299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3756 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_3756  hypothetical protein  100 
 
 		 127 aa  262  1e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00341379  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3424  hypothetical protein  66.67 
 
 		 125 aa  171  1.9999999999999998e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3485  hypothetical protein  65.85 
 
 		 125 aa  170  5.999999999999999e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000340579 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2864  hypothetical protein  67.23 
 
 		 122 aa  164  2.9999999999999998e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00415914  hitchhiker  0.000000500394 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0650  hypothetical protein  61.6 
 
 		 128 aa  158  3e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1186  hypothetical protein  59.84 
 
 		 140 aa  155  2e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00400032  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2230  protein of unknown function UPF0102  54.17 
 
 		 127 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0169041  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0756  hypothetical protein  48.18 
 
 		 118 aa  103  1e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.477778  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2298  hypothetical protein  47.83 
 
 		 123 aa  100  6e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1447  protein of unknown function UPF0102  43.09 
 
 		 127 aa  100  7e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07400  hypothetical protein  44.35 
 
 		 116 aa  98.6  3e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0993  protein of unknown function UPF0102  44.17 
 
 		 129 aa  98.2  4e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00109853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2202  hypothetical protein  43.22 
 
 		 121 aa  96.3  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.474644  normal  0.174288 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2217  hypothetical protein  46.55 
 
 		 123 aa  95.5  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000089571  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0460  protein of unknown function UPF0102  42.98 
 
 		 153 aa  95.5  2e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09830  conserved hypothetical protein TIGR00252  42.48 
 
 		 125 aa  94.7  4e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.351272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0016  hypothetical protein  46.72 
 
 		 129 aa  94.7  4e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.197298  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1218  protein of unknown function UPF0102  42.48 
 
 		 119 aa  94.4  5e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.648075  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0666  hypothetical protein  41.88 
 
 		 116 aa  94.4  5e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0397911  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1550  hypothetical protein  41.13 
 
 		 132 aa  94.4  5e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.176091 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0017  hypothetical protein  47.15 
 
 		 128 aa  93.6  9e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000457371  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1959  hypothetical protein  42.24 
 
 		 122 aa  92.8  1e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.142549  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3004  hypothetical protein  51.61 
 
 		 95 aa  92.8  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.350262  normal  0.587814 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3046  hypothetical protein  51.61 
 
 		 95 aa  92.8  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.339629  normal  0.794955 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1992  hypothetical protein  45.38 
 
 		 129 aa  92.4  2e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1677  hypothetical protein  42.24 
 
 		 122 aa  92  2e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.238653  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0037  hypothetical protein  43.9 
 
 		 127 aa  92.8  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1406  protein of unknown function UPF0102  43.52 
 
 		 114 aa  92.4  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0017  hypothetical protein  42.74 
 
 		 126 aa  91.3  5e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00052241  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0977  hypothetical protein  46.55 
 
 		 119 aa  90.5  7e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.320606  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1291  protein of unknown function UPF0102  40.35 
 
 		 115 aa  90.5  8e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000677509  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1406  protein of unknown function UPF0102  43.48 
 
 		 173 aa  90.5  8e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000418677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1530  hypothetical protein  41.03 
 
 		 118 aa  90.1  1e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0048655  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10070  conserved hypothetical protein TIGR00252  43.12 
 
 		 153 aa  89.4  1e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0294595  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1475  endonuclease  42.61 
 
 		 115 aa  89.7  1e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.733308  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2019  protein of unknown function UPF0102  39.47 
 
 		 134 aa  89  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.573307  normal  0.167847 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3311  protein of unknown function UPF0102  40.71 
 
 		 134 aa  88.6  3e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0195  hypothetical protein  40 
 
 		 119 aa  88.2  3e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.227376  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3998  protein of unknown function UPF0102  41.74 
 
 		 139 aa  88.6  3e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0707  hypothetical protein  38.79 
 
 		 121 aa  86.3  1e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1228  hypothetical protein  41.74 
 
 		 119 aa  86.7  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.74821  normal  0.260342 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1910  hypothetical protein  41.74 
 
 		 134 aa  85.9  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.179028  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5877  protein of unknown function UPF0102  40.68 
 
 		 117 aa  84.7  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.662779 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10390  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  41.88 
 
 		 167 aa  84.7  4e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000139118  unclonable  0.000000000910029 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1792  hypothetical protein  42.48 
 
 		 160 aa  84.3  5e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23670  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  35 
 
 		 127 aa  83.6  8e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.183487  normal  0.0867152 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2488  protein of unknown function UPF0102  38.46 
 
 		 123 aa  83.6  8e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0776001  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1969  hypothetical protein  43.75 
 
 		 133 aa  83.6  8e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00399816  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0720  hypothetical protein  38.21 
 
