142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0262 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_0262  hypothetical protein  100 
 
 		 116 aa  219  9.999999999999999e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.605183  normal  0.332641 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0572  hypothetical protein  65.49 
 
 		 118 aa  137  3.9999999999999997e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.421068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2083  hypothetical protein  66 
 
 		 104 aa  105  3e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3586  hypothetical protein  46.55 
 
 		 133 aa  85.1  3e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0420  hypothetical protein  44.14 
 
 		 128 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0400  hypothetical protein  44.04 
 
 		 131 aa  82.8  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0146  hypothetical protein  43.48 
 
 		 135 aa  80.1  0.000000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0116  hypothetical protein  43.48 
 
 		 118 aa  79  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.185512 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3692  hypothetical protein  49.07 
 
 		 125 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.598845  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0320  hypothetical protein  45.05 
 
 		 135 aa  78.2  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1042  hypothetical protein  42.2 
 
 		 122 aa  78.2  0.00000000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0556279  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0181  hypothetical protein  40.87 
 
 		 136 aa  75.5  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.973166  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0178  hypothetical protein  42.72 
 
 		 126 aa  72  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.647134  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0175  hypothetical protein  43.59 
 
 		 139 aa  72.4  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.361745 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3014  hypothetical protein  43.7 
 
 		 127 aa  71.6  0.000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0325  hypothetical protein  39.64 
 
 		 130 aa  71.2  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.493012  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0187  hypothetical protein  41.9 
 
 		 125 aa  70.5  0.000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4010  hypothetical protein  38.46 
 
 		 124 aa  70.1  0.000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.571569  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3545  hypothetical protein  41.28 
 
 		 122 aa  65.9  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0189  protein of unknown function UPF0102  37.84 
 
 		 127 aa  65.5  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.452343  normal  0.48907 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3496  hypothetical protein  42.16 
 
 		 125 aa  59.7  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.215369 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0439  hypothetical protein  40.35 
 
 		 128 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.111388  normal  0.465101 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0339  hypothetical protein  40 
 
 		 127 aa  57.4  0.00000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0692015  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4331  hypothetical protein  36.89 
 
 		 122 aa  57.4  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.84486 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3870  protein of unknown function UPF0102  35.58 
 
 		 144 aa  57  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0406  hypothetical protein  40.35 
 
 		 128 aa  57  0.00000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.442549 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3919  protein of unknown function UPF0102  35.58 
 
 		 144 aa  57  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000143067  normal  0.216721 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0503  hypothetical protein  35.29 
 
 		 120 aa  57  0.00000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.451178 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0293  protein of unknown function UPF0102  39.45 
 
 		 124 aa  56.2  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.210059 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0465  hypothetical protein  30.56 
 
 		 113 aa  56.6  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0629  hypothetical protein  28.07 
 
 		 122 aa  54.7  0.0000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0093  hypothetical protein  24.78 
 
 		 122 aa  54.7  0.0000005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.560974  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4594  hypothetical protein  34.95 
 
 		 122 aa  54.3  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.042758 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0464  hypothetical protein  30.39 
 
 		 116 aa  53.9  0.0000007  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0353  hypothetical protein  37.61 
 
 		 128 aa  53.9  0.0000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0112  hypothetical protein  30.56 
 
 		 122 aa  53.9  0.0000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3485  hypothetical protein  32.5 
 
 		 125 aa  53.5  0.0000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000340579 
 
 
-
 
NC_002936  DET0781  hypothetical protein  33.33 
 
 		 121 aa  53.1  0.000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2488  protein of unknown function UPF0102  41.24 
 
 		 123 aa  53.1  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0776001  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0021  hypothetical protein  40.37 
 
 		 133 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0577391 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3424  hypothetical protein  32.5 
 
 		 125 aa  53.1  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0226  hypothetical protein  43.1 
 
 		 114 aa  52.8  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.113401  normal  0.113585 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3756  hypothetical protein  32.5 
 
 		 127 aa  52.4  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00341379  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0474  hypothetical protein  40.35 
 
 		 125 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10070  conserved hypothetical protein TIGR00252  40.86 
 
 		 153 aa  52  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0294595  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1350  protein of unknown function UPF0102  37.37 
 
 		 118 aa  51.6  0.000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2864  hypothetical protein  34.25 
 
 		 122 aa  51.2  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00415914  hitchhiker  0.000000500394 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1406  protein of unknown function UPF0102  48.15 
 
 		 114 aa  51.6  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5877  protein of unknown function UPF0102  31.25 
 
 		 117 aa  51.2  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.662779 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2298  hypothetical protein  44.9 
 
