247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2261 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_2261  hypothetical protein  100 
 
 
128 aa  243  4.9999999999999997e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0189  protein of unknown function UPF0102  44.55 
 
 
127 aa  86.3  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.452343  normal  0.48907 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3014  hypothetical protein  47.06 
 
 
127 aa  78.2  0.00000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0420  hypothetical protein  41.44 
 
 
128 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2103  hypothetical protein  43.75 
 
 
121 aa  77.8  0.00000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.374615  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0146  hypothetical protein  44.09 
 
 
135 aa  77.4  0.00000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0400  hypothetical protein  40.91 
 
 
131 aa  77  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0320  hypothetical protein  41.38 
 
 
135 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4524  hypothetical protein  37.72 
 
 
123 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0116  hypothetical protein  43.3 
 
 
118 aa  74.3  0.0000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.185512 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0181  hypothetical protein  40.37 
 
 
136 aa  73.6  0.0000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.973166  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0353  hypothetical protein  39.81 
 
 
128 aa  73.2  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0503  hypothetical protein  41.07 
 
 
120 aa  71.2  0.000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.451178 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0675  protein of unknown function UPF0102  36.59 
 
 
165 aa  70.9  0.000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0325  hypothetical protein  41.67 
 
 
130 aa  70.9  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.493012  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13130  hypothetical protein  40.35 
 
 
120 aa  70.5  0.000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4400  hypothetical protein  36.84 
 
 
123 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.147019 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1324  hypothetical protein  36.84 
 
 
124 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.294844  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1695  hypothetical protein  33.64 
 
 
120 aa  70.1  0.00000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0187  hypothetical protein  40.82 
 
 
125 aa  67.4  0.00000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4685  hypothetical protein  37.61 
 
 
120 aa  67.4  0.00000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0484178 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1042  hypothetical protein  37.62 
 
 
122 aa  66.2  0.0000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0556279  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3586  hypothetical protein  50 
 
 
133 aa  66.2  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0932  hypothetical protein  35.09 
 
 
123 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0756  hypothetical protein  39.66 
 
 
118 aa  63.5  0.0000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.477778  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0315  protein of unknown function UPF0102  38.94 
 
 
121 aa  63.5  0.0000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000225244 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3265  hypothetical protein  44.55 
 
 
130 aa  63.5  0.0000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0142  conserved hypothetical protein TIGR00252  38.94 
 
 
121 aa  63.5  0.0000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1674  hypothetical protein  44.9 
 
 
121 aa  63.2  0.000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2298  hypothetical protein  35.65 
 
 
123 aa  63.2  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57490  hypothetical protein  35.25 
 
 
125 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4996  hypothetical protein  36.21 
 
 
125 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.608406  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1748  hypothetical protein  44.9 
 
 
121 aa  63.2  0.000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0339  hypothetical protein  52.63 
 
 
127 aa  61.6  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0692015  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4010  hypothetical protein  38.38 
 
 
124 aa  62  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.571569  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2488  protein of unknown function UPF0102  36.89 
 
 
123 aa  61.6  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0776001  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0355  hypothetical protein  35 
 
 
124 aa  61.6  0.000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5237  protein of unknown function UPF0102  30.63 
 
 
164 aa  61.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2213  protein of unknown function UPF0102  40.54 
 
 
118 aa  61.6  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.19652 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04380  hypothetical protein  47.67 
 
 
122 aa  61.6  0.000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0112  hypothetical protein  38.54 
 
 
122 aa  60.8  0.000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2398  hypothetical protein  31.19 
 
 
118 aa  60.5  0.000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.430013  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4337  hypothetical protein  39.58 
 
 
117 aa  59.7  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.977576  normal  0.214034 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4114  hypothetical protein  36.61 
 
 
123 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3919  protein of unknown function UPF0102  35.71 
 
 
144 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000143067  normal  0.216721 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3870  protein of unknown function UPF0102  35.71 
 
 
144 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4331  hypothetical protein  38.24 
 
 
122 aa  59.7  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.84486 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0910  hypothetical protein  40.82 
 
 
119 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.21322  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0197  hypothetical protein  42.99 
 
 
137 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.404878  unclonable  0.00000000000559374 
 
