174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3692 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3692  hypothetical protein  100 
 
 		 125 aa  239  1e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.598845  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3586  hypothetical protein  51.33 
 
 		 133 aa  105  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3014  hypothetical protein  47.58 
 
 		 127 aa  99.4  1e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0572  hypothetical protein  46.15 
 
 		 118 aa  94  6e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.421068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0325  hypothetical protein  46.43 
 
 		 130 aa  92.8  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.493012  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3496  hypothetical protein  43.55 
 
 		 125 aa  90.9  5e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.215369 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0320  hypothetical protein  46.43 
 
 		 135 aa  88.6  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0181  hypothetical protein  46.43 
 
 		 136 aa  87.4  6e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.973166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0353  hypothetical protein  39.83 
 
 		 128 aa  87.4  6e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0400  hypothetical protein  45.54 
 
 		 131 aa  87  9e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0146  hypothetical protein  48.21 
 
 		 135 aa  86.7  9e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0420  hypothetical protein  44.64 
 
 		 128 aa  86.3  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1042  hypothetical protein  41.88 
 
 		 122 aa  84  6e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0556279  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0116  hypothetical protein  47.27 
 
 		 118 aa  82.8  0.000000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.185512 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4010  hypothetical protein  40.83 
 
 		 124 aa  83.2  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.571569  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0262  hypothetical protein  50 
 
 		 116 aa  82.4  0.000000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.605183  normal  0.332641 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0293  protein of unknown function UPF0102  41.8 
 
 		 124 aa  82  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.210059 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3545  hypothetical protein  41.96 
 
 		 122 aa  80.1  0.000000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0439  hypothetical protein  46.22 
 
 		 128 aa  78.2  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.111388  normal  0.465101 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0187  hypothetical protein  40.17 
 
 		 125 aa  78.2  0.00000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0406  hypothetical protein  46.22 
 
 		 128 aa  77.8  0.00000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.442549 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4331  hypothetical protein  39.32 
 
 		 122 aa  77  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.84486 
 
 
-
 
NC_004310  BR0178  hypothetical protein  41.88 
 
 		 126 aa  76.3  0.0000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.647134  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0017  hypothetical protein  43.43 
 
 		 126 aa  72.8  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00052241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0175  hypothetical protein  41.44 
 
 		 139 aa  67.8  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.361745 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3919  protein of unknown function UPF0102  36.27 
 
 		 144 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000143067  normal  0.216721 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3870  protein of unknown function UPF0102  36.27 
 
 		 144 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2083  hypothetical protein  45.79 
 
 		 104 aa  64.7  0.0000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0037  hypothetical protein  37 
 
 		 127 aa  63.9  0.0000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0017  hypothetical protein  38.38 
 
 		 128 aa  62  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000457371  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2398  hypothetical protein  35.71 
 
 		 118 aa  62.4  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.430013  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1291  protein of unknown function UPF0102  31.86 
 
 		 115 aa  62  0.000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000677509  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0189  protein of unknown function UPF0102  34.21 
 
 		 127 aa  62  0.000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.452343  normal  0.48907 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0977  hypothetical protein  35.35 
 
 		 119 aa  62  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.320606  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0474  hypothetical protein  46.39 
 
 		 125 aa  61.2  0.000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0675  protein of unknown function UPF0102  36 
 
 		 165 aa  60.8  0.000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4594  hypothetical protein  38.89 
 
 		 122 aa  61.2  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.042758 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2938  hypothetical protein  36.84 
 
 		 129 aa  60.5  0.000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.703285  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3485  hypothetical protein  31.5 
 
 		 125 aa  60.1  0.000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000340579 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3756  hypothetical protein  35.43 
 
 		 127 aa  59.7  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00341379  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1723  hypothetical protein  36.27 
 
 		 123 aa  59.7  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.471951 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0057  hypothetical protein  30.63 
 
 		 122 aa  59.3  0.00000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2019  protein of unknown function UPF0102  38.61 
 
 		 134 aa  58.9  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.573307  normal  0.167847 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0093  hypothetical protein  29.73 
 
 		 122 aa  58.9  0.00000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.560974  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3424  hypothetical protein  32.28 
 
 		 125 aa  59.3  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2830  hypothetical protein  43.9 
 
 		 134 aa  59.3  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.31307  normal  0.486249 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0021  hypothetical protein  40.87 
 
 		 133 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0577391 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0900  hypothetical protein  42.17 
 
 		 100 aa  58.2  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.813892 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0465  hypothetical protein  30.09 
 
 		 113 aa  58.2  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0016  hypothetical protein  37.37 
 
