286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0781 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0781  hypothetical protein  100 
 
 		 121 aa  246  6e-65  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_687  endonuclease  92.56 
 
 		 121 aa  233  7e-61  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0707  hypothetical protein  85.95 
 
 		 121 aa  216  1e-55  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2230  protein of unknown function UPF0102  41.74 
 
 		 127 aa  90.9  6e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0169041  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1530  hypothetical protein  37.61 
 
 		 118 aa  88.2  3e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0048655  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0977  hypothetical protein  38.46 
 
 		 119 aa  87  7e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.320606  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0145  hypothetical protein  38.79 
 
 		 124 aa  87  7e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0280805  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0650  hypothetical protein  36.44 
 
 		 128 aa  85.9  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57490  hypothetical protein  38.79 
 
 		 125 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07400  hypothetical protein  36.28 
 
 		 116 aa  85.1  3e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0016  hypothetical protein  44.12 
 
 		 129 aa  84.7  4e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.197298  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2217  hypothetical protein  33.9 
 
 		 123 aa  84.3  5e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000089571  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1447  protein of unknown function UPF0102  36.36 
 
 		 127 aa  84  7e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1406  protein of unknown function UPF0102  41.59 
 
 		 114 aa  82.8  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4996  hypothetical protein  37.93 
 
 		 125 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.608406  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2474  hypothetical protein  41.82 
 
 		 118 aa  82.8  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0253334  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2007  hypothetical protein  39.84 
 
 		 124 aa  81.3  0.000000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.63182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3424  hypothetical protein  36.04 
 
 		 125 aa  80.9  0.000000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3485  hypothetical protein  36.04 
 
 		 125 aa  80.9  0.000000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000340579 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0355  hypothetical protein  37.93 
 
 		 124 aa  79.7  0.00000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5877  protein of unknown function UPF0102  33.62 
 
 		 117 aa  79.3  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.662779 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3065  hypothetical protein  38.79 
 
 		 118 aa  78.2  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0231  protein of unknown function UPF0102  37.62 
 
 		 121 aa  78.6  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.819406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2864  hypothetical protein  35.59 
 
 		 122 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00415914  hitchhiker  0.000000500394 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0017  hypothetical protein  37.25 
 
 		 128 aa  78.2  0.00000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000457371  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2201  hypothetical protein  34.71 
 
 		 123 aa  78.6  0.00000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0037  hypothetical protein  40.43 
 
 		 127 aa  78.6  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1723  hypothetical protein  37.7 
 
 		 123 aa  77.8  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.471951 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3585  hypothetical protein  34.45 
 
 		 131 aa  77.8  0.00000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.186326 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0910  hypothetical protein  34.21 
 
 		 119 aa  77.4  0.00000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.21322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3756  hypothetical protein  35.96 
 
 		 127 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00341379  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13130  hypothetical protein  34.48 
 
 		 120 aa  76.3  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2019  protein of unknown function UPF0102  35.59 
 
 		 134 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.573307  normal  0.167847 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1959  hypothetical protein  34.86 
 
 		 122 aa  76.3  0.0000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.142549  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1218  protein of unknown function UPF0102  36.67 
 
 		 119 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.648075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0988  hypothetical protein  41.67 
 
 		 120 aa  75.5  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.659164 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3311  protein of unknown function UPF0102  35.71 
 
 		 134 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2298  hypothetical protein  37.29 
 
 		 123 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10070  conserved hypothetical protein TIGR00252  39.58 
 
 		 153 aa  75.9  0.0000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0294595  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0930  hypothetical protein  38.21 
 
 		 123 aa  75.1  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.930588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4685  hypothetical protein  33.63 
 
 		 120 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0484178 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0756  hypothetical protein  36.44 
 
 		 118 aa  74.7  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.477778  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0017  hypothetical protein  36.29 
 
 		 126 aa  74.7  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00052241  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3740  protein of unknown function UPF0102  36.04 
 
 		 121 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000086697  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1291  protein of unknown function UPF0102  33.9 
 
 		 115 aa  74.7  0.0000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000677509  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2035  hypothetical protein  36.07 
 
 		 122 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.848509  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1406  protein of unknown function UPF0102  31.48 
 
 		 173 aa  74.3  0.0000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000418677  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4420  hypothetical protein  32.35 
 
 		 128 aa  73.6  0.0000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.149236  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23670  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  38.18 
 
 		 127 aa  73.6  0.0000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.183487  normal  0.0867152 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0758  hypothetical protein  33.33 
 
 		 130 aa  73.2  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1992  hypothetical protein  34.69 
 
 		 129 aa  72.8  0.000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3985  hypothetical protein  35.09 
 
