More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1272 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_1272  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 138 aa  280  6.000000000000001e-75  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.828897 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  36.81 
 
 		 145 aa  83.2  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  36.11 
 
 		 145 aa  81.3  0.000000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  36.11 
 
 		 145 aa  79.7  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  34.72 
 
 		 148 aa  79  0.00000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1768  UspA domain-containing protein  33.58 
 
 		 140 aa  76.6  0.0000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1659  UspA domain-containing protein  31.39 
 
 		 140 aa  75.1  0.0000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  34.03 
 
 		 145 aa  74.7  0.0000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  31.39 
 
 		 138 aa  73.6  0.0000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  30.99 
 
 		 145 aa  73.6  0.0000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3643  UspA domain protein  30.82 
 
 		 141 aa  72.4  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0969583  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0913  UspA domain-containing protein  32.09 
 
 		 138 aa  72  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0674  UspA domain-containing protein  36.23 
 
 		 143 aa  72.8  0.000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  32.14 
 
 		 143 aa  69.3  0.00000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1529  UspA domain protein  33.33 
 
 		 141 aa  67.8  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1803  UspA domain protein  32.67 
 
 		 143 aa  67  0.00000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1120  UspA domain protein  29.58 
 
 		 140 aa  67.4  0.00000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.295874  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  32.62 
 
 		 139 aa  66.2  0.0000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  29.2 
 
 		 158 aa  66.6  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0589  universal stress protein  28.78 
 
 		 140 aa  65.5  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.558284  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2567  UspA domain protein  30.88 
 
 		 325 aa  65.1  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0384  UspA domain protein  31.65 
 
 		 142 aa  65.1  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150335  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1383  UspA domain protein  29.58 
 
 		 142 aa  65.1  0.0000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2327  UspA domain protein  28.17 
 
 		 139 aa  63.5  0.0000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1509  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  33.57 
 
 		 142 aa  63.5  0.0000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.767189  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0982  UspA domain protein  28.47 
 
 		 140 aa  63.2  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00474456  normal  0.0330842 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0870  UspA domain protein  31.91 
 
 		 140 aa  63.2  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  28.78 
 
 		 149 aa  62.4  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  30.15 
 
 		 159 aa  62.4  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2826  UspA domain protein  28.68 
 
 		 286 aa  62  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.232825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0826  universal stress protein  27.94 
 
 		 165 aa  61.6  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1517  UspA domain protein  28.17 
 
 		 148 aa  61.6  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.346414  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2278  UspA domain protein  27.59 
 
 		 143 aa  61.6  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  28.39 
 
 		 305 aa  62  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1861  UspA domain protein  29.08 
 
 		 145 aa  62  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0942342  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1206  hypothetical protein  27.78 
 
 		 154 aa  61.6  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.670905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0914  UspA domain-containing protein  32.84 
 
 		 297 aa  62  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2829  UspA domain protein  31.72 
 
 		 169 aa  61.6  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0510043  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  28.78 
 
 		 180 aa  61.6  0.000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  27.27 
 
 		 151 aa  61.2  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  24.5 
 
 		 157 aa  61.2  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0118  UspA domain-containing protein  31.21 
 
 		 144 aa  61.2  0.000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.385941 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1589  UspA domain-containing protein  30.07 
 
 		 140 aa  61.2  0.000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000251397  normal  0.0131871 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2886  UspA domain-containing protein  32.39 
 
 		 148 aa  61.2  0.000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0844522  normal  0.787665 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1257  UspA domain protein  27.54 
 
 		 136 aa  60.8  0.000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0806  UspA domain-containing protein  27.54 
 
 		 137 aa  60.8  0.000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0671262  normal  0.592673 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1511  UspA domain protein  30.56 
 
 		 151 aa  60.8  0.000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0780  UspA domain protein  26.43 
 
 		 142 aa  60.5  0.000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0608906  normal  0.0365188 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2705  UspA domain protein  30.56 
 
 		 151 aa  60.8  0.000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000991163 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4395  universal stress protein UspA  29.66 
 
 		 164 aa  60.5  0.000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.124166  normal  0.25513 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3201  hypothetical protein  29.86 
 
