152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0900 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_0900  hypothetical protein  100 
 
 
100 aa  204  4e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.813892 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3959  hypothetical protein  50.52 
 
 
137 aa  98.6  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0461  hypothetical protein  49.49 
 
 
117 aa  90.9  5e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0472  hypothetical protein  53.33 
 
 
117 aa  90.9  5e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0276117 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1814  hypothetical protein  49.49 
 
 
117 aa  89.7  1e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.842664  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0449  hypothetical protein  49.47 
 
 
124 aa  81.3  0.000000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.283123  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2830  hypothetical protein  39.78 
 
 
134 aa  76.6  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.31307  normal  0.486249 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3586  hypothetical protein  48.72 
 
 
133 aa  64.7  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0325  hypothetical protein  40.96 
 
 
130 aa  61.2  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.493012  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0146  hypothetical protein  41.67 
 
 
135 aa  59.7  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0116  hypothetical protein  39.29 
 
 
118 aa  58.2  0.00000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.185512 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0400  hypothetical protein  39.51 
 
 
131 aa  57.4  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0420  hypothetical protein  40.48 
 
 
128 aa  57.4  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0320  hypothetical protein  41.67 
 
 
135 aa  57.4  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2007  hypothetical protein  38.75 
 
 
124 aa  57.4  0.00000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.63182  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4252  hypothetical protein  40 
 
 
117 aa  57.4  0.00000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000137469 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0181  hypothetical protein  39.74 
 
 
136 aa  57  0.00000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.973166  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2019  protein of unknown function UPF0102  43.68 
 
 
134 aa  56.6  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.573307  normal  0.167847 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1475  endonuclease  34.38 
 
 
115 aa  56.6  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.733308  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3766  hypothetical protein  40.86 
 
 
122 aa  56.6  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.969308  normal  0.0430921 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3919  protein of unknown function UPF0102  38.82 
 
 
144 aa  55.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000143067  normal  0.216721 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0189  protein of unknown function UPF0102  34.41 
 
 
127 aa  56.2  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.452343  normal  0.48907 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0142  conserved hypothetical protein TIGR00252  36.84 
 
 
121 aa  55.8  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0315  protein of unknown function UPF0102  36.84 
 
 
121 aa  55.8  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000225244 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3870  protein of unknown function UPF0102  38.82 
 
 
144 aa  55.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0226  hypothetical protein  39.39 
 
 
114 aa  55.1  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.113401  normal  0.113585 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0299  hypothetical protein  39 
 
 
108 aa  54.7  0.0000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0910  hypothetical protein  37.76 
 
 
119 aa  53.9  0.0000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.21322  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0388  hypothetical protein  41.67 
 
 
108 aa  53.5  0.0000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.597532  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1723  hypothetical protein  38.37 
 
 
123 aa  53.5  0.0000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.471951 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1695  hypothetical protein  34.04 
 
 
120 aa  52.8  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13130  hypothetical protein  34.94 
 
 
120 aa  53.5  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0260  hypothetical protein  38 
 
 
108 aa  53.1  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3881  hypothetical protein  38 
 
 
108 aa  53.1  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.114446 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3685  hypothetical protein  37 
 
 
108 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3355  hypothetical protein  39 
 
 
108 aa  52.8  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3693  hypothetical protein  38.71 
 
 
108 aa  52.8  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.678912  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0675  protein of unknown function UPF0102  36.47 
 
 
165 aa  52.4  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4685  hypothetical protein  33.33 
 
 
120 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0484178 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0756  hypothetical protein  37.86 
 
 
118 aa  52  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.477778  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4100  hypothetical protein  37.76 
 
 
108 aa  51.6  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3990  hypothetical protein  37.76 
 
 
108 aa  51.6  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4070  hypothetical protein  37.76 
 
 
108 aa  51.6  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4188  hypothetical protein  37.76 
 
 
108 aa  51.6  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4996  hypothetical protein  38.83 
 
 
125 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.608406  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0272  hypothetical protein  38.89 
 
 
108 aa  50.8  0.000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000600044  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57490  hypothetical protein  38.61 
 
 
125 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0271  hypothetical protein  40.86 
 
 
153 aa  50.4  0.000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2398  hypothetical protein  32 
 