 		 143 aa  73.6  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.889068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1677  hypothetical protein  33.03 
 
 		 122 aa  73.2  0.000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.238653  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1550  hypothetical protein  41.49 
 
 		 132 aa  73.2  0.000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.176091 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2202  hypothetical protein  34.51 
 
 		 121 aa  72.8  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.474644  normal  0.174288 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0112  hypothetical protein  29.57 
 
 		 122 aa  72.4  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1228  hypothetical protein  33.61 
 
 		 119 aa  71.6  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.74821  normal  0.260342 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0675  protein of unknown function UPF0102  38.1 
 
 		 165 aa  72  0.000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3783  hypothetical protein  33.33 
 
 		 118 aa  72  0.000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00882109  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1475  endonuclease  34.51 
 
 		 115 aa  72  0.000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.733308  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1324  hypothetical protein  34.51 
 
 		 124 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.294844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4114  hypothetical protein  31.62 
 
 		 123 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2213  protein of unknown function UPF0102  37.5 
 
 		 118 aa  71.2  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.19652 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0184  hypothetical protein  36.84 
 
 		 123 aa  70.9  0.000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2095  protein of unknown function UPF0102  31.13 
 
 		 137 aa  70.9  0.000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1894  hypothetical protein  40.24 
 
 		 113 aa  70.9  0.000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.642217 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1272  protein of unknown function UPF0102  37.86 
 
 		 125 aa  70.9  0.000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4400  hypothetical protein  34.51 
 
 		 123 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.147019 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09830  conserved hypothetical protein TIGR00252  33.66 
 
 		 125 aa  70.5  0.000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.351272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2398  hypothetical protein  37.07 
 
 		 118 aa  70.5  0.000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.430013  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0142  conserved hypothetical protein TIGR00252  36.97 
 
 		 121 aa  70.5  0.000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0315  protein of unknown function UPF0102  36.97 
 
 		 121 aa  70.5  0.000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000225244 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1934  hypothetical protein  35.59 
 
 		 120 aa  70.1  0.000000000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.547856  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3919  protein of unknown function UPF0102  36.44 
 
 		 144 aa  70.1  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000143067  normal  0.216721 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3870  protein of unknown function UPF0102  36.44 
 
 		 144 aa  70.1  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2488  protein of unknown function UPF0102  32.74 
 
 		 123 aa  70.1  0.000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0776001  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0259  hypothetical protein  35.59 
 
 		 120 aa  70.1  0.000000000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2213  hypothetical protein  36.7 
 
 		 132 aa  70.1  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000124547 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4524  hypothetical protein  34.51 
 
 		 123 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0720  hypothetical protein  31.4 
 
 		 126 aa  69.7  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0341617  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1186  hypothetical protein  36.36 
 
 		 140 aa  69.7  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00400032  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04380  hypothetical protein  34.45 
 
 		 122 aa  70.1  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1093  endonuclease-like  35.24 
 
 		 202 aa  69.3  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1175  protein of unknown function UPF0102  36.75 
 
 		 122 aa  68.6  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3998  protein of unknown function UPF0102  36.79 
 
 		 139 aa  69.3  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0666  hypothetical protein  39.22 
 
 		 116 aa  68.9  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0397911  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1478  protein of unknown function UPF0102  44.29 
 
 		 118 aa  68.6  0.00000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.10043  normal  0.036198 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0503  hypothetical protein  35.45 
 
 		 120 aa  68.2  0.00000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.451178 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2532  protein of unknown function UPF0102  37.23 
 
 		 118 aa  68.2  0.00000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.388001 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0351  hypothetical protein  33.66 
 
 		 117 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0502533  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0460  protein of unknown function UPF0102  34.82 
 
 		 153 aa  67.8  0.00000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1792  hypothetical protein  32.73 
 
 		 160 aa  67.8  0.00000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3443  hypothetical protein  31.62 
 
 		 131 aa  67.4  0.00000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3004  hypothetical protein  35.16 
 
 		 95 aa  67.4  0.00000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.350262  normal  0.587814 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3046  hypothetical protein  35.16 
 
 		 95 aa  67.4  0.00000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.339629  normal  0.794955 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3463  hypothetical protein  34.19 
 
 		 125 aa  67  0.00000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0676  hypothetical protein  32.76 
 
 		 167 aa  67  0.00000000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0552943  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3248  hypothetical protein  37.76 
 
 		 124 aa  67  0.00000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.852323  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1350  protein of unknown function UPF0102  36.13 
 
 		 118 aa  67  0.00000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0557  protein of unknown function UPF0102  31.62 
 
 		 131 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>