237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0406 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_0406  hypothetical protein  100 
 
 		 128 aa  241  3e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.442549 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0439  hypothetical protein  98.44 
 
 		 128 aa  238  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.111388  normal  0.465101 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0474  hypothetical protein  88.8 
 
 		 125 aa  162  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0024  hypothetical protein  78.69 
 
 		 129 aa  132  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0228023  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0021  hypothetical protein  74.34 
 
 		 133 aa  131  3e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0577391 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2938  hypothetical protein  59.35 
 
 		 129 aa  131  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.703285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3496  hypothetical protein  59.32 
 
 		 125 aa  123  9e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.215369 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0293  protein of unknown function UPF0102  57.76 
 
 		 124 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.210059 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0420  hypothetical protein  53.39 
 
 		 128 aa  110  6e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0400  hypothetical protein  51.64 
 
 		 131 aa  110  6e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0181  hypothetical protein  51.64 
 
 		 136 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.973166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0320  hypothetical protein  55.14 
 
 		 135 aa  107  5e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3586  hypothetical protein  56.6 
 
 		 133 aa  105  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0325  hypothetical protein  52.34 
 
 		 130 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.493012  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0146  hypothetical protein  54.21 
 
 		 135 aa  105  3e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0116  hypothetical protein  52.34 
 
 		 118 aa  101  3e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.185512 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0187  hypothetical protein  47.06 
 
 		 125 aa  100  5e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0353  hypothetical protein  45.9 
 
 		 128 aa  100  6e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0178  hypothetical protein  48.31 
 
 		 126 aa  97.8  5e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.647134  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4010  hypothetical protein  48.67 
 
 		 124 aa  94  6e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.571569  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3545  hypothetical protein  48.6 
 
 		 122 aa  89.4  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3014  hypothetical protein  48.15 
 
 		 127 aa  85.9  2e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1042  hypothetical protein  42.98 
 
 		 122 aa  85.9  2e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0556279  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4331  hypothetical protein  46.61 
 
 		 122 aa  85.1  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.84486 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3692  hypothetical protein  46.79 
 
 		 125 aa  84  6e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.598845  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0572  hypothetical protein  42.61 
 
 		 118 aa  72.4  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.421068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0175  hypothetical protein  44.55 
 
 		 139 aa  71.2  0.000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.361745 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4594  hypothetical protein  44.66 
 
 		 122 aa  69.3  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.042758 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2864  hypothetical protein  36.75 
 
 		 122 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00415914  hitchhiker  0.000000500394 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0339  hypothetical protein  47.32 
 
 		 127 aa  68.2  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0692015  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0017  hypothetical protein  36.07 
 
 		 128 aa  64.3  0.0000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000457371  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2103  hypothetical protein  45.65 
 
 		 121 aa  64.3  0.0000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.374615  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1062  hypothetical protein  39.55 
 
 		 138 aa  62  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.340253 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2230  protein of unknown function UPF0102  38.46 
 
 		 127 aa  62  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0169041  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3298  hypothetical protein  40.62 
 
 		 124 aa  60.5  0.000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.861672  normal  0.570212 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0650  hypothetical protein  37.17 
 
 		 128 aa  60.1  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3424  hypothetical protein  31.4 
 
 		 125 aa  59.7  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0262  hypothetical protein  40.62 
 
 		 116 aa  59.7  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.605183  normal  0.332641 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3485  hypothetical protein  30.58 
 
 		 125 aa  58.9  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000340579 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2083  hypothetical protein  47.52 
 
 		 104 aa  58.9  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4524  hypothetical protein  35.9 
 
 		 123 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0932  hypothetical protein  35.9 
 
 		 123 aa  58.2  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3756  hypothetical protein  34.75 
 
 		 127 aa  58.9  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00341379  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0093  hypothetical protein  26.17 
 
 		 122 aa  58.2  0.00000004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.560974  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2283  hypothetical protein  39.8 
 
 		 113 aa  57.8  0.00000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.567685 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0189  protein of unknown function UPF0102  36.22 
 
 		 127 aa  57.8  0.00000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.452343  normal  0.48907 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2398  hypothetical protein  33.04 
 
 		 118 aa  57  0.00000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.430013  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1695  hypothetical protein  30.91 
 
 		 120 aa  56.6  0.0000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4685  hypothetical protein  35.4 
 
 		 120 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0484178 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2019  protein of unknown function UPF0102  39.6 
 
