42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_19120 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_19120  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  100 
 
 		 117 aa  238  2.9999999999999997e-62  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.651626  normal  0.248755 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13870  hypothetical protein  68.75 
 
 		 249 aa  152  1e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1209  hypothetical protein  41.82 
 
 		 117 aa  94.4  5e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0937  protein of unknown function UPF0102  42.34 
 
 		 122 aa  90.1  8e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.105402 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1525  protein of unknown function UPF0102  40.87 
 
 		 123 aa  87.4  6e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0905238 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1406  protein of unknown function UPF0102  38.39 
 
 		 173 aa  79.7  0.00000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000418677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10390  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  39.6 
 
 		 167 aa  77.4  0.00000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000139118  unclonable  0.000000000910029 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07020  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  37.37 
 
 		 186 aa  64.3  0.0000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00114408  normal  0.507303 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07400  hypothetical protein  26.21 
 
 		 116 aa  52  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3709  protein of unknown function UPF0102  30.93 
 
 		 119 aa  51.6  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20220  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  32.99 
 
 		 130 aa  49.7  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0533456  normal  0.101532 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0277  protein of unknown function UPF0102  30.63 
 
 		 120 aa  49.3  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.107261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0017  hypothetical protein  33.72 
 
 		 126 aa  49.3  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00052241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3998  protein of unknown function UPF0102  32.99 
 
 		 139 aa  47.8  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2230  protein of unknown function UPF0102  27.45 
 
 		 127 aa  47.4  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0169041  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0650  hypothetical protein  29.13 
 
 		 128 aa  46.2  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1475  endonuclease  31.07 
 
 		 115 aa  46.6  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.733308  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0993  protein of unknown function UPF0102  34.44 
 
 		 129 aa  46.6  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00109853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0720  hypothetical protein  29.55 
 
 		 126 aa  45.4  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0341617  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0700  protein of unknown function UPF0102  31.43 
 
 		 172 aa  45.1  0.0003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000202877  hitchhiker  0.000000354886 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2881  hypothetical protein  29.41 
 
 		 146 aa  45.1  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.696458 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4036  protein of unknown function UPF0102  29.41 
 
 		 118 aa  44.7  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.261027  normal  0.0798574 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1447  protein of unknown function UPF0102  27.78 
 
 		 127 aa  44.3  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3424  hypothetical protein  26.47 
 
 		 125 aa  44.3  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2019  protein of unknown function UPF0102  26.61 
 
 		 134 aa  43.9  0.0007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.573307  normal  0.167847 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11140  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  28.85 
 
 		 120 aa  43.9  0.0008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0330886  normal  0.323386 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0758  hypothetical protein  29.55 
 
 		 130 aa  43.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0546  hypothetical protein  30.68 
 
 		 115 aa  43.5  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.672576  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10070  conserved hypothetical protein TIGR00252  29.41 
 
 		 153 aa  42.7  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0294595  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1186  hypothetical protein  26.92 
 
 		 140 aa  42.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00400032  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0669  hypothetical protein  27.36 
 
 		 124 aa  42.7  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3485  hypothetical protein  25.49 
 
 		 125 aa  42.7  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000340579 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0017  hypothetical protein  31.25 
 
 		 128 aa  42.4  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000457371  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2007  hypothetical protein  31.46 
 
 		 124 aa  42  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.63182  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09830  conserved hypothetical protein TIGR00252  26.92 
 
 		 125 aa  41.6  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.351272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2035  hypothetical protein  26.45 
 
 		 122 aa  41.6  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.848509  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0037  hypothetical protein  26.44 
 
 		 127 aa  41.6  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0465  hypothetical protein  28.24 
 
 		 113 aa  41.2  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1272  protein of unknown function UPF0102  29.91 
 
 		 125 aa  41.6  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5917  protein of unknown function UPF0102  32.56 
 
 		 117 aa  40.8  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00245822  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1530  hypothetical protein  25.29 
 
 		 118 aa  40.8  0.006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0048655  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2398  hypothetical protein  32.35 
 
 		 118 aa  40  0.01  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.430013  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>