286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1407 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1407  protein of unknown function UPF0102  100 
 
 		 122 aa  241  3e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.993674  normal  0.0549137 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3248  hypothetical protein  53.91 
 
 		 124 aa  118  1.9999999999999998e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.852323  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1550  hypothetical protein  49.19 
 
 		 132 aa  115  1.9999999999999998e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.176091 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3998  protein of unknown function UPF0102  54.78 
 
 		 139 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1175  protein of unknown function UPF0102  54.17 
 
 		 122 aa  112  1.0000000000000001e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3586  hypothetical protein  52.99 
 
 		 118 aa  110  6e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1836  hypothetical protein  56.78 
 
 		 117 aa  110  9e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0316841 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2213  hypothetical protein  50.42 
 
 		 132 aa  108  3e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000124547 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0992  hypothetical protein  55.93 
 
 		 117 aa  108  3e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.528214  normal  0.0951104 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1156  hypothetical protein  48.31 
 
 		 118 aa  107  5e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0160558  normal  0.0576877 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1478  protein of unknown function UPF0102  64.37 
 
 		 118 aa  107  7.000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.10043  normal  0.036198 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3413  protein of unknown function UPF0102  50.83 
 
 		 124 aa  107  8.000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23670  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  52.99 
 
 		 127 aa  106  1e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.183487  normal  0.0867152 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2474  hypothetical protein  50.85 
 
 		 118 aa  106  1e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0253334  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1228  hypothetical protein  48.28 
 
 		 119 aa  103  8e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.74821  normal  0.260342 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2202  hypothetical protein  46.72 
 
 		 121 aa  100  6e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.474644  normal  0.174288 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09830  conserved hypothetical protein TIGR00252  47.32 
 
 		 125 aa  98.6  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.351272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5917  protein of unknown function UPF0102  49.15 
 
 		 117 aa  95.9  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00245822  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11140  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  51.72 
 
 		 120 aa  95.9  2e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0330886  normal  0.323386 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0993  protein of unknown function UPF0102  48.15 
 
 		 129 aa  94.7  4e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00109853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2095  protein of unknown function UPF0102  44.44 
 
 		 137 aa  94  6e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1985  hypothetical protein  46.55 
 
 		 135 aa  94  7e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0318406  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2031  hypothetical protein  46.55 
 
 		 135 aa  94  7e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.474175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1965  hypothetical protein  45.69 
 
 		 135 aa  93.6  8e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.52969 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2532  protein of unknown function UPF0102  56.3 
 
 		 118 aa  93.6  9e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.388001 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0669  hypothetical protein  48.67 
 
 		 124 aa  90.5  7e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1641  protein of unknown function UPF0102  44.26 
 
 		 122 aa  89.7  1e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0797113  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10070  conserved hypothetical protein TIGR00252  46.49 
 
 		 153 aa  89.7  1e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0294595  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3123  protein of unknown function UPF0102  45.61 
 
 		 121 aa  87.8  5e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0308676  normal  0.107591 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4140  hypothetical protein  43.55 
 
 		 123 aa  84.7  4e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3740  protein of unknown function UPF0102  37.37 
 
 		 121 aa  82.8  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000086697  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09240  Holliday junction resolvase-like endonuclease  44.55 
 
 		 139 aa  83.2  0.000000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0928499  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0145  hypothetical protein  36.13 
 
 		 124 aa  82.8  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0280805  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0930  hypothetical protein  48.54 
 
 		 123 aa  82  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.930588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1521  protein of unknown function UPF0102  41.73 
 
 		 157 aa  82  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0637187  normal  0.0119716 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1320  hypothetical protein  45.69 
 
 		 121 aa  82.4  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2007  hypothetical protein  45.95 
 
 		 124 aa  81.6  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.63182  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0231  protein of unknown function UPF0102  47.79 
 
 		 121 aa  81.3  0.000000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.819406  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1272  protein of unknown function UPF0102  40.38 
 
 		 125 aa  80.9  0.000000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0017  hypothetical protein  44.79 
 
 		 126 aa  80.9  0.000000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00052241  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1475  endonuclease  37.61 
 
 		 115 aa  80.9  0.000000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.733308  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0977  hypothetical protein  34.29 
 
 		 119 aa  81.3  0.000000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.320606  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07400  hypothetical protein  35.14 
 
 		 116 aa  80.9  0.000000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2193  hypothetical protein  46.51 
 
 		 207 aa  79.7  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1725  normal  0.994481 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1723  hypothetical protein  42.34 
 
 		 123 aa  79.7  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.471951 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0639  conserved hypothetical protein TIGR00252  43.56 
 
 		 182 aa  79.7  0.00000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.372666 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1530  hypothetical protein  33.33 
 
 		 118 aa  79.3  0.00000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0048655  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1695  hypothetical protein  37.04 
 
 		 120 aa  78.6  0.00000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0700  protein of unknown function UPF0102  35.09 
 
