212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3545 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_3545  hypothetical protein  100 
 
 		 122 aa  244  4e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4331  hypothetical protein  66.67 
 
 		 122 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.84486 
 
 
-
 
NC_004310  BR0178  hypothetical protein  64.55 
 
 		 126 aa  139  1.9999999999999998e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.647134  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0353  hypothetical protein  59.66 
 
 		 128 aa  138  1.9999999999999998e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4010  hypothetical protein  61.26 
 
 		 124 aa  137  4.999999999999999e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.571569  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0187  hypothetical protein  60.18 
 
 		 125 aa  133  7.000000000000001e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4594  hypothetical protein  66.35 
 
 		 122 aa  125  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.042758 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1042  hypothetical protein  49.55 
 
 		 122 aa  111  3e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0556279  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0146  hypothetical protein  51.33 
 
 		 135 aa  108  3e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0420  hypothetical protein  51.33 
 
 		 128 aa  107  5e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0181  hypothetical protein  50.44 
 
 		 136 aa  107  8.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.973166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0116  hypothetical protein  50 
 
 		 118 aa  106  1e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.185512 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0400  hypothetical protein  49.56 
 
 		 131 aa  104  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0320  hypothetical protein  49.56 
 
 		 135 aa  103  6e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0325  hypothetical protein  46.9 
 
 		 130 aa  99  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.493012  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3586  hypothetical protein  49.11 
 
 		 133 aa  94  6e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0293  protein of unknown function UPF0102  47.86 
 
 		 124 aa  94  7e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.210059 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3014  hypothetical protein  42.45 
 
 		 127 aa  88.2  3e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0439  hypothetical protein  48.6 
 
 		 128 aa  84  6e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.111388  normal  0.465101 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0406  hypothetical protein  48.6 
 
 		 128 aa  84  6e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.442549 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0021  hypothetical protein  47.66 
 
 		 133 aa  83.6  7e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0577391 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3496  hypothetical protein  40.91 
 
 		 125 aa  80.9  0.000000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.215369 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0175  hypothetical protein  41.51 
 
 		 139 aa  76.6  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.361745 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0024  hypothetical protein  48.6 
 
 		 129 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0228023  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0572  hypothetical protein  42.73 
 
 		 118 aa  73.2  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.421068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2938  hypothetical protein  37.39 
 
 		 129 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.703285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0474  hypothetical protein  46.88 
 
 		 125 aa  69.3  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3692  hypothetical protein  42.06 
 
 		 125 aa  69.3  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.598845  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0339  hypothetical protein  43.93 
 
 		 127 aa  67  0.00000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0692015  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3485  hypothetical protein  36.61 
 
 		 125 aa  64.3  0.0000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000340579 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2230  protein of unknown function UPF0102  37.17 
 
 		 127 aa  63.9  0.0000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0169041  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3424  hypothetical protein  36.61 
 
 		 125 aa  63.5  0.0000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0650  hypothetical protein  38.54 
 
 		 128 aa  60.8  0.000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2488  protein of unknown function UPF0102  41.84 
 
 		 123 aa  61.2  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0776001  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1530  hypothetical protein  35.05 
 
 		 118 aa  60.1  0.000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0048655  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2095  protein of unknown function UPF0102  36.46 
 
 		 137 aa  59.7  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0629  hypothetical protein  31.9 
 
 		 122 aa  59.3  0.00000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5877  protein of unknown function UPF0102  36.94 
 
 		 117 aa  59.3  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.662779 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1376  protein of unknown function UPF0102  32.46 
 
 		 119 aa  58.5  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000032081  normal  0.333882 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1703  hypothetical protein  31.58 
 
 		 123 aa  58.2  0.00000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004502  endonuclease  33.33 
 
 		 122 aa  57.8  0.00000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000161677  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2864  hypothetical protein  36.84 
 
 		 122 aa  57.4  0.00000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00415914  hitchhiker  0.000000500394 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5237  protein of unknown function UPF0102  33.33 
 
 		 164 aa  57.4  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3998  protein of unknown function UPF0102  38.54 
 
 		 139 aa  57.4  0.00000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0700  protein of unknown function UPF0102  35.65 
 
 		 172 aa  57  0.00000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000202877  hitchhiker  0.000000354886 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07400  hypothetical protein  30.63 
 
 		 116 aa  57  0.00000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0355  hypothetical protein  33.04 
 
 		 124 aa  56.6  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1901  formate dehydrogenase H large subunit  32.29 
 
 		 109 aa  56.2  0.0000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1291  protein of unknown function UPF0102  33.68 
 
