262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_0671 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0695  hypothetical protein  100 
 
 
108 aa  220  4e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000229548  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0671  hypothetical protein  100 
 
 
108 aa  220  4e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000156143  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1509  hypothetical protein  45.79 
 
 
133 aa  96.3  1e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0184  hypothetical protein  40.86 
 
 
123 aa  78.6  0.00000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0216  hypothetical protein  38.24 
 
 
112 aa  78.2  0.00000000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3298  hypothetical protein  43.88 
 
 
124 aa  78.2  0.00000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.861672  normal  0.570212 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0144  hypothetical protein  36.54 
 
 
112 aa  77.4  0.00000000000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0163  hypothetical protein  35.58 
 
 
112 aa  77.4  0.00000000000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0184  hypothetical protein  36.54 
 
 
112 aa  77.4  0.00000000000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.805797  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1406  protein of unknown function UPF0102  42.71 
 
 
114 aa  75.5  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1143  hypothetical protein  38.46 
 
 
113 aa  74.7  0.0000000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1413  hypothetical protein  36.36 
 
 
112 aa  73.6  0.0000000000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2398  hypothetical protein  44.44 
 
 
118 aa  71.6  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.430013  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1272  protein of unknown function UPF0102  43.62 
 
 
125 aa  70.9  0.000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0017  hypothetical protein  47.37 
 
 
128 aa  71.2  0.000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000457371  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2864  hypothetical protein  43.3 
 
 
122 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00415914  hitchhiker  0.000000500394 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5917  protein of unknown function UPF0102  40.45 
 
 
117 aa  68.6  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00245822  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2019  protein of unknown function UPF0102  39.78 
 
 
134 aa  67.8  0.00000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.573307  normal  0.167847 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1475  endonuclease  47.3 
 
 
115 aa  67.4  0.00000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.733308  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0170  protein of unknown function UPF0102  38 
 
 
108 aa  67  0.00000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.633607  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3311  protein of unknown function UPF0102  40.86 
 
 
134 aa  66.2  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1992  hypothetical protein  36.08 
 
 
129 aa  66.6  0.0000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1350  protein of unknown function UPF0102  40.45 
 
 
118 aa  65.9  0.0000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2217  hypothetical protein  37.14 
 
 
123 aa  65.9  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000089571  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0016  hypothetical protein  35 
 
 
129 aa  65.5  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.197298  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0546  hypothetical protein  40.57 
 
 
115 aa  65.5  0.0000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.672576  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2095  protein of unknown function UPF0102  35.56 
 
 
137 aa  65.9  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0294  hypothetical protein  30 
 
 
112 aa  65.5  0.0000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1218  protein of unknown function UPF0102  37.38 
 
 
119 aa  65.1  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.648075  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1447  protein of unknown function UPF0102  37.61 
 
 
127 aa  64.3  0.0000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3694  hypothetical protein  38.61 
 
 
114 aa  63.9  0.0000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2474  hypothetical protein  34.86 
 
 
118 aa  64.3  0.0000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0253334  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0781  hypothetical protein  41.49 
 
 
121 aa  63.9  0.0000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1901  formate dehydrogenase H large subunit  37.62 
 
 
109 aa  63.9  0.0000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3756  hypothetical protein  38.71 
 
 
127 aa  63.9  0.0000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00341379  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3004  hypothetical protein  45.57 
 
 
95 aa  63.5  0.0000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.350262  normal  0.587814 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3046  hypothetical protein  45.57 
 
 
95 aa  63.5  0.0000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.339629  normal  0.794955 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1550  hypothetical protein  39 
 
 
132 aa  63.5  0.0000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.176091 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0666  hypothetical protein  41.3 
 
 
116 aa  63.2  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0397911  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0017  hypothetical protein  42.11 
 
 
126 aa  62.4  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00052241  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1093  endonuclease-like  38.71 
 
 
202 aa  62.4  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57490  hypothetical protein  38.38 
 
 
125 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2202  hypothetical protein  35.78 
 
 
121 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.474644  normal  0.174288 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0707  hypothetical protein  39.56 
 
 
121 aa  62.8  0.000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0460  protein of unknown function UPF0102  38.24 
 
 
153 aa  61.2  0.000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0629  hypothetical protein  36.36 
 
 
122 aa  61.6  0.000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0669  hypothetical protein  37.78 
 
 
124 aa  60.8  0.000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1985  hypothetical protein  35.48 
 
 
135 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0318406  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2031  hypothetical protein  35.48 
 
 
135 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.474175  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1965  hypothetical protein  34.68 
 
