278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_0145 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_0145  hypothetical protein  100 
 
 
124 aa  247  3e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0280805  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1723  hypothetical protein  46.72 
 
 
123 aa  97.1  7e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.471951 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2007  hypothetical protein  46.28 
 
 
124 aa  94.7  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.63182  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0930  hypothetical protein  48.62 
 
 
123 aa  89.7  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.930588  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0781  hypothetical protein  38.79 
 
 
121 aa  87  7e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1218  protein of unknown function UPF0102  36.36 
 
 
119 aa  87  8e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.648075  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0707  hypothetical protein  39.66 
 
 
121 aa  87  8e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_687  endonuclease  39.66 
 
 
121 aa  85.9  2e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0992  hypothetical protein  41.32 
 
 
117 aa  85.1  3e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.528214  normal  0.0951104 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1550  hypothetical protein  40.94 
 
 
132 aa  85.1  3e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.176091 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1272  protein of unknown function UPF0102  39.62 
 
 
125 aa  84.7  4e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09830  conserved hypothetical protein TIGR00252  39.83 
 
 
125 aa  82.8  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.351272  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07400  hypothetical protein  34.48 
 
 
116 aa  83.2  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1407  protein of unknown function UPF0102  36.13 
 
 
122 aa  82.8  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.993674  normal  0.0549137 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1703  hypothetical protein  34.17 
 
 
123 aa  82.8  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1175  protein of unknown function UPF0102  45.63 
 
 
122 aa  81.6  0.000000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3740  protein of unknown function UPF0102  40.57 
 
 
121 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000086697  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1475  endonuclease  33.63 
 
 
115 aa  81.6  0.000000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.733308  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23670  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  35.83 
 
 
127 aa  80.9  0.000000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.183487  normal  0.0867152 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0977  hypothetical protein  34.95 
 
 
119 aa  79.7  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.320606  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4140  hypothetical protein  36.59 
 
 
123 aa  79.7  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2202  hypothetical protein  37.4 
 
 
121 aa  79.7  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.474644  normal  0.174288 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2035  hypothetical protein  36.94 
 
 
122 aa  77.4  0.00000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.848509  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0355  hypothetical protein  43.69 
 
 
124 aa  76.3  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1836  hypothetical protein  38.26 
 
 
117 aa  76.6  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0316841 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2474  hypothetical protein  37.07 
 
 
118 aa  76.6  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0253334  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0016  hypothetical protein  40.57 
 
 
129 aa  75.5  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.197298  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12912  hypothetical protein  37.9 
 
 
141 aa  75.5  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0199208  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10070  conserved hypothetical protein TIGR00252  39.66 
 
 
153 aa  75.1  0.0000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0294595  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1406  protein of unknown function UPF0102  35.65 
 
 
173 aa  74.7  0.0000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000418677  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0666  hypothetical protein  38.32 
 
 
116 aa  74.7  0.0000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0397911  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0231  protein of unknown function UPF0102  33.88 
 
 
121 aa  74.3  0.0000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.819406  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0112  hypothetical protein  41.84 
 
 
122 aa  74.3  0.0000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0650  hypothetical protein  38.46 
 
 
128 aa  73.6  0.0000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1176  hypothetical protein  39.05 
 
 
122 aa  73.6  0.0000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.108145 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5877  protein of unknown function UPF0102  34.23 
 
 
117 aa  73.6  0.0000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.662779 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4420  hypothetical protein  40.37 
 
 
128 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.149236  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3709  protein of unknown function UPF0102  36.28 
 
 
119 aa  72.8  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07020  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  37.21 
 
 
186 aa  73.2  0.000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00114408  normal  0.507303 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2864  hypothetical protein  34.17 
 
 
122 aa  72  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00415914  hitchhiker  0.000000500394 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1985  hypothetical protein  35.54 
 
 
135 aa  72  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0318406  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13130  hypothetical protein  42.86 
 
 
120 aa  72  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2031  hypothetical protein  35.54 
 
 
135 aa  72  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.474175  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1478  protein of unknown function UPF0102  42.35 
 
 
118 aa  71.6  0.000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.10043  normal  0.036198 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0460  protein of unknown function UPF0102  39.81 
 
 
153 aa  71.6  0.000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4114  hypothetical protein  39.09 
 
 
123 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0277  protein of unknown function UPF0102  35.92 
 
 
120 aa  71.2  0.000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.107261  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3694  hypothetical protein  39 
 
 
114 aa  71.2  0.000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0037  hypothetical protein  36.8 
 
 
127 aa  71.6  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3413  protein of unknown function UPF0102  36.51 
 
 
124 aa  70.9  0.000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0017  hypothetical protein  38.38 
 
