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.973166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0187  hypothetical protein  47.46 
 
 		 125 aa  94.4  4e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0146  hypothetical protein  51.4 
 
 		 135 aa  93.2  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0116  hypothetical protein  49.53 
 
 		 118 aa  90.1  8e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.185512 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4010  hypothetical protein  48.67 
 
 		 124 aa  88.6  3e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.571569  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0353  hypothetical protein  42.62 
 
 		 128 aa  86.7  9e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1042  hypothetical protein  42.98 
 
 		 122 aa  84.7  4e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0556279  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3545  hypothetical protein  47.75 
 
 		 122 aa  84.3  6e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3014  hypothetical protein  47.22 
 
 		 127 aa  80.9  0.000000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3692  hypothetical protein  45.87 
 
 		 125 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.598845  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4331  hypothetical protein  45.76 
 
 		 122 aa  77.8  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.84486 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0175  hypothetical protein  43.2 
 
 		 139 aa  74.3  0.0000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.361745 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2864  hypothetical protein  38.94 
 
 		 122 aa  72.8  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00415914  hitchhiker  0.000000500394 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0572  hypothetical protein  40.87 
 
 		 118 aa  71.2  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.421068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2230  protein of unknown function UPF0102  35 
 
 		 127 aa  64.3  0.0000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0169041  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2103  hypothetical protein  46.15 
 
 		 121 aa  64.3  0.0000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.374615  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3424  hypothetical protein  33.06 
 
 		 125 aa  63.2  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3485  hypothetical protein  32.23 
 
 		 125 aa  62.4  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000340579 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4594  hypothetical protein  43.69 
 
 		 122 aa  62.4  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.042758 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4685  hypothetical protein  37.27 
 
 		 120 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0484178 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0262  hypothetical protein  40.62 
 
 		 116 aa  61.2  0.000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.605183  normal  0.332641 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0339  hypothetical protein  45.97 
 
 		 127 aa  60.8  0.000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0692015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0093  hypothetical protein  27.1 
 
 		 122 aa  60.5  0.000000008  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.560974  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2398  hypothetical protein  34.86 
 
 		 118 aa  60.5  0.000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.430013  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1723  hypothetical protein  40.62 
 
 		 123 aa  60.5  0.000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.471951 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0017  hypothetical protein  42.17 
 
 		 128 aa  59.7  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000457371  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03015  hypothetical protein  39.45 
 
 		 131 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0557  protein of unknown function UPF0102  39.45 
 
 		 131 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0932  hypothetical protein  36.75 
 
 		 123 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0550  hypothetical protein  39.45 
 
 		 131 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3443  hypothetical protein  39.45 
 
 		 131 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3756  hypothetical protein  36.52 
 
 		 127 aa  59.3  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00341379  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02966  hypothetical protein  39.45 
 
 		 131 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0650  hypothetical protein  37.07 
 
 		 128 aa  58.2  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3630  hypothetical protein  38.53 
 
 		 131 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4467  hypothetical protein  38.53 
 
 		 131 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2019  protein of unknown function UPF0102  39.82 
 
 		 134 aa  57  0.00000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.573307  normal  0.167847 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1324  hypothetical protein  35.9 
 
 		 124 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.294844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4524  hypothetical protein  35.9 
 
 		 123 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1186  hypothetical protein  35.25 
 
 		 140 aa  56.2  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00400032  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4400  hypothetical protein  35.9 
 
 		 123 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.147019 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2283  hypothetical protein  39.8 
 
 		 113 aa  56.2  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.567685 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0695  hypothetical protein  37.63 
 
 		 108 aa  55.8  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000229548  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3298  hypothetical protein  37.17 
 
 		 124 aa  55.8  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.861672  normal  0.570212 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0671  hypothetical protein  37.63 
 
 		 108 aa  55.8  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000156143  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004502  endonuclease  36.17 
 
 		 122 aa  55.1  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000161677  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3624  hypothetical protein  37.61 
 
 		 131 aa  55.5  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1062  hypothetical protein  40.37 
 
 		 138 aa  54.7  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.340253 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13130  hypothetical protein  40.86 
 
 		 120 aa  54.7  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1413  hypothetical protein  27.85 
 
 		 112 aa  53.9  0.0000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0666  hypothetical protein  36.28 
 
 		 116 aa  53.5  0.0000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0397911  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1901  formate dehydrogenase H large subunit  32.08 
 
 		 109 aa  53.5  0.0000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0977  hypothetical protein  32.26 
 
 		 119 aa  53.5  0.0000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.320606  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2007  hypothetical protein  37.5 
 
 		 124 aa  52.8  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.63182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00890  hypothetical protein  37.23 
 
 		 122 aa  53.5  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0142  conserved hypothetical protein TIGR00252  41.25 
 
 		 121 aa  52.8  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0189  protein of unknown function UPF0102  36.29 
 
 		 127 aa  52.8  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.452343  normal  0.48907 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3065  hypothetical protein  27.19 
 
 		 118 aa  52.8  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0057  hypothetical protein  23.36 
 
 		 122 aa  52.4  0.000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0315  protein of unknown function UPF0102  41.25 
 
 		 121 aa  52.8  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000225244 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1703  hypothetical protein  31.03 
 
 		 123 aa  52.8  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1156  hypothetical protein  40 
 
 		 118 aa  52.8  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0160558  normal  0.0576877 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2083  hypothetical protein  43.56 
 
 		 104 aa  52  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3340  hypothetical protein  46.27 
 
 		 89 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3146  sigma-54 factor  34.82 
 
 		 118 aa  52.4  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1530  hypothetical protein  30.7 
 
 		 118 aa  52.8  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0048655  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0037  hypothetical protein  35 
 
 		 127 aa  52.4  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0756  hypothetical protein  36.75 
 
 		 118 aa  52.4  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.477778  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0016  hypothetical protein  37.5 
 
 		 129 aa  52.8  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.197298  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1992  hypothetical protein  35.92 
 
 		 129 aa  51.6  0.000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0589  hypothetical protein  37.23 
 
 		 131 aa  51.6  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.424556  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4420  hypothetical protein  33.33 
 
 		 128 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.149236  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1406  protein of unknown function UPF0102  38.14 
 
 		 114 aa  51.6  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0231  protein of unknown function UPF0102  40.2 
 
 		 121 aa  51.2  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.819406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4252  hypothetical protein  34.78 
 
 		 117 aa  51.6  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000137469 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3585  hypothetical protein  36.08 
 
 		 131 aa  51.2  0.000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.186326 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0017  hypothetical protein  32.77 
 
 		 126 aa  50.8  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00052241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3311  protein of unknown function UPF0102  41.98 
 
 		 134 aa  50.4  0.000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0464  hypothetical protein  30.34 
 
 		 116 aa  50.8  0.000007  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1959  hypothetical protein  26.67 
 
 		 122 aa  50.4  0.000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.142549  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3452  hypothetical protein  39.08 
 
 		 131 aa  50.4  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2298  hypothetical protein  35.04 
 
 		 123 aa  50.4  0.000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0123  hypothetical protein  43.21 
 
 		 156 aa  50.4  0.000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0629  hypothetical protein  30.09 
 
 		 122 aa  50.1  0.000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0630  hypothetical protein  38.6 
 
 		 144 aa  50.4  0.000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0216  hypothetical protein  27.71 
 
 		 112 aa  50.1  0.000009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>