177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1901 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_1901  formate dehydrogenase H large subunit  100 
 
 		 109 aa  222  1e-57  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0144  hypothetical protein  41.9 
 
 		 112 aa  85.1  3e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0184  hypothetical protein  41.9 
 
 		 112 aa  85.1  3e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.805797  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0216  hypothetical protein  45.71 
 
 		 112 aa  84  7e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0163  hypothetical protein  40 
 
 		 112 aa  82.4  0.000000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1143  hypothetical protein  41.9 
 
 		 113 aa  82  0.000000000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0294  hypothetical protein  40 
 
 		 112 aa  79  0.00000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0170  protein of unknown function UPF0102  42.59 
 
 		 108 aa  79.3  0.00000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.633607  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0546  hypothetical protein  38.1 
 
 		 115 aa  70.9  0.000000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.672576  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1413  hypothetical protein  39.42 
 
 		 112 aa  68.6  0.00000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0400  hypothetical protein  33.98 
 
 		 131 aa  67.8  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0420  hypothetical protein  32.04 
 
 		 128 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0320  hypothetical protein  30.61 
 
 		 135 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0116  hypothetical protein  29.59 
 
 		 118 aa  65.1  0.0000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.185512 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0181  hypothetical protein  34.69 
 
 		 136 aa  65.5  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.973166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0146  hypothetical protein  30.61 
 
 		 135 aa  64.3  0.0000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0671  hypothetical protein  37.62 
 
 		 108 aa  63.9  0.0000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000156143  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0695  hypothetical protein  37.62 
 
 		 108 aa  63.9  0.0000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000229548  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1218  protein of unknown function UPF0102  34.86 
 
 		 119 aa  62  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.648075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0226  hypothetical protein  29.81 
 
 		 114 aa  60.5  0.000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.113401  normal  0.113585 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3990  hypothetical protein  34.69 
 
 		 108 aa  60.5  0.000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4100  hypothetical protein  34.69 
 
 		 108 aa  60.5  0.000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4070  hypothetical protein  34.69 
 
 		 108 aa  60.5  0.000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00890  hypothetical protein  34.34 
 
 		 122 aa  60.5  0.000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4188  hypothetical protein  34.69 
 
 		 108 aa  60.5  0.000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1530  hypothetical protein  33.33 
 
 		 118 aa  60.1  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0048655  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1406  protein of unknown function UPF0102  33.04 
 
 		 114 aa  58.9  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2230  protein of unknown function UPF0102  33.33 
 
 		 127 aa  58.9  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0169041  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2488  protein of unknown function UPF0102  37.04 
 
 		 123 aa  58.9  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0776001  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2025  hypothetical protein  38.38 
 
 		 119 aa  58.5  0.00000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1509  hypothetical protein  37.5 
 
 		 133 aa  58.5  0.00000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0702  hypothetical protein  36.96 
 
 		 112 aa  58.5  0.00000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.254087  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0629  hypothetical protein  33.96 
 
 		 122 aa  58.2  0.00000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0388  hypothetical protein  31.63 
 
 		 108 aa  57.4  0.00000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.597532  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1176  hypothetical protein  35.05 
 
 		 122 aa  57.4  0.00000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.108145 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0325  hypothetical protein  29.47 
 
 		 130 aa  57  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.493012  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0187  hypothetical protein  31.63 
 
 		 125 aa  57  0.00000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09240  Holliday junction resolvase-like endonuclease  32.65 
 
 		 139 aa  56.6  0.0000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0928499  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2201  hypothetical protein  32.65 
 
 		 123 aa  56.2  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3545  hypothetical protein  32.29 
 
 		 122 aa  56.2  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0503  hypothetical protein  33 
 
 		 120 aa  55.8  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.451178 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0251  hypothetical protein  31.96 
 
 		 112 aa  55.8  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1959  hypothetical protein  36.46 
 
 		 122 aa  55.5  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.142549  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3053  protein of unknown function UPF0102  34.26 
 
 		 111 aa  55.5  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0178  hypothetical protein  27.55 
 
 		 126 aa  54.7  0.0000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.647134  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1677  hypothetical protein  37.08 
 
 		 122 aa  54.7  0.0000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.238653  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0758  hypothetical protein  39.08 
 
 		 130 aa  55.1  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0299  hypothetical protein  30.61 
 
 		 108 aa  54.3  0.0000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1639  protein of unknown function UPF0102  37.04 
 
 		 110 aa  54.3  0.0000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004502  endonuclease  35.35 
 
 		 122 aa  54.3  0.0000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000161677  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3685  hypothetical protein  31.63 
 
