More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1959 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1959  hypothetical protein  100 
 
 		 122 aa  242  9.999999999999999e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.142549  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1677  hypothetical protein  94.26 
 
 		 122 aa  232  1.0000000000000001e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.238653  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1703  hypothetical protein  47.06 
 
 		 123 aa  100  8e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2217  hypothetical protein  39.62 
 
 		 123 aa  95.1  3e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000089571  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1475  endonuclease  40.52 
 
 		 115 aa  94.7  4e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.733308  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0977  hypothetical protein  45.3 
 
 		 119 aa  92.8  1e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.320606  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3756  hypothetical protein  42.24 
 
 		 127 aa  92.8  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00341379  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2864  hypothetical protein  43.27 
 
 		 122 aa  92.4  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00415914  hitchhiker  0.000000500394 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0720  hypothetical protein  42.62 
 
 		 126 aa  92  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0341617  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1992  hypothetical protein  42.86 
 
 		 129 aa  90.9  6e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1530  hypothetical protein  42.24 
 
 		 118 aa  89.4  1e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0048655  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1447  protein of unknown function UPF0102  37.4 
 
 		 127 aa  89.4  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1291  protein of unknown function UPF0102  40.17 
 
 		 115 aa  87.8  4e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000677509  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1186  hypothetical protein  37.29 
 
 		 140 aa  87.8  5e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00400032  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0650  hypothetical protein  38.18 
 
 		 128 aa  86.7  9e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2488  protein of unknown function UPF0102  35.54 
 
 		 123 aa  87  9e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0776001  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2230  protein of unknown function UPF0102  40 
 
 		 127 aa  85.9  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0169041  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2298  hypothetical protein  39.29 
 
 		 123 aa  84.7  4e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07400  hypothetical protein  37.93 
 
 		 116 aa  84.7  4e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1218  protein of unknown function UPF0102  38.94 
 
 		 119 aa  83.6  9e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.648075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1228  hypothetical protein  33.33 
 
 		 119 aa  82.8  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.74821  normal  0.260342 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0017  hypothetical protein  38.46 
 
 		 128 aa  82.4  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000457371  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3740  protein of unknown function UPF0102  39.25 
 
 		 121 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000086697  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0666  hypothetical protein  38.05 
 
 		 116 aa  82  0.000000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0397911  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3485  hypothetical protein  42.57 
 
 		 125 aa  81.6  0.000000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000340579 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1406  protein of unknown function UPF0102  37.76 
 
 		 173 aa  81.3  0.000000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000418677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3311  protein of unknown function UPF0102  37.5 
 
 		 134 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2464  hypothetical protein  33.06 
 
 		 123 aa  81.6  0.000000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.164658  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0460  protein of unknown function UPF0102  38.05 
 
 		 153 aa  80.9  0.000000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0037  hypothetical protein  41.32 
 
 		 127 aa  81.3  0.000000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2398  hypothetical protein  40.68 
 
 		 118 aa  80.9  0.000000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.430013  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1406  protein of unknown function UPF0102  38.53 
 
 		 114 aa  80.5  0.000000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3004  hypothetical protein  39.78 
 
 		 95 aa  80.5  0.000000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.350262  normal  0.587814 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3046  hypothetical protein  39.78 
 
 		 95 aa  80.5  0.000000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.339629  normal  0.794955 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1478  protein of unknown function UPF0102  34.94 
 
 		 118 aa  80.1  0.000000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.10043  normal  0.036198 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07020  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  42.42 
 
 		 186 aa  80.1  0.000000000000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00114408  normal  0.507303 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09830  conserved hypothetical protein TIGR00252  36.46 
 
 		 125 aa  79.7  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.351272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3424  hypothetical protein  42.57 
 
 		 125 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2007  hypothetical protein  29.66 
 
 		 124 aa  80.1  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.63182  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4420  hypothetical protein  31.71 
 
 		 128 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.149236  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3998  protein of unknown function UPF0102  32.2 
 
 		 139 aa  79.3  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57490  hypothetical protein  28.33 
 
 		 125 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0669  hypothetical protein  34.69 
 
 		 124 aa  78.2  0.00000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0707  hypothetical protein  36.04 
 
 		 121 aa  77.8  0.00000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0017  hypothetical protein  43.88 
 
 		 126 aa  78.2  0.00000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00052241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0993  protein of unknown function UPF0102  32.54 
 
 		 129 aa  78.2  0.00000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00109853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0355  hypothetical protein  34.45 
 
 		 124 aa  77.8  0.00000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0756  hypothetical protein  32.14 
 
 		 118 aa  77.4  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.477778  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2035  hypothetical protein  36.89 
 
 		 122 aa  77.8  0.00000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.848509  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4114  hypothetical protein  30 
 
