255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0189 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_0189  protein of unknown function UPF0102  100 
 
 		 127 aa  260  4e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.452343  normal  0.48907 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0325  hypothetical protein  43.75 
 
 		 130 aa  86.3  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.493012  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0400  hypothetical protein  42.86 
 
 		 131 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0116  hypothetical protein  42.86 
 
 		 118 aa  80.9  0.000000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.185512 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0339  hypothetical protein  44.64 
 
 		 127 aa  79.7  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0692015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2103  hypothetical protein  45.13 
 
 		 121 aa  79.3  0.00000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.374615  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3586  hypothetical protein  41.23 
 
 		 133 aa  78.2  0.00000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0420  hypothetical protein  41.96 
 
 		 128 aa  77.4  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0320  hypothetical protein  40.18 
 
 		 135 aa  77.4  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2261  hypothetical protein  44.55 
 
 		 128 aa  75.5  0.0000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0181  hypothetical protein  39.29 
 
 		 136 aa  72.8  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.973166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0146  hypothetical protein  37.84 
 
 		 135 aa  71.6  0.000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3014  hypothetical protein  43.14 
 
 		 127 aa  69.3  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3959  hypothetical protein  36.44 
 
 		 137 aa  68.6  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0572  hypothetical protein  35.96 
 
 		 118 aa  68.6  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.421068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4331  hypothetical protein  35.45 
 
 		 122 aa  67.8  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.84486 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0676  hypothetical protein  38.02 
 
 		 167 aa  67.4  0.00000000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0552943  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5877  protein of unknown function UPF0102  36.28 
 
 		 117 aa  67.4  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.662779 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1406  protein of unknown function UPF0102  37.38 
 
 		 114 aa  66.2  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0175  hypothetical protein  36.21 
 
 		 139 aa  65.9  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.361745 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00890  hypothetical protein  37.84 
 
 		 122 aa  65.9  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2830  hypothetical protein  37.5 
 
 		 134 aa  65.1  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.31307  normal  0.486249 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1475  endonuclease  32.43 
 
 		 115 aa  64.3  0.0000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.733308  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0546  hypothetical protein  29.2 
 
 		 115 aa  63.9  0.0000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.672576  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0461  hypothetical protein  38.94 
 
 		 117 aa  63.5  0.0000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1814  hypothetical protein  38.94 
 
 		 117 aa  63.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.842664  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3298  hypothetical protein  35.4 
 
 		 124 aa  63.2  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.861672  normal  0.570212 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2488  protein of unknown function UPF0102  38.94 
 
 		 123 aa  62.8  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0776001  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0629  hypothetical protein  28.95 
 
 		 122 aa  62.4  0.000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0187  hypothetical protein  34.48 
 
 		 125 aa  62  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4010  hypothetical protein  35.05 
 
 		 124 aa  62.8  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.571569  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1042  hypothetical protein  33.64 
 
 		 122 aa  62.4  0.000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0556279  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004502  endonuclease  38.78 
 
 		 122 aa  62  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000161677  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2298  hypothetical protein  35.14 
 
 		 123 aa  62  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2395  hypothetical protein  34.21 
 
 		 127 aa  61.6  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.615386  normal  0.0739869 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0675  protein of unknown function UPF0102  32.31 
 
 		 165 aa  60.8  0.000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04380  hypothetical protein  36.44 
 
 		 122 aa  60.8  0.000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3496  hypothetical protein  36.28 
 
 		 125 aa  59.7  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.215369 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0037  hypothetical protein  32.23 
 
 		 127 aa  60.1  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1291  protein of unknown function UPF0102  32.73 
 
 		 115 aa  60.1  0.00000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000677509  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1695  hypothetical protein  34.19 
 
 		 120 aa  58.9  0.00000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2283  hypothetical protein  37.5 
 
 		 113 aa  59.3  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.567685 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0142  conserved hypothetical protein TIGR00252  37.84 
 
 		 121 aa  58.5  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2398  hypothetical protein  33.33 
 
 		 118 aa  58.5  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.430013  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0993  protein of unknown function UPF0102  40.19 
 
 		 129 aa  58.9  0.00000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00109853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0315  protein of unknown function UPF0102  37.84 
 
 		 121 aa  58.5  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000225244 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0472  hypothetical protein  35.4 
 
 		 117 aa  58.2  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0276117 
 
 
-
 
NC_004310  BR0178  hypothetical protein  36.08 
 
 		 126 aa  58.2  0.00000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.647134  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1324  protein of unknown function UPF0102  30.56 
 
 		 148 aa  57.8  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0992  hypothetical protein  40.71 
 
