178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_0021 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_0021  hypothetical protein  100 
 
 		 133 aa  252  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0577391 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0024  hypothetical protein  90.16 
 
 		 129 aa  160  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0228023  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0406  hypothetical protein  71.77 
 
 		 128 aa  147  3e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.442549 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0439  hypothetical protein  70.97 
 
 		 128 aa  145  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.111388  normal  0.465101 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2938  hypothetical protein  61.67 
 
 		 129 aa  135  2e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.703285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0293  protein of unknown function UPF0102  53.66 
 
 		 124 aa  123  1e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.210059 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3496  hypothetical protein  52.42 
 
 		 125 aa  117  3.9999999999999996e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.215369 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0474  hypothetical protein  69.83 
 
 		 125 aa  115  3e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0181  hypothetical protein  45.45 
 
 		 136 aa  104  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.973166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0146  hypothetical protein  50 
 
 		 135 aa  104  4e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0187  hypothetical protein  45.69 
 
 		 125 aa  104  4e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4010  hypothetical protein  50.88 
 
 		 124 aa  102  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.571569  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0178  hypothetical protein  46.55 
 
 		 126 aa  101  3e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.647134  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0420  hypothetical protein  49.14 
 
 		 128 aa  100  9e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0400  hypothetical protein  46.72 
 
 		 131 aa  99  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0116  hypothetical protein  47.79 
 
 		 118 aa  97.8  5e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.185512 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0320  hypothetical protein  48.72 
 
 		 135 aa  97.1  8e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3586  hypothetical protein  53.15 
 
 		 133 aa  96.7  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0353  hypothetical protein  45.24 
 
 		 128 aa  94.7  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3545  hypothetical protein  47.66 
 
 		 122 aa  94.4  5e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0325  hypothetical protein  47.79 
 
 		 130 aa  90.5  7e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.493012  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3014  hypothetical protein  49.07 
 
 		 127 aa  82.8  0.000000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1042  hypothetical protein  39.82 
 
 		 122 aa  79.7  0.00000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0556279  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4331  hypothetical protein  41.53 
 
 		 122 aa  72.4  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.84486 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4594  hypothetical protein  39.81 
 
 		 122 aa  68.6  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.042758 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3692  hypothetical protein  40.54 
 
 		 125 aa  67.4  0.00000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.598845  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0175  hypothetical protein  42.86 
 
 		 139 aa  65.9  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.361745 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2103  hypothetical protein  46.34 
 
 		 121 aa  62  0.000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.374615  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0017  hypothetical protein  34.78 
 
 		 128 aa  60.8  0.000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000457371  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1062  hypothetical protein  42.15 
 
 		 138 aa  60.8  0.000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.340253 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3298  hypothetical protein  39.82 
 
 		 124 aa  60.1  0.000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.861672  normal  0.570212 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0572  hypothetical protein  37.07 
 
 		 118 aa  57  0.00000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.421068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0189  protein of unknown function UPF0102  35.48 
 
 		 127 aa  56.2  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.452343  normal  0.48907 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0339  hypothetical protein  42.34 
 
 		 127 aa  56.6  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0692015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0671  hypothetical protein  39.13 
 
 		 108 aa  55.8  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000156143  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0695  hypothetical protein  39.13 
 
 		 108 aa  55.8  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000229548  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2230  protein of unknown function UPF0102  35.65 
 
 		 127 aa  54.3  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0169041  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0262  hypothetical protein  39.18 
 
 		 116 aa  54.3  0.0000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.605183  normal  0.332641 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0315  protein of unknown function UPF0102  35.51 
 
 		 121 aa  53.5  0.0000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000225244 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0142  conserved hypothetical protein TIGR00252  35.51 
 
 		 121 aa  53.5  0.0000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0589  hypothetical protein  39.36 
 
 		 131 aa  53.5  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.424556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2283  hypothetical protein  37.76 
 
 		 113 aa  53.1  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.567685 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2864  hypothetical protein  37.5 
 
 		 122 aa  52.8  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00415914  hitchhiker  0.000000500394 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0464  hypothetical protein  32.65 
 
 		 116 aa  52.4  0.000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2830  hypothetical protein  35.44 
 
 		 134 aa  52.4  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.31307  normal  0.486249 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4685  hypothetical protein  35.24 
 
 		 120 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0484178 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3146  sigma-54 factor  37.63 
 
 		 118 aa  52  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13130  hypothetical protein  39.51 
 
 		 120 aa  51.2  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0093  hypothetical protein  25 
 
