212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2193 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_2193  hypothetical protein  100 
 
 
207 aa  401  1e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1725  normal  0.994481 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3248  hypothetical protein  54.55 
 
 
124 aa  89.7  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.852323  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1550  hypothetical protein  53.25 
 
 
132 aa  84.7  8e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.176091 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3998  protein of unknown function UPF0102  48.84 
 
 
139 aa  84  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1228  hypothetical protein  51.81 
 
 
119 aa  84.3  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.74821  normal  0.260342 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0669  hypothetical protein  55.7 
 
 
124 aa  83.2  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2474  hypothetical protein  46.51 
 
 
118 aa  82.4  0.000000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0253334  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0977  hypothetical protein  47.44 
 
 
119 aa  80.9  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.320606  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09830  conserved hypothetical protein TIGR00252  53.25 
 
 
125 aa  79.7  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.351272  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2202  hypothetical protein  53.25 
 
 
121 aa  80.5  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.474644  normal  0.174288 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2213  hypothetical protein  48.1 
 
 
132 aa  79.7  0.00000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000124547 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1965  hypothetical protein  53.16 
 
 
135 aa  79.7  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.52969 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1407  protein of unknown function UPF0102  46.51 
 
 
122 aa  79  0.00000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.993674  normal  0.0549137 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1156  hypothetical protein  52.56 
 
 
118 aa  78.2  0.00000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0160558  normal  0.0576877 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1985  hypothetical protein  51.9 
 
 
135 aa  77.4  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0318406  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2031  hypothetical protein  51.9 
 
 
135 aa  77.4  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.474175  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3413  protein of unknown function UPF0102  51.22 
 
 
124 aa  77  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0231  protein of unknown function UPF0102  53.66 
 
 
121 aa  77.4  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.819406  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4140  hypothetical protein  49.37 
 
 
123 aa  75.5  0.0000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3123  protein of unknown function UPF0102  49.41 
 
 
121 aa  73.9  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0308676  normal  0.107591 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12912  hypothetical protein  48.15 
 
 
141 aa  73.6  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0199208  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1703  hypothetical protein  35.96 
 
 
123 aa  72.4  0.000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1272  protein of unknown function UPF0102  43.82 
 
 
125 aa  72  0.000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09240  Holliday junction resolvase-like endonuclease  46.32 
 
 
139 aa  72  0.000000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0928499  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1320  hypothetical protein  50 
 
 
121 aa  72  0.000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07400  hypothetical protein  45.45 
 
 
116 aa  72  0.000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0992  hypothetical protein  50 
 
 
117 aa  71.2  0.000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.528214  normal  0.0951104 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1093  endonuclease-like  47.5 
 
 
202 aa  71.2  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10070  conserved hypothetical protein TIGR00252  44.58 
 
 
153 aa  71.2  0.00000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0294595  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2217  hypothetical protein  47.5 
 
 
123 aa  70.5  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000089571  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0666  hypothetical protein  44.16 
 
 
116 aa  70.1  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0397911  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2095  protein of unknown function UPF0102  46.34 
 
 
137 aa  70.5  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1217  hypothetical protein  38.64 
 
 
123 aa  69.7  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.266389  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3311  protein of unknown function UPF0102  45.35 
 
 
134 aa  68.9  0.00000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1530  hypothetical protein  38.75 
 
 
118 aa  68.9  0.00000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0048655  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1406  protein of unknown function UPF0102  46.91 
 
 
173 aa  68.9  0.00000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000418677  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1478  protein of unknown function UPF0102  46.75 
 
 
118 aa  68.9  0.00000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.10043  normal  0.036198 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3675  protein of unknown function UPF0102  51.16 
 
 
122 aa  68.6  0.00000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.344366 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0676  hypothetical protein  40.91 
 
 
167 aa  68.6  0.00000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0552943  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1218  protein of unknown function UPF0102  40.74 
 
 
119 aa  68.6  0.00000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.648075  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10390  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  46.99 
 
 
167 aa  68.2  0.00000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000139118  unclonable  0.000000000910029 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5917  protein of unknown function UPF0102  43.9 
 
 
117 aa  67.8  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00245822  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1677  hypothetical protein  38.96 
 
 
122 aa  67.4  0.0000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.238653  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2864  hypothetical protein  40 
 
 
122 aa  67  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00415914  hitchhiker  0.000000500394 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1959  hypothetical protein  37.66 
 
 
122 aa  67  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.142549  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1475  endonuclease  40 
 
 
115 aa  67  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.733308  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0650  hypothetical protein  43.75 
 
 
128 aa  65.9  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0639  conserved hypothetical protein TIGR00252  40 
 
 
182 aa  65.5  0.0000000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.372666 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3586  hypothetical protein  48.39 
 
