174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0312 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0312  hypothetical protein  100 
 
 		 142 aa  283  5e-76  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1324  protein of unknown function UPF0102  40.74 
 
 		 148 aa  100  7e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5237  protein of unknown function UPF0102  48.96 
 
 		 164 aa  99.8  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3870  protein of unknown function UPF0102  41.73 
 
 		 144 aa  94.4  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3919  protein of unknown function UPF0102  41.73 
 
 		 144 aa  94.4  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000143067  normal  0.216721 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4800  hypothetical protein  34.27 
 
 		 151 aa  83.6  9e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0733  hypothetical protein  42.15 
 
 		 180 aa  83.2  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.646389 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1291  protein of unknown function UPF0102  35.48 
 
 		 115 aa  65.9  0.0000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000677509  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0650  hypothetical protein  41.11 
 
 		 128 aa  63.9  0.0000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1475  endonuclease  42.86 
 
 		 115 aa  62.8  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.733308  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3998  protein of unknown function UPF0102  40.74 
 
 		 139 aa  62  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0676  hypothetical protein  39 
 
 		 167 aa  60.5  0.000000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0552943  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0355  hypothetical protein  39.33 
 
 		 124 aa  60.5  0.000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16141  hypothetical protein  41.77 
 
 		 126 aa  60.1  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.21518 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3065  hypothetical protein  29.7 
 
 		 118 aa  59.3  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0666  hypothetical protein  33.08 
 
 		 116 aa  59.3  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0397911  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2864  hypothetical protein  33.02 
 
 		 122 aa  58.5  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00415914  hitchhiker  0.000000500394 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2202  hypothetical protein  39.45 
 
 		 121 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.474644  normal  0.174288 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1992  hypothetical protein  39.36 
 
 		 129 aa  57.4  0.00000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2217  hypothetical protein  39.62 
 
 		 123 aa  57  0.00000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000089571  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1406  protein of unknown function UPF0102  36.17 
 
 		 114 aa  56.6  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3311  protein of unknown function UPF0102  33.96 
 
 		 134 aa  56.6  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4114  hypothetical protein  33.33 
 
 		 123 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1186  hypothetical protein  40.45 
 
 		 114 aa  56.2  0.0000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0977  hypothetical protein  31.58 
 
 		 119 aa  55.8  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.320606  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1550  hypothetical protein  34.23 
 
 		 132 aa  56.2  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.176091 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0195  hypothetical protein  35.42 
 
 		 119 aa  55.5  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.227376  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2488  protein of unknown function UPF0102  38.71 
 
 		 123 aa  55.1  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0776001  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2298  hypothetical protein  33 
 
 		 123 aa  54.7  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2398  hypothetical protein  32.98 
 
 		 118 aa  54.3  0.0000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.430013  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0992  hypothetical protein  40.2 
 
 		 117 aa  53.9  0.0000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.528214  normal  0.0951104 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57490  hypothetical protein  36.84 
 
 		 125 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2303  hypothetical protein  33.02 
 
 		 130 aa  53.5  0.0000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0306992  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0037  hypothetical protein  32.99 
 
 		 127 aa  53.5  0.0000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0756  hypothetical protein  38.04 
 
 		 118 aa  53.5  0.0000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.477778  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4420  hypothetical protein  32.63 
 
 		 128 aa  52.8  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.149236  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0700  protein of unknown function UPF0102  33.64 
 
 		 172 aa  53.1  0.000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000202877  hitchhiker  0.000000354886 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1284  hypothetical protein  47.46 
 
 		 121 aa  53.5  0.000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1176  hypothetical protein  27.72 
 
 		 122 aa  53.5  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.108145 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3756  hypothetical protein  32.69 
 
 		 127 aa  53.5  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00341379  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07020  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  35.42 
 
 		 186 aa  53.5  0.000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00114408  normal  0.507303 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0017  hypothetical protein  32.67 
 
 		 126 aa  52.4  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00052241  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13130  hypothetical protein  36.08 
 
 		 120 aa  52.4  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4313  hypothetical protein  41.49 
 
 		 140 aa  52.4  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1447  protein of unknown function UPF0102  37.04 
 
 		 127 aa  52.4  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1703  hypothetical protein  27.19 
 
 		 123 aa  52.4  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0145  hypothetical protein  36.59 
 
 		 124 aa  52  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0280805  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1324  hypothetical protein  33.7 
 
 		 124 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.294844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0016  hypothetical protein  33.33 
 