 
-
 
NC_004310  BR0178  hypothetical protein  40.82 
 
 
126 aa  59.3  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.647134  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1093  endonuclease-like  39.58 
 
 
202 aa  59.3  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0589  hypothetical protein  42.86 
 
 
131 aa  58.9  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.424556  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0175  hypothetical protein  40.86 
 
 
139 aa  58.2  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.361745 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3311  protein of unknown function UPF0102  36.56 
 
 
134 aa  58.2  0.00000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0017  hypothetical protein  29.29 
 
 
126 aa  57.8  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00052241  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0259  hypothetical protein  29.59 
 
 
120 aa  57.8  0.00000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1934  hypothetical protein  29.59 
 
 
120 aa  57.8  0.00000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.547856  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1992  hypothetical protein  34.26 
 
 
129 aa  57.4  0.00000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3545  hypothetical protein  34.91 
 
 
122 aa  57.4  0.00000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2201  hypothetical protein  36.84 
 
 
123 aa  57  0.00000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4420  hypothetical protein  37 
 
 
128 aa  57  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.149236  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3391  hypothetical protein  45.1 
 
 
128 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3463  hypothetical protein  40.35 
 
 
125 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2303  hypothetical protein  26.45 
 
 
130 aa  55.5  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0306992  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3148  hypothetical protein  42.27 
 
 
160 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2283  hypothetical protein  36.61 
 
 
113 aa  55.8  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.567685 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0216  hypothetical protein  45.1 
 
 
142 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0192793 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0016  hypothetical protein  31.37 
 
 
129 aa  55.5  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.197298  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0449  hypothetical protein  33.68 
 
 
124 aa  55.1  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.283123  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3135  hypothetical protein  39.47 
 
 
125 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2019  protein of unknown function UPF0102  31.3 
 
 
134 aa  55.1  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.573307  normal  0.167847 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0460  protein of unknown function UPF0102  32.65 
 
 
153 aa  55.1  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0041  hypothetical protein  41.58 
 
 
160 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0293  protein of unknown function UPF0102  34.23 
 
 
124 aa  54.7  0.0000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.210059 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3452  hypothetical protein  33.67 
 
 
131 aa  54.7  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3900  hypothetical protein  41.58 
 
 
144 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3625  hypothetical protein  37.63 
 
 
113 aa  54.7  0.0000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3523  hypothetical protein  33.67 
 
 
131 aa  53.9  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.578592  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2801  hypothetical protein  41.58 
 
 
160 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.135805  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3620  hypothetical protein  33.67 
 
 
131 aa  53.9  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3454  hypothetical protein  33.67 
 
 
131 aa  53.9  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3819  hypothetical protein  41.58 
 
 
144 aa  53.9  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.213422  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3560  hypothetical protein  33.67 
 
 
131 aa  53.9  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3585  hypothetical protein  32.04 
 
 
131 aa  53.9  0.0000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.186326 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1376  protein of unknown function UPF0102  28.95 
 
 
119 aa  53.9  0.0000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000032081  normal  0.333882 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1475  endonuclease  35.19 
 
 
115 aa  53.9  0.0000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.733308  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0024  hypothetical protein  41.58 
 
 
144 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.308699  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1742  hypothetical protein  41.58 
 
 
144 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3176  hypothetical protein  41.58 
 
 
144 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0472  hypothetical protein  38.74 
 
 
117 aa  53.9  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0276117 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0290  hypothetical protein  43.14 
 
 
158 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2816  hypothetical protein  43.14 
 
 
142 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0271  hypothetical protein  43.14 
 
 
142 aa  52.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0679864 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0977  hypothetical protein  29.2 
 
 
119 aa  53.5  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.320606  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3881  hypothetical protein  35.51 
 
 
108 aa  53.1  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.114446 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3424  hypothetical protein  32.14 
 
 
125 aa  52.4  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0195  hypothetical protein  35.09 
 
 
119 aa  52.8  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.227376  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1969  hypothetical protein  44.33 
 
 
133 aa  52.4  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00399816  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0202  hypothetical protein  43.14 
 
 
142 aa  52.4  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0538  hypothetical protein  35.42 
 
 
117 aa  52  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.670141  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>