293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3298 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3298  hypothetical protein  100 
 
 
124 aa  255  2e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.861672  normal  0.570212 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0315  protein of unknown function UPF0102  43.36 
 
 
121 aa  88.6  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000225244 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0142  conserved hypothetical protein TIGR00252  43.36 
 
 
121 aa  88.6  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0460  protein of unknown function UPF0102  42.59 
 
 
153 aa  85.5  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3756  hypothetical protein  39.5 
 
 
127 aa  83.6  7e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00341379  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1156  hypothetical protein  46.15 
 
 
118 aa  82.4  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0160558  normal  0.0576877 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2864  hypothetical protein  36.36 
 
 
122 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00415914  hitchhiker  0.000000500394 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0017  hypothetical protein  41.35 
 
 
126 aa  79  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00052241  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0695  hypothetical protein  43.88 
 
 
108 aa  78.2  0.00000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000229548  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0671  hypothetical protein  43.88 
 
 
108 aa  78.2  0.00000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000156143  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1272  protein of unknown function UPF0102  41.9 
 
 
125 aa  77.8  0.00000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57490  hypothetical protein  40 
 
 
125 aa  77.4  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0932  hypothetical protein  41.84 
 
 
123 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2398  hypothetical protein  35.9 
 
 
118 aa  76.6  0.00000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.430013  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2488  protein of unknown function UPF0102  37.82 
 
 
123 aa  76.6  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0776001  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2035  hypothetical protein  38.18 
 
 
122 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.848509  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1792  hypothetical protein  38.94 
 
 
160 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4996  hypothetical protein  42.11 
 
 
125 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.608406  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4524  hypothetical protein  40.82 
 
 
123 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0675  protein of unknown function UPF0102  34.17 
 
 
165 aa  75.1  0.0000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2217  hypothetical protein  38.98 
 
 
123 aa  74.7  0.0000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000089571  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0910  hypothetical protein  36.89 
 
 
119 aa  73.9  0.0000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.21322  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4114  hypothetical protein  35.92 
 
 
123 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1406  protein of unknown function UPF0102  40.82 
 
 
114 aa  72.8  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2283  hypothetical protein  38.26 
 
 
113 aa  72.8  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.567685 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2298  hypothetical protein  37.72 
 
 
123 aa  72.4  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0993  protein of unknown function UPF0102  37.19 
 
 
129 aa  72.8  0.000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00109853  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1703  hypothetical protein  33.33 
 
 
123 aa  72.4  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1992  hypothetical protein  36.44 
 
 
129 aa  72  0.000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2103  hypothetical protein  37.07 
 
 
121 aa  72.4  0.000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.374615  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1324  hypothetical protein  39.22 
 
 
124 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.294844  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4400  hypothetical protein  39.22 
 
 
123 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.147019 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1530  hypothetical protein  28.57 
 
 
118 aa  71.6  0.000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0048655  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0400  hypothetical protein  40 
 
 
131 aa  70.9  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0195  hypothetical protein  36.07 
 
 
119 aa  70.5  0.000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.227376  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3485  hypothetical protein  38.14 
 
 
125 aa  70.5  0.000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000340579 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13130  hypothetical protein  36.63 
 
 
120 aa  70.5  0.000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09830  conserved hypothetical protein TIGR00252  39.18 
 
 
125 aa  70.1  0.000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.351272  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0650  hypothetical protein  34.45 
 
 
128 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1212  protein of unknown function UPF0102  33.33 
 
 
121 aa  69.7  0.00000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4420  hypothetical protein  35 
 
 
128 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.149236  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3586  hypothetical protein  44.66 
 
 
118 aa  70.1  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0977  hypothetical protein  32.79 
 
 
119 aa  68.9  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.320606  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3424  hypothetical protein  37.29 
 
 
125 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0676  hypothetical protein  42.31 
 
 
167 aa  68.6  0.00000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0552943  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1291  protein of unknown function UPF0102  32.2 
 
 
115 aa  67.8  0.00000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000677509  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4685  hypothetical protein  36.84 
 
 
120 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0484178 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0420  hypothetical protein  40 
 
 
128 aa  67.8  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0112  hypothetical protein  31.45 
 
 
122 aa  68.2  0.00000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0017  hypothetical protein  36.36 
 
 
128 aa  67.8  0.00000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000457371  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1959  hypothetical protein  33.33 
 
 
122 aa  67.8  0.00000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.142549  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1407  protein of unknown function UPF0102  34.95 
 
