285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1894 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1894  hypothetical protein  100 
 
 		 113 aa  224  2e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.642217 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1406  protein of unknown function UPF0102  43.12 
 
 		 114 aa  82.8  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0707  hypothetical protein  41.67 
 
 		 121 aa  82.8  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1695  hypothetical protein  41.24 
 
 		 120 aa  81.6  0.000000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0272  hypothetical protein  42.27 
 
 		 108 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000600044  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0226  hypothetical protein  43.88 
 
 		 114 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.113401  normal  0.113585 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0503  hypothetical protein  49.49 
 
 		 120 aa  80.9  0.000000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.451178 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0355  hypothetical protein  44.79 
 
 		 124 aa  79  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_687  endonuclease  41.67 
 
 		 121 aa  79.3  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0315  protein of unknown function UPF0102  46.15 
 
 		 121 aa  79.3  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000225244 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0142  conserved hypothetical protein TIGR00252  46.15 
 
 		 121 aa  79.3  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0781  hypothetical protein  39.58 
 
 		 121 aa  78.2  0.00000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0358  protein of unknown function UPF0102  43.75 
 
 		 108 aa  77.4  0.00000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.856807 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3135  hypothetical protein  50.98 
 
 		 125 aa  76.3  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1324  hypothetical protein  39.22 
 
 		 124 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.294844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2213  protein of unknown function UPF0102  44.55 
 
 		 118 aa  75.9  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.19652 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0756  hypothetical protein  46.6 
 
 		 118 aa  75.9  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.477778  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3463  hypothetical protein  50 
 
 		 125 aa  75.1  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3585  hypothetical protein  44.68 
 
 		 131 aa  74.3  0.0000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.186326 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4685  hypothetical protein  39.6 
 
 		 120 aa  74.3  0.0000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0484178 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4400  hypothetical protein  39.22 
 
 		 123 aa  74.3  0.0000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.147019 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0650  hypothetical protein  42.11 
 
 		 128 aa  73.9  0.0000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4524  hypothetical protein  39.22 
 
 		 123 aa  73.6  0.0000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0732  hypothetical protein  41.07 
 
 		 108 aa  73.2  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.821091  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3065  hypothetical protein  36.54 
 
 		 118 aa  73.6  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2019  protein of unknown function UPF0102  45 
 
 		 134 aa  72.8  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.573307  normal  0.167847 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3053  protein of unknown function UPF0102  40.4 
 
 		 111 aa  73.2  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4420  hypothetical protein  37.27 
 
 		 128 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.149236  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0666  hypothetical protein  46.32 
 
 		 116 aa  72  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0397911  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3452  hypothetical protein  45.74 
 
 		 131 aa  72.4  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3523  hypothetical protein  45.74 
 
 		 131 aa  71.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.578592  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3560  hypothetical protein  45.74 
 
 		 131 aa  71.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3881  hypothetical protein  39.58 
 
 		 108 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.114446 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3620  hypothetical protein  45.74 
 
 		 131 aa  71.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3454  hypothetical protein  45.74 
 
 		 131 aa  71.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0299  hypothetical protein  38.54 
 
 		 108 aa  71.6  0.000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0388  hypothetical protein  39.58 
 
 		 108 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.597532  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0993  protein of unknown function UPF0102  38.46 
 
 		 129 aa  71.2  0.000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00109853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0546  hypothetical protein  33.33 
 
 		 115 aa  70.9  0.000000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.672576  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1291  protein of unknown function UPF0102  37.11 
 
 		 115 aa  70.5  0.000000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000677509  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1407  protein of unknown function UPF0102  43 
 
 		 122 aa  70.5  0.000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.993674  normal  0.0549137 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3355  hypothetical protein  43.3 
 
 		 108 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4188  hypothetical protein  37.11 
 
 		 108 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3990  hypothetical protein  37.11 
 
 		 108 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4070  hypothetical protein  37.11 
 
 		 108 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4100  hypothetical protein  37.11 
 
 		 108 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2103  hypothetical protein  43.43 
 
 		 121 aa  70.1  0.000000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.374615  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0231  protein of unknown function UPF0102  50 
 
 		 121 aa  70.1  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.819406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3693  hypothetical protein  40.21 
 
 		 108 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.678912  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13130  hypothetical protein  41.24 
 
