244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3586 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_3586  hypothetical protein  100 
 
 		 133 aa  252  1.0000000000000001e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0320  hypothetical protein  55.36 
 
 		 135 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0146  hypothetical protein  49.62 
 
 		 135 aa  107  5e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0420  hypothetical protein  50.89 
 
 		 128 aa  106  1e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4010  hypothetical protein  52.73 
 
 		 124 aa  106  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.571569  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0400  hypothetical protein  50.89 
 
 		 131 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0181  hypothetical protein  49.11 
 
 		 136 aa  105  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.973166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0325  hypothetical protein  51.79 
 
 		 130 aa  102  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.493012  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0187  hypothetical protein  50.47 
 
 		 125 aa  99.8  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0439  hypothetical protein  55.86 
 
 		 128 aa  98.2  3e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.111388  normal  0.465101 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0116  hypothetical protein  50 
 
 		 118 aa  96.7  9e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.185512 
 
 
-
 
NC_004310  BR0178  hypothetical protein  50.94 
 
 		 126 aa  95.9  2e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.647134  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0406  hypothetical protein  56.6 
 
 		 128 aa  95.1  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.442549 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3545  hypothetical protein  49.11 
 
 		 122 aa  94  6e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3692  hypothetical protein  51.85 
 
 		 125 aa  94  7e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.598845  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0175  hypothetical protein  45.8 
 
 		 139 aa  92.4  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.361745 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1042  hypothetical protein  44.34 
 
 		 122 aa  89  2e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0556279  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0353  hypothetical protein  47.17 
 
 		 128 aa  88.2  4e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3014  hypothetical protein  47.22 
 
 		 127 aa  85.9  2e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0293  protein of unknown function UPF0102  44.55 
 
 		 124 aa  85.9  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.210059 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3496  hypothetical protein  45.28 
 
 		 125 aa  84.3  4e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.215369 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2938  hypothetical protein  45.79 
 
 		 129 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.703285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0572  hypothetical protein  45.95 
 
 		 118 aa  82  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.421068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0262  hypothetical protein  47.42 
 
 		 116 aa  80.1  0.00000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.605183  normal  0.332641 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0189  protein of unknown function UPF0102  41.23 
 
 		 127 aa  78.2  0.00000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.452343  normal  0.48907 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0021  hypothetical protein  53.7 
 
 		 133 aa  77.8  0.00000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0577391 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4331  hypothetical protein  42.02 
 
 		 122 aa  77.4  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.84486 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5237  protein of unknown function UPF0102  38.78 
 
 		 164 aa  77  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0024  hypothetical protein  54.05 
 
 		 129 aa  74.3  0.0000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0228023  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3919  protein of unknown function UPF0102  36.19 
 
 		 144 aa  73.9  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000143067  normal  0.216721 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3870  protein of unknown function UPF0102  36.19 
 
 		 144 aa  73.9  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0474  hypothetical protein  53.26 
 
 		 125 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2083  hypothetical protein  43.69 
 
 		 104 aa  69.3  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4594  hypothetical protein  42.72 
 
 		 122 aa  68.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.042758 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0093  hypothetical protein  28.7 
 
 		 122 aa  67.4  0.00000000006  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.560974  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3424  hypothetical protein  39 
 
 		 125 aa  65.5  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0339  hypothetical protein  44.86 
 
 		 127 aa  65.9  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0692015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0057  hypothetical protein  25 
 
 		 122 aa  65.1  0.0000000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0900  hypothetical protein  48.72 
 
 		 100 aa  64.7  0.0000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.813892 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1695  hypothetical protein  29.31 
 
 		 120 aa  63.9  0.0000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3485  hypothetical protein  38 
 
 		 125 aa  63.9  0.0000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000340579 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3355  hypothetical protein  47.42 
 
 		 108 aa  61.6  0.000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0017  hypothetical protein  34.95 
 
 		 126 aa  60.5  0.000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00052241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0675  protein of unknown function UPF0102  37.89 
 
 		 165 aa  60.1  0.00000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10390  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  35.82 
 
 		 167 aa  59.3  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000139118  unclonable  0.000000000910029 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1406  protein of unknown function UPF0102  39.18 
 
 		 173 aa  59.3  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000418677  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0299  hypothetical protein  41.67 
 
 		 108 aa  58.5  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0503  hypothetical protein  39.05 
 
 		 120 aa  58.5  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.451178 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0017  hypothetical protein  36.54 
 
 		 128 aa  58.2  0.00000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000457371  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2830  hypothetical protein  39.51 
 