 		 156 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308557  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3734  UspA domain protein  27.78 
 
 		 138 aa  59.7  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.210471  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2727  universal stress protein  28.37 
 
 		 140 aa  60.1  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.671125  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1111  UspA domain-containing protein  32.62 
 
 		 145 aa  59.7  0.00000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0916  hypothetical protein  29.8 
 
 		 173 aa  60.1  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1933  UspA domain-containing protein  27.86 
 
 		 141 aa  58.9  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0098  universal stress protein  28.47 
 
 		 140 aa  59.3  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.45012  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2474  hypothetical protein  29.17 
 
 		 141 aa  58.9  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1196  UspA domain-containing protein  27.86 
 
 		 142 aa  58.9  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.196709  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0309  hypothetical protein  27.14 
 
 		 142 aa  58.9  0.00000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  27.97 
 
 		 156 aa  58.5  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1083  universal stress protein family  32.62 
 
 		 145 aa  58.2  0.00000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3776  UspA domain-containing protein  26.06 
 
 		 297 aa  57.8  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226753  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1311  UspA domain protein  28.47 
 
 		 187 aa  57.8  0.00000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.519886  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5551  UspA domain protein  25.87 
 
 		 165 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.883405 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4016  UspA domain protein  26.62 
 
 		 142 aa  57.4  0.00000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1858  UspA domain protein  25.18 
 
 		 147 aa  57.4  0.00000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2050  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  25.55 
 
 		 143 aa  57.8  0.00000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.450915  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3798  UspA domain protein  27.41 
 
 		 281 aa  57.4  0.00000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2634  UspA domain protein  30.67 
 
 		 170 aa  57.4  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  24.48 
 
 		 164 aa  57  0.00000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0093  UspA domain protein  32.39 
 
 		 140 aa  57.4  0.00000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.29194  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2538  UspA domain protein  30.67 
 
 		 170 aa  57.4  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205387  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1343  UspA domain protein  26.06 
 
 		 139 aa  57.4  0.00000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.292273  normal  0.588543 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  28.89 
 
 		 152 aa  57  0.00000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1274  UspA domain-containing protein  28.17 
 
 		 145 aa  57  0.00000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.331528 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3774  UspA domain-containing protein  26.9 
 
 		 317 aa  57  0.00000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.143188  normal  0.471237 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2792  UspA domain protein  26.76 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0997  UspA domain protein  28.28 
 
 		 147 aa  56.6  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1134  UspA domain-containing protein  32.41 
 
 		 167 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4014  UspA domain protein  25.19 
 
 		 136 aa  56.6  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4616  UspA domain protein  27.13 
 
 		 141 aa  56.2  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3847  UspA domain protein  28.28 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000916772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4350  UspA domain protein  26.47 
 
 		 294 aa  56.2  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.252521  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0074  UspA domain-containing protein  32.39 
 
 		 140 aa  56.2  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.937758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1081  UspA domain-containing protein  28.28 
 
 		 147 aa  56.6  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0952859  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  29.37 
 
 		 143 aa  55.5  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2059  UspA domain protein  31.47 
 
 		 156 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.3944  hitchhiker  0.00218931 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0912  UspA domain-containing protein  27.59 
 
 		 317 aa  56.2  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0363039 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2199  universal stress protein  26.43 
 
 		 139 aa  56.2  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0228  UspA domain protein  30.67 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.115538 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4775  UspA domain protein  29.71 
 
 		 141 aa  55.8  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1409  UspA domain protein  26.95 
 
 		 140 aa  56.2  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.554815 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5241  UspA domain protein  27.52 
 
 		 154 aa  56.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.639442 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1646  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  35.42 
 
 		 146 aa  55.8  0.0000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1762  UspA domain-containing protein  26.32 
 
 		 324 aa  56.2  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2091  UspA domain-containing protein  25.53 
 
 		 140 aa  55.8  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.10254  normal  0.0585614 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2298  UspA domain-containing protein  25.52 
 
 		 164 aa  55.5  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.178234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3082  UspA domain protein  27.97 
 
 		 138 aa  55.1  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0081  UspA domain protein  25.93 
 
 		 137 aa  55.1  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>