282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0231 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_0231  protein of unknown function UPF0102  100 
 
 		 121 aa  236  1e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.819406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0669  hypothetical protein  55 
 
 		 124 aa  111  3e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2474  hypothetical protein  54.05 
 
 		 118 aa  102  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0253334  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2213  hypothetical protein  52.59 
 
 		 132 aa  102  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000124547 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09830  conserved hypothetical protein TIGR00252  50.47 
 
 		 125 aa  97.4  5e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.351272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3998  protein of unknown function UPF0102  52.73 
 
 		 139 aa  95.9  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3413  protein of unknown function UPF0102  50 
 
 		 124 aa  94.7  4e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0992  hypothetical protein  46.85 
 
 		 117 aa  94  6e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.528214  normal  0.0951104 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1550  hypothetical protein  55.17 
 
 		 132 aa  91.7  3e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.176091 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1836  hypothetical protein  45.05 
 
 		 117 aa  90.1  8e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0316841 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0993  protein of unknown function UPF0102  48.57 
 
 		 129 aa  90.1  9e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00109853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3311  protein of unknown function UPF0102  45.71 
 
 		 134 aa  89.7  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0930  hypothetical protein  43.12 
 
 		 123 aa  88.2  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.930588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3248  hypothetical protein  47.01 
 
 		 124 aa  87.8  4e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.852323  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2202  hypothetical protein  45.83 
 
 		 121 aa  87.8  5e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.474644  normal  0.174288 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1175  protein of unknown function UPF0102  53.09 
 
 		 122 aa  86.3  1e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1792  hypothetical protein  43.52 
 
 		 160 aa  85.5  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2095  protein of unknown function UPF0102  44.66 
 
 		 137 aa  85.1  3e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23670  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  51.38 
 
 		 127 aa  85.1  3e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.183487  normal  0.0867152 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1291  protein of unknown function UPF0102  33.96 
 
 		 115 aa  84.3  5e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000677509  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0707  hypothetical protein  39.6 
 
 		 121 aa  84  6e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0650  hypothetical protein  43.69 
 
 		 128 aa  84  7e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2864  hypothetical protein  38.18 
 
 		 122 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00415914  hitchhiker  0.000000500394 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5917  protein of unknown function UPF0102  45.05 
 
 		 117 aa  82.4  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00245822  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1530  hypothetical protein  32.67 
 
 		 118 aa  81.6  0.000000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0048655  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1407  protein of unknown function UPF0102  47.79 
 
 		 122 aa  81.3  0.000000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.993674  normal  0.0549137 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1478  protein of unknown function UPF0102  52.38 
 
 		 118 aa  81.6  0.000000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.10043  normal  0.036198 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07400  hypothetical protein  34.26 
 
 		 116 aa  80.9  0.000000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1228  hypothetical protein  43.75 
 
 		 119 aa  80.5  0.000000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.74821  normal  0.260342 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2532  protein of unknown function UPF0102  48.25 
 
 		 118 aa  80.5  0.000000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.388001 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1406  protein of unknown function UPF0102  44.86 
 
 		 173 aa  80.5  0.000000000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000418677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2217  hypothetical protein  41.28 
 
 		 123 aa  79.7  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000089571  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1272  protein of unknown function UPF0102  42.48 
 
 		 125 aa  80.1  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4140  hypothetical protein  44.95 
 
 		 123 aa  79.7  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3485  hypothetical protein  39.8 
 
 		 125 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000340579 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10070  conserved hypothetical protein TIGR00252  48.42 
 
 		 153 aa  79  0.00000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0294595  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0781  hypothetical protein  37.62 
 
 		 121 aa  78.6  0.00000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2398  hypothetical protein  42 
 
 		 118 aa  78.2  0.00000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.430013  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1447  protein of unknown function UPF0102  40 
 
 		 127 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3424  hypothetical protein  38.78 
 
 		 125 aa  78.2  0.00000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11140  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  50.44 
 
 		 120 aa  78.2  0.00000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0330886  normal  0.323386 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2193  hypothetical protein  53.66 
 
 		 207 aa  78.2  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1725  normal  0.994481 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0037  hypothetical protein  37.11 
 
 		 127 aa  77.8  0.00000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1093  endonuclease-like  46.15 
 
 		 202 aa  77  0.00000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1156  hypothetical protein  45.45 
 
 		 118 aa  76.6  0.00000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0160558  normal  0.0576877 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0676  hypothetical protein  40.54 
 
 		 167 aa  76.6  0.0000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0552943  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0017  hypothetical protein  38.1 
 
 		 126 aa  76.3  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00052241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3123  protein of unknown function UPF0102  50.96 
 
 		 121 aa  76.6  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0308676  normal  0.107591 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0112  hypothetical protein  33.96 
 
 		 122 aa  75.5  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_687  endonuclease  36.63 
 
