25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_1525 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_1525  protein of unknown function UPF0102  100 
 
 		 123 aa  249  1e-65  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0905238 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0937  protein of unknown function UPF0102  45 
 
 		 122 aa  94  7e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.105402 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19120  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  40.87 
 
 		 117 aa  87.4  6e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.651626  normal  0.248755 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1406  protein of unknown function UPF0102  40 
 
 		 173 aa  73.9  0.0000000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000418677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13870  hypothetical protein  43.75 
 
 		 249 aa  72.8  0.000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10390  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  35.83 
 
 		 167 aa  64.7  0.0000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000139118  unclonable  0.000000000910029 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0930  hypothetical protein  37.07 
 
 		 123 aa  62.4  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.930588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1209  hypothetical protein  30.83 
 
 		 117 aa  57  0.00000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07020  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  33.62 
 
 		 186 aa  52.4  0.000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00114408  normal  0.507303 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07400  hypothetical protein  30.65 
 
 		 116 aa  49.7  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2398  hypothetical protein  32.73 
 
 		 118 aa  49.3  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.430013  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1156  hypothetical protein  33.6 
 
 		 118 aa  48.9  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0160558  normal  0.0576877 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1186  hypothetical protein  30.7 
 
 		 140 aa  47  0.00008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00400032  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2007  hypothetical protein  36.17 
 
 		 124 aa  45.1  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.63182  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3123  protein of unknown function UPF0102  31.2 
 
 		 121 aa  45.4  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0308676  normal  0.107591 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20490  Uncharacterized protein family UPF0102  28.07 
 
 		 181 aa  44.7  0.0004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.205618  normal  0.240792 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0700  protein of unknown function UPF0102  29.41 
 
 		 172 aa  44.7  0.0004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000202877  hitchhiker  0.000000354886 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0758  hypothetical protein  35.96 
 
 		 130 aa  43.5  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0993  protein of unknown function UPF0102  34.04 
 
 		 129 aa  43.5  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00109853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0669  hypothetical protein  28.81 
 
 		 124 aa  42.7  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1272  protein of unknown function UPF0102  27.93 
 
 		 125 aa  42.7  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2298  hypothetical protein  30.09 
 
 		 123 aa  42.4  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0650  hypothetical protein  28.69 
 
 		 128 aa  42.7  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0400  hypothetical protein  32.71 
 
 		 131 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1478  protein of unknown function UPF0102  35 
 
 		 118 aa  40  0.01  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.10043  normal  0.036198 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>