195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1521 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_1521  protein of unknown function UPF0102  100 
 
 		 157 aa  318  1.9999999999999998e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0637187  normal  0.0119716 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1641  protein of unknown function UPF0102  42.15 
 
 		 122 aa  89.4  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0797113  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2474  hypothetical protein  40.94 
 
 		 118 aa  88.2  4e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0253334  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3413  protein of unknown function UPF0102  41.18 
 
 		 124 aa  84.7  4e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1407  protein of unknown function UPF0102  41.73 
 
 		 122 aa  82  0.000000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.993674  normal  0.0549137 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1836  hypothetical protein  50 
 
 		 117 aa  80.9  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0316841 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3998  protein of unknown function UPF0102  40 
 
 		 139 aa  80.5  0.000000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1175  protein of unknown function UPF0102  41.73 
 
 		 122 aa  80.1  0.00000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1478  protein of unknown function UPF0102  52.94 
 
 		 118 aa  79.7  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.10043  normal  0.036198 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2213  hypothetical protein  39.37 
 
 		 132 aa  79.3  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000124547 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1550  hypothetical protein  41.09 
 
 		 132 aa  79  0.00000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.176091 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10070  conserved hypothetical protein TIGR00252  40.15 
 
 		 153 aa  79  0.00000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0294595  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0993  protein of unknown function UPF0102  38.93 
 
 		 129 aa  77.4  0.00000000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00109853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1156  hypothetical protein  43.1 
 
 		 118 aa  75.5  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0160558  normal  0.0576877 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23670  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  39.37 
 
 		 127 aa  74.7  0.0000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.183487  normal  0.0867152 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3248  hypothetical protein  34.65 
 
 		 124 aa  73.9  0.0000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.852323  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0669  hypothetical protein  42.73 
 
 		 124 aa  73.9  0.0000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2095  protein of unknown function UPF0102  43.56 
 
 		 137 aa  73.6  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09830  conserved hypothetical protein TIGR00252  45.45 
 
 		 125 aa  72  0.000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.351272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12912  hypothetical protein  37.96 
 
 		 141 aa  72  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0199208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3123  protein of unknown function UPF0102  40.48 
 
 		 121 aa  71.2  0.000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0308676  normal  0.107591 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0231  protein of unknown function UPF0102  48.28 
 
 		 121 aa  68.9  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.819406  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0992  hypothetical protein  40 
 
 		 117 aa  69.3  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.528214  normal  0.0951104 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0017  hypothetical protein  35.34 
 
 		 126 aa  68.6  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00052241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1992  hypothetical protein  40.7 
 
 		 129 aa  68.2  0.00000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0930  hypothetical protein  44.19 
 
 		 123 aa  67.8  0.00000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.930588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10390  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  41.76 
 
 		 167 aa  67.8  0.00000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000139118  unclonable  0.000000000910029 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0639  conserved hypothetical protein TIGR00252  31.65 
 
 		 182 aa  67.4  0.00000000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.372666 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0017  hypothetical protein  40.91 
 
 		 128 aa  66.2  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000457371  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2019  protein of unknown function UPF0102  39.77 
 
 		 134 aa  67  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.573307  normal  0.167847 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0650  hypothetical protein  47.56 
 
 		 128 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2217  hypothetical protein  44.32 
 
 		 123 aa  65.9  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000089571  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07020  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  36.04 
 
 		 186 aa  65.9  0.0000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00114408  normal  0.507303 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0037  hypothetical protein  34.38 
 
 		 127 aa  65.9  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1530  hypothetical protein  27.87 
 
 		 118 aa  65.9  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0048655  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1291  protein of unknown function UPF0102  37.5 
 
 		 115 aa  65.5  0.0000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000677509  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2864  hypothetical protein  34.35 
 
 		 122 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00415914  hitchhiker  0.000000500394 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5917  protein of unknown function UPF0102  37.39 
 
 		 117 aa  65.1  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00245822  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09240  Holliday junction resolvase-like endonuclease  38.58 
 
 		 139 aa  65.1  0.0000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0928499  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2230  protein of unknown function UPF0102  36 
 
 		 127 aa  64.3  0.0000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0169041  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3311  protein of unknown function UPF0102  32.54 
 
 		 134 aa  63.2  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2193  hypothetical protein  44.44 
 
 		 207 aa  62.8  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1725  normal  0.994481 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1406  protein of unknown function UPF0102  42.17 
 
 		 173 aa  62.4  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000418677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1272  protein of unknown function UPF0102  40 
 
 		 125 aa  62.4  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0016  hypothetical protein  41.18 
 
 		 129 aa  62.8  0.000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.197298  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0676  hypothetical protein  36.75 
 
 		 167 aa  62.8  0.000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0552943  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1447  protein of unknown function UPF0102  33.33 
 
 		 127 aa  62  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11140  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  37.1 
 
 		 120 aa  62  0.000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0330886  normal  0.323386 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1093  endonuclease-like  44.19 
 
