283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0277 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_0277  protein of unknown function UPF0102  100 
 
 
120 aa  249  6e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.107261  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2025  hypothetical protein  47.9 
 
 
119 aa  107  6e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1217  hypothetical protein  48.36 
 
 
123 aa  106  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.266389  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02085  hypothetical protein  46.61 
 
 
119 aa  100  8e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.997348  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4036  protein of unknown function UPF0102  44.07 
 
 
118 aa  99.4  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.261027  normal  0.0798574 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1447  protein of unknown function UPF0102  42.5 
 
 
127 aa  97.4  6e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5877  protein of unknown function UPF0102  43.59 
 
 
117 aa  96.7  9e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.662779 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0650  hypothetical protein  43.97 
 
 
128 aa  96.7  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3709  protein of unknown function UPF0102  41.88 
 
 
119 aa  95.1  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1186  hypothetical protein  43.1 
 
 
140 aa  94.7  4e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00400032  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0037  hypothetical protein  41.03 
 
 
127 aa  94.4  5e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2864  hypothetical protein  41.18 
 
 
122 aa  92.8  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00415914  hitchhiker  0.000000500394 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0017  hypothetical protein  44.92 
 
 
128 aa  92.4  2e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000457371  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3998  protein of unknown function UPF0102  35.34 
 
 
139 aa  92  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0017  hypothetical protein  42.5 
 
 
126 aa  92  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00052241  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0666  hypothetical protein  36.61 
 
 
116 aa  89  2e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0397911  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2035  hypothetical protein  38.26 
 
 
122 aa  89  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.848509  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2230  protein of unknown function UPF0102  42.48 
 
 
127 aa  89.4  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0169041  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0016  hypothetical protein  40 
 
 
129 aa  88.2  3e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.197298  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1218  protein of unknown function UPF0102  38.39 
 
 
119 aa  88.2  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.648075  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1992  hypothetical protein  38.98 
 
 
129 aa  86.7  9e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1874  hypothetical protein  38.14 
 
 
135 aa  86.3  1e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0701  hypothetical protein  38.79 
 
 
122 aa  86.3  1e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0465  hypothetical protein  40.95 
 
 
113 aa  84.7  4e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1475  endonuclease  40 
 
 
115 aa  84.7  4e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.733308  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2202  hypothetical protein  32.74 
 
 
121 aa  84.3  5e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.474644  normal  0.174288 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0977  hypothetical protein  38.6 
 
 
119 aa  83.6  9e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.320606  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3756  hypothetical protein  38.46 
 
 
127 aa  83.6  9e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00341379  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1406  protein of unknown function UPF0102  40.68 
 
 
173 aa  83.6  9e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000418677  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1703  hypothetical protein  38.66 
 
 
123 aa  82.4  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09830  conserved hypothetical protein TIGR00252  38.39 
 
 
125 aa  82.4  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.351272  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3424  hypothetical protein  35.9 
 
 
125 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2474  hypothetical protein  36.21 
 
 
118 aa  82.4  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0253334  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07020  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  43.88 
 
 
186 aa  82.4  0.000000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00114408  normal  0.507303 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3123  protein of unknown function UPF0102  35.54 
 
 
121 aa  82  0.000000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0308676  normal  0.107591 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10390  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  40.35 
 
 
167 aa  81.6  0.000000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000139118  unclonable  0.000000000910029 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3485  hypothetical protein  35.9 
 
 
125 aa  81.6  0.000000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000340579 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2213  hypothetical protein  38.26 
 
 
132 aa  81.6  0.000000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000124547 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1175  protein of unknown function UPF0102  36.45 
 
 
122 aa  81.3  0.000000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07400  hypothetical protein  37.17 
 
 
116 aa  80.5  0.000000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1530  hypothetical protein  38.46 
 
 
118 aa  80.5  0.000000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0048655  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1272  protein of unknown function UPF0102  35.59 
 
 
125 aa  79.3  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1376  protein of unknown function UPF0102  43.36 
 
 
119 aa  80.1  0.00000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000032081  normal  0.333882 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1792  hypothetical protein  39.5 
 
 
160 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0993  protein of unknown function UPF0102  36.07 
 
 
129 aa  78.2  0.00000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00109853  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3311  protein of unknown function UPF0102  36.52 
 
 
134 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1985  hypothetical protein  34.21 
 
 
135 aa  78.2  0.00000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0318406  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2031  hypothetical protein  34.21 
 
 
135 aa  78.2  0.00000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.474175  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1156  hypothetical protein  35.59 
 
 
118 aa  77.8  0.00000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0160558  normal  0.0576877 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1677  hypothetical protein  34.17 
 
 
122 aa  77.4  0.00000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.238653  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11140  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  32.76 
 
