More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3485 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_3485  hypothetical protein  100 
 
 		 125 aa  257  5.0000000000000005e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000340579 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3424  hypothetical protein  98.4 
 
 		 125 aa  254  4e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3756  hypothetical protein  65.85 
 
 		 127 aa  170  5.999999999999999e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00341379  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2864  hypothetical protein  62.18 
 
 		 122 aa  149  1e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00415914  hitchhiker  0.000000500394 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0650  hypothetical protein  58.82 
 
 		 128 aa  147  4e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1186  hypothetical protein  58.87 
 
 		 140 aa  145  1.0000000000000001e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00400032  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2230  protein of unknown function UPF0102  53.72 
 
 		 127 aa  135  2e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0169041  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2217  hypothetical protein  47.83 
 
 		 123 aa  104  5e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000089571  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2298  hypothetical protein  49.11 
 
 		 123 aa  101  4e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07400  hypothetical protein  43.1 
 
 		 116 aa  97.4  6e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09830  conserved hypothetical protein TIGR00252  42.28 
 
 		 125 aa  95.9  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.351272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1447  protein of unknown function UPF0102  40.65 
 
 		 127 aa  94.7  3e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1530  hypothetical protein  41.88 
 
 		 118 aa  94.7  4e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0048655  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0756  hypothetical protein  42.74 
 
 		 118 aa  94.4  5e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.477778  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2202  hypothetical protein  37.82 
 
 		 121 aa  94.4  5e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.474644  normal  0.174288 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0017  hypothetical protein  45.83 
 
 		 126 aa  93.2  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00052241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3998  protein of unknown function UPF0102  38.76 
 
 		 139 aa  92  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1218  protein of unknown function UPF0102  45.13 
 
 		 119 aa  92  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.648075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0758  hypothetical protein  41.13 
 
 		 130 aa  90.1  8e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1550  hypothetical protein  37.8 
 
 		 132 aa  89.7  1e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.176091 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1792  hypothetical protein  41.59 
 
 		 160 aa  89  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0676  hypothetical protein  40.87 
 
 		 167 aa  89  2e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0552943  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0666  hypothetical protein  43.36 
 
 		 116 aa  88.2  4e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0397911  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2095  protein of unknown function UPF0102  41.58 
 
 		 137 aa  87.8  4e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10070  conserved hypothetical protein TIGR00252  44.44 
 
 		 153 aa  87.4  6e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0294595  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1291  protein of unknown function UPF0102  40.18 
 
 		 115 aa  87.4  6e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000677509  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0993  protein of unknown function UPF0102  44 
 
 		 129 aa  86.3  1e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00109853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1475  endonuclease  40.87 
 
 		 115 aa  86.7  1e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.733308  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1992  hypothetical protein  42.06 
 
 		 129 aa  85.9  2e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0707  hypothetical protein  38.74 
 
 		 121 aa  85.9  2e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1228  hypothetical protein  40.87 
 
 		 119 aa  85.5  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.74821  normal  0.260342 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0460  protein of unknown function UPF0102  38.52 
 
 		 153 aa  84.7  4e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0720  hypothetical protein  36.22 
 
 		 126 aa  84.7  4e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0341617  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0016  hypothetical protein  46.39 
 
 		 129 aa  84  6e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.197298  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3248  hypothetical protein  38.74 
 
 		 124 aa  84  6e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.852323  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0017  hypothetical protein  43.59 
 
 		 128 aa  84  6e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000457371  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1406  protein of unknown function UPF0102  41.74 
 
 		 173 aa  84  7e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000418677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23670  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  34.17 
 
 		 127 aa  83.6  9e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.183487  normal  0.0867152 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5877  protein of unknown function UPF0102  37.61 
 
 		 117 aa  82.8  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.662779 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3311  protein of unknown function UPF0102  39.82 
 
 		 134 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2019  protein of unknown function UPF0102  38.6 
 
 		 134 aa  82  0.000000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.573307  normal  0.167847 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0277  protein of unknown function UPF0102  35.9 
 
 		 120 aa  81.6  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.107261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1959  hypothetical protein  42.57 
 
 		 122 aa  81.6  0.000000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.142549  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0037  hypothetical protein  40.65 
 
 		 127 aa  81.3  0.000000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0781  hypothetical protein  36.04 
 
 		 121 aa  80.9  0.000000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004502  endonuclease  42.57 
 
 		 122 aa  80.9  0.000000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000161677  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1910  hypothetical protein  41.84 
 
 		 134 aa  80.1  0.000000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.179028  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00890  hypothetical protein  41.58 
 
 		 122 aa  80.1  0.000000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0231  protein of unknown function UPF0102  39.8 
 