 		 172 aa  78.2  0.00000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000202877  hitchhiker  0.000000354886 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0650  hypothetical protein  37.29 
 
 		 128 aa  78.2  0.00000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0553  protein of unknown function UPF0102  43.64 
 
 		 118 aa  77.4  0.00000000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.156898 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1703  hypothetical protein  34.65 
 
 		 123 aa  77  0.00000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3756  hypothetical protein  35.45 
 
 		 127 aa  77.4  0.00000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00341379  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12912  hypothetical protein  43.22 
 
 		 141 aa  76.6  0.00000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0199208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1406  protein of unknown function UPF0102  38.89 
 
 		 173 aa  76.6  0.0000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000418677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2488  protein of unknown function UPF0102  45.54 
 
 		 123 aa  75.1  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0776001  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2230  protein of unknown function UPF0102  34.78 
 
 		 127 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0169041  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1093  endonuclease-like  39.81 
 
 		 202 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0666  hypothetical protein  38.05 
 
 		 116 aa  74.3  0.0000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0397911  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2864  hypothetical protein  38.18 
 
 		 122 aa  73.9  0.0000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00415914  hitchhiker  0.000000500394 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2655  hypothetical protein  39.58 
 
 		 123 aa  73.6  0.0000000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1186  hypothetical protein  36.94 
 
 		 140 aa  72.8  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00400032  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13130  hypothetical protein  34.86 
 
 		 120 aa  72.8  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1218  protein of unknown function UPF0102  36.89 
 
 		 119 aa  71.6  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.648075  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02085  hypothetical protein  33.33 
 
 		 119 aa  72  0.000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.997348  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0017  hypothetical protein  40.82 
 
 		 128 aa  71.6  0.000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000457371  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3675  protein of unknown function UPF0102  42.48 
 
 		 122 aa  71.2  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.344366 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3065  hypothetical protein  29.47 
 
 		 118 aa  71.2  0.000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0758  hypothetical protein  38.32 
 
 		 130 aa  70.9  0.000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1894  hypothetical protein  43.75 
 
 		 113 aa  70.5  0.000000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.642217 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5877  protein of unknown function UPF0102  32.43 
 
 		 117 aa  70.1  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.662779 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3311  protein of unknown function UPF0102  38.32 
 
 		 134 aa  69.7  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1959  hypothetical protein  32.04 
 
 		 122 aa  70.1  0.00000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.142549  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3485  hypothetical protein  33.63 
 
 		 125 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000340579 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3424  hypothetical protein  33.63 
 
 		 125 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10390  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  36.36 
 
 		 167 aa  69.3  0.00000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000139118  unclonable  0.000000000910029 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2217  hypothetical protein  39.82 
 
 		 123 aa  68.9  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000089571  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0707  hypothetical protein  35.29 
 
 		 121 aa  68.9  0.00000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3694  hypothetical protein  35.35 
 
 		 114 aa  68.6  0.00000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0676  hypothetical protein  41 
 
 		 167 aa  68.2  0.00000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0552943  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1677  hypothetical protein  31.07 
 
 		 122 aa  68.2  0.00000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.238653  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0355  hypothetical protein  35.24 
 
 		 124 aa  67.8  0.00000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3919  protein of unknown function UPF0102  36.7 
 
 		 144 aa  67.8  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000143067  normal  0.216721 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3870  protein of unknown function UPF0102  36.7 
 
 		 144 aa  67.8  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2054  hypothetical protein  40.86 
 
 		 133 aa  67.8  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.595954  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3298  hypothetical protein  34.95 
 
 		 124 aa  67.8  0.00000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.861672  normal  0.570212 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0351  hypothetical protein  33.33 
 
 		 117 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0502533  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1969  hypothetical protein  40.86 
 
 		 133 aa  67.8  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00399816  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03356  Sigma-54 factor  38.14 
 
 		 113 aa  67.4  0.00000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0277  protein of unknown function UPF0102  30.09 
 
 		 120 aa  67.4  0.00000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.107261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0388  hypothetical protein  39.39 
 
 		 108 aa  67  0.00000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.597532  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2398  hypothetical protein  40 
 
 		 118 aa  66.6  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.430013  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1910  hypothetical protein  41.07 
 
 		 134 aa  66.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.179028  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0142  conserved hypothetical protein TIGR00252  42.27 
 
 		 121 aa  66.2  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0315  protein of unknown function UPF0102  42.27 
 
 		 121 aa  66.2  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000225244 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1406  protein of unknown function UPF0102  37.89 
 
 		 114 aa  66.2  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0293  protein of unknown function UPF0102  39.09 
 
 		 124 aa  66.6  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.210059 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3265  hypothetical protein  44.57 
 
 		 130 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1792  hypothetical protein  44.79 
 
 		 160 aa  65.9  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0016  hypothetical protein  37.11 
 
 		 129 aa  64.7  0.0000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.197298  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>