280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_1212 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_1212  protein of unknown function UPF0102  100 
 
 
121 aa  239  7e-63  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0675  protein of unknown function UPF0102  37.4 
 
 
165 aa  85.5  2e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0932  hypothetical protein  35 
 
 
123 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2283  hypothetical protein  41.18 
 
 
113 aa  78.2  0.00000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.567685 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4400  hypothetical protein  35.83 
 
 
123 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.147019 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00890  hypothetical protein  40.52 
 
 
122 aa  77.4  0.00000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4524  hypothetical protein  35.83 
 
 
123 aa  77  0.00000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13130  hypothetical protein  36.97 
 
 
120 aa  76.6  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0756  hypothetical protein  48.24 
 
 
118 aa  76.3  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.477778  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004502  endonuclease  40.52 
 
 
122 aa  76.3  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000161677  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1324  hypothetical protein  35.83 
 
 
124 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.294844  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0355  hypothetical protein  38.05 
 
 
124 aa  75.9  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4685  hypothetical protein  35.25 
 
 
120 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0484178 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4114  hypothetical protein  37.25 
 
 
123 aa  73.9  0.0000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0313  hypothetical protein  38.1 
 
 
118 aa  73.9  0.0000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.674161  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4433  hypothetical protein  35.09 
 
 
129 aa  73.6  0.0000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.875795  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3756  hypothetical protein  36.67 
 
 
127 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00341379  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0259  hypothetical protein  37.72 
 
 
120 aa  72.8  0.000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1934  hypothetical protein  37.72 
 
 
120 aa  72.8  0.000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.547856  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0474  hypothetical protein  39.42 
 
 
117 aa  72  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57490  hypothetical protein  33.04 
 
 
125 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4996  hypothetical protein  32.23 
 
 
125 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.608406  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0538  hypothetical protein  39.42 
 
 
117 aa  72  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.670141  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1121  hypothetical protein  39.42 
 
 
117 aa  72  0.000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0307  hypothetical protein  36.19 
 
 
118 aa  71.2  0.000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.432671  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3766  hypothetical protein  38.94 
 
 
122 aa  71.2  0.000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.969308  normal  0.0430921 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4337  hypothetical protein  35.83 
 
 
117 aa  70.9  0.000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.977576  normal  0.214034 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0910  hypothetical protein  33.33 
 
 
119 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.21322  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0503  hypothetical protein  41 
 
 
120 aa  70.5  0.000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.451178 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1530  hypothetical protein  40.86 
 
 
118 aa  70.5  0.000000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0048655  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0650  hypothetical protein  34.75 
 
 
128 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4420  hypothetical protein  35.58 
 
 
128 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.149236  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3783  hypothetical protein  37.14 
 
 
118 aa  70.1  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00882109  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3463  hypothetical protein  37.82 
 
 
125 aa  69.7  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1677  hypothetical protein  40 
 
 
122 aa  69.7  0.00000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.238653  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3298  hypothetical protein  33.33 
 
 
124 aa  69.7  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.861672  normal  0.570212 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0184  hypothetical protein  36.54 
 
 
123 aa  68.9  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3560  hypothetical protein  35.59 
 
 
131 aa  68.6  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3452  hypothetical protein  35.59 
 
 
131 aa  69.3  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1674  hypothetical protein  34.43 
 
 
121 aa  69.3  0.00000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3523  hypothetical protein  35.59 
 
 
131 aa  68.6  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.578592  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3135  hypothetical protein  37.82 
 
 
125 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3620  hypothetical protein  35.59 
 
 
131 aa  68.6  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1748  hypothetical protein  34.43 
 
 
121 aa  69.3  0.00000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3454  hypothetical protein  35.59 
 
 
131 aa  68.6  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2103  hypothetical protein  35.83 
 
 
121 aa  69.3  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.374615  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1703  hypothetical protein  45.24 
 
 
123 aa  68.2  0.00000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0589  hypothetical protein  31.67 
 
 
131 aa  68.6  0.00000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.424556  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1959  hypothetical protein  38.33 
 
 
122 aa  68.2  0.00000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.142549  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3740  protein of unknown function UPF0102  38.55 
 
 
121 aa  67.8  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000086697  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2864  hypothetical protein  39.53 
 
 
122 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00415914  hitchhiker  0.000000500394 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1447  protein of unknown function UPF0102  38.28 
 
