228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_0358 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_0358  protein of unknown function UPF0102  100 
 
 
108 aa  219  9.999999999999999e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.856807 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0732  hypothetical protein  75.93 
 
 
108 aa  169  7.999999999999999e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.821091  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1475  endonuclease  49.35 
 
 
115 aa  71.6  0.000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.733308  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3248  hypothetical protein  45.71 
 
 
124 aa  67.4  0.00000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.852323  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2095  protein of unknown function UPF0102  39.39 
 
 
137 aa  67.4  0.00000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3355  hypothetical protein  38.54 
 
 
108 aa  67  0.00000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0546  hypothetical protein  32.73 
 
 
115 aa  66.6  0.0000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.672576  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1894  hypothetical protein  43.75 
 
 
113 aa  66.2  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.642217 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3881  hypothetical protein  36.56 
 
 
108 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.114446 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0992  hypothetical protein  47.06 
 
 
117 aa  66.2  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.528214  normal  0.0951104 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1228  hypothetical protein  36.94 
 
 
119 aa  66.6  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.74821  normal  0.260342 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3685  hypothetical protein  36.56 
 
 
108 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0388  hypothetical protein  41.25 
 
 
108 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.597532  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3693  hypothetical protein  37.5 
 
 
108 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.678912  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1478  protein of unknown function UPF0102  44.44 
 
 
118 aa  65.9  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.10043  normal  0.036198 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03356  Sigma-54 factor  43.75 
 
 
113 aa  65.5  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0299  hypothetical protein  35.48 
 
 
108 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0260  hypothetical protein  36.56 
 
 
108 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1320  hypothetical protein  35.78 
 
 
121 aa  65.1  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1291  protein of unknown function UPF0102  34.02 
 
 
115 aa  65.1  0.0000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000677509  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1639  protein of unknown function UPF0102  38.18 
 
 
110 aa  64.3  0.0000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1550  hypothetical protein  45.45 
 
 
132 aa  63.2  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.176091 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0460  protein of unknown function UPF0102  37.37 
 
 
153 aa  62.4  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3990  hypothetical protein  37.36 
 
 
108 aa  62  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4188  hypothetical protein  37.36 
 
 
108 aa  62  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1175  protein of unknown function UPF0102  48.57 
 
 
122 aa  62.8  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4100  hypothetical protein  37.36 
 
 
108 aa  62  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0707  hypothetical protein  33.98 
 
 
121 aa  62.8  0.000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0666  hypothetical protein  37.96 
 
 
116 aa  62.4  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0397911  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4070  hypothetical protein  37.36 
 
 
108 aa  62  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0195  hypothetical protein  38.61 
 
 
119 aa  62  0.000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.227376  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2283  hypothetical protein  35.87 
 
 
113 aa  62  0.000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.567685 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0272  hypothetical protein  39.02 
 
 
108 aa  61.2  0.000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000600044  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4140  hypothetical protein  41.28 
 
 
123 aa  61.6  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004502  endonuclease  44.93 
 
 
122 aa  61.2  0.000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000161677  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1407  protein of unknown function UPF0102  45.71 
 
 
122 aa  61.6  0.000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.993674  normal  0.0549137 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2298  hypothetical protein  33.33 
 
 
123 aa  61.2  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0720  hypothetical protein  36.84 
 
 
126 aa  60.8  0.000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0341617  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0676  hypothetical protein  41.07 
 
 
167 aa  61.2  0.000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0552943  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2202  hypothetical protein  45.71 
 
 
121 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.474644  normal  0.174288 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0231  protein of unknown function UPF0102  44.29 
 
 
121 aa  61.2  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.819406  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00890  hypothetical protein  44.93 
 
 
122 aa  60.8  0.000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0251  hypothetical protein  35.11 
 
 
112 aa  60.8  0.000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4433  hypothetical protein  35.8 
 
 
129 aa  60.5  0.000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.875795  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02085  hypothetical protein  32.08 
 
 
119 aa  60.5  0.000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.997348  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2019  protein of unknown function UPF0102  34.95 
 
 
134 aa  60.5  0.000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.573307  normal  0.167847 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07400  hypothetical protein  30.84 
 
 
116 aa  60.5  0.000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0355  hypothetical protein  41.25 
 
 
124 aa  59.7  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0226  hypothetical protein  35.71 
 
 
114 aa  60.1  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.113401  normal  0.113585 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1985  hypothetical protein  40.37 
 