 		 108 aa  54.3  0.0000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2395  hypothetical protein  33.33 
 
 		 127 aa  53.9  0.0000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.615386  normal  0.0739869 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0260  hypothetical protein  30.61 
 
 		 108 aa  53.9  0.0000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3693  hypothetical protein  31.63 
 
 		 108 aa  53.9  0.0000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.678912  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0112  hypothetical protein  30.1 
 
 		 122 aa  53.9  0.0000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4252  hypothetical protein  29.63 
 
 		 117 aa  53.5  0.0000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000137469 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0195  hypothetical protein  34.02 
 
 		 119 aa  52.8  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.227376  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0293  protein of unknown function UPF0102  33.33 
 
 		 124 aa  53.5  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.210059 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0465  hypothetical protein  32.41 
 
 		 113 aa  52.4  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3881  hypothetical protein  30.61 
 
 		 108 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.114446 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10070  conserved hypothetical protein TIGR00252  29.73 
 
 		 153 aa  52.4  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0294595  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07020  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  35.9 
 
 		 186 aa  52.4  0.000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00114408  normal  0.507303 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03356  Sigma-54 factor  29.46 
 
 		 113 aa  51.6  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1475  endonuclease  33.73 
 
 		 115 aa  52  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.733308  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3311  protein of unknown function UPF0102  38.27 
 
 		 134 aa  51.2  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4433  hypothetical protein  35.63 
 
 		 129 aa  51.2  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.875795  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0355  hypothetical protein  30.69 
 
 		 124 aa  51.2  0.000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1723  hypothetical protein  30.77 
 
 		 123 aa  51.2  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.471951 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2283  hypothetical protein  29.9 
 
 		 113 aa  50.8  0.000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.567685 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3355  hypothetical protein  28.57 
 
 		 108 aa  50.8  0.000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2095  protein of unknown function UPF0102  31.91 
 
 		 137 aa  50.8  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1186  hypothetical protein  34.31 
 
 		 140 aa  50.4  0.000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00400032  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0175  hypothetical protein  36 
 
 		 139 aa  50.8  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.361745 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0017  hypothetical protein  31.91 
 
 		 126 aa  50.4  0.000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00052241  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4331  hypothetical protein  31.31 
 
 		 122 aa  50.1  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.84486 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2655  hypothetical protein  31.07 
 
 		 123 aa  50.4  0.000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3485  hypothetical protein  40.24 
 
 		 125 aa  50.4  0.000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000340579 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3065  hypothetical protein  35.71 
 
 		 118 aa  50.1  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3298  hypothetical protein  33.33 
 
 		 124 aa  49.7  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.861672  normal  0.570212 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2019  protein of unknown function UPF0102  31.91 
 
 		 134 aa  50.1  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.573307  normal  0.167847 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1376  protein of unknown function UPF0102  32.69 
 
 		 119 aa  50.1  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000032081  normal  0.333882 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2398  hypothetical protein  31.48 
 
 		 118 aa  50.1  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.430013  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5237  protein of unknown function UPF0102  34.29 
 
 		 164 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0720  hypothetical protein  37.8 
 
 		 126 aa  50.1  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0341617  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1703  hypothetical protein  37.18 
 
 		 123 aa  50.1  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0781  hypothetical protein  32.98 
 
 		 121 aa  48.9  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0650  hypothetical protein  32.41 
 
 		 128 aa  49.3  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1272  protein of unknown function UPF0102  35.37 
 
 		 125 aa  48.9  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4800  hypothetical protein  33.33 
 
 		 151 aa  48.9  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1992  hypothetical protein  31.18 
 
 		 129 aa  49.3  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2213  protein of unknown function UPF0102  25.81 
 
 		 118 aa  48.9  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.19652 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3014  hypothetical protein  27.84 
 
 		 127 aa  48.9  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2103  hypothetical protein  32.14 
 
 		 121 aa  48.9  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.374615  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2298  hypothetical protein  36.17 
 
 		 123 aa  49.3  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3424  hypothetical protein  39.02 
 
 		 125 aa  48.9  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4996  hypothetical protein  32.94 
 
 		 125 aa  48.1  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.608406  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0189  protein of unknown function UPF0102  29.55 
 
 		 127 aa  48.9  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.452343  normal  0.48907 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0315  protein of unknown function UPF0102  34.94 
 
 		 121 aa  48.1  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000225244 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0142  conserved hypothetical protein TIGR00252  34.94 
 
 		 121 aa  48.1  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0351  hypothetical protein  27.78 
 
 		 117 aa  48.1  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0502533  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>