 		 122 aa  50.8  0.000005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.560974  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0932  hypothetical protein  36.56 
 
 		 123 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0503  hypothetical protein  35.96 
 
 		 120 aa  50.4  0.000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.451178 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3065  hypothetical protein  28.72 
 
 		 118 aa  50.1  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1992  hypothetical protein  32.2 
 
 		 129 aa  50.1  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2298  hypothetical protein  34.86 
 
 		 123 aa  49.7  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2398  hypothetical protein  32.98 
 
 		 118 aa  50.1  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.430013  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0650  hypothetical protein  35 
 
 		 128 aa  48.9  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0546  hypothetical protein  31.25 
 
 		 115 aa  49.3  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.672576  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1674  hypothetical protein  38.14 
 
 		 121 aa  48.9  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1186  hypothetical protein  32.37 
 
 		 140 aa  49.3  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00400032  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0037  hypothetical protein  24.79 
 
 		 127 aa  48.9  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1748  hypothetical protein  38.14 
 
 		 121 aa  48.9  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2019  protein of unknown function UPF0102  33.93 
 
 		 134 aa  49.3  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.573307  normal  0.167847 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1212  protein of unknown function UPF0102  30.19 
 
 		 121 aa  49.3  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1291  protein of unknown function UPF0102  33.04 
 
 		 115 aa  48.9  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000677509  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00890  hypothetical protein  32.98 
 
 		 122 aa  48.5  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1284  hypothetical protein  34.52 
 
 		 121 aa  47.8  0.00004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1413  hypothetical protein  23.71 
 
 		 112 aa  48.1  0.00004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0294  hypothetical protein  23 
 
 		 112 aa  48.1  0.00004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3485  hypothetical protein  31.65 
 
 		 125 aa  48.1  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000340579 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0701  hypothetical protein  27.27 
 
 		 122 aa  48.1  0.00004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1792  hypothetical protein  38 
 
 		 160 aa  48.1  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0756  hypothetical protein  41.46 
 
 		 118 aa  48.1  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.477778  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4524  hypothetical protein  35.48 
 
 		 123 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3443  hypothetical protein  35.71 
 
 		 131 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5237  protein of unknown function UPF0102  30.93 
 
 		 164 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2083  hypothetical protein  43 
 
 		 104 aa  47.8  0.00005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1272  protein of unknown function UPF0102  35.06 
 
 		 125 aa  47.8  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0630  hypothetical protein  39.81 
 
 		 144 aa  47.8  0.00005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3624  hypothetical protein  35.79 
 
 		 131 aa  47.8  0.00005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03015  hypothetical protein  35.71 
 
 		 131 aa  47.8  0.00006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0557  protein of unknown function UPF0102  35.71 
 
 		 131 aa  47.8  0.00006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4467  hypothetical protein  35.79 
 
 		 131 aa  47.4  0.00006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02966  hypothetical protein  35.71 
 
 		 131 aa  47.8  0.00006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0550  hypothetical protein  35.71 
 
 		 131 aa  47.8  0.00006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04380  hypothetical protein  38.3 
 
 		 122 aa  47.4  0.00007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0700  protein of unknown function UPF0102  30.17 
 
 		 172 aa  47.4  0.00007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000202877  hitchhiker  0.000000354886 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3630  hypothetical protein  35.79 
 
 		 131 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1406  protein of unknown function UPF0102  35.8 
 
 		 114 aa  47  0.00008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3783  hypothetical protein  38.16 
 
 		 118 aa  47  0.00008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00882109  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1406  protein of unknown function UPF0102  32.14 
 
 		 173 aa  47  0.00008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000418677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0900  hypothetical protein  34.02 
 
 		 100 aa  46.2  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.813892 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1723  hypothetical protein  35.42 
 
 		 123 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.471951 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2488  protein of unknown function UPF0102  39.76 
 
 		 123 aa  46.6  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0776001  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1228  hypothetical protein  37.5 
 
 		 119 aa  46.6  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.74821  normal  0.260342 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0195  hypothetical protein  37.04 
 
 		 119 aa  45.8  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.227376  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1530  hypothetical protein  39.62 
 
 		 118 aa  45.4  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0048655  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3424  hypothetical protein  30.38 
 
 		 125 aa  45.8  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3452  hypothetical protein  35.24 
 
 		 131 aa  45.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2202  hypothetical protein  37.23 
 
 		 121 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.474644  normal  0.174288 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1376  protein of unknown function UPF0102  28.42 
 
 		 119 aa  45.4  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000032081  normal  0.333882 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>