 		 120 aa  69.7  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0260  hypothetical protein  38.54 
 
 		 108 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3783  hypothetical protein  42.57 
 
 		 118 aa  69.7  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00882109  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3625  hypothetical protein  42.42 
 
 		 113 aa  70.1  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4114  hypothetical protein  37.96 
 
 		 123 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0195  hypothetical protein  42.72 
 
 		 119 aa  69.3  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.227376  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0932  hypothetical protein  38.24 
 
 		 123 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3685  hypothetical protein  37.5 
 
 		 108 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1475  endonuclease  42.31 
 
 		 115 aa  68.9  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.733308  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2488  protein of unknown function UPF0102  43.88 
 
 		 123 aa  68.9  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0776001  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1934  hypothetical protein  36.63 
 
 		 120 aa  68.2  0.00000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.547856  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0259  hypothetical protein  36.63 
 
 		 120 aa  68.2  0.00000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1550  hypothetical protein  48.15 
 
 		 132 aa  68.6  0.00000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.176091 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2202  hypothetical protein  40 
 
 		 121 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.474644  normal  0.174288 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2201  hypothetical protein  43.88 
 
 		 123 aa  67.8  0.00000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3694  hypothetical protein  43.04 
 
 		 114 aa  67.8  0.00000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4433  hypothetical protein  32.73 
 
 		 129 aa  67.8  0.00000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.875795  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03356  Sigma-54 factor  36.63 
 
 		 113 aa  67.8  0.00000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0391  hypothetical protein  42.37 
 
 		 149 aa  67.8  0.00000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0487377 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0460  protein of unknown function UPF0102  40.21 
 
 		 153 aa  67.8  0.00000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1175  protein of unknown function UPF0102  42.31 
 
 		 122 aa  67.8  0.00000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04380  hypothetical protein  43.43 
 
 		 122 aa  67  0.00000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3265  hypothetical protein  48.42 
 
 		 130 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3900  hypothetical protein  44.9 
 
 		 144 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2283  hypothetical protein  43.16 
 
 		 113 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.567685 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1156  hypothetical protein  42.05 
 
 		 118 aa  66.2  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0160558  normal  0.0576877 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2398  hypothetical protein  36.08 
 
 		 118 aa  66.2  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.430013  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0017  hypothetical protein  40 
 
 		 128 aa  66.6  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000457371  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03015  hypothetical protein  40.43 
 
 		 131 aa  65.5  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0557  protein of unknown function UPF0102  40.43 
 
 		 131 aa  65.5  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3819  hypothetical protein  44.9 
 
 		 144 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.213422  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2801  hypothetical protein  44.9 
 
 		 160 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.135805  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0041  hypothetical protein  44.9 
 
 		 160 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0550  hypothetical protein  40.43 
 
 		 131 aa  65.5  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1992  hypothetical protein  37.5 
 
 		 129 aa  66.2  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3176  hypothetical protein  44.9 
 
 		 144 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0197  hypothetical protein  44.33 
 
 		 137 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.404878  unclonable  0.00000000000559374 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4140  hypothetical protein  43.3 
 
 		 123 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0320  hypothetical protein  42.11 
 
 		 135 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02966  hypothetical protein  40.43 
 
 		 131 aa  65.5  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3443  hypothetical protein  41.49 
 
 		 131 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0313  hypothetical protein  40 
 
 		 118 aa  65.9  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.674161  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0675  protein of unknown function UPF0102  37.5 
 
 		 165 aa  66.2  0.0000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4337  hypothetical protein  42.42 
 
 		 117 aa  65.9  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.977576  normal  0.214034 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0024  hypothetical protein  44.9 
 
 		 144 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.308699  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1742  hypothetical protein  44.9 
 
 		 144 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2532  protein of unknown function UPF0102  54.84 
 
 		 118 aa  65.1  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.388001 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3004  hypothetical protein  43.02 
 
 		 95 aa  65.5  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.350262  normal  0.587814 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3046  hypothetical protein  43.02 
 
 		 95 aa  65.5  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.339629  normal  0.794955 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3248  hypothetical protein  48.72 
 
 		 124 aa  65.1  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.852323  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3630  hypothetical protein  40.82 
 
 		 131 aa  65.5  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>