252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2303 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE2303  hypothetical protein  100 
 
 		 130 aa  264  2.9999999999999995e-70  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0306992  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1703  hypothetical protein  39.84 
 
 		 123 aa  82  0.000000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2864  hypothetical protein  40.94 
 
 		 122 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00415914  hitchhiker  0.000000500394 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2198  hypothetical protein  36.27 
 
 		 172 aa  75.1  0.0000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00219221  decreased coverage  0.00807275 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1447  protein of unknown function UPF0102  30.08 
 
 		 127 aa  71.6  0.000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2230  protein of unknown function UPF0102  33.59 
 
 		 127 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0169041  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2488  protein of unknown function UPF0102  34.71 
 
 		 123 aa  69.7  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0776001  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2398  hypothetical protein  37.6 
 
 		 118 aa  68.9  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.430013  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1908  hypothetical protein  34.91 
 
 		 173 aa  68.9  0.00000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000102604  hitchhiker  0.00425538 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07400  hypothetical protein  38.4 
 
 		 116 aa  69.3  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1324  protein of unknown function UPF0102  40.19 
 
 		 148 aa  69.3  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1992  hypothetical protein  38.1 
 
 		 129 aa  68.6  0.00000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1959  hypothetical protein  40.65 
 
 		 122 aa  68.2  0.00000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.142549  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2035  hypothetical protein  34.15 
 
 		 122 aa  68.6  0.00000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.848509  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0017  hypothetical protein  36 
 
 		 128 aa  66.2  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000457371  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1677  hypothetical protein  40.65 
 
 		 122 aa  66.6  0.0000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.238653  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1695  hypothetical protein  31.97 
 
 		 120 aa  65.5  0.0000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3919  protein of unknown function UPF0102  33.64 
 
 		 144 aa  65.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000143067  normal  0.216721 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3870  protein of unknown function UPF0102  33.64 
 
 		 144 aa  65.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0546  hypothetical protein  35.04 
 
 		 115 aa  65.5  0.0000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.672576  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1324  hypothetical protein  29.75 
 
 		 124 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.294844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0932  hypothetical protein  30.08 
 
 		 123 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3998  protein of unknown function UPF0102  34.43 
 
 		 139 aa  65.1  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4400  hypothetical protein  29.75 
 
 		 123 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.147019 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4524  hypothetical protein  29.75 
 
 		 123 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1792  hypothetical protein  33.6 
 
 		 160 aa  64.3  0.0000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0016  hypothetical protein  38.28 
 
 		 129 aa  64.3  0.0000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.197298  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0315  protein of unknown function UPF0102  35.29 
 
 		 121 aa  64.3  0.0000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000225244 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0142  conserved hypothetical protein TIGR00252  35.29 
 
 		 121 aa  64.3  0.0000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09830  conserved hypothetical protein TIGR00252  34.15 
 
 		 125 aa  63.5  0.0000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.351272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12912  hypothetical protein  34.58 
 
 		 141 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0199208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3756  hypothetical protein  35.94 
 
 		 127 aa  63.2  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00341379  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10390  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  37.86 
 
 		 167 aa  62  0.000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000139118  unclonable  0.000000000910029 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1186  hypothetical protein  36.27 
 
 		 140 aa  62.4  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00400032  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0420  hypothetical protein  31.4 
 
 		 128 aa  61.6  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0181  hypothetical protein  35.19 
 
 		 136 aa  61.6  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.973166  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0460  protein of unknown function UPF0102  33.87 
 
 		 153 aa  61.2  0.000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0116  hypothetical protein  33.33 
 
 		 118 aa  60.8  0.000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.185512 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2095  protein of unknown function UPF0102  35.19 
 
 		 137 aa  60.8  0.000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5877  protein of unknown function UPF0102  27.2 
 
 		 117 aa  60.5  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.662779 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0037  hypothetical protein  33.6 
 
 		 127 aa  60.5  0.000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2019  protein of unknown function UPF0102  30.58 
 
 		 134 aa  60.5  0.000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.573307  normal  0.167847 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0930  hypothetical protein  36.54 
 
 		 123 aa  60.5  0.000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.930588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0320  hypothetical protein  30.39 
 
 		 135 aa  60.5  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0146  hypothetical protein  32.35 
 
 		 135 aa  60.5  0.000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0017  hypothetical protein  33.6 
 
 		 126 aa  60.5  0.000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00052241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0993  protein of unknown function UPF0102  35.16 
 
 		 129 aa  60.1  0.00000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00109853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0676  hypothetical protein  34.4 
 
 		 167 aa  60.1  0.00000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0552943  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2881  hypothetical protein  28.85 
 