 		 129 aa  57.8  0.00000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.197298  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2007  hypothetical protein  36.27 
 
 		 124 aa  57.4  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.63182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1992  hypothetical protein  33.06 
 
 		 129 aa  56.6  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2230  protein of unknown function UPF0102  38.66 
 
 		 127 aa  56.6  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0169041  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1959  hypothetical protein  28.57 
 
 		 122 aa  56.2  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.142549  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1677  hypothetical protein  29.37 
 
 		 122 aa  55.5  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.238653  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0546  hypothetical protein  30.17 
 
 		 115 aa  55.8  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.672576  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0024  hypothetical protein  42.15 
 
 		 129 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0228023  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0650  hypothetical protein  38.26 
 
 		 128 aa  54.7  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1509  hypothetical protein  29.57 
 
 		 133 aa  54.7  0.0000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0339  hypothetical protein  42.86 
 
 		 127 aa  54.7  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0692015  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3065  hypothetical protein  25.42 
 
 		 118 aa  54.3  0.0000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1406  protein of unknown function UPF0102  36.89 
 
 		 114 aa  53.9  0.0000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1324  protein of unknown function UPF0102  33.98 
 
 		 148 aa  53.9  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4800  hypothetical protein  36.54 
 
 		 151 aa  53.9  0.0000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0315  protein of unknown function UPF0102  35.04 
 
 		 121 aa  53.9  0.0000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000225244 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0671  hypothetical protein  32.11 
 
 		 108 aa  53.5  0.0000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000156143  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0142  conserved hypothetical protein TIGR00252  35.04 
 
 		 121 aa  53.9  0.0000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0695  hypothetical protein  32.11 
 
 		 108 aa  53.5  0.0000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000229548  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1530  hypothetical protein  32.32 
 
 		 118 aa  53.5  0.0000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0048655  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2217  hypothetical protein  36.36 
 
 		 123 aa  53.5  0.0000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000089571  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2864  hypothetical protein  34.75 
 
 		 122 aa  53.5  0.0000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00415914  hitchhiker  0.000000500394 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0629  hypothetical protein  30 
 
 		 122 aa  53.1  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13130  hypothetical protein  37.25 
 
 		 120 aa  53.1  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3709  protein of unknown function UPF0102  28.8 
 
 		 119 aa  52.8  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0460  protein of unknown function UPF0102  36.94 
 
 		 153 aa  52.4  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1695  hypothetical protein  28.81 
 
 		 120 aa  52.8  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2261  hypothetical protein  37 
 
 		 128 aa  52.4  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0216  hypothetical protein  31.33 
 
 		 112 aa  52.8  0.000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1218  protein of unknown function UPF0102  27.35 
 
 		 119 aa  52.8  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.648075  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1376  protein of unknown function UPF0102  28.1 
 
 		 119 aa  52  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000032081  normal  0.333882 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1475  endonuclease  33.66 
 
 		 115 aa  52  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.733308  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5237  protein of unknown function UPF0102  30.69 
 
 		 164 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1062  hypothetical protein  35.19 
 
 		 138 aa  51.6  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.340253 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0993  protein of unknown function UPF0102  35.83 
 
 		 129 aa  51.6  0.000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00109853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0630  hypothetical protein  35.64 
 
 		 144 aa  51.2  0.000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2103  hypothetical protein  35.51 
 
 		 121 aa  50.8  0.000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.374615  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3740  protein of unknown function UPF0102  35.35 
 
 		 121 aa  51.2  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000086697  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07400  hypothetical protein  28.33 
 
 		 116 aa  50.8  0.000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3298  hypothetical protein  37.29 
 
 		 124 aa  50.8  0.000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.861672  normal  0.570212 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0016  hypothetical protein  36.36 
 
 		 127 aa  50.8  0.000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.204452  unclonable  0.000000883308 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02085  hypothetical protein  27.5 
 
 		 119 aa  50.4  0.000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.997348  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3985  hypothetical protein  34.65 
 
 		 143 aa  49.7  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.889068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1186  hypothetical protein  35.78 
 
 		 140 aa  49.7  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00400032  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0758  hypothetical protein  32.99 
 
 		 130 aa  49.7  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2298  hypothetical protein  33.94 
 
 		 123 aa  49.7  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1703  hypothetical protein  31.31 
 
 		 123 aa  49.7  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0666  hypothetical protein  38 
 
 		 116 aa  50.1  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0397911  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0781  hypothetical protein  31.31 
 
 		 121 aa  48.9  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0355  hypothetical protein  28.81 
 
 		 124 aa  48.5  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3959  hypothetical protein  33.64 
 
 		 137 aa  48.1  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>