232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5917 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5917  protein of unknown function UPF0102  100 
 
 		 117 aa  228  3e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00245822  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09830  conserved hypothetical protein TIGR00252  53.64 
 
 		 125 aa  113  6.9999999999999995e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.351272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1550  hypothetical protein  46.03 
 
 		 132 aa  100  8e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.176091 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0992  hypothetical protein  48.72 
 
 		 117 aa  97.8  4e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.528214  normal  0.0951104 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3413  protein of unknown function UPF0102  46.22 
 
 		 124 aa  97.4  6e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3123  protein of unknown function UPF0102  46.55 
 
 		 121 aa  97.1  7e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0308676  normal  0.107591 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3248  hypothetical protein  46.49 
 
 		 124 aa  96.3  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.852323  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2474  hypothetical protein  45.3 
 
 		 118 aa  95.1  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0253334  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1407  protein of unknown function UPF0102  49.15 
 
 		 122 aa  95.9  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.993674  normal  0.0549137 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0669  hypothetical protein  49.11 
 
 		 124 aa  95.1  3e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1836  hypothetical protein  49.57 
 
 		 117 aa  95.1  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0316841 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1156  hypothetical protein  44.83 
 
 		 118 aa  92  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0160558  normal  0.0576877 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3586  hypothetical protein  48.28 
 
 		 118 aa  91.3  4e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2213  hypothetical protein  42.74 
 
 		 132 aa  90.9  5e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000124547 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1478  protein of unknown function UPF0102  52.87 
 
 		 118 aa  89.7  1e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.10043  normal  0.036198 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11140  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  47.27 
 
 		 120 aa  89.7  1e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0330886  normal  0.323386 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1175  protein of unknown function UPF0102  42.98 
 
 		 122 aa  88.2  4e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2095  protein of unknown function UPF0102  41.38 
 
 		 137 aa  87.8  5e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23670  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  46.28 
 
 		 127 aa  86.7  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.183487  normal  0.0867152 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0231  protein of unknown function UPF0102  45.05 
 
 		 121 aa  82.4  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.819406  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1641  protein of unknown function UPF0102  43.33 
 
 		 122 aa  82  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0797113  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2532  protein of unknown function UPF0102  48.72 
 
 		 118 aa  81.3  0.000000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.388001 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3998  protein of unknown function UPF0102  44.55 
 
 		 139 aa  80.5  0.000000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0993  protein of unknown function UPF0102  42.27 
 
 		 129 aa  77.8  0.00000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00109853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12912  hypothetical protein  39.66 
 
 		 141 aa  76.6  0.00000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0199208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2202  hypothetical protein  41.44 
 
 		 121 aa  76.3  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.474644  normal  0.174288 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1218  protein of unknown function UPF0102  34.21 
 
 		 119 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.648075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1530  hypothetical protein  31.07 
 
 		 118 aa  74.7  0.0000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0048655  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4140  hypothetical protein  46.02 
 
 		 123 aa  74.7  0.0000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1934  hypothetical protein  34.31 
 
 		 120 aa  74.3  0.0000000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.547856  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0259  hypothetical protein  34.31 
 
 		 120 aa  74.3  0.0000000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1093  endonuclease-like  43.48 
 
 		 202 aa  73.9  0.0000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09240  Holliday junction resolvase-like endonuclease  41.44 
 
 		 139 aa  73.9  0.0000000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0928499  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1406  protein of unknown function UPF0102  39.25 
 
 		 173 aa  73.9  0.0000000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000418677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3311  protein of unknown function UPF0102  39.22 
 
 		 134 aa  73.6  0.0000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1228  hypothetical protein  35.4 
 
 		 119 aa  73.2  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.74821  normal  0.260342 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10070  conserved hypothetical protein TIGR00252  38.46 
 
 		 153 aa  73.2  0.000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0294595  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2019  protein of unknown function UPF0102  40.74 
 
 		 134 aa  73.2  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.573307  normal  0.167847 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0650  hypothetical protein  36.61 
 
 		 128 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3424  hypothetical protein  35 
 
 		 125 aa  72  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2864  hypothetical protein  35.19 
 
 		 122 aa  71.6  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00415914  hitchhiker  0.000000500394 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0546  hypothetical protein  38.54 
 
 		 115 aa  71.6  0.000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.672576  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3675  protein of unknown function UPF0102  46.67 
 
 		 122 aa  71.2  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.344366 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3485  hypothetical protein  35 
 
 		 125 aa  71.6  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000340579 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2035  hypothetical protein  32.74 
 
 		 122 aa  71.2  0.000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.848509  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1985  hypothetical protein  38.05 
 
 		 135 aa  70.5  0.000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0318406  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2031  hypothetical protein  38.05 
 
 		 135 aa  70.5  0.000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.474175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1965  hypothetical protein  37.17 
 