 		 146 aa  58.9  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.696458 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0184  hypothetical protein  28.83 
 
 		 123 aa  58.9  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0756  hypothetical protein  32.35 
 
 		 118 aa  59.3  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.477778  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0057  hypothetical protein  35.43 
 
 		 122 aa  58.9  0.00000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2217  hypothetical protein  33.33 
 
 		 123 aa  59.3  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000089571  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3485  hypothetical protein  36.92 
 
 		 125 aa  58.9  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000340579 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4313  hypothetical protein  28.23 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0400  hypothetical protein  31.4 
 
 		 131 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07020  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  32.5 
 
 		 186 aa  59.3  0.00000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00114408  normal  0.507303 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4036  protein of unknown function UPF0102  35.77 
 
 		 118 aa  58.5  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.261027  normal  0.0798574 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0325  hypothetical protein  28.1 
 
 		 130 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.493012  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1407  protein of unknown function UPF0102  30.48 
 
 		 122 aa  58.2  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.993674  normal  0.0549137 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0733  hypothetical protein  33.33 
 
 		 180 aa  57.8  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.646389 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3311  protein of unknown function UPF0102  29.84 
 
 		 134 aa  57.8  0.00000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3424  hypothetical protein  36.92 
 
 		 125 aa  57.8  0.00000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1291  protein of unknown function UPF0102  34 
 
 		 115 aa  57.4  0.00000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000677509  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5237  protein of unknown function UPF0102  34.62 
 
 		 164 aa  57.4  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1175  protein of unknown function UPF0102  32.41 
 
 		 122 aa  57.4  0.00000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1406  protein of unknown function UPF0102  31.09 
 
 		 114 aa  57.4  0.00000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2103  hypothetical protein  28.1 
 
 		 121 aa  57.4  0.00000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.374615  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0977  hypothetical protein  37.5 
 
 		 119 aa  57.4  0.00000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.320606  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1218  protein of unknown function UPF0102  32.8 
 
 		 119 aa  57  0.00000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.648075  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0666  hypothetical protein  32.69 
 
 		 116 aa  57  0.00000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0397911  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0629  hypothetical protein  32.82 
 
 		 122 aa  57  0.00000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4800  hypothetical protein  38 
 
 		 151 aa  56.6  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0355  hypothetical protein  30.58 
 
 		 124 aa  56.6  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13130  hypothetical protein  31.91 
 
 		 120 aa  57  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2298  hypothetical protein  34.62 
 
 		 123 aa  56.2  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4114  hypothetical protein  27.27 
 
 		 123 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2283  hypothetical protein  28.3 
 
 		 113 aa  55.8  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.567685 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1217  hypothetical protein  30.95 
 
 		 123 aa  55.5  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.266389  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3766  hypothetical protein  30 
 
 		 122 aa  55.5  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.969308  normal  0.0430921 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3463  hypothetical protein  28.35 
 
 		 125 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0405  hypothetical protein  27.42 
 
 		 154 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0650  hypothetical protein  33.33 
 
 		 128 aa  54.7  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0195  hypothetical protein  29.52 
 
 		 119 aa  55.1  0.0000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.227376  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1530  hypothetical protein  33.64 
 
 		 118 aa  54.7  0.0000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0048655  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1093  endonuclease-like  27.59 
 
 		 202 aa  54.3  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0497  hypothetical protein  30.71 
 
 		 142 aa  54.7  0.0000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0259  hypothetical protein  31.68 
 
 		 120 aa  54.7  0.0000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1934  hypothetical protein  31.68 
 
 		 120 aa  54.7  0.0000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.547856  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1156  hypothetical protein  34.15 
 
 		 118 aa  54.3  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0160558  normal  0.0576877 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3135  hypothetical protein  28.35 
 
 		 125 aa  54.7  0.0000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0123  hypothetical protein  27.05 
 
 		 156 aa  53.9  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0675  protein of unknown function UPF0102  29.13 
 
 		 165 aa  54.3  0.0000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0720  hypothetical protein  33.33 
 
 		 126 aa  53.5  0.0000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0341617  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1176  hypothetical protein  32.71 
 
 		 122 aa  53.9  0.0000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.108145 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0758  hypothetical protein  35.92 
 
 		 130 aa  53.9  0.0000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1376  protein of unknown function UPF0102  32.81 
 
 		 119 aa  53.5  0.0000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000032081  normal  0.333882 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0312  hypothetical protein  33.02 
 
 		 142 aa  53.5  0.0000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02085  hypothetical protein  29.03 
 
 		 119 aa  53.5  0.0000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.997348  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0700  protein of unknown function UPF0102  32.54 
 
 		 172 aa  53.5  0.0000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000202877  hitchhiker  0.000000354886 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>