180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_1639 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_1639  protein of unknown function UPF0102  100 
 
 		 110 aa  224  3e-58  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0546  hypothetical protein  40.57 
 
 		 115 aa  79.3  0.00000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.672576  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0629  hypothetical protein  33.04 
 
 		 122 aa  68.2  0.00000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1406  protein of unknown function UPF0102  33.33 
 
 		 114 aa  67  0.00000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0144  hypothetical protein  45.63 
 
 		 112 aa  66.2  0.0000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0184  hypothetical protein  45.63 
 
 		 112 aa  66.2  0.0000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.805797  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0992  hypothetical protein  31.82 
 
 		 117 aa  65.9  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.528214  normal  0.0951104 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0701  hypothetical protein  40 
 
 		 122 aa  65.5  0.0000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0702  hypothetical protein  38.61 
 
 		 112 aa  64.7  0.0000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.254087  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0358  protein of unknown function UPF0102  38.18 
 
 		 108 aa  64.3  0.0000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.856807 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0163  hypothetical protein  43.81 
 
 		 112 aa  63.9  0.0000000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3413  protein of unknown function UPF0102  30.43 
 
 		 124 aa  63.2  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0669  hypothetical protein  35.11 
 
 		 124 aa  62.4  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10070  conserved hypothetical protein TIGR00252  28.83 
 
 		 153 aa  62.4  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0294595  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07400  hypothetical protein  41.11 
 
 		 116 aa  62.8  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1836  hypothetical protein  32.73 
 
 		 117 aa  61.6  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0316841 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3709  protein of unknown function UPF0102  35.19 
 
 		 119 aa  62  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1478  protein of unknown function UPF0102  41.43 
 
 		 118 aa  62  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.10043  normal  0.036198 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2398  hypothetical protein  35.51 
 
 		 118 aa  62  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.430013  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1272  protein of unknown function UPF0102  43.48 
 
 		 125 aa  60.8  0.000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09830  conserved hypothetical protein TIGR00252  35.11 
 
 		 125 aa  60.5  0.000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.351272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0277  protein of unknown function UPF0102  36.28 
 
 		 120 aa  60.1  0.000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.107261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0720  hypothetical protein  41.75 
 
 		 126 aa  60.1  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0341617  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1969  hypothetical protein  35.42 
 
 		 133 aa  60.1  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00399816  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2054  hypothetical protein  35.42 
 
 		 133 aa  60.1  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.595954  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09240  Holliday junction resolvase-like endonuclease  33.33 
 
 		 139 aa  59.7  0.00000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0928499  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1228  hypothetical protein  31.19 
 
 		 119 aa  60.1  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.74821  normal  0.260342 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2025  hypothetical protein  38.14 
 
 		 119 aa  59.7  0.00000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0977  hypothetical protein  32.99 
 
 		 119 aa  59.3  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.320606  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1910  hypothetical protein  32.5 
 
 		 134 aa  58.9  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.179028  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0993  protein of unknown function UPF0102  31.53 
 
 		 129 aa  58.9  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00109853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3248  hypothetical protein  30.61 
 
 		 124 aa  58.9  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.852323  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03356  Sigma-54 factor  31.19 
 
 		 113 aa  58.5  0.00000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2488  protein of unknown function UPF0102  29.7 
 
 		 123 aa  57.8  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0776001  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0666  hypothetical protein  29.52 
 
 		 116 aa  57.8  0.00000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0397911  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0017  hypothetical protein  35.11 
 
 		 126 aa  57.4  0.00000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00052241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0988  hypothetical protein  32.94 
 
 		 120 aa  57.4  0.00000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.659164 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0671  hypothetical protein  33.94 
 
 		 108 aa  57.4  0.00000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000156143  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1947  hypothetical protein  31.46 
 
 		 133 aa  57.4  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.439621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0695  hypothetical protein  33.94 
 
 		 108 aa  57.4  0.00000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000229548  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1186  hypothetical protein  33.65 
 
 		 140 aa  57  0.00000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00400032  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1703  hypothetical protein  36.56 
 
 		 123 aa  57  0.00000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07020  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  38.67 
 
 		 186 aa  57  0.00000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00114408  normal  0.507303 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1175  protein of unknown function UPF0102  30.61 
 
 		 122 aa  56.6  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1218  protein of unknown function UPF0102  31.18 
 
 		 119 aa  56.6  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.648075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2474  hypothetical protein  27.27 
 
 		 118 aa  56.6  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0253334  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0294  hypothetical protein  33.98 
 
 		 112 aa  56.6  0.0000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1509  hypothetical protein  38.32 
 
 		 133 aa  56.2  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0700  protein of unknown function UPF0102  29.57 
 
 		 172 aa  56.2  0.0000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000202877  hitchhiker  0.000000354886 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1475  endonuclease  29.81 
 