 		 126 aa  83.6  8e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0341617  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3298  hypothetical protein  39.5 
 
 		 124 aa  83.6  8e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.861672  normal  0.570212 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2054  hypothetical protein  43.75 
 
 		 133 aa  83.6  8e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.595954  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2398  hypothetical protein  41.53 
 
 		 118 aa  83.6  8e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.430013  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0277  protein of unknown function UPF0102  38.46 
 
 		 120 aa  83.6  9e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.107261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2213  hypothetical protein  38.94 
 
 		 132 aa  83.6  9e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000124547 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1934  hypothetical protein  40 
 
 		 120 aa  82.8  0.000000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.547856  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3463  hypothetical protein  45.83 
 
 		 125 aa  82.8  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0259  hypothetical protein  40 
 
 		 120 aa  82.8  0.000000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2035  hypothetical protein  41.03 
 
 		 122 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.848509  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004502  endonuclease  39.64 
 
 		 122 aa  82.8  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000161677  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3135  hypothetical protein  45.83 
 
 		 125 aa  82.4  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1703  hypothetical protein  42.86 
 
 		 123 aa  82.4  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0758  hypothetical protein  40.32 
 
 		 130 aa  82  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1272  protein of unknown function UPF0102  39.66 
 
 		 125 aa  81.6  0.000000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02085  hypothetical protein  40.17 
 
 		 119 aa  81.6  0.000000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.997348  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2655  hypothetical protein  40.5 
 
 		 123 aa  81.3  0.000000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0676  hypothetical protein  38.46 
 
 		 167 aa  81.3  0.000000000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0552943  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2474  hypothetical protein  39.45 
 
 		 118 aa  80.9  0.000000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0253334  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3065  hypothetical protein  38.05 
 
 		 118 aa  80.1  0.000000000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1985  hypothetical protein  39.64 
 
 		 135 aa  80.1  0.000000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0318406  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2031  hypothetical protein  39.64 
 
 		 135 aa  80.1  0.000000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.474175  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1324  hypothetical protein  38.05 
 
 		 124 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.294844  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13130  hypothetical protein  33.05 
 
 		 120 aa  79.7  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1965  hypothetical protein  39.64 
 
 		 135 aa  79.7  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.52969 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4140  hypothetical protein  37.19 
 
 		 123 aa  79.3  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00890  hypothetical protein  41.41 
 
 		 122 aa  79  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4400  hypothetical protein  38.05 
 
 		 123 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.147019 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0629  hypothetical protein  41.03 
 
 		 122 aa  79.3  0.00000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0932  hypothetical protein  36.67 
 
 		 123 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0355  hypothetical protein  35.83 
 
 		 124 aa  78.6  0.00000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1723  hypothetical protein  39.66 
 
 		 123 aa  78.2  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.471951 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1156  hypothetical protein  37.39 
 
 		 118 aa  78.2  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0160558  normal  0.0576877 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0992  hypothetical protein  44.21 
 
 		 117 aa  78.6  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.528214  normal  0.0951104 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2103  hypothetical protein  38.98 
 
 		 121 aa  78.6  0.00000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.374615  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4524  hypothetical protein  38.05 
 
 		 123 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12912  hypothetical protein  39.47 
 
 		 141 aa  78.2  0.00000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0199208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2283  hypothetical protein  37.39 
 
 		 113 aa  77.8  0.00000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.567685 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0315  protein of unknown function UPF0102  41.23 
 
 		 121 aa  77.8  0.00000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000225244 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0142  conserved hypothetical protein TIGR00252  41.23 
 
 		 121 aa  77.8  0.00000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0700  protein of unknown function UPF0102  39.83 
 
 		 172 aa  77.8  0.00000000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000202877  hitchhiker  0.000000354886 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1407  protein of unknown function UPF0102  35.45 
 
 		 122 aa  77.4  0.00000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.993674  normal  0.0549137 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1093  endonuclease-like  39.81 
 
 		 202 aa  76.6  0.00000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0781  hypothetical protein  35.96 
 
 		 121 aa  76.3  0.0000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3248  hypothetical protein  32.46 
 
 		 124 aa  76.6  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.852323  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4996  hypothetical protein  36.07 
 
 		 125 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.608406  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0988  hypothetical protein  43.75 
 
 		 120 aa  75.9  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.659164 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2025  hypothetical protein  36.75 
 
 		 119 aa  75.9  0.0000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1376  protein of unknown function UPF0102  37.29 
 
 		 119 aa  75.9  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000032081  normal  0.333882 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1217  hypothetical protein  39.17 
 
 		 123 aa  75.9  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.266389  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2464  hypothetical protein  33.61 
 
 		 123 aa  75.9  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.164658  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0930  hypothetical protein  35.65 
 
 		 123 aa  75.1  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.930588  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>