 		 121 aa  75.9  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1723  hypothetical protein  44.74 
 
 		 123 aa  75.9  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.471951 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0666  hypothetical protein  47.5 
 
 		 116 aa  75.5  0.0000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0397911  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1320  hypothetical protein  42.86 
 
 		 121 aa  75.1  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07020  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  38.39 
 
 		 186 aa  75.1  0.0000000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00114408  normal  0.507303 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1186  hypothetical protein  39.29 
 
 		 140 aa  74.7  0.0000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00400032  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2019  protein of unknown function UPF0102  42.11 
 
 		 134 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.573307  normal  0.167847 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0145  hypothetical protein  33.88 
 
 		 124 aa  74.3  0.0000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0280805  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0017  hypothetical protein  38.95 
 
 		 128 aa  73.9  0.0000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000457371  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0016  hypothetical protein  39.18 
 
 		 129 aa  73.9  0.0000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.197298  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5877  protein of unknown function UPF0102  34.86 
 
 		 117 aa  73.9  0.0000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.662779 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3756  hypothetical protein  36.73 
 
 		 127 aa  73.9  0.0000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00341379  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2881  hypothetical protein  41.51 
 
 		 146 aa  73.2  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.696458 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3740  protein of unknown function UPF0102  38.24 
 
 		 121 aa  72.4  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000086697  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1965  hypothetical protein  48.31 
 
 		 135 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.52969 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1985  hypothetical protein  48.31 
 
 		 135 aa  72  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0318406  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1959  hypothetical protein  31.25 
 
 		 122 aa  72.8  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.142549  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2031  hypothetical protein  48.31 
 
 		 135 aa  72  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.474175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2007  hypothetical protein  47.06 
 
 		 124 aa  71.2  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.63182  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0639  conserved hypothetical protein TIGR00252  38.89 
 
 		 182 aa  70.9  0.000000000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.372666 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1992  hypothetical protein  41.56 
 
 		 129 aa  69.7  0.00000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1677  hypothetical protein  31.25 
 
 		 122 aa  70.1  0.00000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.238653  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10390  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  38.18 
 
 		 167 aa  70.1  0.00000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000139118  unclonable  0.000000000910029 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2298  hypothetical protein  44 
 
 		 123 aa  70.1  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1475  endonuclease  34.86 
 
 		 115 aa  69.7  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.733308  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0277  protein of unknown function UPF0102  31.07 
 
 		 120 aa  69.3  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.107261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1521  protein of unknown function UPF0102  48.28 
 
 		 157 aa  68.9  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0637187  normal  0.0119716 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3004  hypothetical protein  44.44 
 
 		 95 aa  68.9  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.350262  normal  0.587814 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3046  hypothetical protein  44.44 
 
 		 95 aa  68.9  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.339629  normal  0.794955 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2148  hypothetical protein  39.64 
 
 		 134 aa  68.2  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1217  hypothetical protein  39.24 
 
 		 123 aa  67.8  0.00000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.266389  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0701  hypothetical protein  28.3 
 
 		 122 aa  67.4  0.00000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1703  hypothetical protein  35 
 
 		 123 aa  67  0.00000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2230  protein of unknown function UPF0102  35.58 
 
 		 127 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0169041  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1406  protein of unknown function UPF0102  39.24 
 
 		 114 aa  66.6  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0977  hypothetical protein  33.33 
 
 		 119 aa  66.6  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.320606  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1218  protein of unknown function UPF0102  34 
 
 		 119 aa  65.5  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.648075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3694  hypothetical protein  33.98 
 
 		 114 aa  66.2  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12912  hypothetical protein  40.62 
 
 		 141 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0199208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00890  hypothetical protein  31.73 
 
 		 122 aa  65.1  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3586  hypothetical protein  41.59 
 
 		 118 aa  65.1  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0503  hypothetical protein  43.56 
 
 		 120 aa  64.7  0.0000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.451178 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1894  hypothetical protein  52.31 
 
 		 113 aa  64.7  0.0000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.642217 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09240  Holliday junction resolvase-like endonuclease  44.44 
 
 		 139 aa  64.7  0.0000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0928499  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0758  hypothetical protein  32.35 
 
 		 130 aa  64.7  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3355  hypothetical protein  42.55 
 
 		 108 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3298  hypothetical protein  37.76 
 
 		 124 aa  63.9  0.0000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.861672  normal  0.570212 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3065  hypothetical protein  28.42 
 
 		 118 aa  63.9  0.0000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0720  hypothetical protein  33.66 
 
 		 126 aa  62.8  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0341617  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0272  hypothetical protein  34.38 
 
 		 108 aa  63.5  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000600044  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2488  protein of unknown function UPF0102  41.94 
 
 		 123 aa  63.2  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0776001  normal  0.272437 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>