150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2083 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_2083  hypothetical protein  100 
 
 		 104 aa  194  4.0000000000000005e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0262  hypothetical protein  65.31 
 
 		 116 aa  125  2.0000000000000002e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.605183  normal  0.332641 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0572  hypothetical protein  58 
 
 		 118 aa  105  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.421068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3586  hypothetical protein  45.63 
 
 		 133 aa  84.3  6e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0420  hypothetical protein  47.06 
 
 		 128 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3692  hypothetical protein  45.79 
 
 		 125 aa  73.6  0.0000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.598845  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0400  hypothetical protein  47.06 
 
 		 131 aa  72.8  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0116  hypothetical protein  44.44 
 
 		 118 aa  72.8  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.185512 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0146  hypothetical protein  43.43 
 
 		 135 aa  70.9  0.000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0320  hypothetical protein  43.14 
 
 		 135 aa  67.8  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0325  hypothetical protein  42.42 
 
 		 130 aa  67.4  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.493012  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0175  hypothetical protein  42.72 
 
 		 139 aa  67.4  0.00000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.361745 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0181  hypothetical protein  45.1 
 
 		 136 aa  67  0.00000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.973166  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0406  hypothetical protein  48.51 
 
 		 128 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.442549 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1042  hypothetical protein  41.58 
 
 		 122 aa  65.1  0.0000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0556279  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4331  hypothetical protein  42 
 
 		 122 aa  64.3  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.84486 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0439  hypothetical protein  47.52 
 
 		 128 aa  63.9  0.0000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.111388  normal  0.465101 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4010  hypothetical protein  41 
 
 		 124 aa  62  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.571569  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0093  hypothetical protein  27.62 
 
 		 122 aa  61.2  0.000000004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.560974  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0178  hypothetical protein  38.83 
 
 		 126 aa  61.2  0.000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.647134  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3496  hypothetical protein  44.44 
 
 		 125 aa  60.8  0.000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.215369 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3014  hypothetical protein  40.78 
 
 		 127 aa  60.1  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0293  protein of unknown function UPF0102  42.27 
 
 		 124 aa  59.3  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.210059 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4594  hypothetical protein  41 
 
 		 122 aa  59.3  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.042758 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0189  protein of unknown function UPF0102  37.5 
 
 		 127 aa  58.9  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.452343  normal  0.48907 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0017  hypothetical protein  38.64 
 
 		 128 aa  59.3  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000457371  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0144  hypothetical protein  29.89 
 
 		 112 aa  57.4  0.00000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0464  hypothetical protein  31.87 
 
 		 116 aa  57.8  0.00000006  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0184  hypothetical protein  29.89 
 
 		 112 aa  57.4  0.00000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.805797  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0187  hypothetical protein  35.92 
 
 		 125 aa  57.4  0.00000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0163  hypothetical protein  28.74 
 
 		 112 aa  57.4  0.00000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0474  hypothetical protein  45.16 
 
 		 125 aa  57  0.00000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3545  hypothetical protein  38.24 
 
 		 122 aa  56.6  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2398  hypothetical protein  34.65 
 
 		 118 aa  56.2  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.430013  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0629  hypothetical protein  33.33 
 
 		 122 aa  56.6  0.0000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1291  protein of unknown function UPF0102  33.98 
 
 		 115 aa  56.2  0.0000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000677509  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1509  hypothetical protein  30.21 
 
 		 133 aa  54.7  0.0000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1413  hypothetical protein  23.26 
 
 		 112 aa  53.5  0.0000009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0184  hypothetical protein  36.26 
 
 		 123 aa  53.5  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2217  hypothetical protein  47.37 
 
 		 123 aa  52.8  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000089571  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004502  endonuclease  30.84 
 
 		 122 aa  53.1  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000161677  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3756  hypothetical protein  34.09 
 
 		 127 aa  53.1  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00341379  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2864  hypothetical protein  34.29 
 
 		 122 aa  52.8  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00415914  hitchhiker  0.000000500394 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0930  hypothetical protein  40.48 
 
 		 123 aa  52.8  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.930588  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1530  hypothetical protein  32.61 
 
 		 118 aa  52.4  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0048655  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2464  hypothetical protein  34.91 
 
 		 123 aa  52.4  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.164658  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0057  hypothetical protein  25.71 
 
 		 122 aa  52  0.000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00890  hypothetical protein  30.84 
 
 		 122 aa  52  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0353  hypothetical protein  35.64 
 
 		 128 aa  51.2  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2298  hypothetical protein  35.63 
 
