281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_1376 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_1376  protein of unknown function UPF0102  100 
 
 
119 aa  242  9.999999999999999e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000032081  normal  0.333882 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1447  protein of unknown function UPF0102  41.73 
 
 
127 aa  92.8  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07400  hypothetical protein  44.54 
 
 
116 aa  91.7  3e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1703  hypothetical protein  42.15 
 
 
123 aa  90.5  8e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0977  hypothetical protein  42.5 
 
 
119 aa  85.5  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.320606  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1406  protein of unknown function UPF0102  41.88 
 
 
114 aa  84.7  4e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0666  hypothetical protein  40 
 
 
116 aa  82.4  0.000000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0397911  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1218  protein of unknown function UPF0102  41.74 
 
 
119 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.648075  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1475  endonuclease  41.88 
 
 
115 aa  82  0.000000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.733308  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3709  protein of unknown function UPF0102  39.82 
 
 
119 aa  81.6  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0758  hypothetical protein  40.65 
 
 
130 aa  81.6  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0277  protein of unknown function UPF0102  43.36 
 
 
120 aa  80.1  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.107261  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1530  hypothetical protein  42.72 
 
 
118 aa  79.3  0.00000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0048655  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1272  protein of unknown function UPF0102  44.55 
 
 
125 aa  79  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0720  hypothetical protein  40.32 
 
 
126 aa  79.3  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0341617  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5877  protein of unknown function UPF0102  38.6 
 
 
117 aa  78.6  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.662779 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0016  hypothetical protein  42.28 
 
 
129 aa  78.2  0.00000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.197298  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0017  hypothetical protein  40.68 
 
 
126 aa  77.8  0.00000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00052241  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2095  protein of unknown function UPF0102  40.62 
 
 
137 aa  77.8  0.00000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3998  protein of unknown function UPF0102  36.28 
 
 
139 aa  77.4  0.00000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13130  hypothetical protein  32.77 
 
 
120 aa  77.4  0.00000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07020  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  35.34 
 
 
186 aa  77  0.00000000000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00114408  normal  0.507303 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02085  hypothetical protein  38.94 
 
 
119 aa  76.6  0.0000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.997348  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0460  protein of unknown function UPF0102  40.35 
 
 
153 aa  76.6  0.0000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3756  hypothetical protein  37.29 
 
 
127 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00341379  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2217  hypothetical protein  39.13 
 
 
123 aa  75.5  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000089571  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2035  hypothetical protein  39.5 
 
 
122 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.848509  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1677  hypothetical protein  42.37 
 
 
122 aa  75.5  0.0000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.238653  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2474  hypothetical protein  37.27 
 
 
118 aa  75.9  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0253334  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2230  protein of unknown function UPF0102  37.82 
 
 
127 aa  73.9  0.0000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0169041  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1186  hypothetical protein  38.33 
 
 
140 aa  73.9  0.0000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00400032  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2398  hypothetical protein  40.83 
 
 
118 aa  73.6  0.0000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.430013  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0037  hypothetical protein  40.68 
 
 
127 aa  73.6  0.0000000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4420  hypothetical protein  39.6 
 
 
128 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.149236  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10390  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  35.83 
 
 
167 aa  73.2  0.000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000139118  unclonable  0.000000000910029 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1959  hypothetical protein  40.68 
 
 
122 aa  73.2  0.000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.142549  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3311  protein of unknown function UPF0102  39.18 
 
 
134 aa  72.8  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10070  conserved hypothetical protein TIGR00252  34.78 
 
 
153 aa  72.4  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0294595  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1792  hypothetical protein  37.17 
 
 
160 aa  72  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0017  hypothetical protein  40.68 
 
 
128 aa  71.2  0.000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000457371  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3485  hypothetical protein  39.83 
 
 
125 aa  71.2  0.000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000340579 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0546  hypothetical protein  38.66 
 
 
115 aa  71.2  0.000000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.672576  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1406  protein of unknown function UPF0102  35.04 
 
 
173 aa  70.9  0.000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000418677  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0639  conserved hypothetical protein TIGR00252  38.53 
 
 
182 aa  70.9  0.000000000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.372666 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0187  hypothetical protein  37.5 
 
 
125 aa  70.1  0.000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3424  hypothetical protein  39.83 
 
 
125 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0993  protein of unknown function UPF0102  36.13 
 
 
129 aa  68.9  0.00000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00109853  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4114  hypothetical protein  33.9 
 
 
123 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1992  hypothetical protein  38.98 
 
 
129 aa  69.3  0.00000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2488  protein of unknown function UPF0102  34.75 
 