 		 121 aa  79.7  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.819406  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2054  hypothetical protein  43.88 
 
 		 133 aa  79.7  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.595954  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1969  hypothetical protein  43.88 
 
 		 133 aa  79.7  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00399816  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2398  hypothetical protein  43.36 
 
 		 118 aa  79.3  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.430013  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1677  hypothetical protein  42.57 
 
 		 122 aa  79.3  0.00000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.238653  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3004  hypothetical protein  46.24 
 
 		 95 aa  80.1  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.350262  normal  0.587814 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3046  hypothetical protein  46.24 
 
 		 95 aa  80.1  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.339629  normal  0.794955 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2488  protein of unknown function UPF0102  39.17 
 
 		 123 aa  80.1  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0776001  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2213  hypothetical protein  40 
 
 		 132 aa  80.1  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000124547 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0195  hypothetical protein  42.61 
 
 		 119 aa  79.3  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.227376  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1934  hypothetical protein  37.7 
 
 		 120 aa  78.6  0.00000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.547856  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1985  hypothetical protein  35.96 
 
 		 135 aa  78.2  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0318406  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0259  hypothetical protein  37.7 
 
 		 120 aa  78.6  0.00000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2031  hypothetical protein  35.96 
 
 		 135 aa  78.2  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.474175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4140  hypothetical protein  34.45 
 
 		 123 aa  77.8  0.00000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1965  hypothetical protein  35.96 
 
 		 135 aa  77.8  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.52969 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1703  hypothetical protein  39.5 
 
 		 123 aa  77.8  0.00000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02085  hypothetical protein  41.03 
 
 		 119 aa  77.4  0.00000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.997348  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3709  protein of unknown function UPF0102  36.36 
 
 		 119 aa  76.6  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2474  hypothetical protein  40.91 
 
 		 118 aa  76.3  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0253334  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1406  protein of unknown function UPF0102  35.4 
 
 		 114 aa  75.9  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0977  hypothetical protein  40.68 
 
 		 119 aa  75.9  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.320606  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0992  hypothetical protein  42.57 
 
 		 117 aa  75.5  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.528214  normal  0.0951104 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1156  hypothetical protein  41.38 
 
 		 118 aa  75.1  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0160558  normal  0.0576877 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2655  hypothetical protein  42.45 
 
 		 123 aa  75.1  0.0000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1093  endonuclease-like  36.45 
 
 		 202 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0629  hypothetical protein  42.5 
 
 		 122 aa  75.5  0.0000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3443  hypothetical protein  35.77 
 
 		 131 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2103  hypothetical protein  37.7 
 
 		 121 aa  75.1  0.0000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.374615  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03015  hypothetical protein  34.96 
 
 		 131 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0557  protein of unknown function UPF0102  34.96 
 
 		 131 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02966  hypothetical protein  34.96 
 
 		 131 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3630  hypothetical protein  36.59 
 
 		 131 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0553  protein of unknown function UPF0102  41.44 
 
 		 118 aa  74.7  0.0000000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.156898 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0550  hypothetical protein  34.96 
 
 		 131 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3585  hypothetical protein  36.07 
 
 		 131 aa  74.3  0.0000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.186326 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0546  hypothetical protein  40.71 
 
 		 115 aa  74.3  0.0000000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.672576  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3783  hypothetical protein  38.53 
 
 		 118 aa  73.9  0.0000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00882109  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0146  hypothetical protein  39.34 
 
 		 135 aa  74.3  0.0000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10390  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  37.72 
 
 		 167 aa  73.9  0.0000000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000139118  unclonable  0.000000000910029 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_687  endonuclease  34.23 
 
 		 121 aa  73.6  0.0000000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2532  protein of unknown function UPF0102  37.72 
 
 		 118 aa  73.2  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.388001 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3452  hypothetical protein  37.72 
 
 		 131 aa  72.8  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1272  protein of unknown function UPF0102  36.97 
 
 		 125 aa  72.8  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3620  hypothetical protein  37.72 
 
 		 131 aa  72.4  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2201  hypothetical protein  37.4 
 
 		 123 aa  72.4  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3560  hypothetical protein  37.72 
 
 		 131 aa  72.4  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2025  hypothetical protein  39.13 
 
 		 119 aa  72.4  0.000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4467  hypothetical protein  35.77 
 
 		 131 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3523  hypothetical protein  37.72 
 
 		 131 aa  72.4  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.578592  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3454  hypothetical protein  37.72 
 
 		 131 aa  72.4  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1947  hypothetical protein  37.74 
 
 		 133 aa  71.6  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.439621  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>