 
127 aa  67.8  0.00000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0630  hypothetical protein  34.78 
 
 
144 aa  67.4  0.00000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1062  hypothetical protein  33.91 
 
 
138 aa  67.4  0.00000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.340253 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1291  protein of unknown function UPF0102  33.88 
 
 
115 aa  67.4  0.00000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000677509  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1176  hypothetical protein  40.82 
 
 
122 aa  67  0.00000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.108145 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0226  hypothetical protein  38.79 
 
 
114 aa  67  0.00000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.113401  normal  0.113585 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1228  hypothetical protein  37.93 
 
 
119 aa  67  0.00000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.74821  normal  0.260342 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3625  hypothetical protein  38.3 
 
 
113 aa  66.2  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3585  hypothetical protein  40 
 
 
131 aa  66.6  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.186326 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4818  protein of unknown function UPF0102  34.48 
 
 
123 aa  66.2  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2202  hypothetical protein  38.38 
 
 
121 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.474644  normal  0.174288 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03015  hypothetical protein  34.19 
 
 
131 aa  65.5  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0557  protein of unknown function UPF0102  34.19 
 
 
131 aa  65.5  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0299  hypothetical protein  37.72 
 
 
108 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3624  hypothetical protein  35.04 
 
 
131 aa  65.5  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2035  hypothetical protein  35.64 
 
 
122 aa  65.5  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.848509  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0550  hypothetical protein  34.19 
 
 
131 aa  65.5  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1175  protein of unknown function UPF0102  36.19 
 
 
122 aa  66.2  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3443  hypothetical protein  35.04 
 
 
131 aa  66.2  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0993  protein of unknown function UPF0102  34.88 
 
 
129 aa  65.5  0.0000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00109853  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1792  hypothetical protein  35.71 
 
 
160 aa  65.9  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0707  hypothetical protein  33.62 
 
 
121 aa  65.5  0.0000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02966  hypothetical protein  34.19 
 
 
131 aa  65.5  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3630  hypothetical protein  35.04 
 
 
131 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1985  hypothetical protein  40 
 
 
135 aa  65.5  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0318406  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4467  hypothetical protein  35.04 
 
 
131 aa  65.5  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2031  hypothetical protein  40 
 
 
135 aa  65.5  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.474175  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3485  hypothetical protein  34.43 
 
 
125 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000340579 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0315  protein of unknown function UPF0102  35.85 
 
 
121 aa  64.7  0.0000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000225244 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0666  hypothetical protein  38.64 
 
 
116 aa  64.7  0.0000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0397911  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2398  hypothetical protein  34.75 
 
 
118 aa  64.7  0.0000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.430013  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0142  conserved hypothetical protein TIGR00252  35.85 
 
 
121 aa  64.7  0.0000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1639  hypothetical protein  40.18 
 
 
136 aa  64.7  0.0000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.106195 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1550  hypothetical protein  35.96 
 
 
132 aa  64.3  0.0000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.176091 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1965  hypothetical protein  38.82 
 
 
135 aa  63.9  0.0000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.52969 
 
 
-
 
NC_002936  DET0781  hypothetical protein  32.48 
 
 
121 aa  63.9  0.0000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3873  hypothetical protein  37.86 
 
 
128 aa  63.9  0.0000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4252  hypothetical protein  36.73 
 
 
117 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000137469 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_687  endonuclease  33.04 
 
 
121 aa  63.5  0.0000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1478  protein of unknown function UPF0102  35.23 
 
 
118 aa  63.2  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.10043  normal  0.036198 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2655  hypothetical protein  33.33 
 
 
123 aa  62.8  0.000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2217  hypothetical protein  37.36 
 
 
123 aa  63.5  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000089571  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0460  protein of unknown function UPF0102  42.7 
 
 
153 aa  63.2  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0676  hypothetical protein  35.63 
 
 
167 aa  62.8  0.000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0552943  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3424  hypothetical protein  33.61 
 
 
125 aa  63.2  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1406  protein of unknown function UPF0102  37.11 
 
 
114 aa  62.8  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3355  hypothetical protein  37.17 
 
 
108 aa  63.2  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03356  Sigma-54 factor  40 
 
 
113 aa  63.2  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0720  hypothetical protein  30.4 
 
 
126 aa  62.8  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0341617  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>