 		 115 aa  55.5  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.733308  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0650  hypothetical protein  30.28 
 
 		 128 aa  55.1  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5877  protein of unknown function UPF0102  30.56 
 
 		 117 aa  55.5  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.662779 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2035  hypothetical protein  28.57 
 
 		 122 aa  55.1  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.848509  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1407  protein of unknown function UPF0102  32.63 
 
 		 122 aa  55.1  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.993674  normal  0.0549137 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0037  hypothetical protein  34.38 
 
 		 127 aa  54.7  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11140  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  40.98 
 
 		 120 aa  54.7  0.0000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0330886  normal  0.323386 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2213  hypothetical protein  28.32 
 
 		 132 aa  54.3  0.0000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000124547 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1901  formate dehydrogenase H large subunit  37.04 
 
 		 109 aa  54.3  0.0000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0017  hypothetical protein  40.58 
 
 		 128 aa  54.3  0.0000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000457371  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0226  hypothetical protein  32.38 
 
 		 114 aa  54.3  0.0000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.113401  normal  0.113585 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2864  hypothetical protein  33.03 
 
 		 122 aa  53.9  0.0000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00415914  hitchhiker  0.000000500394 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10390  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  36.36 
 
 		 167 aa  53.9  0.0000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000139118  unclonable  0.000000000910029 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0465  hypothetical protein  39.44 
 
 		 113 aa  53.5  0.0000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02085  hypothetical protein  35.71 
 
 		 119 aa  53.5  0.0000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.997348  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1677  hypothetical protein  40 
 
 		 122 aa  53.1  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.238653  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3998  protein of unknown function UPF0102  28.72 
 
 		 139 aa  53.1  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0231  protein of unknown function UPF0102  30.85 
 
 		 121 aa  53.1  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.819406  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0170  protein of unknown function UPF0102  38.32 
 
 		 108 aa  52.8  0.000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.633607  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1530  hypothetical protein  35.11 
 
 		 118 aa  52.4  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0048655  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1695  hypothetical protein  29.41 
 
 		 120 aa  52.4  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1413  hypothetical protein  37.14 
 
 		 112 aa  52.4  0.000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2230  protein of unknown function UPF0102  39.39 
 
 		 127 aa  52.4  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0169041  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1406  protein of unknown function UPF0102  32.08 
 
 		 173 aa  52  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000418677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1959  hypothetical protein  38.46 
 
 		 122 aa  51.6  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.142549  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1217  hypothetical protein  32.11 
 
 		 123 aa  52  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.266389  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3311  protein of unknown function UPF0102  35.21 
 
 		 134 aa  52  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3694  hypothetical protein  30.59 
 
 		 114 aa  51.6  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0216  hypothetical protein  33.64 
 
 		 112 aa  51.2  0.000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2298  hypothetical protein  31.91 
 
 		 123 aa  51.2  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1320  hypothetical protein  33.96 
 
 		 121 aa  50.8  0.000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2202  hypothetical protein  28.72 
 
 		 121 aa  50.4  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.474644  normal  0.174288 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0460  protein of unknown function UPF0102  34.04 
 
 		 153 aa  50.4  0.000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1156  hypothetical protein  30.61 
 
 		 118 aa  50.4  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0160558  normal  0.0576877 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0676  hypothetical protein  28.83 
 
 		 167 aa  50.1  0.000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0552943  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5917  protein of unknown function UPF0102  30 
 
 		 117 aa  50.1  0.000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00245822  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0299  hypothetical protein  27.45 
 
 		 108 aa  49.7  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4036  protein of unknown function UPF0102  36.84 
 
 		 118 aa  49.7  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.261027  normal  0.0798574 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2217  hypothetical protein  31.25 
 
 		 123 aa  50.1  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000089571  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2095  protein of unknown function UPF0102  36.36 
 
 		 137 aa  50.1  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1376  protein of unknown function UPF0102  42.86 
 
 		 119 aa  49.7  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000032081  normal  0.333882 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0572  hypothetical protein  27.78 
 
 		 118 aa  50.1  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.421068  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0184  hypothetical protein  25 
 
 		 123 aa  49.3  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3740  protein of unknown function UPF0102  33.68 
 
 		 121 aa  49.3  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000086697  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0758  hypothetical protein  32.63 
 
 		 130 aa  49.3  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2193  hypothetical protein  37.5 
 
 		 207 aa  49.7  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1725  normal  0.994481 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4252  hypothetical protein  32.41 
 
 		 117 aa  49.3  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000137469 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0732  hypothetical protein  32.73 
 
 		 108 aa  48.5  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.821091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4140  hypothetical protein  26.67 
 
 		 123 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3693  hypothetical protein  29 
 
 		 108 aa  48.1  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.678912  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3756  hypothetical protein  33.33 
 
 		 127 aa  48.1  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00341379  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>