 
135 aa  60.8  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.52969 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0226  hypothetical protein  31.96 
 
 
114 aa  60.8  0.000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.113401  normal  0.113585 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0231  protein of unknown function UPF0102  38.3 
 
 
121 aa  60.8  0.000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.819406  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0993  protein of unknown function UPF0102  37.65 
 
 
129 aa  60.5  0.000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00109853  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0355  hypothetical protein  35.14 
 
 
124 aa  60.5  0.000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4252  hypothetical protein  35.79 
 
 
117 aa  60.5  0.000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000137469 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_687  endonuclease  39.36 
 
 
121 aa  60.5  0.000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1291  protein of unknown function UPF0102  42.31 
 
 
115 aa  60.5  0.000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000677509  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4996  hypothetical protein  37.37 
 
 
125 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.608406  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1406  protein of unknown function UPF0102  38.3 
 
 
173 aa  60.5  0.000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000418677  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0251  hypothetical protein  35.71 
 
 
112 aa  60.1  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12912  hypothetical protein  35.4 
 
 
141 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0199208  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0930  hypothetical protein  36.56 
 
 
123 aa  60.1  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.930588  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2201  hypothetical protein  35.87 
 
 
123 aa  59.7  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3424  hypothetical protein  40.66 
 
 
125 aa  59.7  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2464  hypothetical protein  31.07 
 
 
123 aa  60.1  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.164658  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5877  protein of unknown function UPF0102  31.25 
 
 
117 aa  58.9  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.662779 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0732  hypothetical protein  41.05 
 
 
108 aa  59.3  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.821091  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0299  hypothetical protein  35.79 
 
 
108 aa  58.9  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4114  hypothetical protein  32.99 
 
 
123 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10070  conserved hypothetical protein TIGR00252  34.86 
 
 
153 aa  58.9  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0294595  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0992  hypothetical protein  35.92 
 
 
117 aa  59.3  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.528214  normal  0.0951104 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2213  protein of unknown function UPF0102  36.11 
 
 
118 aa  58.9  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.19652 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1934  hypothetical protein  34.38 
 
 
120 aa  58.9  0.00000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.547856  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1703  hypothetical protein  41.56 
 
 
123 aa  58.9  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3485  hypothetical protein  40.66 
 
 
125 aa  58.9  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000340579 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2007  hypothetical protein  37.76 
 
 
124 aa  59.3  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.63182  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0260  hypothetical protein  35.79 
 
 
108 aa  58.9  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2298  hypothetical protein  39.39 
 
 
123 aa  59.3  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3355  hypothetical protein  36.26 
 
 
108 aa  59.3  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0259  hypothetical protein  34.38 
 
 
120 aa  58.9  0.00000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1042  hypothetical protein  31.96 
 
 
122 aa  58.9  0.00000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0556279  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0910  hypothetical protein  32.41 
 
 
119 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.21322  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03356  Sigma-54 factor  31.48 
 
 
113 aa  58.5  0.00000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2488  protein of unknown function UPF0102  40 
 
 
123 aa  58.5  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0776001  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0465  hypothetical protein  36.56 
 
 
113 aa  58.5  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3685  hypothetical protein  34.74 
 
 
108 aa  58.2  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1530  hypothetical protein  34 
 
 
118 aa  58.5  0.00000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0048655  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0650  hypothetical protein  37.36 
 
 
128 aa  58.2  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4420  hypothetical protein  32.35 
 
 
128 aa  57.8  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.149236  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0977  hypothetical protein  37.14 
 
 
119 aa  58.2  0.00000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.320606  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0195  hypothetical protein  35.35 
 
 
119 aa  58.2  0.00000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.227376  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0272  hypothetical protein  31.48 
 
 
108 aa  58.2  0.00000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000600044  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1836  hypothetical protein  33.33 
 
 
117 aa  58.2  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0316841 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1186  hypothetical protein  39.78 
 
 
140 aa  58.2  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00400032  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0758  hypothetical protein  39.36 
 
 
130 aa  58.2  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2035  hypothetical protein  41.56 
 
 
122 aa  58.2  0.00000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.848509  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23670  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  33.04 
 
 
127 aa  57.8  0.00000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.183487  normal  0.0867152 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3998  protein of unknown function UPF0102  36.14 
 
 
139 aa  57.4  0.00000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1639  protein of unknown function UPF0102  33.94 
 
 
110 aa  57.4  0.00000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3990  hypothetical protein  30.93 
 
 
108 aa  57.4  0.00000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>