 
135 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0318406  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4252  hypothetical protein  31.18 
 
 
117 aa  58.9  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000137469 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3413  protein of unknown function UPF0102  36.7 
 
 
124 aa  59.3  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2031  hypothetical protein  40.37 
 
 
135 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.474175  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1965  hypothetical protein  39.45 
 
 
135 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.52969 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1836  hypothetical protein  44.29 
 
 
117 aa  58.9  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0316841 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2655  hypothetical protein  33.01 
 
 
123 aa  59.3  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1703  hypothetical protein  33.64 
 
 
123 aa  58.5  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0351  hypothetical protein  31.18 
 
 
117 aa  58.5  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0502533  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3485  hypothetical protein  31.48 
 
 
125 aa  58.2  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000340579 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1934  hypothetical protein  32 
 
 
120 aa  57.8  0.00000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.547856  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0259  hypothetical protein  32 
 
 
120 aa  57.8  0.00000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3065  hypothetical protein  32.35 
 
 
118 aa  57.8  0.00000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10070  conserved hypothetical protein TIGR00252  40.21 
 
 
153 aa  57.4  0.00000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0294595  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2201  hypothetical protein  32.71 
 
 
123 aa  57.4  0.00000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3694  hypothetical protein  39.24 
 
 
114 aa  57.4  0.00000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1176  hypothetical protein  32.98 
 
 
122 aa  57.4  0.00000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.108145 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5917  protein of unknown function UPF0102  38.74 
 
 
117 aa  57  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00245822  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0756  hypothetical protein  39.8 
 
 
118 aa  57  0.00000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.477778  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1992  hypothetical protein  44.16 
 
 
129 aa  57  0.00000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0650  hypothetical protein  34.58 
 
 
128 aa  56.6  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0993  protein of unknown function UPF0102  34.19 
 
 
129 aa  56.2  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00109853  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3424  hypothetical protein  31.48 
 
 
125 aa  56.6  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2217  hypothetical protein  34.91 
 
 
123 aa  56.2  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000089571  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1121  hypothetical protein  36.36 
 
 
117 aa  56.2  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1677  hypothetical protein  35.9 
 
 
122 aa  56.6  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.238653  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1406  protein of unknown function UPF0102  36.79 
 
 
173 aa  56.6  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000418677  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2532  protein of unknown function UPF0102  48.39 
 
 
118 aa  56.2  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.388001 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0538  hypothetical protein  36.36 
 
 
117 aa  56.2  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.670141  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0474  hypothetical protein  36.36 
 
 
117 aa  56.2  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1530  hypothetical protein  32.86 
 
 
118 aa  55.8  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0048655  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0503  hypothetical protein  36.84 
 
 
120 aa  55.8  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.451178 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2213  protein of unknown function UPF0102  39.8 
 
 
118 aa  55.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.19652 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2864  hypothetical protein  33.02 
 
 
122 aa  56.2  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00415914  hitchhiker  0.000000500394 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1406  protein of unknown function UPF0102  32.41 
 
 
114 aa  55.8  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0391  hypothetical protein  35.96 
 
 
149 aa  56.2  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0487377 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1959  hypothetical protein  34.62 
 
 
122 aa  55.8  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.142549  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3998  protein of unknown function UPF0102  42.25 
 
 
139 aa  55.8  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2474  hypothetical protein  38.94 
 
 
118 aa  55.5  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0253334  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1217  hypothetical protein  32.11 
 
 
123 aa  55.5  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.266389  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4996  hypothetical protein  41.98 
 
 
125 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.608406  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5877  protein of unknown function UPF0102  35.51 
 
 
117 aa  55.1  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.662779 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3756  hypothetical protein  30.63 
 
 
127 aa  55.1  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00341379  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_687  endonuclease  40.32 
 
 
121 aa  54.7  0.0000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1218  protein of unknown function UPF0102  28.7 
 
 
119 aa  54.7  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.648075  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3311  protein of unknown function UPF0102  40.74 
 
 
134 aa  54.3  0.0000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13130  hypothetical protein  42.86 
 
 
120 aa  54.3  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2025  hypothetical protein  28.3 
 
 
119 aa  54.7  0.0000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3452  hypothetical protein  35.71 
 
 
131 aa  53.9  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12912  hypothetical protein  37.62 
 
 
141 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0199208  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1272  protein of unknown function UPF0102  37.5 
 
 
125 aa  53.9  0.0000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>