 		 123 aa  50.8  0.000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0650  hypothetical protein  41.1 
 
 		 128 aa  50.4  0.000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0057  hypothetical protein  24.35 
 
 		 122 aa  50.1  0.00001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0460  protein of unknown function UPF0102  33.68 
 
 		 153 aa  49.7  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0037  hypothetical protein  27.27 
 
 		 127 aa  49.7  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3355  hypothetical protein  48.98 
 
 		 108 aa  49.7  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1836  hypothetical protein  37.86 
 
 		 117 aa  49.7  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0316841 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1530  hypothetical protein  27 
 
 		 118 aa  49.3  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0048655  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5237  protein of unknown function UPF0102  32.99 
 
 		 164 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2261  hypothetical protein  49.06 
 
 		 128 aa  49.3  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0671  hypothetical protein  29.25 
 
 		 108 aa  48.9  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000156143  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0216  hypothetical protein  20.41 
 
 		 112 aa  49.3  0.00002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00890  hypothetical protein  29.79 
 
 		 122 aa  49.3  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0756  hypothetical protein  34.34 
 
 		 118 aa  48.9  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.477778  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0695  hypothetical protein  29.25 
 
 		 108 aa  48.9  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000229548  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0017  hypothetical protein  32.63 
 
 		 126 aa  48.1  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00052241  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0992  hypothetical protein  39.6 
 
 		 117 aa  47.8  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.528214  normal  0.0951104 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_687  endonuclease  31.18 
 
 		 121 aa  47.4  0.00006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1186  hypothetical protein  31.58 
 
 		 140 aa  47.8  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00400032  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004502  endonuclease  38.78 
 
 		 122 aa  47.4  0.00007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000161677  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2532  protein of unknown function UPF0102  46.55 
 
 		 118 aa  47  0.00008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.388001 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0184  hypothetical protein  31.25 
 
 		 123 aa  46.6  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0977  hypothetical protein  38.78 
 
 		 119 aa  47  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.320606  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2201  hypothetical protein  50 
 
 		 123 aa  46.2  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0024  hypothetical protein  39.32 
 
 		 129 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0228023  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0170  protein of unknown function UPF0102  27.14 
 
 		 108 aa  46.6  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.633607  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2395  hypothetical protein  25.23 
 
 		 127 aa  46.6  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.615386  normal  0.0739869 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1992  hypothetical protein  32.61 
 
 		 129 aa  45.8  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1695  hypothetical protein  27 
 
 		 120 aa  46.2  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3985  hypothetical protein  37.78 
 
 		 143 aa  45.8  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.889068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1176  hypothetical protein  28.04 
 
 		 122 aa  45.4  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.108145 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0675  protein of unknown function UPF0102  34.62 
 
 		 165 aa  45.8  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0666  hypothetical protein  41.89 
 
 		 116 aa  45.8  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0397911  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2303  hypothetical protein  30.84 
 
 		 130 aa  45.4  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0306992  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0144  hypothetical protein  22.34 
 
 		 112 aa  45.4  0.0003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3265  hypothetical protein  36.45 
 
 		 127 aa  45.1  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2217  hypothetical protein  48.98 
 
 		 123 aa  45.4  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000089571  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1475  endonuclease  29.21 
 
 		 115 aa  45.1  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.733308  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0184  hypothetical protein  22.34 
 
 		 112 aa  45.4  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.805797  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0707  hypothetical protein  37.25 
 
 		 121 aa  45.4  0.0003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0163  hypothetical protein  21.28 
 
 		 112 aa  45.4  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2938  hypothetical protein  36.84 
 
 		 129 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.703285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0017  hypothetical protein  37.74 
 
 		 128 aa  45.4  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000457371  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2398  hypothetical protein  32.43 
 
 		 118 aa  44.7  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.430013  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1703  hypothetical protein  30.19 
 
 		 123 aa  44.7  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2213  protein of unknown function UPF0102  38.54 
 
 		 118 aa  44.3  0.0005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.19652 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1406  protein of unknown function UPF0102  30.51 
 
 		 173 aa  44.7  0.0005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000418677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3311  protein of unknown function UPF0102  29.52 
 
 		 134 aa  44.3  0.0006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0546  hypothetical protein  22.22 
 
 		 115 aa  44.3  0.0006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.672576  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0700  protein of unknown function UPF0102  31.36 
 
 		 172 aa  43.9  0.0007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000202877  hitchhiker  0.000000354886 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1291  protein of unknown function UPF0102  31.08 
 
 		 115 aa  43.9  0.0008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000677509  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>