 		 134 aa  55.8  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.573307  normal  0.167847 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0315  protein of unknown function UPF0102  37.17 
 
 		 121 aa  56.2  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000225244 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0589  hypothetical protein  39.36 
 
 		 131 aa  55.8  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.424556  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0695  hypothetical protein  37.63 
 
 		 108 aa  55.8  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000229548  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1530  hypothetical protein  29.82 
 
 		 118 aa  55.5  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0048655  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2830  hypothetical protein  37.78 
 
 		 134 aa  55.8  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.31307  normal  0.486249 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0142  conserved hypothetical protein TIGR00252  37.17 
 
 		 121 aa  56.2  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0671  hypothetical protein  37.63 
 
 		 108 aa  55.8  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000156143  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0977  hypothetical protein  32.58 
 
 		 119 aa  55.1  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.320606  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13130  hypothetical protein  41.38 
 
 		 120 aa  55.5  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4400  hypothetical protein  35.04 
 
 		 123 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.147019 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1703  hypothetical protein  31.25 
 
 		 123 aa  55.1  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1324  hypothetical protein  35.04 
 
 		 124 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.294844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3443  hypothetical protein  40 
 
 		 131 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0503  hypothetical protein  37.27 
 
 		 120 aa  54.3  0.0000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.451178 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2488  protein of unknown function UPF0102  37.23 
 
 		 123 aa  54.7  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0776001  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2395  hypothetical protein  32.79 
 
 		 127 aa  54.7  0.0000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.615386  normal  0.0739869 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1186  hypothetical protein  34.43 
 
 		 140 aa  54.3  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00400032  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03015  hypothetical protein  40 
 
 		 131 aa  54.3  0.0000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0557  protein of unknown function UPF0102  40 
 
 		 131 aa  54.3  0.0000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1723  hypothetical protein  39.13 
 
 		 123 aa  53.9  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.471951 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02966  hypothetical protein  40 
 
 		 131 aa  54.3  0.0000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3959  hypothetical protein  39.13 
 
 		 137 aa  54.3  0.0000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0550  hypothetical protein  40 
 
 		 131 aa  54.3  0.0000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3630  hypothetical protein  40 
 
 		 131 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004502  endonuclease  34.04 
 
 		 122 aa  53.9  0.0000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000161677  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4433  hypothetical protein  33.98 
 
 		 129 aa  53.5  0.0000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.875795  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00890  hypothetical protein  36.17 
 
 		 122 aa  53.1  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4467  hypothetical protein  40 
 
 		 131 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2007  hypothetical protein  36.84 
 
 		 124 aa  53.5  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.63182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0037  hypothetical protein  33.75 
 
 		 127 aa  53.1  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0546  hypothetical protein  31.25 
 
 		 115 aa  52.8  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.672576  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3065  hypothetical protein  26.5 
 
 		 118 aa  52.4  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0016  hypothetical protein  36.25 
 
 		 129 aa  52.4  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.197298  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4800  hypothetical protein  35.48 
 
 		 151 aa  52.8  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0017  hypothetical protein  30 
 
 		 126 aa  52.8  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00052241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3146  sigma-54 factor  34.82 
 
 		 118 aa  52.4  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2202  hypothetical protein  37.17 
 
 		 121 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.474644  normal  0.174288 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2298  hypothetical protein  35.9 
 
 		 123 aa  52.4  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1156  hypothetical protein  40.74 
 
 		 118 aa  52  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0160558  normal  0.0576877 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1992  hypothetical protein  36.84 
 
 		 129 aa  52  0.000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1959  hypothetical protein  27 
 
 		 122 aa  52  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.142549  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0675  protein of unknown function UPF0102  33.96 
 
 		 165 aa  52  0.000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1748  hypothetical protein  36.08 
 
 		 121 aa  51.2  0.000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0057  hypothetical protein  22.43 
 
 		 122 aa  51.6  0.000004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1413  hypothetical protein  25 
 
 		 112 aa  51.2  0.000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1674  hypothetical protein  36.08 
 
 		 121 aa  51.2  0.000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0630  hypothetical protein  37.93 
 
 		 144 aa  51.2  0.000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1406  protein of unknown function UPF0102  38.14 
 
 		 114 aa  51.6  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1406  protein of unknown function UPF0102  32.37 
 
 		 173 aa  51.6  0.000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000418677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3311  protein of unknown function UPF0102  42.5 
 
 		 134 aa  51.2  0.000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>