248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4331 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_4331  hypothetical protein  100 
 
 
122 aa  239  7e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.84486 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4594  hypothetical protein  93.44 
 
 
122 aa  189  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.042758 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0353  hypothetical protein  65.22 
 
 
128 aa  149  1e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3545  hypothetical protein  66.67 
 
 
122 aa  145  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4010  hypothetical protein  58.41 
 
 
124 aa  124  6e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.571569  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0178  hypothetical protein  59.29 
 
 
126 aa  123  1e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.647134  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0187  hypothetical protein  56.64 
 
 
125 aa  122  1e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1042  hypothetical protein  50.44 
 
 
122 aa  110  5e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0556279  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0420  hypothetical protein  48.67 
 
 
128 aa  95.9  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0325  hypothetical protein  45.24 
 
 
130 aa  95.9  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.493012  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0400  hypothetical protein  47.79 
 
 
131 aa  94  6e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3014  hypothetical protein  45.05 
 
 
127 aa  93.2  1e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0181  hypothetical protein  50.44 
 
 
136 aa  92.8  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.973166  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0146  hypothetical protein  48.18 
 
 
135 aa  91.3  4e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0320  hypothetical protein  46.02 
 
 
135 aa  89.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0116  hypothetical protein  45.61 
 
 
118 aa  85.9  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.185512 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0439  hypothetical protein  46.61 
 
 
128 aa  81.6  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.111388  normal  0.465101 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0406  hypothetical protein  46.61 
 
 
128 aa  81.3  0.000000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.442549 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3586  hypothetical protein  42.02 
 
 
133 aa  77.4  0.00000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0293  protein of unknown function UPF0102  44.44 
 
 
124 aa  75.5  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.210059 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3496  hypothetical protein  38.14 
 
 
125 aa  75.1  0.0000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.215369 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0175  hypothetical protein  45.79 
 
 
139 aa  73.2  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.361745 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1218  protein of unknown function UPF0102  39.82 
 
 
119 aa  70.1  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.648075  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0189  protein of unknown function UPF0102  35.45 
 
 
127 aa  67.8  0.00000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.452343  normal  0.48907 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2864  hypothetical protein  38.33 
 
 
122 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00415914  hitchhiker  0.000000500394 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1703  hypothetical protein  35.09 
 
 
123 aa  65.9  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0021  hypothetical protein  41.12 
 
 
133 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0577391 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3998  protein of unknown function UPF0102  40.62 
 
 
139 aa  64.7  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0572  hypothetical protein  37.27 
 
 
118 aa  64.7  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.421068  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2398  hypothetical protein  36.36 
 
 
118 aa  63.5  0.0000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.430013  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1530  hypothetical protein  32.76 
 
 
118 aa  62.4  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0048655  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0339  hypothetical protein  43.93 
 
 
127 aa  62.8  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0692015  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3485  hypothetical protein  36.61 
 
 
125 aa  62  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000340579 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1406  protein of unknown function UPF0102  39.58 
 
 
114 aa  61.6  0.000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0474  hypothetical protein  45.76 
 
 
125 aa  61.6  0.000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0017  hypothetical protein  35.9 
 
 
128 aa  61.2  0.000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000457371  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3424  hypothetical protein  36.61 
 
 
125 aa  60.8  0.000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0977  hypothetical protein  36.46 
 
 
119 aa  60.1  0.000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.320606  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3692  hypothetical protein  37.96 
 
 
125 aa  60.1  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.598845  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2083  hypothetical protein  41.75 
 
 
104 aa  59.7  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2938  hypothetical protein  37.17 
 
 
129 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.703285  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0629  hypothetical protein  34.78 
 
 
122 aa  60.1  0.00000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3756  hypothetical protein  36.61 
 
 
127 aa  60.1  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00341379  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0024  hypothetical protein  42.5 
 
 
129 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0228023  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1910  hypothetical protein  39.39 
 
 
134 aa  58.5  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.179028  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0720  hypothetical protein  36.08 
 
 
126 aa  58.5  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0341617  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1969  hypothetical protein  40.4 
 
 
133 aa  58.5  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00399816  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2298  hypothetical protein  39.18 
 
 
123 aa  58.5  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2054  hypothetical protein  40.4 
 
 
133 aa  58.5  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.595954  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2095  protein of unknown function UPF0102  36.21 
 
 
137 aa  58.2  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1376  protein of unknown function UPF0102  29.82 
 