 
118 aa  49.7  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.430013  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2655  hypothetical protein  33.65 
 
 
123 aa  48.9  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1291  protein of unknown function UPF0102  30.61 
 
 
115 aa  48.9  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000677509  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1324  protein of unknown function UPF0102  33.75 
 
 
148 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3692  hypothetical protein  42.17 
 
 
125 aa  48.5  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.598845  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5237  protein of unknown function UPF0102  32.53 
 
 
164 aa  48.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4524  hypothetical protein  38.1 
 
 
123 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2213  protein of unknown function UPF0102  35.56 
 
 
118 aa  47.4  0.00006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.19652 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0630  hypothetical protein  37 
 
 
144 aa  47.4  0.00006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2298  hypothetical protein  34.02 
 
 
123 aa  47.4  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10390  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  34.15 
 
 
167 aa  47.4  0.00007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000139118  unclonable  0.000000000910029 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0391  hypothetical protein  38.89 
 
 
149 aa  47  0.00008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0487377 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0355  hypothetical protein  32.22 
 
 
124 aa  47  0.00009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3014  hypothetical protein  37.18 
 
 
127 aa  47  0.00009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0057  hypothetical protein  25.84 
 
 
122 aa  46.6  0.0001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1836  hypothetical protein  44.07 
 
 
117 aa  46.6  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0316841 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0988  hypothetical protein  40.96 
 
 
120 aa  46.6  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.659164 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1272  protein of unknown function UPF0102  32.14 
 
 
125 aa  46.2  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0112  hypothetical protein  32.99 
 
 
122 aa  46.2  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1212  protein of unknown function UPF0102  37.78 
 
 
121 aa  47  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1703  hypothetical protein  31.25 
 
 
123 aa  46.2  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0932  hypothetical protein  39.76 
 
 
123 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0781  hypothetical protein  34.69 
 
 
121 aa  45.8  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1324  hypothetical protein  36.9 
 
 
124 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.294844  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4420  hypothetical protein  33.73 
 
 
128 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.149236  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1639  hypothetical protein  39.78 
 
 
136 aa  45.4  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.106195 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0546  hypothetical protein  26.26 
 
 
115 aa  46.2  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.672576  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4313  hypothetical protein  41.03 
 
 
140 aa  46.2  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0930  hypothetical protein  32.26 
 
 
123 aa  45.8  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.930588  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2881  hypothetical protein  36.25 
 
 
146 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.696458 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1509  hypothetical protein  27.54 
 
 
133 aa  45.8  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3311  protein of unknown function UPF0102  35 
 
 
134 aa  45.1  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2283  hypothetical protein  34.48 
 
 
113 aa  45.4  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.567685 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4400  hypothetical protein  36.9 
 
 
123 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.147019 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0351  hypothetical protein  35 
 
 
117 aa  45.4  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0502533  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1062  hypothetical protein  36.47 
 
 
138 aa  45.4  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.340253 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2103  hypothetical protein  40 
 
 
121 aa  44.7  0.0004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.374615  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3265  hypothetical protein  38.37 
 
 
130 aa  44.3  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4114  hypothetical protein  33.33 
 
 
123 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0630  hypothetical protein  37.21 
 
 
135 aa  44.3  0.0006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0163  hypothetical protein  21.21 
 
 
112 aa  44.3  0.0006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0037  hypothetical protein  32.53 
 
 
127 aa  43.9  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0123  hypothetical protein  41.56 
 
 
156 aa  43.9  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2395  hypothetical protein  35.37 
 
 
127 aa  43.9  0.0007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.615386  normal  0.0739869 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0144  hypothetical protein  22.22 
 
 
112 aa  43.9  0.0008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0195  hypothetical protein  36.26 
 
 
119 aa  43.9  0.0008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.227376  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0733  hypothetical protein  31.58 
 
 
180 aa  43.9  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.646389 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0184  hypothetical protein  22.22 
 
 
112 aa  43.9  0.0008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.805797  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0589  hypothetical protein  38.16 
 
 
131 aa  43.9  0.0008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.424556  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0707  hypothetical protein  32.35 
 
 
121 aa  43.9  0.0008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0202  hypothetical protein  39.76 
 
 
142 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0414  hypothetical protein  37.93 
 
 
132 aa  43.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.768838  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>