 		 202 aa  61.6  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3586  hypothetical protein  40 
 
 		 118 aa  61.6  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1212  protein of unknown function UPF0102  35.63 
 
 		 121 aa  61.6  0.000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1217  hypothetical protein  36.9 
 
 		 123 aa  61.6  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.266389  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0977  hypothetical protein  30.4 
 
 		 119 aa  60.8  0.000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.320606  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1703  hypothetical protein  29.46 
 
 		 123 aa  61.2  0.000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1218  protein of unknown function UPF0102  28.24 
 
 		 119 aa  60.8  0.000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.648075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07400  hypothetical protein  31.09 
 
 		 116 aa  60.8  0.000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1723  hypothetical protein  37.8 
 
 		 123 aa  60.8  0.000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.471951 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2007  hypothetical protein  44.32 
 
 		 124 aa  60.8  0.000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.63182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1959  hypothetical protein  29.31 
 
 		 122 aa  60.1  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.142549  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1677  hypothetical protein  29.31 
 
 		 122 aa  60.1  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.238653  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3298  hypothetical protein  39.53 
 
 		 124 aa  59.7  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.861672  normal  0.570212 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1186  hypothetical protein  32.41 
 
 		 140 aa  60.1  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00400032  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3756  hypothetical protein  32.28 
 
 		 127 aa  60.1  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00341379  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02085  hypothetical protein  26.77 
 
 		 119 aa  58.9  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.997348  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2881  hypothetical protein  42.39 
 
 		 146 aa  58.9  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.696458 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0700  protein of unknown function UPF0102  31.79 
 
 		 172 aa  59.3  0.00000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000202877  hitchhiker  0.000000354886 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1475  endonuclease  34.4 
 
 		 115 aa  59.7  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.733308  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0707  hypothetical protein  33.64 
 
 		 121 aa  59.3  0.00000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0145  hypothetical protein  35.66 
 
 		 124 aa  59.3  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0280805  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1376  protein of unknown function UPF0102  28.46 
 
 		 119 aa  58.9  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000032081  normal  0.333882 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2202  hypothetical protein  42.39 
 
 		 121 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.474644  normal  0.174288 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0701  hypothetical protein  36.36 
 
 		 122 aa  58.2  0.00000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_687  endonuclease  33.33 
 
 		 121 aa  57.4  0.00000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2148  hypothetical protein  47.95 
 
 		 134 aa  57.4  0.00000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1965  hypothetical protein  36.17 
 
 		 135 aa  57.8  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.52969 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1792  hypothetical protein  40.7 
 
 		 160 aa  57.4  0.00000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1985  hypothetical protein  36.17 
 
 		 135 aa  57.4  0.00000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0318406  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2031  hypothetical protein  36.17 
 
 		 135 aa  57.4  0.00000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.474175  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3485  hypothetical protein  30.23 
 
 		 125 aa  56.6  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000340579 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2488  protein of unknown function UPF0102  35.19 
 
 		 123 aa  56.6  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0776001  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_002936  DET0781  hypothetical protein  33.33 
 
 		 121 aa  56.2  0.0000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0460  protein of unknown function UPF0102  40.7 
 
 		 153 aa  55.8  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0720  hypothetical protein  34.02 
 
 		 126 aa  56.2  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0341617  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3424  hypothetical protein  30.23 
 
 		 125 aa  55.5  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2035  hypothetical protein  28.57 
 
 		 122 aa  55.5  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.848509  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0546  hypothetical protein  29.82 
 
 		 115 aa  55.5  0.0000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.672576  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0277  protein of unknown function UPF0102  29.2 
 
 		 120 aa  55.5  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.107261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3675  protein of unknown function UPF0102  36.22 
 
 		 122 aa  55.5  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.344366 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0675  protein of unknown function UPF0102  27.86 
 
 		 165 aa  54.7  0.0000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1228  hypothetical protein  35.43 
 
 		 119 aa  54.7  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.74821  normal  0.260342 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0259  hypothetical protein  29.09 
 
 		 120 aa  53.9  0.0000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1934  hypothetical protein  29.09 
 
 		 120 aa  53.9  0.0000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.547856  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0666  hypothetical protein  29.84 
 
 		 116 aa  53.9  0.0000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0397911  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0629  hypothetical protein  31.45 
 
 		 122 aa  53.9  0.0000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3909  hypothetical protein  35.16 
 
 		 141 aa  53.5  0.0000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.181431  normal  0.486883 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2025  hypothetical protein  28.71 
 
 		 119 aa  53.9  0.0000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5237  protein of unknown function UPF0102  33.63 
 
 		 164 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0142  conserved hypothetical protein TIGR00252  36.52 
 
 		 121 aa  53.1  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0315  protein of unknown function UPF0102  36.52 
 
 		 121 aa  53.1  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000225244 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2398  hypothetical protein  38.37 
 
 		 118 aa  53.1  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.430013  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>