 		 123 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3709  protein of unknown function UPF0102  37.17 
 
 		 119 aa  77.4  0.00000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0277  protein of unknown function UPF0102  33.33 
 
 		 120 aa  77.4  0.00000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.107261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1175  protein of unknown function UPF0102  32.08 
 
 		 122 aa  77  0.00000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10070  conserved hypothetical protein TIGR00252  33.33 
 
 		 153 aa  77  0.00000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0294595  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0781  hypothetical protein  34.86 
 
 		 121 aa  76.3  0.0000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1695  hypothetical protein  37.1 
 
 		 120 aa  76.6  0.0000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2881  hypothetical protein  31.03 
 
 		 146 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.696458 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0315  protein of unknown function UPF0102  32.52 
 
 		 121 aa  75.5  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000225244 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0142  conserved hypothetical protein TIGR00252  32.52 
 
 		 121 aa  75.5  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4996  hypothetical protein  29.2 
 
 		 125 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.608406  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5877  protein of unknown function UPF0102  32.5 
 
 		 117 aa  75.1  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.662779 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0016  hypothetical protein  43.14 
 
 		 129 aa  75.5  0.0000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.197298  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2532  protein of unknown function UPF0102  36 
 
 		 118 aa  75.1  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.388001 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1320  hypothetical protein  32.5 
 
 		 121 aa  75.1  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2095  protein of unknown function UPF0102  34.34 
 
 		 137 aa  74.7  0.0000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0629  hypothetical protein  42.16 
 
 		 122 aa  74.3  0.0000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1550  hypothetical protein  31.75 
 
 		 132 aa  74.3  0.0000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.176091 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0758  hypothetical protein  38.66 
 
 		 130 aa  74.3  0.0000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0932  hypothetical protein  30.43 
 
 		 123 aa  73.9  0.0000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1156  hypothetical protein  35 
 
 		 118 aa  74.3  0.0000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0160558  normal  0.0576877 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1217  hypothetical protein  34.96 
 
 		 123 aa  73.9  0.0000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.266389  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0988  hypothetical protein  40 
 
 		 120 aa  73.9  0.0000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.659164 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13130  hypothetical protein  30.77 
 
 		 120 aa  73.9  0.0000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3463  hypothetical protein  33.33 
 
 		 125 aa  73.6  0.0000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0675  protein of unknown function UPF0102  28.93 
 
 		 165 aa  73.6  0.0000000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1723  hypothetical protein  29.13 
 
 		 123 aa  73.2  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.471951 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0546  hypothetical protein  37.14 
 
 		 115 aa  73.6  0.000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.672576  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3135  hypothetical protein  33.33 
 
 		 125 aa  73.2  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1985  hypothetical protein  35.51 
 
 		 135 aa  72.8  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0318406  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1376  protein of unknown function UPF0102  40.68 
 
 		 119 aa  73.2  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000032081  normal  0.333882 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3248  hypothetical protein  32.99 
 
 		 124 aa  73.2  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.852323  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2031  hypothetical protein  35.51 
 
 		 135 aa  72.8  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.474175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2202  hypothetical protein  34.02 
 
 		 121 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.474644  normal  0.174288 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1324  hypothetical protein  30.09 
 
 		 124 aa  72  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.294844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3870  protein of unknown function UPF0102  36.27 
 
 		 144 aa  72  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0231  protein of unknown function UPF0102  31.25 
 
 		 121 aa  72.8  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.819406  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1792  hypothetical protein  34.74 
 
 		 160 aa  72.8  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3919  protein of unknown function UPF0102  36.27 
 
 		 144 aa  72  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000143067  normal  0.216721 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00890  hypothetical protein  35.34 
 
 		 122 aa  72  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2213  hypothetical protein  35 
 
 		 132 aa  72  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000124547 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2474  hypothetical protein  35.79 
 
 		 118 aa  72  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0253334  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1272  protein of unknown function UPF0102  39.05 
 
 		 125 aa  71.6  0.000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0465  hypothetical protein  40 
 
 		 113 aa  71.6  0.000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_687  endonuclease  33.94 
 
 		 121 aa  71.6  0.000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2395  hypothetical protein  36.97 
 
 		 127 aa  71.2  0.000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.615386  normal  0.0739869 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0259  hypothetical protein  32.52 
 
 		 120 aa  71.2  0.000000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1934  hypothetical protein  32.52 
 
 		 120 aa  71.2  0.000000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.547856  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0910  hypothetical protein  26.45 
 
 		 119 aa  70.9  0.000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.21322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1965  hypothetical protein  34.58 
 
 		 135 aa  70.9  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.52969 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0676  hypothetical protein  34 
 
 		 167 aa  70.9  0.000000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0552943  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>