293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3998 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3998  protein of unknown function UPF0102  100 
 
 		 139 aa  273  5e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1228  hypothetical protein  51.28 
 
 		 119 aa  115  1.9999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.74821  normal  0.260342 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1407  protein of unknown function UPF0102  54.78 
 
 		 122 aa  114  3.9999999999999997e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.993674  normal  0.0549137 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2474  hypothetical protein  50.86 
 
 		 118 aa  110  9e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0253334  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1550  hypothetical protein  49.18 
 
 		 132 aa  107  4.0000000000000004e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.176091 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3123  protein of unknown function UPF0102  53.45 
 
 		 121 aa  103  8e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0308676  normal  0.107591 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1156  hypothetical protein  49.15 
 
 		 118 aa  103  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0160558  normal  0.0576877 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09830  conserved hypothetical protein TIGR00252  44.96 
 
 		 125 aa  102  1e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.351272  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0992  hypothetical protein  55.79 
 
 		 117 aa  101  4e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.528214  normal  0.0951104 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2532  protein of unknown function UPF0102  56.9 
 
 		 118 aa  100  5e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.388001 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2213  hypothetical protein  47.27 
 
 		 132 aa  98.6  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000124547 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12912  hypothetical protein  47.66 
 
 		 141 aa  99  2e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0199208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0669  hypothetical protein  51.82 
 
 		 124 aa  98.6  3e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3248  hypothetical protein  46.36 
 
 		 124 aa  98.6  3e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.852323  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0676  hypothetical protein  44.27 
 
 		 167 aa  97.4  6e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0552943  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07400  hypothetical protein  39.82 
 
 		 116 aa  97.4  6e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1478  protein of unknown function UPF0102  55.68 
 
 		 118 aa  96.3  1e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.10043  normal  0.036198 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1965  hypothetical protein  51.72 
 
 		 135 aa  96.7  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.52969 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3586  hypothetical protein  49.15 
 
 		 118 aa  95.9  1e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0666  hypothetical protein  48.7 
 
 		 116 aa  96.3  1e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0397911  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1985  hypothetical protein  51.72 
 
 		 135 aa  96.3  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0318406  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2031  hypothetical protein  51.72 
 
 		 135 aa  96.3  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.474175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2202  hypothetical protein  50 
 
 		 121 aa  96.3  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.474644  normal  0.174288 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1836  hypothetical protein  53.12 
 
 		 117 aa  95.9  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0316841 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0650  hypothetical protein  46.43 
 
 		 128 aa  95.5  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0231  protein of unknown function UPF0102  52.73 
 
 		 121 aa  95.9  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.819406  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3413  protein of unknown function UPF0102  49.56 
 
 		 124 aa  95.5  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23670  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  50.44 
 
 		 127 aa  95.9  2e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.183487  normal  0.0867152 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1530  hypothetical protein  39.6 
 
 		 118 aa  95.1  3e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0048655  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4140  hypothetical protein  50.43 
 
 		 123 aa  95.1  3e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11140  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  50.89 
 
 		 120 aa  94.7  4e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0330886  normal  0.323386 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1703  hypothetical protein  40.87 
 
 		 123 aa  94.4  5e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3424  hypothetical protein  39.53 
 
 		 125 aa  93.6  8e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3485  hypothetical protein  38.76 
 
 		 125 aa  92  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000340579 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0277  protein of unknown function UPF0102  35.34 
 
 		 120 aa  92  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.107261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2864  hypothetical protein  41.74 
 
 		 122 aa  91.7  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00415914  hitchhiker  0.000000500394 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1447  protein of unknown function UPF0102  42.62 
 
 		 127 aa  91.7  3e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10390  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  41.27 
 
 		 167 aa  89.7  1e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000139118  unclonable  0.000000000910029 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2095  protein of unknown function UPF0102  45.1 
 
 		 137 aa  89.4  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0993  protein of unknown function UPF0102  47.79 
 
 		 129 aa  89  2e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00109853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1175  protein of unknown function UPF0102  46.96 
 
 		 122 aa  89  2e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2217  hypothetical protein  50 
 
 		 123 aa  89  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000089571  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1320  hypothetical protein  50.83 
 
 		 121 aa  89  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1475  endonuclease  43.36 
 
 		 115 aa  88.6  3e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.733308  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0930  hypothetical protein  45.61 
 
 		 123 aa  88.6  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.930588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3756  hypothetical protein  41.74 
 
 		 127 aa  88.6  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00341379  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0017  hypothetical protein  43.3 
 
 		 126 aa  87.4  5e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00052241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1218  protein of unknown function UPF0102  42.48 
 
 		 119 aa  87.4  5e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.648075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1792  hypothetical protein  49.11 
 
 		 160 aa  87.4  6e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1186  hypothetical protein  42.61 
 
 		 140 aa  87.4  6e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00400032  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0037  hypothetical protein  44.9 
 