 
126 aa  70.9  0.000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00052241  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09240  Holliday junction resolvase-like endonuclease  39.62 
 
 
139 aa  70.9  0.000000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0928499  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0720  hypothetical protein  29.6 
 
 
126 aa  70.5  0.000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0341617  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1447  protein of unknown function UPF0102  35.71 
 
 
127 aa  70.5  0.000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2217  hypothetical protein  35 
 
 
123 aa  70.5  0.000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000089571  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0669  hypothetical protein  37.5 
 
 
124 aa  69.7  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1406  protein of unknown function UPF0102  37.76 
 
 
114 aa  69.7  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1992  hypothetical protein  38.61 
 
 
129 aa  70.1  0.00000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2213  hypothetical protein  37.07 
 
 
132 aa  69.7  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000124547 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0017  hypothetical protein  34.71 
 
 
128 aa  69.7  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000457371  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1530  hypothetical protein  28.3 
 
 
118 aa  68.9  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0048655  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1965  hypothetical protein  33.88 
 
 
135 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.52969 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3311  protein of unknown function UPF0102  33.63 
 
 
134 aa  68.9  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57490  hypothetical protein  37.72 
 
 
125 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10390  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  38.46 
 
 
167 aa  68.9  0.00000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000139118  unclonable  0.000000000910029 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3756  hypothetical protein  33.9 
 
 
127 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00341379  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2095  protein of unknown function UPF0102  33.04 
 
 
137 aa  68.6  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3586  hypothetical protein  46.97 
 
 
118 aa  68.6  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0756  hypothetical protein  39.8 
 
 
118 aa  68.6  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.477778  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03356  Sigma-54 factor  41.75 
 
 
113 aa  68.2  0.00000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1156  hypothetical protein  36.04 
 
 
118 aa  68.2  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0160558  normal  0.0576877 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0676  hypothetical protein  32.17 
 
 
167 aa  68.2  0.00000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0552943  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4996  hypothetical protein  37.72 
 
 
125 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.608406  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3248  hypothetical protein  36.44 
 
 
124 aa  67.8  0.00000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.852323  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3065  hypothetical protein  38.96 
 
 
118 aa  67.4  0.00000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2398  hypothetical protein  36.59 
 
 
118 aa  67  0.00000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.430013  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1228  hypothetical protein  33.88 
 
 
119 aa  67  0.00000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.74821  normal  0.260342 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3998  protein of unknown function UPF0102  36.84 
 
 
139 aa  67  0.00000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0910  hypothetical protein  39.6 
 
 
119 aa  67  0.00000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.21322  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3123  protein of unknown function UPF0102  37.93 
 
 
121 aa  66.2  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0308676  normal  0.107591 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4685  hypothetical protein  38.39 
 
 
120 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0484178 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1959  hypothetical protein  28.81 
 
 
122 aa  66.6  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.142549  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0184  hypothetical protein  35.96 
 
 
123 aa  66.2  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4433  hypothetical protein  33.03 
 
 
129 aa  65.9  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.875795  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0639  conserved hypothetical protein TIGR00252  36.11 
 
 
182 aa  66.2  0.0000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.372666 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0993  protein of unknown function UPF0102  43.18 
 
 
129 aa  65.9  0.0000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00109853  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2298  hypothetical protein  37.21 
 
 
123 aa  65.1  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1695  hypothetical protein  33.64 
 
 
120 aa  65.1  0.0000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2213  protein of unknown function UPF0102  40.62 
 
 
118 aa  65.1  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.19652 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2395  hypothetical protein  37.37 
 
 
127 aa  64.7  0.0000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.615386  normal  0.0739869 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1677  hypothetical protein  29.66 
 
 
122 aa  64.7  0.0000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.238653  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0546  hypothetical protein  30.1 
 
 
115 aa  64.7  0.0000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.672576  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0700  protein of unknown function UPF0102  35.92 
 
 
172 aa  63.9  0.0000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000202877  hitchhiker  0.000000354886 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1320  hypothetical protein  32.5 
 
 
121 aa  63.9  0.0000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1969  hypothetical protein  35.71 
 
 
133 aa  63.5  0.0000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00399816  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4524  hypothetical protein  36.7 
 
 
123 aa  63.5  0.0000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11140  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  38.94 
 
 
120 aa  63.5  0.0000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0330886  normal  0.323386 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2054  hypothetical protein  35.71 
 
 
133 aa  63.5  0.0000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.595954  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2532  protein of unknown function UPF0102  35.29 
 
 
118 aa  63.5  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.388001 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2488  protein of unknown function UPF0102  36.27 
 
 
123 aa  63.5  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0776001  normal  0.272437 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>