 
120 aa  77.4  0.00000000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0330886  normal  0.323386 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1959  hypothetical protein  33.33 
 
 
122 aa  77.4  0.00000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.142549  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1550  hypothetical protein  32.79 
 
 
132 aa  77  0.00000000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.176091 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1836  hypothetical protein  40.59 
 
 
117 aa  77  0.00000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0316841 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1965  hypothetical protein  33.33 
 
 
135 aa  76.3  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.52969 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0992  hypothetical protein  39.42 
 
 
117 aa  76.3  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.528214  normal  0.0951104 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0669  hypothetical protein  37.04 
 
 
124 aa  76.6  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4140  hypothetical protein  34.78 
 
 
123 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2881  hypothetical protein  33.04 
 
 
146 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.696458 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1228  hypothetical protein  32.14 
 
 
119 aa  75.5  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.74821  normal  0.260342 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2217  hypothetical protein  41.07 
 
 
123 aa  75.1  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000089571  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2019  protein of unknown function UPF0102  37.29 
 
 
134 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.573307  normal  0.167847 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0629  hypothetical protein  36.36 
 
 
122 aa  74.7  0.0000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3740  protein of unknown function UPF0102  35.78 
 
 
121 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000086697  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12912  hypothetical protein  37.38 
 
 
141 aa  74.3  0.0000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0199208  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0720  hypothetical protein  34.45 
 
 
126 aa  74.3  0.0000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0341617  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1723  hypothetical protein  32.11 
 
 
123 aa  74.3  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.471951 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1406  protein of unknown function UPF0102  30.36 
 
 
114 aa  73.2  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0546  hypothetical protein  36.45 
 
 
115 aa  73.2  0.000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.672576  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3586  hypothetical protein  32.2 
 
 
118 aa  72.4  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0910  hypothetical protein  32.77 
 
 
119 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.21322  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0676  hypothetical protein  35.29 
 
 
167 aa  72  0.000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0552943  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0145  hypothetical protein  35.92 
 
 
124 aa  71.2  0.000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0280805  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2532  protein of unknown function UPF0102  34.21 
 
 
118 aa  70.9  0.000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.388001 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2398  hypothetical protein  33.93 
 
 
118 aa  70.5  0.000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.430013  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0016  hypothetical protein  39.17 
 
 
127 aa  70.5  0.000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.204452  unclonable  0.000000883308 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10070  conserved hypothetical protein TIGR00252  32.74 
 
 
153 aa  70.5  0.000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0294595  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2103  hypothetical protein  36.44 
 
 
121 aa  70.5  0.000000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.374615  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1291  protein of unknown function UPF0102  34.75 
 
 
115 aa  70.1  0.000000000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000677509  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2007  hypothetical protein  35.42 
 
 
124 aa  70.1  0.000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.63182  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2095  protein of unknown function UPF0102  36.73 
 
 
137 aa  69.3  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0460  protein of unknown function UPF0102  35.59 
 
 
153 aa  68.9  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0231  protein of unknown function UPF0102  31.07 
 
 
121 aa  69.3  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.819406  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0700  protein of unknown function UPF0102  33.33 
 
 
172 aa  68.9  0.00000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000202877  hitchhiker  0.000000354886 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3248  hypothetical protein  33.33 
 
 
124 aa  69.3  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.852323  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4114  hypothetical protein  30.83 
 
 
123 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1641  protein of unknown function UPF0102  38.83 
 
 
122 aa  67.8  0.00000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0797113  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2488  protein of unknown function UPF0102  33.33 
 
 
123 aa  67.8  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0776001  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0756  hypothetical protein  34.04 
 
 
118 aa  68.2  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.477778  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5917  protein of unknown function UPF0102  31.9 
 
 
117 aa  67.8  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00245822  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0988  hypothetical protein  35.04 
 
 
120 aa  67.8  0.00000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.659164 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1478  protein of unknown function UPF0102  35.71 
 
 
118 aa  67.4  0.00000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.10043  normal  0.036198 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1407  protein of unknown function UPF0102  30.09 
 
 
122 aa  67.4  0.00000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.993674  normal  0.0549137 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1947  hypothetical protein  39.13 
 
 
133 aa  67.4  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.439621  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0355  hypothetical protein  32.2 
 
 
124 aa  67.4  0.00000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1093  endonuclease-like  32.69 
 
 
202 aa  67  0.00000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4524  hypothetical protein  27.97 
 
 
123 aa  67.4  0.00000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0930  hypothetical protein  34.78 
 
 
123 aa  67  0.00000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.930588  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2054  hypothetical protein  38.78 
 
 
133 aa  66.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.595954  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4400  hypothetical protein  27.97 
 
 
123 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.147019 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>