290 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_10070 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_10070  conserved hypothetical protein TIGR00252  100 
 
 		 153 aa  304  4.0000000000000004e-82  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0294595  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1175  protein of unknown function UPF0102  51.72 
 
 		 122 aa  97.4  6e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1992  hypothetical protein  45.76 
 
 		 129 aa  96.7  1e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0676  hypothetical protein  47.62 
 
 		 167 aa  95.9  2e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0552943  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07400  hypothetical protein  38.6 
 
 		 116 aa  95.5  3e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23670  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  50 
 
 		 127 aa  94.7  4e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.183487  normal  0.0867152 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3413  protein of unknown function UPF0102  45.16 
 
 		 124 aa  94  7e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0037  hypothetical protein  45.26 
 
 		 127 aa  93.2  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0992  hypothetical protein  48.67 
 
 		 117 aa  93.2  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.528214  normal  0.0951104 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2213  hypothetical protein  48.21 
 
 		 132 aa  92.4  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000124547 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1965  hypothetical protein  47.9 
 
 		 135 aa  92  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.52969 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1985  hypothetical protein  47.9 
 
 		 135 aa  92.4  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0318406  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2031  hypothetical protein  47.9 
 
 		 135 aa  92.4  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.474175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0017  hypothetical protein  44.25 
 
 		 126 aa  91.7  4e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00052241  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2474  hypothetical protein  49.11 
 
 		 118 aa  91.3  5e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0253334  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09830  conserved hypothetical protein TIGR00252  50.52 
 
 		 125 aa  90.5  7e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.351272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12912  hypothetical protein  49.52 
 
 		 141 aa  90.1  1e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0199208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0016  hypothetical protein  43.36 
 
 		 129 aa  89.7  1e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.197298  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3248  hypothetical protein  44.14 
 
 		 124 aa  90.1  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.852323  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3998  protein of unknown function UPF0102  45.6 
 
 		 139 aa  89  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0666  hypothetical protein  47.37 
 
 		 116 aa  89.4  2e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0397911  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1475  endonuclease  45.95 
 
 		 115 aa  89  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.733308  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1550  hypothetical protein  50.89 
 
 		 132 aa  88.6  3e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.176091 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0650  hypothetical protein  49.47 
 
 		 128 aa  88.2  4e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1186  hypothetical protein  42.86 
 
 		 140 aa  88.2  4e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00400032  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1407  protein of unknown function UPF0102  46.49 
 
 		 122 aa  88.2  4e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.993674  normal  0.0549137 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3756  hypothetical protein  43.12 
 
 		 127 aa  87.8  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00341379  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1156  hypothetical protein  45.95 
 
 		 118 aa  87.8  5e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0160558  normal  0.0576877 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3485  hypothetical protein  44.44 
 
 		 125 aa  87.4  6e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000340579 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3424  hypothetical protein  44.44 
 
 		 125 aa  87  8e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1228  hypothetical protein  46.79 
 
 		 119 aa  87  9e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.74821  normal  0.260342 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0993  protein of unknown function UPF0102  43.9 
 
 		 129 aa  86.3  1e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00109853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2095  protein of unknown function UPF0102  44.55 
 
 		 137 aa  86.3  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1478  protein of unknown function UPF0102  57.5 
 
 		 118 aa  85.9  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.10043  normal  0.036198 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4140  hypothetical protein  44.63 
 
 		 123 aa  85.5  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2202  hypothetical protein  42.98 
 
 		 121 aa  85.9  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.474644  normal  0.174288 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1217  hypothetical protein  41.07 
 
 		 123 aa  85.1  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.266389  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10390  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  40.87 
 
 		 167 aa  84.7  4e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000139118  unclonable  0.000000000910029 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0460  protein of unknown function UPF0102  43.88 
 
 		 153 aa  84.3  5e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1836  hypothetical protein  46.02 
 
 		 117 aa  84.3  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0316841 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3311  protein of unknown function UPF0102  43.64 
 
 		 134 aa  84  6e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2217  hypothetical protein  47.22 
 
 		 123 aa  84  7e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000089571  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1218  protein of unknown function UPF0102  42.2 
 
 		 119 aa  84  8e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.648075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1447  protein of unknown function UPF0102  40.83 
 
 		 127 aa  82.8  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0756  hypothetical protein  46.08 
 
 		 118 aa  83.2  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.477778  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1530  hypothetical protein  33 
 
 		 118 aa  82  0.000000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0048655  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3709  protein of unknown function UPF0102  38.18 
 
 		 119 aa  82.4  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1272  protein of unknown function UPF0102  41 
 
 		 125 aa  81.6  0.000000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2230  protein of unknown function UPF0102  43.12 
 
 		 127 aa  81.3  0.000000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0169041  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0017  hypothetical protein  40.98 
 
 		 128 aa  80.9  0.000000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000457371  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1641  protein of unknown function UPF0102  38.46 
 