 		 129 aa  50.8  0.000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.197298  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3146  sigma-54 factor  35 
 
 		 118 aa  50.8  0.000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4400  hypothetical protein  33.7 
 
 		 123 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.147019 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2019  protein of unknown function UPF0102  36.21 
 
 		 134 aa  50.4  0.000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.573307  normal  0.167847 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1723  hypothetical protein  36.54 
 
 		 123 aa  50.8  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.471951 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3740  protein of unknown function UPF0102  35.71 
 
 		 121 aa  50.4  0.000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000086697  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4524  hypothetical protein  33.7 
 
 		 123 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4140  hypothetical protein  40 
 
 		 123 aa  50.4  0.000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4996  hypothetical protein  34.74 
 
 		 125 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.608406  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4685  hypothetical protein  37.5 
 
 		 120 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0484178 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1186  hypothetical protein  33.68 
 
 		 140 aa  49.7  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00400032  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3909  hypothetical protein  41.05 
 
 		 141 aa  49.7  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.181431  normal  0.486883 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1695  hypothetical protein  28.28 
 
 		 120 aa  49.3  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3586  hypothetical protein  40 
 
 		 118 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0123  hypothetical protein  39.13 
 
 		 156 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0294  hypothetical protein  24.44 
 
 		 112 aa  48.9  0.00002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10390  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  35.83 
 
 		 167 aa  49.3  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000139118  unclonable  0.000000000910029 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0910  hypothetical protein  35 
 
 		 119 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.21322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3463  hypothetical protein  36.89 
 
 		 125 aa  48.9  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0259  hypothetical protein  29.76 
 
 		 120 aa  49.3  0.00002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1934  hypothetical protein  29.76 
 
 		 120 aa  49.3  0.00002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.547856  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10070  conserved hypothetical protein TIGR00252  40.74 
 
 		 153 aa  48.5  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0294595  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0277  protein of unknown function UPF0102  25.51 
 
 		 120 aa  48.5  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.107261  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3135  hypothetical protein  36.89 
 
 		 125 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2007  hypothetical protein  37.89 
 
 		 124 aa  48.5  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.63182  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0932  hypothetical protein  33.7 
 
 		 123 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0325  hypothetical protein  32 
 
 		 130 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.493012  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3265  hypothetical protein  38.46 
 
 		 127 aa  47.8  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0142  conserved hypothetical protein TIGR00252  35.87 
 
 		 121 aa  47.8  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2283  hypothetical protein  31.58 
 
 		 113 aa  47.8  0.00005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.567685 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3694  hypothetical protein  30.85 
 
 		 114 aa  47.8  0.00005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0315  protein of unknown function UPF0102  35.87 
 
 		 121 aa  47.8  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000225244 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4433  hypothetical protein  28.89 
 
 		 129 aa  47.4  0.00006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.875795  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2201  hypothetical protein  36.96 
 
 		 123 aa  47.4  0.00006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0460  protein of unknown function UPF0102  36.47 
 
 		 153 aa  47.8  0.00006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1413  hypothetical protein  33.33 
 
 		 112 aa  47.4  0.00006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3265  hypothetical protein  38.37 
 
 		 130 aa  47.4  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0146  hypothetical protein  32 
 
 		 135 aa  47.4  0.00007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3586  hypothetical protein  36.96 
 
 		 133 aa  47.4  0.00007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1093  endonuclease-like  35.79 
 
 		 202 aa  47  0.00008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1530  hypothetical protein  23.44 
 
 		 118 aa  47  0.00008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0048655  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07400  hypothetical protein  29.67 
 
 		 116 aa  47.4  0.00008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0320  hypothetical protein  30 
 
 		 135 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1985  hypothetical protein  37.76 
 
 		 135 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0318406  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1959  hypothetical protein  26.13 
 
 		 122 aa  46.6  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.142549  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2031  hypothetical protein  37.76 
 
 		 135 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.474175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1965  hypothetical protein  37.76 
 
 		 135 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.52969 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3424  hypothetical protein  29.59 
 
 		 125 aa  45.8  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1218  protein of unknown function UPF0102  25.42 
 
 		 119 aa  46.2  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.648075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0112  hypothetical protein  30.69 
 
 		 122 aa  45.8  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12912  hypothetical protein  40 
 
 		 141 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0199208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4036  protein of unknown function UPF0102  28.3 
 
 		 118 aa  46.2  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.261027  normal  0.0798574 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>