 		 134 aa  58.5  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.31307  normal  0.486249 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0629  hypothetical protein  27.97 
 
 		 122 aa  58.5  0.00000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1291  protein of unknown function UPF0102  30.63 
 
 		 115 aa  58.2  0.00000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000677509  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0732  hypothetical protein  39.6 
 
 		 108 aa  57.8  0.00000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.821091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3881  hypothetical protein  42.71 
 
 		 108 aa  58.2  0.00000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.114446 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1475  endonuclease  38.78 
 
 		 115 aa  57.8  0.00000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.733308  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2261  hypothetical protein  50 
 
 		 128 aa  57.8  0.00000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0497  hypothetical protein  38.68 
 
 		 142 aa  57.4  0.00000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0260  hypothetical protein  41.67 
 
 		 108 aa  57  0.00000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3756  hypothetical protein  33.63 
 
 		 127 aa  57  0.00000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00341379  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0016  hypothetical protein  36.89 
 
 		 129 aa  56.6  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.197298  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1062  hypothetical protein  41.51 
 
 		 138 aa  56.6  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.340253 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02085  hypothetical protein  32.74 
 
 		 119 aa  56.2  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.997348  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0650  hypothetical protein  38.78 
 
 		 128 aa  55.8  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0666  hypothetical protein  41.24 
 
 		 116 aa  55.8  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0397911  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0733  hypothetical protein  31.48 
 
 		 180 aa  56.2  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.646389 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3685  hypothetical protein  40.62 
 
 		 108 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1186  hypothetical protein  36.19 
 
 		 140 aa  56.2  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00400032  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2398  hypothetical protein  34.82 
 
 		 118 aa  55.5  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.430013  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00890  hypothetical protein  35.71 
 
 		 122 aa  55.1  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2864  hypothetical protein  35.05 
 
 		 122 aa  54.7  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00415914  hitchhiker  0.000000500394 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0037  hypothetical protein  27.87 
 
 		 127 aa  54.7  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0277  protein of unknown function UPF0102  31.3 
 
 		 120 aa  54.3  0.0000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.107261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0630  hypothetical protein  42.99 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2019  protein of unknown function UPF0102  38.14 
 
 		 134 aa  53.9  0.0000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.573307  normal  0.167847 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4524  hypothetical protein  37.5 
 
 		 123 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0216  hypothetical protein  24.21 
 
 		 112 aa  53.9  0.0000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0231  protein of unknown function UPF0102  48.72 
 
 		 121 aa  53.9  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.819406  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1874  hypothetical protein  37.5 
 
 		 135 aa  52.8  0.000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3959  hypothetical protein  37.84 
 
 		 137 aa  53.1  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1406  protein of unknown function UPF0102  33.68 
 
 		 114 aa  52  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0259  hypothetical protein  29.7 
 
 		 120 aa  52.4  0.000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0930  hypothetical protein  36.56 
 
 		 123 aa  52.4  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.930588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0355  hypothetical protein  34.82 
 
 		 124 aa  52.4  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1992  hypothetical protein  35 
 
 		 129 aa  52.4  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0460  protein of unknown function UPF0102  36.73 
 
 		 153 aa  52.4  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3298  hypothetical protein  33.33 
 
 		 124 aa  52.8  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.861672  normal  0.570212 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1934  hypothetical protein  29.7 
 
 		 120 aa  52.4  0.000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.547856  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1324  protein of unknown function UPF0102  29.13 
 
 		 148 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3630  hypothetical protein  36.7 
 
 		 131 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3693  hypothetical protein  41.67 
 
 		 108 aa  52.8  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.678912  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4467  hypothetical protein  36.7 
 
 		 131 aa  51.6  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0993  protein of unknown function UPF0102  34.95 
 
 		 129 aa  51.6  0.000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00109853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004502  endonuclease  34 
 
 		 122 aa  52  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000161677  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0142  conserved hypothetical protein TIGR00252  37.17 
 
 		 121 aa  52  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0315  protein of unknown function UPF0102  37.17 
 
 		 121 aa  52  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000225244 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2298  hypothetical protein  35 
 
 		 123 aa  52  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0756  hypothetical protein  37.61 
 
 		 118 aa  51.2  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.477778  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1376  protein of unknown function UPF0102  30.97 
 
 		 119 aa  51.6  0.000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000032081  normal  0.333882 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4420  hypothetical protein  31.93 
 
 		 128 aa  50.8  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.149236  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4252  hypothetical protein  35.05 
 
 		 117 aa  50.8  0.000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000137469 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>