282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2881 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_2881  hypothetical protein  100 
 
 		 146 aa  294  2e-79  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.696458 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2148  hypothetical protein  64.06 
 
 		 134 aa  144  3e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1792  hypothetical protein  50.7 
 
 		 160 aa  144  5e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1093  endonuclease-like  60 
 
 		 202 aa  124  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3311  protein of unknown function UPF0102  42.86 
 
 		 134 aa  117  7e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2019  protein of unknown function UPF0102  46.03 
 
 		 134 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.573307  normal  0.167847 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1447  protein of unknown function UPF0102  46.22 
 
 		 127 aa  99.4  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0017  hypothetical protein  40.17 
 
 		 126 aa  95.1  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00052241  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0017  hypothetical protein  39.32 
 
 		 128 aa  92  2e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000457371  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2230  protein of unknown function UPF0102  41.18 
 
 		 127 aa  89.4  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0169041  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0016  hypothetical protein  37.29 
 
 		 129 aa  88.6  3e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.197298  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1186  hypothetical protein  38.93 
 
 		 140 aa  87  7e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00400032  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1406  protein of unknown function UPF0102  39.06 
 
 		 173 aa  86.3  1e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000418677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2864  hypothetical protein  37.93 
 
 		 122 aa  85.5  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00415914  hitchhiker  0.000000500394 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2007  hypothetical protein  43.48 
 
 		 124 aa  84  6e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.63182  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3998  protein of unknown function UPF0102  46.02 
 
 		 139 aa  82  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0037  hypothetical protein  33.33 
 
 		 127 aa  80.1  0.000000000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4420  hypothetical protein  40.17 
 
 		 128 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.149236  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0701  hypothetical protein  30.63 
 
 		 122 aa  79.7  0.00000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2217  hypothetical protein  40.35 
 
 		 123 aa  79.3  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000089571  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3709  protein of unknown function UPF0102  36.28 
 
 		 119 aa  78.6  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1475  endonuclease  37.93 
 
 		 115 aa  77.4  0.00000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.733308  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1992  hypothetical protein  34.06 
 
 		 129 aa  76.6  0.0000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0277  protein of unknown function UPF0102  33.04 
 
 		 120 aa  76.6  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.107261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1959  hypothetical protein  31.03 
 
 		 122 aa  76.6  0.0000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.142549  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2398  hypothetical protein  37.5 
 
 		 118 aa  75.5  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.430013  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0675  protein of unknown function UPF0102  40 
 
 		 165 aa  75.9  0.0000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2095  protein of unknown function UPF0102  40.17 
 
 		 137 aa  75.1  0.0000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1677  hypothetical protein  30.17 
 
 		 122 aa  75.1  0.0000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.238653  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0650  hypothetical protein  36.8 
 
 		 128 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5877  protein of unknown function UPF0102  32.73 
 
 		 117 aa  74.7  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.662779 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1934  hypothetical protein  36.36 
 
 		 120 aa  74.7  0.0000000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.547856  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2025  hypothetical protein  32.43 
 
 		 119 aa  74.7  0.0000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0259  hypothetical protein  36.36 
 
 		 120 aa  74.7  0.0000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1530  hypothetical protein  32.2 
 
 		 118 aa  74.7  0.0000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0048655  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10390  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  39.82 
 
 		 167 aa  74.3  0.0000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000139118  unclonable  0.000000000910029 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0503  hypothetical protein  44.92 
 
 		 120 aa  73.9  0.0000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.451178 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0932  hypothetical protein  39.81 
 
 		 123 aa  73.9  0.0000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1874  hypothetical protein  40.35 
 
 		 135 aa  73.6  0.0000000000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0910  hypothetical protein  41.59 
 
 		 119 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.21322  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0231  protein of unknown function UPF0102  41.51 
 
 		 121 aa  73.2  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.819406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3756  hypothetical protein  36.75 
 
 		 127 aa  72  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00341379  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0629  hypothetical protein  37.93 
 
 		 122 aa  71.6  0.000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0720  hypothetical protein  37.5 
 
 		 126 aa  71.6  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0341617  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2464  hypothetical protein  36.36 
 
 		 123 aa  71.6  0.000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.164658  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1703  hypothetical protein  31.93 
 
 		 123 aa  71.6  0.000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1291  protein of unknown function UPF0102  33.62 
 
 		 115 aa  71.2  0.000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000677509  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1910  hypothetical protein  39.82 
 
 		 134 aa  70.9  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.179028  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3485  hypothetical protein  34.45 
 
 		 125 aa  71.2  0.000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000340579 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1218  protein of unknown function UPF0102  34.51 
 
