202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0735 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0735  regulatory protein, TetR  100 
 
 		 204 aa  398  9.999999999999999e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2624  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 210 aa  159  2e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.465145  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0808  transcriptional regulator, TetR family  43.88 
 
 		 222 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8740  putative transcriptional regulator, TetR family  41.45 
 
 		 226 aa  125  6e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1125  transcriptional regulator, TetR family  38.07 
 
 		 210 aa  96.7  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6264  putative transcriptional regulator, TetR family  37.31 
 
 		 196 aa  87.8  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.085092 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1430  regulatory protein TetR  35.68 
 
 		 236 aa  78.6  0.00000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0455  TetR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 224 aa  55.1  0.0000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366206  normal  0.106872 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1459  transcriptional regulator, TetR family  35.87 
 
 		 187 aa  53.9  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1076  TetR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 196 aa  53.9  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.581791 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1052  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 215 aa  53.5  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.857726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6854  TetR family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 224 aa  52.4  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.101929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0619  transcriptional regulator, TetR family  44.83 
 
 		 193 aa  52  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0692  TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 193 aa  52  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.253039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0633  TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 193 aa  52  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0676  TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 193 aa  52  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0323458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2550  TetR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 218 aa  51.6  0.000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.714249  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2595  TetR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 218 aa  51.6  0.000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.470916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2589  TetR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 218 aa  51.6  0.000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0467088  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25080  Transcriptional regulator, TetR family  50.88 
 
 		 191 aa  50.4  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4542  transcriptional regulator, TetR family  34.09 
 
 		 201 aa  50.8  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.204937  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2314  transcriptional regulator, TetR family  48.28 
 
 		 213 aa  49.7  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.251224 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0740  TetR family transcriptional regulator  24.64 
 
 		 205 aa  48.9  0.00004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.891023  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0081  TetR family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 231 aa  49.3  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.672358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4199  TetR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 214 aa  49.3  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.680761 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1828  regulatory protein TetR  47.76 
 
 		 207 aa  48.9  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.790266  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4478  transcriptional regulator, TetR family  37.86 
 
 		 211 aa  48.9  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4147  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 234 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13530  transcriptional regulator, TetR family  43.1 
 
 		 186 aa  48.5  0.00007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00114254  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4300  TetR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 190 aa  48.1  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0607  transcriptional regulator, TetR family  29.27 
 
 		 255 aa  47.8  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.118397  normal  0.590685 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2925  TetR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 259 aa  47.4  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0648  transcriptional regulator, TetR family  29.27 
 
 		 247 aa  48.1  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0672593 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2766  regulatory protein, TetR  35.38 
 
 		 198 aa  47.4  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.597397  hitchhiker  0.0084658 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2556  transcriptional regulator, TetR family  26.9 
 
 		 208 aa  47.8  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000000489141  normal  0.182844 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2506  transcriptional regulator, TetR family  34.62 
 
 		 219 aa  47  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.368527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6787  TetR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 209 aa  47.4  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1597  transcriptional regulator, TetR family  44.64 
 
 		 187 aa  47  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0577868  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4037  TetR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 446 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.755951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3637  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 228 aa  47  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3179  regulatory protein, TetR  31.88 
 
 		 215 aa  47  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.323857 
 
 
-
 
NC_004310  BR1879  hypothetical protein  32.12 
 
 		 297 aa  46.2  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2120  TetR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 195 aa  46.6  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1809  hypothetical protein  32.12 
 
 		 297 aa  46.2  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.492248  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1941  transcriptional regulator, TetR family  37.14 
 
 		 194 aa  46.6  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000874649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0136  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 243 aa  46.6  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.30147  normal  0.0856805 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4287  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 205 aa  46.2  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1456  transcriptional regulator, TetR family  30.15 
 
 		 211 aa  45.8  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1986  TetR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 218 aa  45.8  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0191052  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5533  transcriptional regulator, TetR family  37.88 
 
 		 215 aa  45.8  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.374337  normal  0.0421471 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1649  TetR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 233 aa  45.8  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.617035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0077  TetR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 183 aa  45.8  0.0004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.234691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5693  transcriptional regulator, TetR family  44.12 
 
 		 211 aa  45.8  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0563608  normal  0.866587 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0143  TetR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 266 aa  45.8  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.170765  normal  0.0134311 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5561  transcriptional regulator, TetR family  40.96 
 
 		 196 aa  45.4  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.842065 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1965  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 206 aa  45.4  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0526053  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2358  transcriptional regulator, TetR family  40.98 
 
 		 216 aa  45.4  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0281012 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3140  transcriptional regulator, TetR family  39.74 
 
 		 230 aa  45.4  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2601  regulatory protein, TetR  37.5 
 
 		 224 aa  45.4  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.354794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2800  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 224 aa  45.4  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.697977  decreased coverage  0.000162176 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5253  transcriptional regulator, TetR family  37.88 
 
 		 215 aa  45.1  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2781  TetR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 206 aa  45.1  0.0007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000487748 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1371  transcriptional regulator, TetR family  38.6 
 
 		 189 aa  45.1  0.0007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.91689  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0496  TetR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 202 aa  45.1  0.0007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.250936 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6786  TetR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 199 aa  45.1  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0599  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 200 aa  45.1  0.0008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000153581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08440  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 190 aa  45.1  0.0008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0649  TetR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 231 aa  45.1  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.899851  normal  0.251562 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5257  transcriptional regulator, TetR family  43.1 
 
 		 194 aa  45.1  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.570583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2226  TetR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 210 aa  45.1  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1059  TetR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 217 aa  44.7  0.0009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3625  regulatory protein TetR  36.84 
 
 		 191 aa  44.7  0.0009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1053  transcriptional regulator, TetR family  45.83 
 
 		 193 aa  44.3  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3651  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 		 233 aa  44.3  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.496262 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2786  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 190 aa  43.9  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.06199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0949  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 286 aa  44.3  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1039  TetR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 190 aa  44.3  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3170  transcriptional regulator, TetR family  43.64 
 
 		 216 aa  44.7  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 234 aa  43.9  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1078  TetR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 211 aa  43.5  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4942  transcriptional regulator, TetR family  34.09 
 
 		 247 aa  43.5  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.134742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2599  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 233 aa  43.5  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.87329  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1138  TetR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 228 aa  43.5  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2823  TetR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 178 aa  43.5  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.335296  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0520  transcriptional regulator, TetR family  34.52 
 
 		 197 aa  43.9  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.711752  normal  0.521102 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2019  transcriptional regulator, TetR family  31.63 
 
 		 235 aa  43.9  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2113  transcriptional regulator, TetR family  42.03 
 
 		 207 aa  43.5  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.918403  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2644  putative transcriptional regulator, TetR family  42.59 
 
 		 205 aa  43.9  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0665  TetR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 195 aa  43.9  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0109  TetR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 207 aa  43.5  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0522  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 219 aa  43.5  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3703  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  31.76 
 
 		 215 aa  43.9  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.83778 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2502  transcriptional regulator, TetR family  32.91 
 
 		 291 aa  43.9  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2721  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 194 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0906  transcriptional regulator, TetR family  39.74 
 
 		 232 aa  43.9  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.052988  normal  0.0196 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2221  transcriptional regulator, TetR family  42.37 
 
 		 264 aa  43.9  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.104647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0444  TetR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 220 aa  43.5  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.275459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2055  putative transcriptional regulator, TetR family  38.2 
 
 		 229 aa  43.9  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4153  TetR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 201 aa  43.5  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0444312  normal  0.572162 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1218  TetR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 206 aa  43.5  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>