 
122 aa  67.8  0.00000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.993674  normal  0.0549137 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3311  protein of unknown function UPF0102  39.78 
 
 
134 aa  67.4  0.00000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0355  hypothetical protein  33.9 
 
 
124 aa  67.4  0.00000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3998  protein of unknown function UPF0102  41.84 
 
 
139 aa  67  0.00000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0181  hypothetical protein  38.83 
 
 
136 aa  66.6  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.973166  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1475  endonuclease  34.58 
 
 
115 aa  66.2  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.733308  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1186  hypothetical protein  35.54 
 
 
140 aa  66.2  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00400032  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0016  hypothetical protein  34.95 
 
 
129 aa  66.6  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.197298  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0503  hypothetical protein  35.51 
 
 
120 aa  65.9  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.451178 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1695  hypothetical protein  33.88 
 
 
120 aa  65.9  0.0000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0720  hypothetical protein  31.5 
 
 
126 aa  65.9  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0341617  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00890  hypothetical protein  33.96 
 
 
122 aa  65.1  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0037  hypothetical protein  34.43 
 
 
127 aa  65.1  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2213  protein of unknown function UPF0102  38.38 
 
 
118 aa  65.1  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.19652 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2202  hypothetical protein  41.67 
 
 
121 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.474644  normal  0.174288 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0116  hypothetical protein  38.54 
 
 
118 aa  64.7  0.0000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.185512 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0320  hypothetical protein  37.27 
 
 
135 aa  64.7  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0589  hypothetical protein  36.52 
 
 
131 aa  64.3  0.0000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.424556  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3675  protein of unknown function UPF0102  38.83 
 
 
122 aa  64.7  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.344366 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1093  endonuclease-like  40 
 
 
202 aa  63.9  0.0000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1677  hypothetical protein  31.67 
 
 
122 aa  64.3  0.0000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.238653  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0325  hypothetical protein  38.83 
 
 
130 aa  64.3  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.493012  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0231  protein of unknown function UPF0102  37.76 
 
 
121 aa  63.9  0.0000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.819406  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1550  hypothetical protein  35.48 
 
 
132 aa  63.9  0.0000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.176091 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2095  protein of unknown function UPF0102  35.35 
 
 
137 aa  63.5  0.0000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09240  Holliday junction resolvase-like endonuclease  42.86 
 
 
139 aa  63.5  0.0000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0928499  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0666  hypothetical protein  36.27 
 
 
116 aa  63.2  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0397911  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0189  protein of unknown function UPF0102  35.4 
 
 
127 aa  63.2  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.452343  normal  0.48907 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0701  hypothetical protein  32.76 
 
 
122 aa  63.2  0.000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1413  hypothetical protein  34.09 
 
 
112 aa  63.2  0.000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0144  hypothetical protein  34.34 
 
 
112 aa  62.8  0.000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004502  endonuclease  31.13 
 
 
122 aa  62.8  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000161677  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0146  hypothetical protein  37.5 
 
 
135 aa  62.4  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1985  hypothetical protein  42.53 
 
 
135 aa  62  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0318406  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2031  hypothetical protein  42.53 
 
 
135 aa  62  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.474175  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0546  hypothetical protein  35.4 
 
 
115 aa  62  0.000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.672576  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0163  hypothetical protein  33.33 
 
 
112 aa  62.4  0.000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12912  hypothetical protein  40.59 
 
 
141 aa  62  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0199208  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2193  hypothetical protein  43.84 
 
 
207 aa  62.8  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1725  normal  0.994481 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0184  hypothetical protein  34.34 
 
 
112 aa  62.8  0.000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.805797  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10070  conserved hypothetical protein TIGR00252  40.51 
 
 
153 aa  62  0.000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0294595  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3413  protein of unknown function UPF0102  37.84 
 
 
124 aa  62  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04380  hypothetical protein  34.82 
 
 
122 aa  61.6  0.000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5877  protein of unknown function UPF0102  34.21 
 
 
117 aa  62  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.662779 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0758  hypothetical protein  36.13 
 
 
130 aa  62  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0988  hypothetical protein  36.13 
 
 
120 aa  61.2  0.000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.659164 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1447  protein of unknown function UPF0102  32.8 
 
 
127 aa  60.8  0.000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2007  hypothetical protein  35.05 
 
 
124 aa  61.2  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.63182  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1406  protein of unknown function UPF0102  38.54 
 
 
173 aa  60.8  0.000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000418677  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>