 		 127 aa  87.4  6e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1272  protein of unknown function UPF0102  42.16 
 
 		 125 aa  87  7e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0016  hypothetical protein  45.83 
 
 		 129 aa  87  7e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.197298  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2035  hypothetical protein  40.87 
 
 		 122 aa  86.7  9e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.848509  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0700  protein of unknown function UPF0102  40.34 
 
 		 172 aa  85.5  2e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000202877  hitchhiker  0.000000354886 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1406  protein of unknown function UPF0102  43.62 
 
 		 114 aa  85.9  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2193  hypothetical protein  48.84 
 
 		 207 aa  85.1  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1725  normal  0.994481 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10070  conserved hypothetical protein TIGR00252  45.61 
 
 		 153 aa  85.1  3e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0294595  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1992  hypothetical protein  38.52 
 
 		 129 aa  84.3  4e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0017  hypothetical protein  39.47 
 
 		 128 aa  84.7  4e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000457371  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0977  hypothetical protein  39.8 
 
 		 119 aa  84  7e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.320606  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1406  protein of unknown function UPF0102  39.66 
 
 		 173 aa  83.6  8e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000418677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0720  hypothetical protein  40.4 
 
 		 126 aa  83.2  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0341617  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3311  protein of unknown function UPF0102  42.11 
 
 		 134 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2881  hypothetical protein  46.02 
 
 		 146 aa  82  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.696458 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0639  conserved hypothetical protein TIGR00252  41.75 
 
 		 182 aa  81.6  0.000000000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.372666 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2398  hypothetical protein  47.96 
 
 		 118 aa  81.3  0.000000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.430013  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2230  protein of unknown function UPF0102  39.82 
 
 		 127 aa  80.9  0.000000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0169041  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1291  protein of unknown function UPF0102  40.21 
 
 		 115 aa  80.5  0.000000000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000677509  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3709  protein of unknown function UPF0102  35.65 
 
 		 119 aa  80.5  0.000000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5917  protein of unknown function UPF0102  44.55 
 
 		 117 aa  80.5  0.000000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00245822  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1521  protein of unknown function UPF0102  40 
 
 		 157 aa  80.5  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0637187  normal  0.0119716 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1093  endonuclease-like  45.92 
 
 		 202 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2488  protein of unknown function UPF0102  44.44 
 
 		 123 aa  80.1  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0776001  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3675  protein of unknown function UPF0102  47.83 
 
 		 122 aa  80.1  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.344366 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1959  hypothetical protein  32.2 
 
 		 122 aa  79.3  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.142549  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07020  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  36 
 
 		 186 aa  79  0.00000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00114408  normal  0.507303 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4433  hypothetical protein  34.68 
 
 		 129 aa  78.6  0.00000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.875795  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1176  hypothetical protein  31.86 
 
 		 122 aa  78.2  0.00000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.108145 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5877  protein of unknown function UPF0102  32.46 
 
 		 117 aa  77.8  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.662779 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0758  hypothetical protein  37.61 
 
 		 130 aa  77.4  0.00000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1376  protein of unknown function UPF0102  36.28 
 
 		 119 aa  77.4  0.00000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000032081  normal  0.333882 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1677  hypothetical protein  31.36 
 
 		 122 aa  77  0.00000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.238653  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0553  protein of unknown function UPF0102  45.45 
 
 		 118 aa  77  0.00000000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.156898 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1934  hypothetical protein  39.6 
 
 		 120 aa  75.5  0.0000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.547856  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2201  hypothetical protein  47.87 
 
 		 123 aa  75.5  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0259  hypothetical protein  39.6 
 
 		 120 aa  75.5  0.0000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1910  hypothetical protein  46.43 
 
 		 134 aa  75.1  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.179028  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00890  hypothetical protein  39.18 
 
 		 122 aa  75.1  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4114  hypothetical protein  36.75 
 
 		 123 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0707  hypothetical protein  37.14 
 
 		 121 aa  74.7  0.0000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0756  hypothetical protein  43.43 
 
 		 118 aa  74.3  0.0000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.477778  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1723  hypothetical protein  41.96 
 
 		 123 aa  74.3  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.471951 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09240  Holliday junction resolvase-like endonuclease  44.23 
 
 		 139 aa  73.9  0.0000000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0928499  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2007  hypothetical protein  50 
 
 		 124 aa  73.9  0.0000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.63182  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0701  hypothetical protein  34.38 
 
 		 122 aa  73.9  0.0000000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02085  hypothetical protein  38.6 
 
 		 119 aa  73.6  0.0000000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.997348  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13130  hypothetical protein  37.17 
 
 		 120 aa  73.6  0.0000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4420  hypothetical protein  41 
 
 		 128 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.149236  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0355  hypothetical protein  40 
 
 		 124 aa  73.2  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>