 		 123 aa  51.2  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0021  hypothetical protein  44.57 
 
 		 133 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0577391 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2007  hypothetical protein  39.13 
 
 		 124 aa  51.2  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.63182  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10070  conserved hypothetical protein TIGR00252  39.77 
 
 		 153 aa  50.8  0.000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0294595  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0671  hypothetical protein  32.95 
 
 		 108 aa  50.8  0.000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000156143  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0695  hypothetical protein  32.95 
 
 		 108 aa  50.8  0.000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000229548  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1475  endonuclease  33.65 
 
 		 115 aa  50.4  0.000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.733308  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1992  hypothetical protein  37.93 
 
 		 129 aa  50.4  0.000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3919  protein of unknown function UPF0102  36 
 
 		 144 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000143067  normal  0.216721 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1350  protein of unknown function UPF0102  37.93 
 
 		 118 aa  49.7  0.00001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3870  protein of unknown function UPF0102  36 
 
 		 144 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0781  hypothetical protein  43.18 
 
 		 121 aa  49.3  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0650  hypothetical protein  39.25 
 
 		 128 aa  49.3  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1406  protein of unknown function UPF0102  39.13 
 
 		 114 aa  48.9  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3355  hypothetical protein  47.46 
 
 		 108 aa  49.7  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3443  hypothetical protein  36.9 
 
 		 131 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0017  hypothetical protein  34.48 
 
 		 126 aa  48.9  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00052241  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03015  hypothetical protein  36.9 
 
 		 131 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0557  protein of unknown function UPF0102  36.9 
 
 		 131 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0460  protein of unknown function UPF0102  32.94 
 
 		 153 aa  48.5  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3630  hypothetical protein  36.9 
 
 		 131 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1703  hypothetical protein  33.33 
 
 		 123 aa  48.5  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4467  hypothetical protein  36.9 
 
 		 131 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0550  hypothetical protein  36.9 
 
 		 131 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02966  hypothetical protein  36.9 
 
 		 131 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0112  hypothetical protein  32.22 
 
 		 122 aa  48.1  0.00004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0546  hypothetical protein  24 
 
 		 115 aa  47.8  0.00005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.672576  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0016  hypothetical protein  32.61 
 
 		 129 aa  47.8  0.00005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.197298  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2213  protein of unknown function UPF0102  39.08 
 
 		 118 aa  47.4  0.00006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.19652 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0231  protein of unknown function UPF0102  37.5 
 
 		 121 aa  47.4  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.819406  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0024  hypothetical protein  45.16 
 
 		 129 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0228023  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0977  hypothetical protein  31.03 
 
 		 119 aa  47.4  0.00007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.320606  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2488  protein of unknown function UPF0102  44.83 
 
 		 123 aa  47  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0776001  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0702  hypothetical protein  30.68 
 
 		 112 aa  46.2  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.254087  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10390  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  36.61 
 
 		 167 aa  45.8  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000139118  unclonable  0.000000000910029 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3985  hypothetical protein  36.56 
 
 		 143 aa  45.8  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.889068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1186  hypothetical protein  36.67 
 
 		 140 aa  45.8  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00400032  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0707  hypothetical protein  30.68 
 
 		 121 aa  45.8  0.0002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3424  hypothetical protein  30.19 
 
 		 125 aa  45.8  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0339  hypothetical protein  50 
 
 		 127 aa  45.8  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0692015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3909  hypothetical protein  37.89 
 
 		 141 aa  46.2  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.181431  normal  0.486883 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_687  endonuclease  40.91 
 
 		 121 aa  45.1  0.0003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5877  protein of unknown function UPF0102  30.1 
 
 		 117 aa  45.4  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.662779 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3485  hypothetical protein  30.48 
 
 		 125 aa  45.1  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000340579 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4252  hypothetical protein  32.71 
 
 		 117 aa  45.4  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000137469 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0993  protein of unknown function UPF0102  36.45 
 
 		 129 aa  44.7  0.0004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00109853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5237  protein of unknown function UPF0102  32.61 
 
 		 164 aa  45.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0666  hypothetical protein  42.65 
 
 		 116 aa  44.7  0.0004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0397911  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3624  hypothetical protein  35.71 
 
 		 131 aa  45.1  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0700  protein of unknown function UPF0102  37.11 
 
 		 172 aa  44.3  0.0006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000202877  hitchhiker  0.000000354886 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0037  hypothetical protein  31.91 
 
 		 127 aa  44.3  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>