254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0497 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0497  hypothetical protein  100 
 
 		 142 aa  292  1e-78  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1908  hypothetical protein  53.95 
 
 		 173 aa  173  6e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000102604  hitchhiker  0.00425538 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2198  hypothetical protein  49.01 
 
 		 172 aa  157  4e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00219221  decreased coverage  0.00807275 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4114  hypothetical protein  41.41 
 
 		 123 aa  90.5  8e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4420  hypothetical protein  41.41 
 
 		 128 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.149236  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4524  hypothetical protein  43.8 
 
 		 123 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1324  hypothetical protein  43.75 
 
 		 124 aa  87.8  4e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.294844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0932  hypothetical protein  45.08 
 
 		 123 aa  87.8  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4400  hypothetical protein  43.55 
 
 		 123 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.147019 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3443  hypothetical protein  41.55 
 
 		 131 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13130  hypothetical protein  38.76 
 
 		 120 aa  85.9  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03015  hypothetical protein  40.85 
 
 		 131 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0557  protein of unknown function UPF0102  40.85 
 
 		 131 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0550  hypothetical protein  40.85 
 
 		 131 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02966  hypothetical protein  40.85 
 
 		 131 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3630  hypothetical protein  40.85 
 
 		 131 aa  84  6e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3624  hypothetical protein  40.14 
 
 		 131 aa  83.6  8e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4467  hypothetical protein  44.63 
 
 		 131 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4685  hypothetical protein  42.62 
 
 		 120 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0484178 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2201  hypothetical protein  39.23 
 
 		 123 aa  80.5  0.000000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1176  hypothetical protein  36.92 
 
 		 122 aa  80.1  0.00000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.108145 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0355  hypothetical protein  40.65 
 
 		 124 aa  79  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1934  hypothetical protein  39.45 
 
 		 120 aa  78.2  0.00000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.547856  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0259  hypothetical protein  39.45 
 
 		 120 aa  78.2  0.00000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0112  hypothetical protein  35.82 
 
 		 122 aa  78.2  0.00000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57490  hypothetical protein  37.6 
 
 		 125 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0675  protein of unknown function UPF0102  38.58 
 
 		 165 aa  77.8  0.00000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3454  hypothetical protein  39.84 
 
 		 131 aa  77  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3523  hypothetical protein  39.84 
 
 		 131 aa  77  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.578592  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3620  hypothetical protein  39.84 
 
 		 131 aa  77  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3560  hypothetical protein  39.84 
 
 		 131 aa  77  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04380  hypothetical protein  38.46 
 
 		 122 aa  76.3  0.0000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0315  protein of unknown function UPF0102  36.36 
 
 		 121 aa  76.3  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000225244 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3065  hypothetical protein  36.22 
 
 		 118 aa  75.9  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4996  hypothetical protein  36.8 
 
 		 125 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.608406  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0630  hypothetical protein  43.31 
 
 		 144 aa  75.9  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0142  conserved hypothetical protein TIGR00252  36.36 
 
 		 121 aa  76.3  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1695  hypothetical protein  38.4 
 
 		 120 aa  75.1  0.0000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3452  hypothetical protein  39.06 
 
 		 131 aa  75.1  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3585  hypothetical protein  39.06 
 
 		 131 aa  74.7  0.0000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.186326 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3146  sigma-54 factor  40.31 
 
 		 118 aa  73.6  0.0000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3919  protein of unknown function UPF0102  44.68 
 
 		 144 aa  73.6  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000143067  normal  0.216721 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3870  protein of unknown function UPF0102  44.68 
 
 		 144 aa  73.6  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00890  hypothetical protein  38.58 
 
 		 122 aa  73.2  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0320  hypothetical protein  43 
 
 		 135 aa  72.4  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2283  hypothetical protein  39.52 
 
 		 113 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.567685 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0589  hypothetical protein  35.38 
 
 		 131 aa  72  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.424556  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0123  hypothetical protein  45 
 
 		 156 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1748  hypothetical protein  38.52 
 
 		 121 aa  72  0.000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1674  hypothetical protein  38.52 
 
 		 121 aa  72  0.000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0910  hypothetical protein  35.11 
 