 		 135 aa  70.1  0.000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.52969 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1447  protein of unknown function UPF0102  35.29 
 
 		 127 aa  68.9  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3694  hypothetical protein  35.05 
 
 		 114 aa  68.9  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2193  hypothetical protein  43.9 
 
 		 207 aa  68.2  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1725  normal  0.994481 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0017  hypothetical protein  36.08 
 
 		 126 aa  68.2  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00052241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0671  hypothetical protein  40.45 
 
 		 108 aa  68.6  0.00000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000156143  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0695  hypothetical protein  40.45 
 
 		 108 aa  68.6  0.00000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000229548  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0277  protein of unknown function UPF0102  31.9 
 
 		 120 aa  67.8  0.00000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.107261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1217  hypothetical protein  30.77 
 
 		 123 aa  67  0.00000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.266389  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07400  hypothetical protein  32.63 
 
 		 116 aa  67  0.00000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0666  hypothetical protein  35.96 
 
 		 116 aa  66.2  0.0000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0397911  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0351  hypothetical protein  34.29 
 
 		 117 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0502533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3881  hypothetical protein  39.58 
 
 		 108 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.114446 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4252  hypothetical protein  33.04 
 
 		 117 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000137469 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3990  hypothetical protein  37.11 
 
 		 108 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1959  hypothetical protein  26.8 
 
 		 122 aa  65.9  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.142549  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1677  hypothetical protein  27.84 
 
 		 122 aa  65.5  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.238653  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4188  hypothetical protein  37.11 
 
 		 108 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4100  hypothetical protein  37.11 
 
 		 108 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4070  hypothetical protein  37.11 
 
 		 108 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2217  hypothetical protein  40 
 
 		 123 aa  65.1  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000089571  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3709  protein of unknown function UPF0102  29.82 
 
 		 119 aa  65.1  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3004  hypothetical protein  41.46 
 
 		 95 aa  65.1  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.350262  normal  0.587814 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3046  hypothetical protein  41.46 
 
 		 95 aa  65.1  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.339629  normal  0.794955 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1186  hypothetical protein  35.78 
 
 		 140 aa  65.1  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00400032  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3693  hypothetical protein  38.14 
 
 		 108 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.678912  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1521  protein of unknown function UPF0102  37.39 
 
 		 157 aa  65.1  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0637187  normal  0.0119716 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0299  hypothetical protein  38.54 
 
 		 108 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0260  hypothetical protein  38.54 
 
 		 108 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0707  hypothetical protein  32.67 
 
 		 121 aa  64.7  0.0000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3756  hypothetical protein  30.28 
 
 		 127 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00341379  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1272  protein of unknown function UPF0102  38.55 
 
 		 125 aa  63.9  0.0000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0676  hypothetical protein  37.76 
 
 		 167 aa  63.9  0.0000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0552943  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3685  hypothetical protein  37.5 
 
 		 108 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2398  hypothetical protein  39.18 
 
 		 118 aa  63.5  0.0000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.430013  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1320  hypothetical protein  38.94 
 
 		 121 aa  63.9  0.0000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1371  protein of unknown function UPF0102  40.54 
 
 		 120 aa  63.5  0.0000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0017  hypothetical protein  32.99 
 
 		 128 aa  62.8  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000457371  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0930  hypothetical protein  39.6 
 
 		 123 aa  63.2  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.930588  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0184  hypothetical protein  36.36 
 
 		 123 aa  62.8  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2007  hypothetical protein  40.62 
 
 		 124 aa  62.4  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.63182  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1291  protein of unknown function UPF0102  31.63 
 
 		 115 aa  62.4  0.000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000677509  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0639  conserved hypothetical protein TIGR00252  31.85 
 
 		 182 aa  62  0.000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.372666 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4114  hypothetical protein  32.14 
 
 		 123 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10390  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  36.46 
 
 		 167 aa  61.6  0.000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000139118  unclonable  0.000000000910029 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0553  protein of unknown function UPF0102  39.25 
 
 		 118 aa  61.2  0.000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.156898 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0170  protein of unknown function UPF0102  31.31 
 
 		 108 aa  61.2  0.000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.633607  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2881  hypothetical protein  40.82 
 
 		 146 aa  61.2  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.696458 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13130  hypothetical protein  33.33 
 
 		 120 aa  60.8  0.000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4433  hypothetical protein  33.01 
 
 		 129 aa  60.8  0.000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.875795  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2298  hypothetical protein  32.61 
 
 		 123 aa  60.8  0.000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0700  protein of unknown function UPF0102  30.83 
 
 		 172 aa  60.8  0.000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000202877  hitchhiker  0.000000354886 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0016  hypothetical protein  38.16 
 
 		 129 aa  60.8  0.000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.197298  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>