91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0464 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007798  NSE_0464  hypothetical protein  100 
 
 		 116 aa  236  1e-61  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0146  hypothetical protein  33.7 
 
 		 135 aa  59.3  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0116  hypothetical protein  32.29 
 
 		 118 aa  57.8  0.00000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.185512 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0181  hypothetical protein  32.29 
 
 		 136 aa  57.8  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.973166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0320  hypothetical protein  31.25 
 
 		 135 aa  56.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0572  hypothetical protein  30.19 
 
 		 118 aa  56.2  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.421068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3709  protein of unknown function UPF0102  42.11 
 
 		 119 aa  55.8  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0175  hypothetical protein  35.96 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.361745 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0400  hypothetical protein  30.21 
 
 		 131 aa  52.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0420  hypothetical protein  31.25 
 
 		 128 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0325  hypothetical protein  28.57 
 
 		 130 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.493012  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10070  conserved hypothetical protein TIGR00252  45.1 
 
 		 153 aa  49.7  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0294595  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1175  protein of unknown function UPF0102  38.98 
 
 		 122 aa  49.3  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5877  protein of unknown function UPF0102  30 
 
 		 117 aa  48.5  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.662779 
 
 
-
 
NC_004310  BR0178  hypothetical protein  33.33 
 
 		 126 aa  48.5  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.647134  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2095  protein of unknown function UPF0102  41.1 
 
 		 137 aa  48.1  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0037  hypothetical protein  40 
 
 		 127 aa  48.1  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0187  hypothetical protein  30.53 
 
 		 125 aa  48.1  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1376  protein of unknown function UPF0102  36.36 
 
 		 119 aa  47.8  0.00005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000032081  normal  0.333882 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2083  hypothetical protein  38.18 
 
 		 104 aa  47.4  0.00006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0016  hypothetical protein  38.89 
 
 		 129 aa  47.8  0.00006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.197298  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4010  hypothetical protein  27.37 
 
 		 124 aa  47  0.00008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.571569  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2298  hypothetical protein  39.22 
 
 		 123 aa  47  0.00009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2230  protein of unknown function UPF0102  32 
 
 		 127 aa  46.6  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0169041  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2398  hypothetical protein  41.51 
 
 		 118 aa  46.2  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.430013  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1509  hypothetical protein  26.79 
 
 		 133 aa  46.6  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1291  protein of unknown function UPF0102  32.95 
 
 		 115 aa  46.2  0.0001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000677509  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1093  endonuclease-like  35.14 
 
 		 202 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1992  hypothetical protein  44.23 
 
 		 129 aa  46.6  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0439  hypothetical protein  36.23 
 
 		 128 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.111388  normal  0.465101 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0021  hypothetical protein  41.94 
 
 		 133 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0577391 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3919  protein of unknown function UPF0102  43.4 
 
 		 144 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000143067  normal  0.216721 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2881  hypothetical protein  40 
 
 		 146 aa  45.4  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.696458 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0733  hypothetical protein  32.26 
 
 		 180 aa  45.8  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.646389 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0406  hypothetical protein  36.23 
 
 		 128 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.442549 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3870  protein of unknown function UPF0102  43.4 
 
 		 144 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0277  protein of unknown function UPF0102  35 
 
 		 120 aa  45.4  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.107261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1530  hypothetical protein  29.21 
 
 		 118 aa  45.4  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0048655  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2261  hypothetical protein  43.4 
 
 		 128 aa  45.4  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1475  endonuclease  41.38 
 
 		 115 aa  45.4  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.733308  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0262  hypothetical protein  29.76 
 
 		 116 aa  45.1  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.605183  normal  0.332641 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1217  hypothetical protein  38.89 
 
 		 123 aa  44.7  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.266389  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2474  hypothetical protein  25.47 
 
 		 118 aa  45.1  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0253334  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3586  hypothetical protein  28.26 
 
 		 133 aa  44.3  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13130  hypothetical protein  35.14 
 
 		 120 aa  44.3  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2213  protein of unknown function UPF0102  30.86 
 
 		 118 aa  44.7  0.0005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.19652 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5237  protein of unknown function UPF0102  28.57 
 