 		 119 aa  70.9  0.000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.21322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3340  hypothetical protein  45.74 
 
 		 89 aa  71.2  0.000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2103  hypothetical protein  43.27 
 
 		 121 aa  70.9  0.000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.374615  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5237  protein of unknown function UPF0102  44.55 
 
 		 164 aa  70.5  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0739  hypothetical protein  36.84 
 
 		 120 aa  70.5  0.000000000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.235623  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4818  protein of unknown function UPF0102  40.44 
 
 		 123 aa  69.7  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0184  hypothetical protein  39.17 
 
 		 123 aa  68.9  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0195  hypothetical protein  38.1 
 
 		 119 aa  69.3  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.227376  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0756  hypothetical protein  40.77 
 
 		 118 aa  68.2  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.477778  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004502  endonuclease  39.82 
 
 		 122 aa  68.2  0.00000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000161677  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0733  hypothetical protein  36.67 
 
 		 180 aa  68.2  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.646389 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0405  hypothetical protein  37.86 
 
 		 154 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4313  hypothetical protein  36.3 
 
 		 140 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3783  hypothetical protein  37.4 
 
 		 118 aa  67.4  0.00000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00882109  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1447  protein of unknown function UPF0102  37.9 
 
 		 127 aa  67.4  0.00000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3873  hypothetical protein  37.31 
 
 		 128 aa  67  0.00000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3998  protein of unknown function UPF0102  36.89 
 
 		 139 aa  67  0.00000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4433  hypothetical protein  37.5 
 
 		 129 aa  66.6  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.875795  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1792  hypothetical protein  34.65 
 
 		 160 aa  66.2  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3265  hypothetical protein  39.13 
 
 		 130 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0181  hypothetical protein  34.75 
 
 		 136 aa  65.9  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.973166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3355  hypothetical protein  38.98 
 
 		 108 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0503  hypothetical protein  38.02 
 
 		 120 aa  65.1  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.451178 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0202  hypothetical protein  37.9 
 
 		 142 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2298  hypothetical protein  32.58 
 
 		 123 aa  65.1  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0313  hypothetical protein  36.8 
 
 		 118 aa  64.7  0.0000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.674161  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0629  hypothetical protein  32.76 
 
 		 122 aa  64.7  0.0000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0197  hypothetical protein  36.29 
 
 		 137 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.404878  unclonable  0.00000000000559374 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0299  hypothetical protein  35.59 
 
 		 108 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3766  hypothetical protein  36.43 
 
 		 122 aa  63.9  0.0000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.969308  normal  0.0430921 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0307  hypothetical protein  38.32 
 
 		 118 aa  63.9  0.0000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.432671  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3881  hypothetical protein  36.44 
 
 		 108 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.114446 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0216  hypothetical protein  37.1 
 
 		 142 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0192793 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1062  hypothetical protein  37.23 
 
 		 138 aa  63.9  0.0000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.340253 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0116  hypothetical protein  37.86 
 
 		 118 aa  63.9  0.0000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.185512 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3391  hypothetical protein  37.9 
 
 		 128 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2464  hypothetical protein  33.87 
 
 		 123 aa  63.5  0.0000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.164658  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3625  hypothetical protein  34.96 
 
 		 113 aa  63.5  0.0000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1406  protein of unknown function UPF0102  40.2 
 
 		 114 aa  62.8  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0017  hypothetical protein  30.16 
 
 		 126 aa  63.2  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00052241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0391  hypothetical protein  37.88 
 
 		 149 aa  63.2  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0487377 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0271  hypothetical protein  37.5 
 
 		 153 aa  63.2  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2398  hypothetical protein  38.24 
 
 		 118 aa  62.8  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.430013  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2881  hypothetical protein  39.36 
 
 		 146 aa  63.2  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.696458 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0146  hypothetical protein  37.14 
 
 		 135 aa  62.4  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0271  hypothetical protein  36.89 
 
 		 142 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0679864 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2816  hypothetical protein  36.89 
 
 		 142 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0260  hypothetical protein  35.59 
 
 		 108 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0290  hypothetical protein  36.89 
 
 		 158 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3693  hypothetical protein  36.89 
 
 		 108 aa  62.8  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.678912  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>