 		 115 aa  57  0.0000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000677509  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0262  hypothetical protein  37.63 
 
 		 116 aa  56.6  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.605183  normal  0.332641 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0720  hypothetical protein  37.37 
 
 		 126 aa  55.5  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0341617  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1186  hypothetical protein  37.14 
 
 		 140 aa  55.5  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00400032  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3355  hypothetical protein  38 
 
 		 108 aa  55.5  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00890  hypothetical protein  33.33 
 
 		 122 aa  55.1  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4433  hypothetical protein  32.99 
 
 		 129 aa  54.7  0.0000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.875795  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03356  Sigma-54 factor  34.02 
 
 		 113 aa  54.7  0.0000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2398  hypothetical protein  36.11 
 
 		 118 aa  54.7  0.0000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.430013  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2830  hypothetical protein  37.97 
 
 		 134 aa  55.1  0.0000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.31307  normal  0.486249 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1218  protein of unknown function UPF0102  35.34 
 
 		 119 aa  54.3  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.648075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1406  protein of unknown function UPF0102  37.5 
 
 		 114 aa  54.3  0.0000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0189  protein of unknown function UPF0102  33.33 
 
 		 127 aa  54.7  0.0000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.452343  normal  0.48907 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3630  hypothetical protein  35.29 
 
 		 131 aa  54.3  0.0000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3585  hypothetical protein  34.31 
 
 		 131 aa  53.9  0.0000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.186326 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4467  hypothetical protein  35.29 
 
 		 131 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3624  hypothetical protein  35.29 
 
 		 131 aa  53.5  0.0000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3443  hypothetical protein  34.31 
 
 		 131 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3560  hypothetical protein  38.27 
 
 		 131 aa  52.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3620  hypothetical protein  38.27 
 
 		 131 aa  52.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0093  hypothetical protein  33.33 
 
 		 122 aa  53.1  0.000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.560974  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3454  hypothetical protein  38.27 
 
 		 131 aa  52.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3452  hypothetical protein  38.27 
 
 		 131 aa  53.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3523  hypothetical protein  38.27 
 
 		 131 aa  52.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.578592  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03015  hypothetical protein  34.31 
 
 		 131 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0557  protein of unknown function UPF0102  34.31 
 
 		 131 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0977  hypothetical protein  34.38 
 
 		 119 aa  52.4  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.320606  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2201  hypothetical protein  34.48 
 
 		 123 aa  52.8  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0388  hypothetical protein  37.76 
 
 		 108 aa  52.4  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.597532  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0037  hypothetical protein  34.19 
 
 		 127 aa  52.4  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2202  hypothetical protein  37.89 
 
 		 121 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.474644  normal  0.174288 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0666  hypothetical protein  36.84 
 
 		 116 aa  52.4  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0397911  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02966  hypothetical protein  34.31 
 
 		 131 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0550  hypothetical protein  34.31 
 
 		 131 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_687  endonuclease  34.02 
 
 		 121 aa  52  0.000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2083  hypothetical protein  37.25 
 
 		 104 aa  51.6  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1217  hypothetical protein  32.74 
 
 		 123 aa  52  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.266389  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1407  protein of unknown function UPF0102  35.29 
 
 		 122 aa  52  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.993674  normal  0.0549137 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0756  hypothetical protein  32.76 
 
 		 118 aa  52  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.477778  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2298  hypothetical protein  37.5 
 
 		 123 aa  51.6  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3756  hypothetical protein  37.74 
 
 		 127 aa  51.2  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00341379  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0992  hypothetical protein  41.98 
 
 		 117 aa  51.6  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.528214  normal  0.0951104 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0460  protein of unknown function UPF0102  36.27 
 
 		 153 aa  51.2  0.000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1228  hypothetical protein  38.83 
 
 		 119 aa  49.7  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.74821  normal  0.260342 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0016  hypothetical protein  36.08 
 
 		 129 aa  50.1  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.197298  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1992  hypothetical protein  36.84 
 
 		 129 aa  49.7  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3783  hypothetical protein  37.04 
 
 		 118 aa  50.1  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00882109  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0758  hypothetical protein  37.5 
 
 		 130 aa  50.1  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1406  protein of unknown function UPF0102  36.92 
 
 		 173 aa  50.1  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000418677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0546  hypothetical protein  29.09 
 
 		 115 aa  49.7  0.00001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.672576  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1723  hypothetical protein  41.18 
 
 		 123 aa  50.1  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.471951 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0538  hypothetical protein  41.43 
 
 		 117 aa  49.3  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.670141  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>