 		 122 aa  80.5  0.000000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0797113  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2864  hypothetical protein  43.36 
 
 		 122 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00415914  hitchhiker  0.000000500394 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2035  hypothetical protein  38.39 
 
 		 122 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.848509  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1406  protein of unknown function UPF0102  38.35 
 
 		 173 aa  79.3  0.00000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000418677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1521  protein of unknown function UPF0102  40.15 
 
 		 157 aa  79  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0637187  normal  0.0119716 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0707  hypothetical protein  41.67 
 
 		 121 aa  78.6  0.00000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2398  hypothetical protein  45.26 
 
 		 118 aa  78.6  0.00000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.430013  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2298  hypothetical protein  44.33 
 
 		 123 aa  78.2  0.00000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1406  protein of unknown function UPF0102  40.43 
 
 		 114 aa  78.2  0.00000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2532  protein of unknown function UPF0102  52.68 
 
 		 118 aa  78.2  0.00000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.388001 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0639  conserved hypothetical protein TIGR00252  34.68 
 
 		 182 aa  77.4  0.00000000000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.372666 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0465  hypothetical protein  38 
 
 		 113 aa  77.4  0.00000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0977  hypothetical protein  39.81 
 
 		 119 aa  77.4  0.00000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.320606  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0701  hypothetical protein  35.45 
 
 		 122 aa  77.4  0.00000000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0231  protein of unknown function UPF0102  48.42 
 
 		 121 aa  77  0.00000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.819406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1093  endonuclease-like  45.74 
 
 		 202 aa  77  0.00000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1959  hypothetical protein  33.33 
 
 		 122 aa  77  0.00000000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.142549  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0781  hypothetical protein  40.43 
 
 		 121 aa  75.5  0.0000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_687  endonuclease  42.55 
 
 		 121 aa  75.9  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4036  protein of unknown function UPF0102  37.61 
 
 		 118 aa  74.7  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.261027  normal  0.0798574 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0145  hypothetical protein  37.93 
 
 		 124 aa  75.1  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0280805  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1677  hypothetical protein  32.38 
 
 		 122 aa  74.7  0.0000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.238653  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07020  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  41.41 
 
 		 186 aa  74.3  0.0000000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00114408  normal  0.507303 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1703  hypothetical protein  36.52 
 
 		 123 aa  73.6  0.0000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3740  protein of unknown function UPF0102  38.38 
 
 		 121 aa  73.2  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000086697  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2193  hypothetical protein  44.58 
 
 		 207 aa  73.6  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1725  normal  0.994481 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2488  protein of unknown function UPF0102  41.96 
 
 		 123 aa  72.8  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0776001  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0503  hypothetical protein  40.19 
 
 		 120 aa  72.4  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.451178 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1376  protein of unknown function UPF0102  34.78 
 
 		 119 aa  72.8  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000032081  normal  0.333882 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4433  hypothetical protein  36.04 
 
 		 129 aa  71.6  0.000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.875795  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5917  protein of unknown function UPF0102  38.46 
 
 		 117 aa  72  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00245822  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1792  hypothetical protein  39.39 
 
 		 160 aa  72  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2655  hypothetical protein  36.84 
 
 		 123 aa  71.6  0.000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4252  hypothetical protein  38 
 
 		 117 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000137469 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2881  hypothetical protein  38.71 
 
 		 146 aa  70.9  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.696458 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0277  protein of unknown function UPF0102  32.74 
 
 		 120 aa  70.9  0.000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.107261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0629  hypothetical protein  39.13 
 
 		 122 aa  70.5  0.000000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0720  hypothetical protein  38.24 
 
 		 126 aa  70.5  0.000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0341617  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0546  hypothetical protein  31.3 
 
 		 115 aa  70.5  0.000000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.672576  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3123  protein of unknown function UPF0102  47.79 
 
 		 121 aa  70.5  0.000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0308676  normal  0.107591 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0669  hypothetical protein  39.29 
 
 		 124 aa  70.1  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13130  hypothetical protein  38.83 
 
 		 120 aa  69.7  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0758  hypothetical protein  38.61 
 
 		 130 aa  70.1  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0700  protein of unknown function UPF0102  36.89 
 
 		 172 aa  69.7  0.00000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000202877  hitchhiker  0.000000354886 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3586  hypothetical protein  45.37 
 
 		 118 aa  69.3  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1723  hypothetical protein  38.39 
 
 		 123 aa  69.3  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.471951 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0016  hypothetical protein  46.94 
 
 		 127 aa  68.9  0.00000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.204452  unclonable  0.000000883308 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5877  protein of unknown function UPF0102  35.42 
 
 		 117 aa  68.6  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.662779 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2019  protein of unknown function UPF0102  40.37 
 
 		 134 aa  68.6  0.00000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.573307  normal  0.167847 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0259  hypothetical protein  37.62 
 
 		 120 aa  68.6  0.00000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>