 		 119 aa  71.2  0.000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.648075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07020  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  34.51 
 
 		 186 aa  70.5  0.000000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00114408  normal  0.507303 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0460  protein of unknown function UPF0102  33.06 
 
 		 153 aa  70.9  0.000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07400  hypothetical protein  34.21 
 
 		 116 aa  70.5  0.000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09830  conserved hypothetical protein TIGR00252  41.84 
 
 		 125 aa  70.5  0.000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.351272  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02085  hypothetical protein  34.82 
 
 		 119 aa  69.7  0.00000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.997348  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3123  protein of unknown function UPF0102  46.09 
 
 		 121 aa  69.7  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0308676  normal  0.107591 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2054  hypothetical protein  37.5 
 
 		 133 aa  69.7  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.595954  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1969  hypothetical protein  37.5 
 
 		 133 aa  69.7  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00399816  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2035  hypothetical protein  33.62 
 
 		 122 aa  69.7  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.848509  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3424  hypothetical protein  33.61 
 
 		 125 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1217  hypothetical protein  31.58 
 
 		 123 aa  68.9  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.266389  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2298  hypothetical protein  37.84 
 
 		 123 aa  68.6  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1723  hypothetical protein  38.79 
 
 		 123 aa  68.9  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.471951 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3053  protein of unknown function UPF0102  35.11 
 
 		 111 aa  69.3  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1478  protein of unknown function UPF0102  49.4 
 
 		 118 aa  68.6  0.00000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.10043  normal  0.036198 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1350  protein of unknown function UPF0102  45.92 
 
 		 118 aa  68.6  0.00000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0299  hypothetical protein  38.95 
 
 		 108 aa  67.8  0.00000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2474  hypothetical protein  43.56 
 
 		 118 aa  67.8  0.00000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0253334  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3881  hypothetical protein  40 
 
 		 108 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.114446 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1272  protein of unknown function UPF0102  35.29 
 
 		 125 aa  67.8  0.00000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4400  hypothetical protein  40 
 
 		 123 aa  67  0.00000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.147019 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3135  hypothetical protein  42.5 
 
 		 125 aa  67  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0546  hypothetical protein  33.04 
 
 		 115 aa  67  0.00000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.672576  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4524  hypothetical protein  40 
 
 		 123 aa  67  0.00000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13130  hypothetical protein  38.6 
 
 		 120 aa  67  0.00000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0630  hypothetical protein  43.22 
 
 		 135 aa  67  0.00000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1324  hypothetical protein  40 
 
 		 124 aa  66.6  0.00000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.294844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1406  protein of unknown function UPF0102  36.11 
 
 		 114 aa  67  0.00000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23670  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  40.16 
 
 		 127 aa  66.2  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.183487  normal  0.0867152 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2532  protein of unknown function UPF0102  48.45 
 
 		 118 aa  66.6  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.388001 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2198  hypothetical protein  34.17 
 
 		 172 aa  66.6  0.0000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00219221  decreased coverage  0.00807275 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3463  hypothetical protein  42.5 
 
 		 125 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0016  hypothetical protein  38.46 
 
 		 127 aa  65.5  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.204452  unclonable  0.000000883308 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3685  hypothetical protein  37.89 
 
 		 108 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0260  hypothetical protein  38.95 
 
 		 108 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1550  hypothetical protein  38.93 
 
 		 132 aa  65.9  0.0000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.176091 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3355  hypothetical protein  41.24 
 
 		 108 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0666  hypothetical protein  37.17 
 
 		 116 aa  65.5  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0397911  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10070  conserved hypothetical protein TIGR00252  40 
 
 		 153 aa  65.5  0.0000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0294595  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4114  hypothetical protein  37.17 
 
 		 123 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0351  hypothetical protein  37.23 
 
 		 117 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0502533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3909  hypothetical protein  42.98 
 
 		 141 aa  65.1  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.181431  normal  0.486883 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0355  hypothetical protein  35.71 
 
 		 124 aa  64.7  0.0000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4685  hypothetical protein  37.5 
 
 		 120 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0484178 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0669  hypothetical protein  42.71 
 
 		 124 aa  64.3  0.0000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0930  hypothetical protein  39.09 
 
 		 123 aa  63.9  0.0000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.930588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0993  protein of unknown function UPF0102  38.46 
 
 		 129 aa  63.9  0.0000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00109853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3248  hypothetical protein  38.68 
 
 		 124 aa  63.9  0.0000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.852323  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3766  hypothetical protein  40.78 
 
 		 122 aa  63.9  0.0000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.969308  normal  0.0430921 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3740  protein of unknown function UPF0102  37.11 
 
 		 121 aa  63.9  0.0000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000086697  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>