 
118 aa  64.7  0.0000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0017  hypothetical protein  41.05 
 
 
126 aa  65.1  0.0000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00052241  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0277  protein of unknown function UPF0102  37.5 
 
 
120 aa  64.3  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.107261  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0037  hypothetical protein  44.16 
 
 
127 aa  64.3  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1176  hypothetical protein  33.33 
 
 
122 aa  64.7  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.108145 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0720  hypothetical protein  39.33 
 
 
126 aa  64.3  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0341617  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2230  protein of unknown function UPF0102  42.17 
 
 
127 aa  64.3  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0169041  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1836  hypothetical protein  45.45 
 
 
117 aa  64.3  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0316841 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07020  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  42.53 
 
 
186 aa  63.9  0.000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00114408  normal  0.507303 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13130  hypothetical protein  42.67 
 
 
120 aa  63.2  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2532  protein of unknown function UPF0102  48.39 
 
 
118 aa  62.4  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.388001 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1186  hypothetical protein  43.21 
 
 
140 aa  62.8  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00400032  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3740  protein of unknown function UPF0102  40.23 
 
 
121 aa  62  0.000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000086697  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3298  hypothetical protein  43.84 
 
 
124 aa  62  0.000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.861672  normal  0.570212 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4685  hypothetical protein  40.28 
 
 
120 aa  61.6  0.000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0484178 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1992  hypothetical protein  39.73 
 
 
129 aa  61.6  0.000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1521  protein of unknown function UPF0102  44.44 
 
 
157 aa  61.6  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0637187  normal  0.0119716 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1175  protein of unknown function UPF0102  42.47 
 
 
122 aa  61.2  0.000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0993  protein of unknown function UPF0102  41.67 
 
 
129 aa  61.2  0.000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00109853  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3485  hypothetical protein  37.21 
 
 
125 aa  61.2  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000340579 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3065  hypothetical protein  33.33 
 
 
118 aa  60.1  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0355  hypothetical protein  36.27 
 
 
124 aa  60.1  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0465  hypothetical protein  33.33 
 
 
113 aa  60.5  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1792  hypothetical protein  41.11 
 
 
160 aa  60.8  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1723  hypothetical protein  41.76 
 
 
123 aa  60.8  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.471951 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1509  hypothetical protein  33.77 
 
 
133 aa  60.1  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2007  hypothetical protein  41.49 
 
 
124 aa  60.1  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.63182  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23670  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  42.86 
 
 
127 aa  59.7  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.183487  normal  0.0867152 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1406  protein of unknown function UPF0102  40 
 
 
114 aa  59.3  0.00000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1291  protein of unknown function UPF0102  33.33 
 
 
115 aa  59.3  0.00000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000677509  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3424  hypothetical protein  36.05 
 
 
125 aa  58.9  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57490  hypothetical protein  42.42 
 
 
125 aa  58.5  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0546  hypothetical protein  39.47 
 
 
115 aa  58.5  0.00000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.672576  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2488  protein of unknown function UPF0102  40.66 
 
 
123 aa  57.8  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0776001  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0988  hypothetical protein  47.22 
 
 
120 aa  57.4  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.659164 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5877  protein of unknown function UPF0102  33.33 
 
 
117 aa  57.4  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.662779 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1447  protein of unknown function UPF0102  39.29 
 
 
127 aa  57.8  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2398  hypothetical protein  40.79 
 
 
118 aa  57.4  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.430013  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3756  hypothetical protein  40.26 
 
 
127 aa  57  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00341379  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3440  protein of unknown function UPF0102  43.06 
 
 
150 aa  55.8  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.745172  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0910  hypothetical protein  39.13 
 
 
119 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.21322  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0700  protein of unknown function UPF0102  37.04 
 
 
172 aa  55.8  0.0000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000202877  hitchhiker  0.000000354886 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0701  hypothetical protein  34.12 
 
 
122 aa  55.8  0.0000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4524  hypothetical protein  37.5 
 
 
123 aa  55.8  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2035  hypothetical protein  38.46 
 
 
122 aa  55.8  0.0000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.848509  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3709  protein of unknown function UPF0102  36.36 
 
 
119 aa  55.5  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0932  hypothetical protein  38.36 
 
 
123 aa  55.5  0.0000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0629  hypothetical protein  32.56 
 
 
122 aa  55.5  0.0000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3985  hypothetical protein  36.46 
 
 
143 aa  55.5  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.889068  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3693  hypothetical protein  34.09 
 
 
108 aa  55.5  0.0000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.678912  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2298  hypothetical protein  39.19 
 
 
123 aa  55.1  0.0000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0758  hypothetical protein  40.26 
 
 
130 aa  55.1  0.0000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>