 
119 aa  58.2  0.00000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000032081  normal  0.333882 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2007  hypothetical protein  42.57 
 
 
124 aa  57.8  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.63182  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0037  hypothetical protein  33.9 
 
 
127 aa  57.8  0.00000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0650  hypothetical protein  36.61 
 
 
128 aa  57.4  0.00000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1992  hypothetical protein  37.89 
 
 
129 aa  57.4  0.00000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2230  protein of unknown function UPF0102  35.96 
 
 
127 aa  57  0.00000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0169041  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2830  hypothetical protein  39.24 
 
 
134 aa  56.6  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.31307  normal  0.486249 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1156  hypothetical protein  40.59 
 
 
118 aa  55.8  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0160558  normal  0.0576877 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2217  hypothetical protein  38.39 
 
 
123 aa  55.8  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000089571  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2488  protein of unknown function UPF0102  49.32 
 
 
123 aa  55.8  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0776001  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0695  hypothetical protein  33.7 
 
 
108 aa  55.5  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000229548  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0671  hypothetical protein  33.7 
 
 
108 aa  55.5  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000156143  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0758  hypothetical protein  39.58 
 
 
130 aa  55.5  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2035  hypothetical protein  32.38 
 
 
122 aa  55.8  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.848509  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4433  hypothetical protein  29.46 
 
 
129 aa  55.1  0.0000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.875795  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1186  hypothetical protein  38.38 
 
 
140 aa  54.7  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00400032  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0992  hypothetical protein  41.24 
 
 
117 aa  54.3  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.528214  normal  0.0951104 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2202  hypothetical protein  35.85 
 
 
121 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.474644  normal  0.174288 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3452  hypothetical protein  37.3 
 
 
131 aa  54.3  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3709  protein of unknown function UPF0102  34.21 
 
 
119 aa  54.3  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00890  hypothetical protein  32.29 
 
 
122 aa  53.9  0.0000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2201  hypothetical protein  37.37 
 
 
123 aa  54.3  0.0000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3625  hypothetical protein  36.7 
 
 
113 aa  53.9  0.0000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3454  hypothetical protein  37.3 
 
 
131 aa  53.9  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3620  hypothetical protein  37.3 
 
 
131 aa  53.9  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3560  hypothetical protein  37.3 
 
 
131 aa  53.9  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2103  hypothetical protein  36.54 
 
 
121 aa  53.9  0.0000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.374615  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3523  hypothetical protein  37.3 
 
 
131 aa  53.9  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.578592  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07400  hypothetical protein  32.43 
 
 
116 aa  53.9  0.0000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0465  hypothetical protein  30.28 
 
 
113 aa  53.9  0.0000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1324  hypothetical protein  32.46 
 
 
124 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.294844  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0017  hypothetical protein  37.11 
 
 
126 aa  53.1  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00052241  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4400  hypothetical protein  34.02 
 
 
123 aa  52.8  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.147019 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3311  protein of unknown function UPF0102  36.46 
 
 
134 aa  52.8  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1291  protein of unknown function UPF0102  34.38 
 
 
115 aa  53.1  0.000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000677509  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0930  hypothetical protein  37.78 
 
 
123 aa  53.5  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.930588  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0666  hypothetical protein  36 
 
 
116 aa  53.1  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0397911  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1406  protein of unknown function UPF0102  40.16 
 
 
173 aa  52.4  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000418677  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1509  hypothetical protein  27.78 
 
 
133 aa  52  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0262  hypothetical protein  35.87 
 
 
116 aa  52.4  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.605183  normal  0.332641 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0538  hypothetical protein  42.17 
 
 
117 aa  52.8  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.670141  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0546  hypothetical protein  31.82 
 
 
115 aa  52  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.672576  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1121  hypothetical protein  42.17 
 
 
117 aa  52.8  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0460  protein of unknown function UPF0102  35.48 
 
 
153 aa  52.4  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0474  hypothetical protein  42.17 
 
 
117 aa  52.8  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0016  hypothetical protein  33.9 
 
 
129 aa  52.4  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.197298  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0553  protein of unknown function UPF0102  38.05 
 
 
118 aa  51.6  0.000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.156898 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0739  hypothetical protein  34.69 
 
 
120 aa  52  0.000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.235623  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1947  hypothetical protein  35.56 
 
 
133 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.439621  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4524  hypothetical protein  32.99 
 
 
123 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>