 
123 aa  69.3  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0776001  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1291  protein of unknown function UPF0102  34.51 
 
 
115 aa  68.9  0.00000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000677509  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0910  hypothetical protein  34.29 
 
 
119 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.21322  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3065  hypothetical protein  35.04 
 
 
118 aa  68.6  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2019  protein of unknown function UPF0102  37.17 
 
 
134 aa  68.2  0.00000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.573307  normal  0.167847 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1969  hypothetical protein  36.44 
 
 
133 aa  67.8  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00399816  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2054  hypothetical protein  36.44 
 
 
133 aa  67.8  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.595954  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2103  hypothetical protein  33.05 
 
 
121 aa  67.4  0.00000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.374615  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2864  hypothetical protein  36.13 
 
 
122 aa  67  0.00000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00415914  hitchhiker  0.000000500394 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1156  hypothetical protein  33.63 
 
 
118 aa  66.6  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0160558  normal  0.0576877 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4996  hypothetical protein  32.38 
 
 
125 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.608406  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1947  hypothetical protein  38.89 
 
 
133 aa  65.5  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.439621  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2025  hypothetical protein  36.28 
 
 
119 aa  66.2  0.0000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1175  protein of unknown function UPF0102  30.09 
 
 
122 aa  65.5  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0465  hypothetical protein  40.2 
 
 
113 aa  65.9  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3452  hypothetical protein  39.17 
 
 
131 aa  65.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1723  hypothetical protein  31.19 
 
 
123 aa  65.1  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.471951 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2213  hypothetical protein  34.55 
 
 
132 aa  64.7  0.0000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000124547 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0701  hypothetical protein  38.05 
 
 
122 aa  64.7  0.0000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1910  hypothetical protein  36.28 
 
 
134 aa  64.3  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.179028  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3560  hypothetical protein  39.17 
 
 
131 aa  64.3  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4036  protein of unknown function UPF0102  37.17 
 
 
118 aa  64.3  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.261027  normal  0.0798574 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3454  hypothetical protein  39.17 
 
 
131 aa  64.3  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3523  hypothetical protein  39.17 
 
 
131 aa  64.3  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.578592  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3620  hypothetical protein  39.17 
 
 
131 aa  64.3  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0353  hypothetical protein  34.69 
 
 
128 aa  63.9  0.0000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1217  hypothetical protein  36.52 
 
 
123 aa  63.9  0.0000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.266389  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2532  protein of unknown function UPF0102  36.36 
 
 
118 aa  63.9  0.0000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.388001 
 
 
-
 
NC_004310  BR0178  hypothetical protein  33.65 
 
 
126 aa  63.2  0.000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.647134  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0650  hypothetical protein  36.44 
 
 
128 aa  62.4  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23670  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  28.81 
 
 
127 aa  62.4  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.183487  normal  0.0867152 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1550  hypothetical protein  33.61 
 
 
132 aa  62.8  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.176091 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3630  hypothetical protein  35.83 
 
 
131 aa  61.6  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11140  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  31.62 
 
 
120 aa  61.6  0.000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0330886  normal  0.323386 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57490  hypothetical protein  30.48 
 
 
125 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03015  hypothetical protein  36.67 
 
 
131 aa  61.6  0.000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0557  protein of unknown function UPF0102  36.67 
 
 
131 aa  61.6  0.000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02966  hypothetical protein  36.67 
 
 
131 aa  61.6  0.000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0550  hypothetical protein  36.67 
 
 
131 aa  61.6  0.000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2881  hypothetical protein  27.73 
 
 
146 aa  61.2  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.696458 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0320  hypothetical protein  33.63 
 
 
135 aa  61.2  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0553  protein of unknown function UPF0102  32.73 
 
 
118 aa  61.2  0.000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.156898 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4010  hypothetical protein  32.67 
 
 
124 aa  61.6  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.571569  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0676  hypothetical protein  33.33 
 
 
167 aa  61.2  0.000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0552943  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2298  hypothetical protein  32.74 
 
 
123 aa  61.2  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0016  hypothetical protein  42.86 
 
 
127 aa  61.2  0.000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.204452  unclonable  0.000000883308 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3443  hypothetical protein  35.83 
 
 
131 aa  60.8  0.000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3248  hypothetical protein  31.82 
 
 
124 aa  61.2  0.000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.852323  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1228  hypothetical protein  31.62 
 
 
119 aa  61.2  0.000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.74821  normal  0.260342 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1639  hypothetical protein  37.5 
 
 
136 aa  60.8  0.000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.106195 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0175  hypothetical protein  34.21 
 
 
139 aa  60.8  0.000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.361745 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>