 		 117 aa  58.2  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.528214  normal  0.0951104 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1947  hypothetical protein  40 
 
 		 133 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.439621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0756  hypothetical protein  35.4 
 
 		 118 aa  57.8  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.477778  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3485  hypothetical protein  30 
 
 		 125 aa  57.4  0.00000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000340579 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1959  hypothetical protein  28.7 
 
 		 122 aa  57.4  0.00000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.142549  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0650  hypothetical protein  34.78 
 
 		 128 aa  57.4  0.00000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2864  hypothetical protein  35.09 
 
 		 122 aa  57.4  0.00000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00415914  hitchhiker  0.000000500394 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1407  protein of unknown function UPF0102  40.62 
 
 		 122 aa  57.4  0.00000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.993674  normal  0.0549137 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0353  hypothetical protein  33.94 
 
 		 128 aa  57  0.00000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2213  protein of unknown function UPF0102  32.46 
 
 		 118 aa  57  0.00000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.19652 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3424  hypothetical protein  30.28 
 
 		 125 aa  57  0.00000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0112  hypothetical protein  33 
 
 		 122 aa  57  0.00000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0262  hypothetical protein  36.84 
 
 		 116 aa  56.6  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.605183  normal  0.332641 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0170  protein of unknown function UPF0102  31.33 
 
 		 108 aa  56.2  0.0000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.633607  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0226  hypothetical protein  34.86 
 
 		 114 aa  56.2  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.113401  normal  0.113585 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0977  hypothetical protein  32.2 
 
 		 119 aa  55.8  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.320606  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3998  protein of unknown function UPF0102  38.95 
 
 		 139 aa  55.8  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3919  protein of unknown function UPF0102  38.38 
 
 		 144 aa  55.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000143067  normal  0.216721 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0900  hypothetical protein  34.41 
 
 		 100 aa  56.2  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.813892 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1677  hypothetical protein  27.83 
 
 		 122 aa  55.8  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.238653  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3870  protein of unknown function UPF0102  38.38 
 
 		 144 aa  55.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4594  hypothetical protein  34.95 
 
 		 122 aa  55.5  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.042758 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0460  protein of unknown function UPF0102  37.11 
 
 		 153 aa  55.8  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1910  hypothetical protein  38.54 
 
 		 134 aa  55.1  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.179028  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1350  protein of unknown function UPF0102  34.55 
 
 		 118 aa  55.1  0.0000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0216  hypothetical protein  25.3 
 
 		 112 aa  55.1  0.0000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2019  protein of unknown function UPF0102  33.62 
 
 		 134 aa  55.5  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.573307  normal  0.167847 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0251  hypothetical protein  36.84 
 
 		 112 aa  55.5  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3523  hypothetical protein  35.24 
 
 		 131 aa  55.1  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.578592  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2217  hypothetical protein  34.96 
 
 		 123 aa  54.7  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000089571  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3443  hypothetical protein  35.66 
 
 		 131 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3560  hypothetical protein  35.24 
 
 		 131 aa  55.1  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0293  protein of unknown function UPF0102  35.04 
 
 		 124 aa  54.7  0.0000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.210059 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3620  hypothetical protein  35.24 
 
 		 131 aa  55.1  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3454  hypothetical protein  35.24 
 
 		 131 aa  55.1  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3545  hypothetical protein  33.33 
 
 		 122 aa  54.7  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3630  hypothetical protein  35.66 
 
 		 131 aa  54.3  0.0000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03015  hypothetical protein  34.88 
 
 		 131 aa  54.3  0.0000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0557  protein of unknown function UPF0102  34.88 
 
 		 131 aa  54.3  0.0000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0355  hypothetical protein  32.52 
 
 		 124 aa  54.3  0.0000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02966  hypothetical protein  34.88 
 
 		 131 aa  54.3  0.0000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0550  hypothetical protein  34.88 
 
 		 131 aa  54.3  0.0000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0259  hypothetical protein  28.83 
 
 		 120 aa  53.9  0.0000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1934  hypothetical protein  28.83 
 
 		 120 aa  53.9  0.0000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.547856  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3783  hypothetical protein  33.94 
 
 		 118 aa  53.9  0.0000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00882109  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57490  hypothetical protein  34.29 
 
 		 125 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0260  hypothetical protein  34.26 
 
 		 108 aa  53.5  0.0000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02085  hypothetical protein  30.7 
 
 		 119 aa  53.1  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.997348  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1992  hypothetical protein  34.71 
 
 		 129 aa  53.1  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0449  hypothetical protein  34.07 
 
 		 124 aa  52.8  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.283123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0465  hypothetical protein  29.82 
 
 		 113 aa  53.1  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>