 		 164 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2532  protein of unknown function UPF0102  40.35 
 
 		 118 aa  44.3  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.388001 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0701  hypothetical protein  29.87 
 
 		 122 aa  43.9  0.0007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10390  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  37.5 
 
 		 167 aa  43.9  0.0008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000139118  unclonable  0.000000000910029 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1478  protein of unknown function UPF0102  37.5 
 
 		 118 aa  43.5  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.10043  normal  0.036198 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2193  hypothetical protein  39.29 
 
 		 207 aa  43.5  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1725  normal  0.994481 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2938  hypothetical protein  27.66 
 
 		 129 aa  43.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.703285  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09240  Holliday junction resolvase-like endonuclease  39.62 
 
 		 139 aa  43.1  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0928499  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1792  hypothetical protein  42.31 
 
 		 160 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0189  protein of unknown function UPF0102  27.08 
 
 		 127 aa  43.1  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.452343  normal  0.48907 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0630  hypothetical protein  37.88 
 
 		 135 aa  43.1  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1156  hypothetical protein  37.93 
 
 		 118 aa  43.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0160558  normal  0.0576877 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0093  hypothetical protein  28.57 
 
 		 122 aa  43.5  0.001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.560974  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3545  hypothetical protein  30.53 
 
 		 122 aa  43.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3985  hypothetical protein  30.56 
 
 		 143 aa  42.7  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.889068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3146  sigma-54 factor  28.85 
 
 		 118 aa  42.4  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3014  hypothetical protein  32.22 
 
 		 127 aa  42.7  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1042  hypothetical protein  29.07 
 
 		 122 aa  42.7  0.002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0556279  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2019  protein of unknown function UPF0102  31.19 
 
 		 134 aa  42.7  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.573307  normal  0.167847 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0353  hypothetical protein  29.17 
 
 		 128 aa  42.7  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1447  protein of unknown function UPF0102  38.33 
 
 		 127 aa  42.7  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23670  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  37.29 
 
 		 127 aa  42.4  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.183487  normal  0.0867152 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3909  hypothetical protein  41.38 
 
 		 141 aa  42.7  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.181431  normal  0.486883 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0017  hypothetical protein  31.82 
 
 		 126 aa  42.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00052241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2217  hypothetical protein  31.33 
 
 		 123 aa  42.7  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000089571  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1218  protein of unknown function UPF0102  26.09 
 
 		 119 aa  41.6  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.648075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3586  hypothetical protein  39.66 
 
 		 118 aa  42  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0388  hypothetical protein  41.51 
 
 		 108 aa  42  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.597532  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2213  hypothetical protein  25.74 
 
 		 132 aa  42  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000124547 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2303  hypothetical protein  23.66 
 
 		 130 aa  41.6  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0306992  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3693  hypothetical protein  38.18 
 
 		 108 aa  41.2  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.678912  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1406  protein of unknown function UPF0102  29.49 
 
 		 114 aa  41.2  0.004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0024  hypothetical protein  42.62 
 
 		 129 aa  41.2  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0228023  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0170  protein of unknown function UPF0102  28.99 
 
 		 108 aa  41.6  0.004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.633607  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4331  hypothetical protein  26.04 
 
 		 122 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.84486 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1723  hypothetical protein  32.08 
 
 		 123 aa  40.8  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.471951 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3311  protein of unknown function UPF0102  37.74 
 
 		 134 aa  40.4  0.007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1212  protein of unknown function UPF0102  28.71 
 
 		 121 aa  40.4  0.007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2007  hypothetical protein  38 
 
 		 124 aa  40.8  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.63182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1814  hypothetical protein  27.27 
 
 		 117 aa  40.4  0.008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.842664  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0184  hypothetical protein  27.72 
 
 		 123 aa  40.4  0.009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0732  hypothetical protein  41.18 
 
 		 108 aa  40.4  0.009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.821091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0900  hypothetical protein  53.12 
 
 		 100 aa  40.4  0.009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.813892 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0293  protein of unknown function UPF0102  29.07 
 
 		 124 aa  40  0.01  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.210059 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2025  hypothetical protein  33.33 
 
 		 119 aa  40  0.01  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>